MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 84118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_008554	CGG	2	6	1257245	1257250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116748462
21003	NC_008554	TC	3	6	1257447	1257452	0 %	50 %	0 %	50 %	116748462
21004	NC_008554	TC	3	6	1257468	1257473	0 %	50 %	0 %	50 %	116748462
21005	NC_008554	TCGACG	2	12	1257523	1257534	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116748462
21006	NC_008554	ATGA	2	8	1257537	1257544	50 %	25 %	25 %	0 %	116748462
21007	NC_008554	ATCG	2	8	1257564	1257571	25 %	25 %	25 %	25 %	116748462
21008	NC_008554	CG	3	6	1257570	1257575	0 %	0 %	50 %	50 %	116748462
21009	NC_008554	CGC	2	6	1257593	1257598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748462
21010	NC_008554	C	7	7	1257631	1257637	0 %	0 %	0 %	100 %	116748462
21011	NC_008554	AAG	2	6	1257696	1257701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116748462
21012	NC_008554	TTC	2	6	1257759	1257764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116748462
21013	NC_008554	GCC	2	6	1257803	1257808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748462
21014	NC_008554	ATC	3	9	1257819	1257827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116748462
21015	NC_008554	AGC	2	6	1257832	1257837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748462
21016	NC_008554	ATT	2	6	1257861	1257866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116748462
21017	NC_008554	TCC	2	6	1257920	1257925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116748463
21018	NC_008554	GAA	2	6	1258019	1258024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116748463
21019	NC_008554	CAC	2	6	1258097	1258102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116748463
21020	NC_008554	A	6	6	1258109	1258114	100 %	0 %	0 %	0 %	116748463
21021	NC_008554	CG	3	6	1258171	1258176	0 %	0 %	50 %	50 %	116748463
21022	NC_008554	AAC	2	6	1258190	1258195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116748463
21023	NC_008554	GCC	2	6	1258232	1258237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748463
21024	NC_008554	CG	3	6	1258285	1258290	0 %	0 %	50 %	50 %	116748463
21025	NC_008554	GCC	2	6	1258401	1258406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748463
21026	NC_008554	CCG	2	6	1258518	1258523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748464
21027	NC_008554	CGCC	2	8	1258579	1258586	0 %	0 %	25 %	75 %	116748464
21028	NC_008554	TAA	2	6	1258633	1258638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116748464
21029	NC_008554	GTA	2	6	1258653	1258658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116748464
21030	NC_008554	ATA	2	6	1258695	1258700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116748464
21031	NC_008554	CCCGGT	2	12	1258702	1258713	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116748464
21032	NC_008554	GAC	2	6	1258719	1258724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748464
21033	NC_008554	GCCC	2	8	1258727	1258734	0 %	0 %	25 %	75 %	116748464
21034	NC_008554	GCC	4	12	1258756	1258767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748464
21035	NC_008554	CGC	2	6	1258772	1258777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748464
21036	NC_008554	CCA	2	6	1258781	1258786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116748464
21037	NC_008554	AC	3	6	1258811	1258816	50 %	0 %	0 %	50 %	116748464
21038	NC_008554	ACA	2	6	1258861	1258866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116748464
21039	NC_008554	TTC	2	6	1258894	1258899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116748464
21040	NC_008554	TAT	2	6	1259447	1259452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116748465
21041	NC_008554	T	6	6	1259513	1259518	0 %	100 %	0 %	0 %	116748465
21042	NC_008554	CGGA	2	8	1259545	1259552	25 %	0 %	50 %	25 %	116748465
21043	NC_008554	ACC	2	6	1259564	1259569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116748465
21044	NC_008554	CGCC	2	8	1259577	1259584	0 %	0 %	25 %	75 %	116748465
21045	NC_008554	CGT	2	6	1259629	1259634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748465
21046	NC_008554	C	6	6	1259660	1259665	0 %	0 %	0 %	100 %	116748465
21047	NC_008554	CCGGTG	2	12	1259669	1259680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116748465
21048	NC_008554	CGG	2	6	1259781	1259786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116748465
21049	NC_008554	AGCTC	2	10	1259799	1259808	20 %	20 %	20 %	40 %	116748465
21050	NC_008554	ACG	2	6	1259820	1259825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748465
21051	NC_008554	TGC	2	6	1259847	1259852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748465
21052	NC_008554	AGA	2	6	1259877	1259882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116748465
21053	NC_008554	GAC	2	6	1259890	1259895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748465
21054	NC_008554	CCG	2	6	1259931	1259936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748465
21055	NC_008554	CGT	2	6	1259956	1259961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748465
21056	NC_008554	GTC	2	6	1259993	1259998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748465
