MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 71774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_008700	ATT	2	6	1214382	1214387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119774139
20003	NC_008700	ATG	2	6	1214831	1214836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119774140
20004	NC_008700	CCTTTG	2	12	1214922	1214933	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119774140
20005	NC_008700	GAT	2	6	1215219	1215224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119774141
20006	NC_008700	TGG	2	6	1215235	1215240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119774141
20007	NC_008700	GTT	2	6	1215275	1215280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119774141
20008	NC_008700	GCA	3	9	1215298	1215306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774141
20009	NC_008700	GGCA	2	8	1215329	1215336	25 %	0 %	50 %	25 %	119774141
20010	NC_008700	G	6	6	1215433	1215438	0 %	0 %	100 %	0 %	119774141
20011	NC_008700	TCA	2	6	1215439	1215444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119774141
20012	NC_008700	CTG	2	6	1215536	1215541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774141
20013	NC_008700	CGTAGT	2	12	1215562	1215573	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119774141
20014	NC_008700	TCA	2	6	1215649	1215654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119774141
20015	NC_008700	GTA	2	6	1215728	1215733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119774141
20016	NC_008700	ATG	2	6	1215828	1215833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119774141
20017	NC_008700	GCA	2	6	1215892	1215897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774141
20018	NC_008700	TTC	2	6	1216169	1216174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119774141
20019	NC_008700	CAT	2	6	1216313	1216318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119774141
20020	NC_008700	ATG	2	6	1216338	1216343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119774141
20021	NC_008700	GTC	2	6	1216379	1216384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774141
20022	NC_008700	G	6	6	1216411	1216416	0 %	0 %	100 %	0 %	119774141
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20024	NC_008700	T	6	6	1216439	1216444	0 %	100 %	0 %	0 %	119774141
20025	NC_008700	GTT	2	6	1216499	1216504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119774141
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20032	NC_008700	CCA	2	6	1217161	1217166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119774142
20033	NC_008700	GCC	2	6	1217226	1217231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119774142
20034	NC_008700	TGC	2	6	1217239	1217244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774142
20035	NC_008700	ACA	2	6	1217251	1217256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119774142
20036	NC_008700	CAC	2	6	1217369	1217374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119774142
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20038	NC_008700	GGGC	2	8	1217563	1217570	0 %	0 %	75 %	25 %	119774142
20039	NC_008700	CCTT	2	8	1217647	1217654	0 %	50 %	0 %	50 %	119774142
20040	NC_008700	CTGC	2	8	1217802	1217809	0 %	25 %	25 %	50 %	119774143
20041	NC_008700	GTT	2	6	1217857	1217862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119774143
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20043	NC_008700	TGC	2	6	1217976	1217981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774143
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20046	NC_008700	CTG	2	6	1218152	1218157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774143
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20048	NC_008700	CGTTTA	2	12	1218173	1218184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119774143
20049	NC_008700	GC	3	6	1218209	1218214	0 %	0 %	50 %	50 %	119774143
20050	NC_008700	GCA	2	6	1218292	1218297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774143
20051	NC_008700	GC	3	6	1218394	1218399	0 %	0 %	50 %	50 %	119774143
20052	NC_008700	GGC	2	6	1218442	1218447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774143
20053	NC_008700	GAC	2	6	1218458	1218463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774143
20054	NC_008700	CGT	2	6	1218476	1218481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774143
20055	NC_008700	TAT	2	6	1218490	1218495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119774143
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20059	NC_008700	GC	3	6	1218727	1218732	0 %	0 %	50 %	50 %	119774143
20060	NC_008700	CATA	2	8	1218739	1218746	50 %	25 %	0 %	25 %	119774143
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20113	NC_008700	CGG	2	6	1221909	1221914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774146
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20116	NC_008700	ACCCT	2	10	1221938	1221947	20 %	20 %	0 %	60 %	119774146
20117	NC_008700	CGG	2	6	1222098	1222103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774146
20118	NC_008700	GCTC	2	8	1222142	1222149	0 %	25 %	25 %	50 %	119774146
20119	NC_008700	TCAG	2	8	1222226	1222233	25 %	25 %	25 %	25 %	119774146
20120	NC_008700	CGG	2	6	1222244	1222249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774146
20121	NC_008700	CTG	2	6	1222255	1222260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774146
20122	NC_008700	TAT	2	6	1222291	1222296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119774146
20123	NC_008700	CAAC	2	8	1222301	1222308	50 %	0 %	0 %	50 %	119774146
20124	NC_008700	CCG	2	6	1222382	1222387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119774146
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20131	NC_008700	TGC	2	6	1222638	1222643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774146
20132	NC_008700	TGT	2	6	1222682	1222687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119774146
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20134	NC_008700	CGCTGA	2	12	1222709	1222720	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119774146
20135	NC_008700	GCC	2	6	1222723	1222728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119774146
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20137	NC_008700	GGA	2	6	1222776	1222781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119774146
20138	NC_008700	GAC	2	6	1222831	1222836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774146
20139	NC_008700	GC	3	6	1222863	1222868	0 %	0 %	50 %	50 %	119774146
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20141	NC_008700	TGC	2	6	1222970	1222975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774146
