MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008533	ACCG	2	8	187329	187336	25 %	0 %	25 %	50 %	116515524
3002	NC_008533	ATT	2	6	187483	187488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515524
3003	NC_008533	GAT	2	6	187492	187497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515524
3004	NC_008533	TCG	2	6	187529	187534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515524
3005	NC_008533	GAT	2	6	187537	187542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515524
3006	NC_008533	ATT	2	6	187750	187755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516680
3007	NC_008533	TCTT	2	8	187818	187825	0 %	75 %	0 %	25 %	116516680
3008	NC_008533	ATC	2	6	187880	187885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516680
3009	NC_008533	GTT	2	6	187939	187944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516680
3010	NC_008533	A	6	6	188009	188014	100 %	0 %	0 %	0 %	116516680
3011	NC_008533	GAA	2	6	188029	188034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516680
3012	NC_008533	AAG	2	6	188055	188060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516680
3013	NC_008533	CTA	2	6	188072	188077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516680
3014	NC_008533	AAAG	2	8	188090	188097	75 %	0 %	25 %	0 %	116516680
3015	NC_008533	TCA	2	6	188118	188123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516680
3016	NC_008533	T	6	6	188180	188185	0 %	100 %	0 %	0 %	116516680
3017	NC_008533	AGA	2	6	188218	188223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516680
3018	NC_008533	ATTT	2	8	188242	188249	25 %	75 %	0 %	0 %	116516680
3019	NC_008533	AGA	2	6	188269	188274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516680
3020	NC_008533	ATG	2	6	188349	188354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516680
3021	NC_008533	TAA	2	6	188464	188469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516680
3022	NC_008533	ATTG	2	8	188488	188495	25 %	50 %	25 %	0 %	116516680
3023	NC_008533	TGG	2	6	188518	188523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516680
3024	NC_008533	GA	3	6	188558	188563	50 %	0 %	50 %	0 %	116516680
3025	NC_008533	GAG	2	6	188655	188660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516680
3026	NC_008533	A	6	6	188771	188776	100 %	0 %	0 %	0 %	116516680
3027	NC_008533	AATC	2	8	188791	188798	50 %	25 %	0 %	25 %	116516680
3028	NC_008533	AAG	2	6	188924	188929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516680
3029	NC_008533	TTCA	2	8	188930	188937	25 %	50 %	0 %	25 %	116516680
3030	NC_008533	GAG	2	6	188949	188954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516680
3031	NC_008533	CTT	2	6	188966	188971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516680
3032	NC_008533	CTG	2	6	188973	188978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516680
3033	NC_008533	GGT	2	6	189049	189054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516680
3034	NC_008533	CAAT	2	8	189060	189067	50 %	25 %	0 %	25 %	116516680
3035	NC_008533	AT	3	6	189159	189164	50 %	50 %	0 %	0 %	116516680
3036	NC_008533	GT	3	6	189524	189529	0 %	50 %	50 %	0 %	116515592
3037	NC_008533	GTAGA	2	10	189533	189542	40 %	20 %	40 %	0 %	116515592
3038	NC_008533	CAT	2	6	189598	189603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515592
3039	NC_008533	GTC	2	6	189614	189619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515592
3040	NC_008533	AAG	2	6	189707	189712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515592
3041	NC_008533	TCA	2	6	189741	189746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515592
3042	NC_008533	TAT	2	6	189769	189774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515592
3043	NC_008533	TAT	2	6	189793	189798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515592
3044	NC_008533	AGG	2	6	189864	189869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116515592
3045	NC_008533	T	6	6	189938	189943	0 %	100 %	0 %	0 %	116515592
3046	NC_008533	TGG	2	6	189969	189974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515592
3047	NC_008533	TTTAG	2	10	190018	190027	20 %	60 %	20 %	0 %	116515592
3048	NC_008533	ATC	2	6	190116	190121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515592
3049	NC_008533	TTG	2	6	190153	190158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515592
3050	NC_008533	CTA	2	6	190251	190256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515592
3051	NC_008533	TGC	2	6	190260	190265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515592
3052	NC_008533	T	7	7	190357	190363	0 %	100 %	0 %	0 %	116515592
3053	NC_008533	TTG	2	6	190369	190374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515592
3054	NC_008533	CTTTT	2	10	190492	190501	0 %	80 %	0 %	20 %	116515592
3055	NC_008533	CTT	2	6	190520	190525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515592
3056	NC_008533	GTC	2	6	190534	190539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515592
3057	NC_008533	AGA	2	6	190603	190608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515592
3058	NC_008533	TTC	2	6	190645	190650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515592
3059	NC_008533	T	6	6	190704	190709	0 %	100 %	0 %	0 %	116515592
3060	NC_008533	CTAT	2	8	190796	190803	25 %	50 %	0 %	25 %	116515592
3061	NC_008533	GAT	2	6	190810	190815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515592
3062	NC_008533	TAA	2	6	190902	190907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515592
3063	NC_008533	GAAA	2	8	190923	190930	75 %	0 %	25 %	0 %	116515592
3064	NC_008533	AAC	2	6	190931	190936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515592
3065	NC_008533	GGT	2	6	190962	190967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515592
3066	NC_008533	GTCTG	2	10	190969	190978	0 %	40 %	40 %	20 %	116515592
3067	NC_008533	CAA	2	6	191008	191013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515592
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3069	NC_008533	A	6	6	191194	191199	100 %	0 %	0 %	0 %	116516887
3070	NC_008533	CT	3	6	191215	191220	0 %	50 %	0 %	50 %	116516887
3071	NC_008533	TCG	2	6	191221	191226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516887
3072	NC_008533	CGG	2	6	191287	191292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116516887
3073	NC_008533	CTGA	2	8	191343	191350	25 %	25 %	25 %	25 %	116516887
3074	NC_008533	ATT	2	6	191355	191360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516887
