MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. ANA-3 plasmid 1

Total Repeats: 4077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008573	TTC	2	6	273628	273633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117676322
4002	NC_008573	TGT	2	6	273687	273692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676323
4003	NC_008573	TTGC	2	8	273798	273805	0 %	50 %	25 %	25 %	117676323
4004	NC_008573	CAGA	2	8	273808	273815	50 %	0 %	25 %	25 %	117676323
4005	NC_008573	GGC	2	6	273968	273973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117676323
4006	NC_008573	ATC	2	6	274037	274042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676323
4007	NC_008573	T	6	6	274167	274172	0 %	100 %	0 %	0 %	117676323
4008	NC_008573	CAG	2	6	274204	274209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117676323
4009	NC_008573	TGGC	2	8	274281	274288	0 %	25 %	50 %	25 %	117676323
4010	NC_008573	ACG	2	6	274325	274330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117676323
4011	NC_008573	ATCA	2	8	274574	274581	50 %	25 %	0 %	25 %	117676323
4012	NC_008573	TTG	2	6	274586	274591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676323
4013	NC_008573	ATC	2	6	274668	274673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676323
4014	NC_008573	CTG	2	6	274706	274711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676323
4015	NC_008573	GCT	2	6	274732	274737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676323
4016	NC_008573	GGA	2	6	274868	274873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117676323
4017	NC_008573	T	6	6	274892	274897	0 %	100 %	0 %	0 %	117676323
4018	NC_008573	TC	3	6	274920	274925	0 %	50 %	0 %	50 %	117676323
4019	NC_008573	TTAA	2	8	274937	274944	50 %	50 %	0 %	0 %	117676324
4020	NC_008573	GAA	2	6	274950	274955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117676324
4021	NC_008573	AAC	2	6	275023	275028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676324
4022	NC_008573	GCA	2	6	275302	275307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117676324
4023	NC_008573	TAAA	2	8	275318	275325	75 %	25 %	0 %	0 %	117676324
4024	NC_008573	AAT	2	6	275364	275369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117676324
4025	NC_008573	AAT	2	6	275474	275479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117676324
4026	NC_008573	GCT	2	6	275483	275488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676324
4027	NC_008573	TTG	2	6	275540	275545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676324
4028	NC_008573	ATC	2	6	275578	275583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676324
4029	NC_008573	ACA	2	6	275609	275614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676324
4030	NC_008573	CTG	2	6	275632	275637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676324
4031	NC_008573	AAC	2	6	275695	275700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676324
4032	NC_008573	TGC	2	6	275704	275709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676324
4033	NC_008573	GCA	2	6	275725	275730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117676324
4034	NC_008573	CCA	2	6	275745	275750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117676324
4035	NC_008573	CAA	2	6	275912	275917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676324
4036	NC_008573	GTT	2	6	275950	275955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676325
4037	NC_008573	CAT	2	6	275989	275994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676325
4038	NC_008573	CTT	2	6	276043	276048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117676325
4039	NC_008573	TAA	2	6	276073	276078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117676325
4040	NC_008573	CTTG	2	8	276133	276140	0 %	50 %	25 %	25 %	117676325
4041	NC_008573	T	6	6	276158	276163	0 %	100 %	0 %	0 %	117676325
4042	NC_008573	AG	3	6	276198	276203	50 %	0 %	50 %	0 %	117676325
4043	NC_008573	TGC	2	6	276270	276275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676325
4044	NC_008573	GCT	2	6	276428	276433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676326
4045	NC_008573	GTC	2	6	276437	276442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676326
4046	NC_008573	TCG	2	6	276489	276494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676326
4047	NC_008573	TGT	2	6	276592	276597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676326
4048	NC_008573	CTTTG	2	10	276689	276698	0 %	60 %	20 %	20 %	117676326
4049	NC_008573	ATT	2	6	276721	276726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676326
4050	NC_008573	TTA	2	6	276981	276986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676327
4051	NC_008573	CTT	2	6	277008	277013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117676327
4052	NC_008573	A	6	6	277037	277042	100 %	0 %	0 %	0 %	117676327
4053	NC_008573	TGC	2	6	277051	277056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676327
4054	NC_008573	CAC	2	6	277109	277114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117676327
4055	NC_008573	AG	3	6	277123	277128	50 %	0 %	50 %	0 %	117676327
4056	NC_008573	TCCC	2	8	277150	277157	0 %	25 %	0 %	75 %	117676327
4057	NC_008573	GCT	2	6	277212	277217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676327
4058	NC_008573	GT	3	6	277272	277277	0 %	50 %	50 %	0 %	117676327
4059	NC_008573	TAG	2	6	277342	277347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676327
4060	NC_008573	TCA	2	6	277454	277459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676327
4061	NC_008573	CCT	2	6	277551	277556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117676327
4062	NC_008573	GTTC	2	8	277601	277608	0 %	50 %	25 %	25 %	117676327
4063	NC_008573	AAC	2	6	277610	277615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676327
4064	NC_008573	TGG	2	6	277647	277652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117676327
4065	NC_008573	GCC	2	6	277691	277696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117676327
4066	NC_008573	GCC	2	6	277715	277720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117676327
4067	NC_008573	GA	3	6	277735	277740	50 %	0 %	50 %	0 %	117676327
4068	NC_008573	ATTT	2	8	277757	277764	25 %	75 %	0 %	0 %	117676327
4069	NC_008573	T	6	6	277932	277937	0 %	100 %	0 %	0 %	117676328
4070	NC_008573	CTG	2	6	277941	277946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676328
4071	NC_008573	TTA	2	6	278001	278006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676328
4072	NC_008573	TAC	2	6	278119	278124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676328
4073	NC_008573	AC	3	6	278123	278128	50 %	0 %	0 %	50 %	117676328
4074	NC_008573	G	6	6	278141	278146	0 %	0 %	100 %	0 %	117676328
4075	NC_008573	TTG	2	6	278155	278160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676328
4076	NC_008573	TGG	2	6	278178	278183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117676328
4077	NC_008573	AGGA	2	8	278296	278303	50 %	0 %	50 %	0 %	117676328

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.