MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_008533	AGC	2	6	1050069	1050074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515652
17502	NC_008533	TTC	2	6	1050120	1050125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515652
17503	NC_008533	CTG	2	6	1050137	1050142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515652
17504	NC_008533	AGA	2	6	1050403	1050408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515652
17505	NC_008533	GAT	2	6	1050420	1050425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515652
17506	NC_008533	CAT	2	6	1050579	1050584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515652
17507	NC_008533	CCA	2	6	1050649	1050654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515652
17508	NC_008533	GAT	2	6	1050657	1050662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515652
17509	NC_008533	TCA	2	6	1050700	1050705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515652
17510	NC_008533	ACC	2	6	1050762	1050767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515652
17511	NC_008533	GAA	2	6	1050875	1050880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515652
17512	NC_008533	ACC	2	6	1050891	1050896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515652
17513	NC_008533	AAC	2	6	1050909	1050914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515652
17514	NC_008533	GCA	2	6	1050988	1050993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515652
17515	NC_008533	AAT	2	6	1051008	1051013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515652
17516	NC_008533	AGGT	2	8	1051027	1051034	25 %	25 %	50 %	0 %	116515652
17517	NC_008533	TTGG	2	8	1051036	1051043	0 %	50 %	50 %	0 %	116515652
17518	NC_008533	CCA	2	6	1051069	1051074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515652
17519	NC_008533	CAA	2	6	1051088	1051093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515652
17520	NC_008533	CCG	2	6	1051105	1051110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116515652
17521	NC_008533	CAG	2	6	1051142	1051147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515652
17522	NC_008533	CCA	2	6	1051153	1051158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515652
17523	NC_008533	CAT	2	6	1051178	1051183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515652
17524	NC_008533	CAT	2	6	1051193	1051198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515652
17525	NC_008533	TACAGG	2	12	1051215	1051226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116515652
17526	NC_008533	TGC	2	6	1051242	1051247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515652
17527	NC_008533	TTC	2	6	1051272	1051277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515652
17528	NC_008533	TCT	2	6	1051351	1051356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515652
17529	NC_008533	CTT	2	6	1051412	1051417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515652
17530	NC_008533	T	6	6	1051434	1051439	0 %	100 %	0 %	0 %	116515652
17531	NC_008533	TCAA	2	8	1051579	1051586	50 %	25 %	0 %	25 %	116515407
17532	NC_008533	GGT	2	6	1051637	1051642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515407
17533	NC_008533	GAC	2	6	1051692	1051697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515407
17534	NC_008533	GTTGG	2	10	1051740	1051749	0 %	40 %	60 %	0 %	116515407
17535	NC_008533	TAA	2	6	1051751	1051756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515407
17536	NC_008533	TCT	2	6	1051898	1051903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515407
17537	NC_008533	ACA	2	6	1051915	1051920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515407
17538	NC_008533	TCA	2	6	1051925	1051930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515407
17539	NC_008533	ATCC	2	8	1051938	1051945	25 %	25 %	0 %	50 %	116515407
17540	NC_008533	ATA	2	6	1051981	1051986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515407
17541	NC_008533	TCT	2	6	1051996	1052001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515407
17542	NC_008533	AAC	2	6	1052043	1052048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515407
17543	NC_008533	AAG	2	6	1052058	1052063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515407
17544	NC_008533	AGT	2	6	1052073	1052078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515407
17545	NC_008533	CTT	2	6	1052079	1052084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515407
17546	NC_008533	CTT	2	6	1052115	1052120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515407
17547	NC_008533	CTT	2	6	1052276	1052281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515407
17548	NC_008533	CTT	2	6	1052355	1052360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515407
17549	NC_008533	ATGTT	2	10	1052407	1052416	20 %	60 %	20 %	0 %	116515407
17550	NC_008533	TCT	2	6	1052482	1052487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515407
17551	NC_008533	CGT	2	6	1052522	1052527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515407
17552	NC_008533	ATC	2	6	1052544	1052549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515407
17553	NC_008533	TCA	2	6	1052587	1052592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515407
17554	NC_008533	TCT	2	6	1052912	1052917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516741
17555	NC_008533	TTCTGA	2	12	1052959	1052970	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116516741
17556	NC_008533	AAT	2	6	1052971	1052976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516741
17557	NC_008533	TCT	2	6	1053042	1053047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516741
17558	NC_008533	ATG	2	6	1053059	1053064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516741
17559	NC_008533	CAA	2	6	1053099	1053104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516741
17560	NC_008533	CTT	2	6	1053120	1053125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516741
17561	NC_008533	TTC	2	6	1053133	1053138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516741
17562	NC_008533	AGC	2	6	1053139	1053144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516741
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17565	NC_008533	GTT	2	6	1053304	1053309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516741
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17568	NC_008533	ACC	2	6	1053481	1053486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116516741
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17570	NC_008533	CGA	2	6	1053564	1053569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516741
17571	NC_008533	GCT	2	6	1053590	1053595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516741
17572	NC_008533	CTG	3	9	1053597	1053605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516741
17573	NC_008533	TTC	2	6	1053661	1053666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516741
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17582	NC_008533	GCG	2	6	1054199	1054204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116516204
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17584	NC_008533	AAG	2	6	1054361	1054366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516204
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17586	NC_008533	CTGA	2	8	1054399	1054406	25 %	25 %	25 %	25 %	116516204
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17592	NC_008533	TTC	2	6	1054738	1054743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516204
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17597	NC_008533	A	6	6	1055228	1055233	100 %	0 %	0 %	0 %	116517066
17598	NC_008533	AAGG	2	8	1055302	1055309	50 %	0 %	50 %	0 %	116517066
17599	NC_008533	CAT	2	6	1055370	1055375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116517066
17600	NC_008533	ATAGCC	2	12	1055411	1055422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116517066
17601	NC_008533	TCCT	2	8	1055587	1055594	0 %	50 %	0 %	50 %	116517066
17602	NC_008533	TAAA	2	8	1055658	1055665	75 %	25 %	0 %	0 %	116517066
17603	NC_008533	CAGAA	2	10	1055668	1055677	60 %	0 %	20 %	20 %	116517066
17604	NC_008533	CAAG	2	8	1055682	1055689	50 %	0 %	25 %	25 %	116517066
17605	NC_008533	ACCAGC	2	12	1055716	1055727	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116517066
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17609	NC_008533	TTG	2	6	1055961	1055966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116517066
17610	NC_008533	AAAT	3	12	1056017	1056028	75 %	25 %	0 %	0 %	116517066
17611	NC_008533	CTT	2	6	1056048	1056053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517066
17612	NC_008533	AAAG	2	8	1056124	1056131	75 %	0 %	25 %	0 %	116517066
17613	NC_008533	CAA	2	6	1056204	1056209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116517066
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17615	NC_008533	GAA	2	6	1056250	1056255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517066
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