3075	NC_008533	GCTG	2	8	191453	191460	0 %	25 %	50 %	25 %	116516887
3076	NC_008533	CAA	2	6	191543	191548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516887
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3079	NC_008533	TTG	2	6	191626	191631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516887
3080	NC_008533	AATC	2	8	191635	191642	50 %	25 %	0 %	25 %	116516887
3081	NC_008533	CCA	2	6	191678	191683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116516887
3082	NC_008533	CTG	2	6	191741	191746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516887
3083	NC_008533	TGAT	2	8	191749	191756	25 %	50 %	25 %	0 %	116516887
3084	NC_008533	AG	3	6	191804	191809	50 %	0 %	50 %	0 %	116516887
3085	NC_008533	AGA	2	6	191929	191934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516887
3086	NC_008533	AGA	2	6	191960	191965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516887
3087	NC_008533	GAA	2	6	192002	192007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516887
3088	NC_008533	CT	3	6	192061	192066	0 %	50 %	0 %	50 %	116516887
3089	NC_008533	AGGA	2	8	192244	192251	50 %	0 %	50 %	0 %	116516887
3090	NC_008533	GTCTT	2	10	192315	192324	0 %	60 %	20 %	20 %	116516887
3091	NC_008533	TTG	2	6	192334	192339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516887
3092	NC_008533	GAAT	2	8	192523	192530	50 %	25 %	25 %	0 %	116516887
3093	NC_008533	AGA	2	6	192536	192541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516887
3094	NC_008533	AGA	2	6	192638	192643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516887
3095	NC_008533	TCG	2	6	192668	192673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516887
3096	NC_008533	CAT	2	6	192776	192781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516887
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3098	NC_008533	TCTA	2	8	192837	192844	25 %	50 %	0 %	25 %	116516887
3099	NC_008533	TAC	2	6	192933	192938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516887
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3102	NC_008533	GA	3	6	193191	193196	50 %	0 %	50 %	0 %	116516887
3103	NC_008533	GTT	2	6	193245	193250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516887
3104	NC_008533	AGAA	2	8	193384	193391	75 %	0 %	25 %	0 %	116516887
3105	NC_008533	GC	3	6	193426	193431	0 %	0 %	50 %	50 %	116515859
3106	NC_008533	AAGA	2	8	193478	193485	75 %	0 %	25 %	0 %	116515859
3107	NC_008533	GCTT	2	8	193488	193495	0 %	50 %	25 %	25 %	116515859
3108	NC_008533	ACAAGA	2	12	193518	193529	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116515859
3109	NC_008533	A	6	6	193529	193534	100 %	0 %	0 %	0 %	116515859
3110	NC_008533	ATG	2	6	193629	193634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517222
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3112	NC_008533	CAGGAA	2	12	193722	193733	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116517222
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3118	NC_008533	GAAT	2	8	194078	194085	50 %	25 %	25 %	0 %	116517222
3119	NC_008533	CT	4	8	194184	194191	0 %	50 %	0 %	50 %	116516445
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3121	NC_008533	AGA	2	6	194280	194285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516445
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3123	NC_008533	GAA	2	6	194443	194448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516445
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3246	NC_008533	GACAA	2	10	200616	200625	60 %	0 %	20 %	20 %	116515855
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3250	NC_008533	ATG	2	6	200704	200709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515855
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3253	NC_008533	GTT	2	6	200796	200801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515855
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3273	NC_008533	A	6	6	201573	201578	100 %	0 %	0 %	0 %	116516050
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3362	NC_008533	TCCAA	2	10	206340	206349	40 %	20 %	0 %	40 %	116516915
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3367	NC_008533	TTC	2	6	206587	206592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516915
3368	NC_008533	AGC	2	6	206622	206627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516915
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3370	NC_008533	GTG	2	6	206645	206650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516915
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3373	NC_008533	CTT	2	6	206704	206709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516915
3374	NC_008533	CGT	2	6	206710	206715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516915
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3385	NC_008533	TAC	2	6	207526	207531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515877
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3485	NC_008533	CATA	2	8	214643	214650	50 %	25 %	0 %	25 %	116516726
3486	NC_008533	AGT	2	6	214739	214744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516726
3487	NC_008533	AAAG	2	8	214755	214762	75 %	0 %	25 %	0 %	116516726
3488	NC_008533	TGCT	2	8	214803	214810	0 %	50 %	25 %	25 %	116516726
3489	NC_008533	AAGA	2	8	214854	214861	75 %	0 %	25 %	0 %	116516726
3490	NC_008533	GAA	2	6	214863	214868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516726
3491	NC_008533	AGG	2	6	214871	214876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516726
3492	NC_008533	T	6	6	214893	214898	0 %	100 %	0 %	0 %	116516726
3493	NC_008533	TTC	3	9	215005	215013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516814
3494	NC_008533	TTC	2	6	215023	215028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516814
3495	NC_008533	AAT	2	6	215067	215072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516814
3496	NC_008533	CTC	2	6	215176	215181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116516814
3497	NC_008533	ATA	2	6	215270	215275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516814
3498	NC_008533	TTG	2	6	215347	215352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516814
3499	NC_008533	CTT	3	9	215400	215408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516814
3500	NC_008533	GAG	2	6	215521	215526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516814

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