MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. ANA-3 plasmid 1

Total Repeats: 4077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008573	CTG	2	6	169224	169229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676224
2502	NC_008573	ATGAAC	4	24	169265	169288	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	117676224
2503	NC_008573	ATGGAT	2	12	169289	169300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676224
2504	NC_008573	GAT	2	6	169316	169321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676224
2505	NC_008573	TGC	2	6	169325	169330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676224
2506	NC_008573	TGC	2	6	169423	169428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676224
2507	NC_008573	TTC	2	6	169465	169470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117676224
2508	NC_008573	TCC	2	6	169480	169485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117676224
2509	NC_008573	T	7	7	169664	169670	0 %	100 %	0 %	0 %	117676225
2510	NC_008573	GGGA	2	8	169706	169713	25 %	0 %	75 %	0 %	117676225
2511	NC_008573	GCA	2	6	169728	169733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117676225
2512	NC_008573	TGT	2	6	169788	169793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676225
2513	NC_008573	TTAGTG	2	12	169828	169839	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	117676225
2514	NC_008573	AAC	2	6	169851	169856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676225
2515	NC_008573	T	6	6	169973	169978	0 %	100 %	0 %	0 %	117676225
2516	NC_008573	CCT	2	6	169986	169991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117676225
2517	NC_008573	A	6	6	170088	170093	100 %	0 %	0 %	0 %	117676225
2518	NC_008573	AGT	2	6	170100	170105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676225
2519	NC_008573	GAG	2	6	170133	170138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117676225
2520	NC_008573	CAA	2	6	170200	170205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676226
2521	NC_008573	CT	3	6	170312	170317	0 %	50 %	0 %	50 %	117676226
2522	NC_008573	TTA	2	6	170414	170419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676226
2523	NC_008573	AAG	2	6	170427	170432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117676226
2524	NC_008573	A	6	6	170455	170460	100 %	0 %	0 %	0 %	117676226
2525	NC_008573	TAT	2	6	170497	170502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676226
2526	NC_008573	TGAT	2	8	170661	170668	25 %	50 %	25 %	0 %	117676226
2527	NC_008573	TA	3	6	170689	170694	50 %	50 %	0 %	0 %	117676226
2528	NC_008573	T	6	6	170812	170817	0 %	100 %	0 %	0 %	117676226
2529	NC_008573	CG	3	6	170878	170883	0 %	0 %	50 %	50 %	117676226
2530	NC_008573	AATG	2	8	170935	170942	50 %	25 %	25 %	0 %	117676226
2531	NC_008573	TCC	2	6	170947	170952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117676226
2532	NC_008573	GTT	2	6	170971	170976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676226
2533	NC_008573	ATG	2	6	171138	171143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676226
2534	NC_008573	GGTA	2	8	171214	171221	25 %	25 %	50 %	0 %	117676226
2535	NC_008573	GATATG	2	12	171314	171325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676226
2536	NC_008573	GATTG	2	10	171631	171640	20 %	40 %	40 %	0 %	117676226
2537	NC_008573	CAA	3	9	171650	171658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676226
2538	NC_008573	CCTA	2	8	171704	171711	25 %	25 %	0 %	50 %	117676226
2539	NC_008573	AT	3	6	171769	171774	50 %	50 %	0 %	0 %	117676226
2540	NC_008573	CGC	2	6	171805	171810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117676226
2541	NC_008573	GAT	2	6	171865	171870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676226
2542	NC_008573	GAGT	2	8	171901	171908	25 %	25 %	50 %	0 %	117676226
2543	NC_008573	CCG	2	6	171990	171995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117676226
2544	NC_008573	GTG	2	6	172064	172069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117676226
2545	NC_008573	CGG	2	6	172173	172178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117676227
2546	NC_008573	ATG	2	6	172181	172186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676227
2547	NC_008573	GGTTA	2	10	172271	172280	20 %	40 %	40 %	0 %	117676227
2548	NC_008573	T	7	7	172473	172479	0 %	100 %	0 %	0 %	117676227
2549	NC_008573	ATTT	2	8	172595	172602	25 %	75 %	0 %	0 %	117676227
2550	NC_008573	CCG	2	6	172736	172741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117676227
2551	NC_008573	ATT	2	6	172933	172938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676228
2552	NC_008573	AAC	2	6	172940	172945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676228
2553	NC_008573	CAA	2	6	173046	173051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676228
2554	NC_008573	AGC	2	6	173112	173117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117676228
2555	NC_008573	GAT	2	6	173215	173220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676228
2556	NC_008573	TGA	2	6	173227	173232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676228
2557	NC_008573	TATC	2	8	173412	173419	25 %	50 %	0 %	25 %	117676229
2558	NC_008573	GGC	2	6	173440	173445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117676229
2559	NC_008573	GATT	2	8	173528	173535	25 %	50 %	25 %	0 %	117676229
2560	NC_008573	ATT	2	6	173549	173554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676229
2561	NC_008573	ATGC	2	8	173611	173618	25 %	25 %	25 %	25 %	117676229
2562	NC_008573	TTGC	2	8	173812	173819	0 %	50 %	25 %	25 %	117676229
2563	NC_008573	TGC	2	6	173893	173898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676229
2564	NC_008573	A	6	6	173919	173924	100 %	0 %	0 %	0 %	117676229
2565	NC_008573	TGT	2	6	174002	174007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676229
2566	NC_008573	TGG	2	6	174071	174076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117676229