21057	NC_008554	AAG	2	6	1260109	1260114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116748465
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21059	NC_008554	TTG	2	6	1260817	1260822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116748466
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21062	NC_008554	CCT	2	6	1260872	1260877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116748466
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21087	NC_008554	TCG	2	6	1262458	1262463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748466
21088	NC_008554	ATC	2	6	1262497	1262502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116748466
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21095	NC_008554	CTTC	2	8	1262618	1262625	0 %	50 %	0 %	50 %	116748466
21096	NC_008554	CGA	2	6	1262630	1262635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748466
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21099	NC_008554	GTC	2	6	1262794	1262799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748466
21100	NC_008554	ACG	2	6	1263035	1263040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748467
21101	NC_008554	C	6	6	1263062	1263067	0 %	0 %	0 %	100 %	116748467
21102	NC_008554	ACC	2	6	1263107	1263112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116748467
21103	NC_008554	TCA	2	6	1263120	1263125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116748467
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21105	NC_008554	TGG	2	6	1263195	1263200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116748467
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21112	NC_008554	ATC	2	6	1263560	1263565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116748467
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21115	NC_008554	GGT	2	6	1263840	1263845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116748468
21116	NC_008554	GCA	2	6	1263898	1263903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748468
21117	NC_008554	GCG	2	6	1263913	1263918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116748468
21118	NC_008554	TCC	2	6	1264058	1264063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116748468
21119	NC_008554	ACCG	2	8	1264092	1264099	25 %	0 %	25 %	50 %	116748468
21120	NC_008554	GCC	2	6	1264133	1264138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748468
21121	NC_008554	CCG	2	6	1264143	1264148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748468
21122	NC_008554	GCC	2	6	1264151	1264156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748468
21123	NC_008554	CTC	2	6	1264420	1264425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116748468
21124	NC_008554	GAC	2	6	1264435	1264440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748468
21125	NC_008554	TCA	2	6	1264500	1264505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116748468
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21128	NC_008554	GCT	3	9	1265377	1265385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748469
21129	NC_008554	GCT	2	6	1265398	1265403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748469
21130	NC_008554	CGG	2	6	1265517	1265522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116748469
21131	NC_008554	GCGA	2	8	1265547	1265554	25 %	0 %	50 %	25 %	116748469
21132	NC_008554	CAA	2	6	1265582	1265587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116748469
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21134	NC_008554	ACC	2	6	1265816	1265821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116748469
21135	NC_008554	GC	3	6	1265920	1265925	0 %	0 %	50 %	50 %	116748469
21136	NC_008554	AAC	2	6	1265933	1265938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116748469
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21138	NC_008554	CAGTAC	2	12	1266068	1266079	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116748469
21139	NC_008554	ACC	2	6	1266098	1266103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116748469
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21141	NC_008554	GC	3	6	1266202	1266207	0 %	0 %	50 %	50 %	116748469
21142	NC_008554	CA	3	6	1266300	1266305	50 %	0 %	0 %	50 %	116748469
21143	NC_008554	GAG	2	6	1266347	1266352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116748469
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21147	NC_008554	GGT	2	6	1266598	1266603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116748469
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21150	NC_008554	CTT	2	6	1267000	1267005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116748470
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21152	NC_008554	TTC	2	6	1267054	1267059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116748470
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21154	NC_008554	GCC	2	6	1267208	1267213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748470
21155	NC_008554	GAG	2	6	1267512	1267517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116748470
21156	NC_008554	TGG	2	6	1267518	1267523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116748470
