MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 71095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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71002	NC_008750	CTG	2	6	4703202	4703207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600872
71003	NC_008750	AAT	2	6	4703269	4703274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120600872
71004	NC_008750	TTTC	2	8	4703304	4703311	0 %	75 %	0 %	25 %	120600872
71005	NC_008750	CAT	2	6	4703382	4703387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600872
71006	NC_008750	AGGT	2	8	4703432	4703439	25 %	25 %	50 %	0 %	120600872
71007	NC_008750	ATG	2	6	4703495	4703500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600872
71008	NC_008750	GGC	2	6	4703524	4703529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120600872
71009	NC_008750	TTG	2	6	4703537	4703542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120600872
71010	NC_008750	T	6	6	4703632	4703637	0 %	100 %	0 %	0 %	120600872
71011	NC_008750	TTC	2	6	4703644	4703649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120600872
71012	NC_008750	GCTCT	2	10	4703658	4703667	0 %	40 %	20 %	40 %	120600872
71013	NC_008750	CTG	2	6	4703694	4703699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600872
71014	NC_008750	GAA	2	6	4703720	4703725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120600872
71015	NC_008750	GTA	2	6	4703758	4703763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600872
71016	NC_008750	TTA	2	6	4703810	4703815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120600872
71017	NC_008750	CAGCCT	2	12	4703847	4703858	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120600872
71018	NC_008750	T	6	6	4703953	4703958	0 %	100 %	0 %	0 %	120600872
71019	NC_008750	CAA	2	6	4703973	4703978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120600872
71020	NC_008750	GTA	3	9	4703983	4703991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600872
71021	NC_008750	CGG	2	6	4704451	4704456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120600873
71022	NC_008750	TCA	2	6	4704523	4704528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600873
71023	NC_008750	TTC	2	6	4704576	4704581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120600873
71024	NC_008750	GTG	3	9	4704700	4704708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120600873
71025	NC_008750	ATAA	2	8	4704718	4704725	75 %	25 %	0 %	0 %	120600873
71026	NC_008750	GC	3	6	4704757	4704762	0 %	0 %	50 %	50 %	120600873
71027	NC_008750	CTG	2	6	4704806	4704811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600873
71028	NC_008750	ATA	2	6	4704817	4704822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120600873
71029	NC_008750	GTA	2	6	4704857	4704862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600873
71030	NC_008750	AGT	2	6	4704870	4704875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600873
71031	NC_008750	TAA	2	6	4704924	4704929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120600873
71032	NC_008750	CGGC	2	8	4704952	4704959	0 %	0 %	50 %	50 %	120600873
71033	NC_008750	CAC	2	6	4704963	4704968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120600873
71034	NC_008750	GAT	2	6	4705032	4705037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600873
71035	NC_008750	CTT	2	6	4705082	4705087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120600873
71036	NC_008750	CCA	2	6	4705142	4705147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120600873
71037	NC_008750	GC	3	6	4705190	4705195	0 %	0 %	50 %	50 %	120600873
71038	NC_008750	GGC	2	6	4705200	4705205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120600873
71039	NC_008750	TGG	2	6	4705214	4705219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120600873
71040	NC_008750	TCAT	2	8	4705267	4705274	25 %	50 %	0 %	25 %	120600873
71041	NC_008750	GCC	2	6	4705365	4705370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120600873
71042	NC_008750	A	6	6	4705422	4705427	100 %	0 %	0 %	0 %	120600873
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71047	NC_008750	ATAA	2	8	4705757	4705764	75 %	25 %	0 %	0 %	120600874
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71051	NC_008750	GAA	2	6	4705835	4705840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120600874
71052	NC_008750	CAT	2	6	4705868	4705873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600874
71053	NC_008750	TCG	2	6	4705894	4705899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120600874
71054	NC_008750	ATG	2	6	4705923	4705928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600874
71055	NC_008750	GTA	2	6	4705961	4705966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120600874
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71058	NC_008750	TCTT	2	8	4706112	4706119	0 %	75 %	0 %	25 %	120600874
71059	NC_008750	CAT	2	6	4706129	4706134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600874
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71071	NC_008750	CAT	3	9	4706708	4706716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120600874
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71088	NC_008750	TTG	2	6	4707626	4707631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120600876
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.