2567	NC_008573	AGC	2	6	174093	174098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117676229
2568	NC_008573	CAAAA	2	10	174152	174161	80 %	0 %	0 %	20 %	117676229
2569	NC_008573	ACA	2	6	174214	174219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676229
2570	NC_008573	TGA	2	6	174375	174380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676230
2571	NC_008573	AC	3	6	174382	174387	50 %	0 %	0 %	50 %	117676230
2572	NC_008573	CCG	2	6	174422	174427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117676230
2573	NC_008573	TGT	2	6	174435	174440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676230
2574	NC_008573	TGC	2	6	174453	174458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676230
2575	NC_008573	TTA	2	6	174493	174498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676230
2576	NC_008573	ATC	2	6	174560	174565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676230
2577	NC_008573	CTTA	2	8	174584	174591	25 %	50 %	0 %	25 %	117676230
2578	NC_008573	TTAA	2	8	174727	174734	50 %	50 %	0 %	0 %	117676230
2579	NC_008573	TC	3	6	175027	175032	0 %	50 %	0 %	50 %	117676231
2580	NC_008573	GTC	2	6	175129	175134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676231
2581	NC_008573	T	7	7	175136	175142	0 %	100 %	0 %	0 %	117676231
2582	NC_008573	TAT	2	6	175200	175205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676231
2583	NC_008573	GAAA	2	8	175273	175280	75 %	0 %	25 %	0 %	117676231
2584	NC_008573	ACT	2	6	175308	175313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676231
2585	NC_008573	ATT	2	6	175374	175379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676231
2586	NC_008573	TGT	2	6	175398	175403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117676231
2587	NC_008573	TAT	2	6	175446	175451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676231
2588	NC_008573	T	6	6	175503	175508	0 %	100 %	0 %	0 %	117676231
2589	NC_008573	TTA	2	6	175977	175982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676232
2590	NC_008573	TAA	2	6	175991	175996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117676232
2591	NC_008573	CT	3	6	176001	176006	0 %	50 %	0 %	50 %	117676232
2592	NC_008573	ATG	2	6	176008	176013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676232
2593	NC_008573	TGG	2	6	176132	176137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117676232
2594	NC_008573	GAG	2	6	176182	176187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117676232
2595	NC_008573	ATG	4	12	176218	176229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676232
2596	NC_008573	TAT	2	6	176266	176271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676232
2597	NC_008573	T	6	6	176279	176284	0 %	100 %	0 %	0 %	117676232
2598	NC_008573	ACA	2	6	176324	176329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676232
2599	NC_008573	TCA	2	6	176334	176339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676232
2600	NC_008573	TTGATT	2	12	176497	176508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	117676232
2601	NC_008573	ATG	2	6	176551	176556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117676232
2602	NC_008573	T	7	7	176560	176566	0 %	100 %	0 %	0 %	117676232
2603	NC_008573	A	6	6	176592	176597	100 %	0 %	0 %	0 %	117676232
2604	NC_008573	TAA	2	6	176626	176631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117676232
2605	NC_008573	AACT	2	8	176675	176682	50 %	25 %	0 %	25 %	117676232
2606	NC_008573	TGCAA	2	10	176696	176705	40 %	20 %	20 %	20 %	117676232
2607	NC_008573	TCAG	2	8	176773	176780	25 %	25 %	25 %	25 %	117676232
2608	NC_008573	GGA	2	6	176781	176786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117676232
2609	NC_008573	T	7	7	176792	176798	0 %	100 %	0 %	0 %	117676232
2610	NC_008573	GGA	2	6	176817	176822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117676232
2611	NC_008573	ATA	2	6	176833	176838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117676232
2612	NC_008573	TTA	2	6	176867	176872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676232
2613	NC_008573	ACT	2	6	176886	176891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676232
2614	NC_008573	AATG	2	8	177024	177031	50 %	25 %	25 %	0 %	117676232
2615	NC_008573	CT	3	6	177636	177641	0 %	50 %	0 %	50 %	117676233
2616	NC_008573	AG	3	6	177651	177656	50 %	0 %	50 %	0 %	117676233
2617	NC_008573	TCACA	2	10	177682	177691	40 %	20 %	0 %	40 %	117676233
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2620	NC_008573	GATAA	2	10	178127	178136	60 %	20 %	20 %	0 %	117676234
2621	NC_008573	A	6	6	178333	178338	100 %	0 %	0 %	0 %	117676234
2622	NC_008573	CT	3	6	178340	178345	0 %	50 %	0 %	50 %	117676234
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2624	NC_008573	ATT	2	6	178411	178416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117676234
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2989	NC_008573	GCG	2	6	201900	201905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117676250
2990	NC_008573	GCC	2	6	201950	201955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117676250
2991	NC_008573	CAC	2	6	201991	201996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117676250
2992	NC_008573	CTT	2	6	202264	202269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117676250
2993	NC_008573	ACAGC	2	10	202366	202375	40 %	0 %	20 %	40 %	117676251
2994	NC_008573	TCA	3	9	202378	202386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117676251
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2996	NC_008573	GCT	2	6	202464	202469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117676251
2997	NC_008573	AAC	2	6	202600	202605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117676251
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2999	NC_008573	AACCC	2	10	202649	202658	40 %	0 %	0 %	60 %	117676251
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