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21188	NC_008554	CTG	2	6	1270640	1270645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748472
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21221	NC_008554	TCC	2	6	1273232	1273237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116748474
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21225	NC_008554	ATC	2	6	1273306	1273311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116748474
21226	NC_008554	CGG	2	6	1273323	1273328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116748474
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21228	NC_008554	GGT	2	6	1273484	1273489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116748474
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21230	NC_008554	CGG	2	6	1273548	1273553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116748474
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21232	NC_008554	CCG	2	6	1273574	1273579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748474
21233	NC_008554	CGA	2	6	1273596	1273601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748474
21234	NC_008554	GGC	2	6	1273606	1273611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116748474
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21348	NC_008554	CGG	3	9	1279783	1279791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116748478
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21462	NC_008554	GAAAG	2	10	1286755	1286764	60 %	0 %	40 %	0 %	116748484
21463	NC_008554	GC	3	6	1286775	1286780	0 %	0 %	50 %	50 %	116748484
21464	NC_008554	TCA	2	6	1286852	1286857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116748484
21465	NC_008554	TCC	2	6	1286906	1286911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116748484
21466	NC_008554	CCA	2	6	1286999	1287004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116748484
21467	NC_008554	AGG	2	6	1287050	1287055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116748484
21468	NC_008554	TCA	2	6	1287524	1287529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116748485
21469	NC_008554	ATG	2	6	1287783	1287788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116748485
21470	NC_008554	CGC	2	6	1287794	1287799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748485
21471	NC_008554	GC	3	6	1287889	1287894	0 %	0 %	50 %	50 %	116748485
21472	NC_008554	CCG	2	6	1287906	1287911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748485
21473	NC_008554	GGC	2	6	1287923	1287928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116748485
21474	NC_008554	GCA	2	6	1287981	1287986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748485
21475	NC_008554	GTCTC	2	10	1288007	1288016	0 %	40 %	20 %	40 %	116748485
21476	NC_008554	TCG	2	6	1288017	1288022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748485
21477	NC_008554	CCGC	2	8	1288083	1288090	0 %	0 %	25 %	75 %	116748485
21478	NC_008554	TG	3	6	1288096	1288101	0 %	50 %	50 %	0 %	116748485
21479	NC_008554	CCA	2	6	1288126	1288131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116748485
21480	NC_008554	GAC	2	6	1288133	1288138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748485
21481	NC_008554	ATG	2	6	1288185	1288190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116748485
21482	NC_008554	CAG	2	6	1288321	1288326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748485
21483	NC_008554	GAA	2	6	1288329	1288334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116748485
21484	NC_008554	G	6	6	1288352	1288357	0 %	0 %	100 %	0 %	116748485
21485	NC_008554	ACG	2	6	1288360	1288365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748485
21486	NC_008554	T	7	7	1289137	1289143	0 %	100 %	0 %	0 %	116748486
21487	NC_008554	CAT	2	6	1289201	1289206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116748486
21488	NC_008554	CA	3	6	1289209	1289214	50 %	0 %	0 %	50 %	116748486
21489	NC_008554	ACC	2	6	1289229	1289234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116748486
21490	NC_008554	ACGGA	2	10	1289238	1289247	40 %	0 %	40 %	20 %	116748486
21491	NC_008554	ACG	2	6	1289290	1289295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748486
21492	NC_008554	TGGA	2	8	1289313	1289320	25 %	25 %	50 %	0 %	116748486
21493	NC_008554	GCAGGA	2	12	1289321	1289332	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116748486
21494	NC_008554	GAC	2	6	1289360	1289365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748486
21495	NC_008554	GTC	2	6	1289598	1289603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748486
21496	NC_008554	ACG	2	6	1289719	1289724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748486
21497	NC_008554	CGA	2	6	1289825	1289830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116748486
21498	NC_008554	GCC	2	6	1289871	1289876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116748486
21499	NC_008554	GAA	2	6	1289948	1289953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116748486
21500	NC_008554	GCT	2	6	1289969	1289974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116748486

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