MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_008533	T	6	6	1131841	1131846	0 %	100 %	0 %	0 %	116516398
19003	NC_008533	CAAT	2	8	1131856	1131863	50 %	25 %	0 %	25 %	116516398
19004	NC_008533	TTC	2	6	1131881	1131886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19005	NC_008533	CCT	2	6	1131906	1131911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116516398
19006	NC_008533	AAG	2	6	1132020	1132025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516398
19007	NC_008533	ATA	2	6	1132059	1132064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516398
19008	NC_008533	GAC	2	6	1132111	1132116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516398
19009	NC_008533	CAG	2	6	1132117	1132122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516398
19010	NC_008533	ATCA	2	8	1132124	1132131	50 %	25 %	0 %	25 %	116516398
19011	NC_008533	GCTG	2	8	1132184	1132191	0 %	25 %	50 %	25 %	116516398
19012	NC_008533	TAC	2	6	1132214	1132219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516398
19013	NC_008533	TCG	2	6	1132232	1132237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516398
19014	NC_008533	AGCT	2	8	1132247	1132254	25 %	25 %	25 %	25 %	116516398
19015	NC_008533	CTG	2	6	1132282	1132287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516398
19016	NC_008533	CTT	2	6	1132301	1132306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19017	NC_008533	TTGT	2	8	1132313	1132320	0 %	75 %	25 %	0 %	116516398
19018	NC_008533	GTT	2	6	1132347	1132352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516398
19019	NC_008533	CAA	2	6	1132372	1132377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516398
19020	NC_008533	ATG	2	6	1132461	1132466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516398
19021	NC_008533	ACG	2	6	1132469	1132474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516398
19022	NC_008533	TCC	2	6	1132524	1132529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116516398
19023	NC_008533	CAG	2	6	1132571	1132576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516398
19024	NC_008533	TTC	2	6	1132577	1132582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19025	NC_008533	TTC	2	6	1132598	1132603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19026	NC_008533	AAG	2	6	1132626	1132631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516398
19027	NC_008533	TCT	2	6	1132701	1132706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19028	NC_008533	ATT	2	6	1132739	1132744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516398
19029	NC_008533	TTC	2	6	1132745	1132750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19030	NC_008533	CTT	2	6	1132777	1132782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19031	NC_008533	TTC	2	6	1132796	1132801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19032	NC_008533	CTT	2	6	1132804	1132809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19033	NC_008533	TTC	2	6	1132847	1132852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19034	NC_008533	CTT	2	6	1132873	1132878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19035	NC_008533	CAA	2	6	1132894	1132899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516398
19036	NC_008533	CTT	2	6	1132912	1132917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19037	NC_008533	CTT	2	6	1132987	1132992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19038	NC_008533	CTT	2	6	1132999	1133004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19039	NC_008533	TTC	2	6	1133015	1133020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516398
19040	NC_008533	T	7	7	1133021	1133027	0 %	100 %	0 %	0 %	116516398
19041	NC_008533	TTC	2	6	1133078	1133083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515438
19042	NC_008533	AG	3	6	1133201	1133206	50 %	0 %	50 %	0 %	116515438
19043	NC_008533	CAC	2	6	1133221	1133226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515438
19044	NC_008533	TCT	2	6	1133371	1133376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515438
19045	NC_008533	TGT	2	6	1133422	1133427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515438
19046	NC_008533	TTC	2	6	1133576	1133581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515438
19047	NC_008533	CAT	3	9	1133596	1133604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515438
19048	NC_008533	CCA	2	6	1133655	1133660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515438
19049	NC_008533	GAAA	2	8	1133713	1133720	75 %	0 %	25 %	0 %	116515438
19050	NC_008533	GAC	2	6	1133737	1133742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515438
19051	NC_008533	AGT	2	6	1133822	1133827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515438
19052	NC_008533	GTCCAA	2	12	1133840	1133851	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116515438
19053	NC_008533	CAAT	2	8	1133854	1133861	50 %	25 %	0 %	25 %	116515438
19054	NC_008533	ACCG	2	8	1133900	1133907	25 %	0 %	25 %	50 %	116516975
19055	NC_008533	CAT	2	6	1133995	1134000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516975
19056	NC_008533	T	6	6	1134058	1134063	0 %	100 %	0 %	0 %	116516975
19057	NC_008533	CAA	2	6	1134072	1134077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516975
19058	NC_008533	TCT	2	6	1134194	1134199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516975
19059	NC_008533	GTTG	2	8	1134205	1134212	0 %	50 %	50 %	0 %	116516975
19060	NC_008533	TCA	2	6	1134302	1134307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516975
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19062	NC_008533	TCA	2	6	1134488	1134493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516975
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19065	NC_008533	AG	3	6	1134582	1134587	50 %	0 %	50 %	0 %	116516975
19066	NC_008533	CTA	2	6	1134651	1134656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516975
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19069	NC_008533	GCAAG	2	10	1134923	1134932	40 %	0 %	40 %	20 %	116515906
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19074	NC_008533	TCTT	2	8	1135429	1135436	0 %	75 %	0 %	25 %	116515906
19075	NC_008533	TTGC	2	8	1135452	1135459	0 %	50 %	25 %	25 %	116515906
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19091	NC_008533	GCTT	2	8	1136136	1136143	0 %	50 %	25 %	25 %	116515906
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19100	NC_008533	TCT	2	6	1136548	1136553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515906
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19350	NC_008533	TCT	2	6	1151904	1151909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515556
19351	NC_008533	AAT	2	6	1151923	1151928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515556
19352	NC_008533	CAT	2	6	1151939	1151944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515556
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19381	NC_008533	AT	3	6	1154144	1154149	50 %	50 %	0 %	0 %	116516400
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