20142	NC_008700	GT	3	6	1223000	1223005	0 %	50 %	50 %	0 %	119774146
20143	NC_008700	TGC	2	6	1223036	1223041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774146
20144	NC_008700	CGC	2	6	1223173	1223178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119774146
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20148	NC_008700	CGG	2	6	1223408	1223413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774146
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20346	NC_008700	CAT	2	6	1234246	1234251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119774156
20347	NC_008700	GTG	2	6	1234272	1234277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119774156
20348	NC_008700	CTC	2	6	1234281	1234286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119774156
20349	NC_008700	ACTTTG	2	12	1234287	1234298	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119774156
20350	NC_008700	CAA	2	6	1234312	1234317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119774156
20351	NC_008700	CAA	2	6	1234423	1234428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119774156
20352	NC_008700	GCG	2	6	1234431	1234436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774156
20353	NC_008700	GCT	2	6	1234439	1234444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774156
20354	NC_008700	CTG	2	6	1234451	1234456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774156
20355	NC_008700	CTAT	2	8	1234560	1234567	25 %	50 %	0 %	25 %	119774157
20356	NC_008700	GTT	2	6	1234663	1234668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119774157
20357	NC_008700	GGT	2	6	1234816	1234821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119774157
20358	NC_008700	CGG	2	6	1234979	1234984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774158
20359	NC_008700	CGA	2	6	1235092	1235097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774158
20360	NC_008700	TTC	2	6	1235171	1235176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119774158
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20362	NC_008700	GCC	2	6	1235237	1235242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119774158
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20364	NC_008700	GCC	2	6	1235336	1235341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119774158
20365	NC_008700	GGC	2	6	1235366	1235371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774158
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20371	NC_008700	CGG	2	6	1235898	1235903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774158
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20374	NC_008700	GCC	2	6	1236097	1236102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119774159
20375	NC_008700	CTG	2	6	1236115	1236120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774159
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20378	NC_008700	CTGG	2	8	1236297	1236304	0 %	25 %	50 %	25 %	119774159
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20381	NC_008700	CTGC	2	8	1236435	1236442	0 %	25 %	25 %	50 %	119774159
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20444	NC_008700	TCAGC	2	10	1240590	1240599	20 %	20 %	20 %	40 %	119774162
20445	NC_008700	CGC	2	6	1240695	1240700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119774162
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20449	NC_008700	CGC	2	6	1241069	1241074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119774163
20450	NC_008700	TGG	2	6	1241423	1241428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119774163
20451	NC_008700	TCA	2	6	1241465	1241470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119774163
20452	NC_008700	CTG	2	6	1241617	1241622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774163
20453	NC_008700	AATCC	2	10	1241666	1241675	40 %	20 %	0 %	40 %	119774163
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20455	NC_008700	CGG	2	6	1241720	1241725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774163
20456	NC_008700	GCT	3	9	1241832	1241840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774163
20457	NC_008700	AGGGT	2	10	1241890	1241899	20 %	20 %	60 %	0 %	119774163
20458	NC_008700	TCG	2	6	1241962	1241967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774163
20459	NC_008700	AGC	2	6	1241977	1241982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774163
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20461	NC_008700	GCA	2	6	1242107	1242112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774163
20462	NC_008700	CTG	2	6	1242135	1242140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774163
20463	NC_008700	GAC	2	6	1242176	1242181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774163
20464	NC_008700	CGAC	2	8	1242200	1242207	25 %	0 %	25 %	50 %	119774163
20465	NC_008700	GCA	2	6	1242212	1242217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774163
20466	NC_008700	CAG	2	6	1242240	1242245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774163
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20468	NC_008700	AG	3	6	1242269	1242274	50 %	0 %	50 %	0 %	119774163
20469	NC_008700	GTG	2	6	1242276	1242281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119774163
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20472	NC_008700	TCG	2	6	1242409	1242414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119774163
20473	NC_008700	TCC	2	6	1242433	1242438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119774163
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20480	NC_008700	TGCC	2	8	1242849	1242856	0 %	25 %	25 %	50 %	119774164
20481	NC_008700	CAG	2	6	1242904	1242909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119774164
20482	NC_008700	GGC	2	6	1242919	1242924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119774164
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20484	NC_008700	CAGT	2	8	1243275	1243282	25 %	25 %	25 %	25 %	119774164
20485	NC_008700	TGGC	2	8	1243286	1243293	0 %	25 %	50 %	25 %	119774164
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20488	NC_008700	GTA	2	6	1243618	1243623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119774164
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20492	NC_008700	GAG	2	6	1243720	1243725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119774164
20493	NC_008700	GA	3	6	1243871	1243876	50 %	0 %	50 %	0 %	119774165
20494	NC_008700	TGG	2	6	1243921	1243926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119774165
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20500	NC_008700	A	7	7	1244254	1244260	100 %	0 %	0 %	0 %	119774165

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