MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_008533	TTC	2	6	844040	844045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516561
14003	NC_008533	TCA	2	6	844070	844075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516561
14004	NC_008533	GAA	2	6	844213	844218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516561
14005	NC_008533	GGCT	2	8	844220	844227	0 %	25 %	50 %	25 %	116516561
14006	NC_008533	TGC	2	6	844233	844238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516561
14007	NC_008533	TTTGGA	2	12	844263	844274	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116516561
14008	NC_008533	A	6	6	844291	844296	100 %	0 %	0 %	0 %	116516561
14009	NC_008533	TCT	2	6	844317	844322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516561
14010	NC_008533	T	6	6	844573	844578	0 %	100 %	0 %	0 %	116515715
14011	NC_008533	TCA	2	6	844684	844689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515715
14012	NC_008533	TGG	2	6	844711	844716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515715
14013	NC_008533	ATC	2	6	844761	844766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515715
14014	NC_008533	GAA	2	6	844821	844826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515715
14015	NC_008533	TCT	2	6	844849	844854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515715
14016	NC_008533	AAG	2	6	844924	844929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515715
14017	NC_008533	A	6	6	844971	844976	100 %	0 %	0 %	0 %	116515715
14018	NC_008533	CTG	2	6	845073	845078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515715
14019	NC_008533	TAG	2	6	845086	845091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515715
14020	NC_008533	A	6	6	845097	845102	100 %	0 %	0 %	0 %	116515715
14021	NC_008533	GAT	2	6	845142	845147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515715
14022	NC_008533	GTAAGA	2	12	845211	845222	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116515715
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14024	NC_008533	A	6	6	845364	845369	100 %	0 %	0 %	0 %	116516332
14025	NC_008533	ATT	2	6	845372	845377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516332
14026	NC_008533	GAT	2	6	845388	845393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516332
14027	NC_008533	ATGT	2	8	845639	845646	25 %	50 %	25 %	0 %	116516332
14028	NC_008533	A	6	6	845688	845693	100 %	0 %	0 %	0 %	116515519
14029	NC_008533	GAT	2	6	845756	845761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515519
14030	NC_008533	GATTG	2	10	845798	845807	20 %	40 %	40 %	0 %	116515519
14031	NC_008533	CTG	2	6	845808	845813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515519
14032	NC_008533	CCA	2	6	845859	845864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515519
14033	NC_008533	A	6	6	845898	845903	100 %	0 %	0 %	0 %	116515519
14034	NC_008533	TGATT	2	10	845908	845917	20 %	60 %	20 %	0 %	116515519
14035	NC_008533	GAA	2	6	846017	846022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515519
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14040	NC_008533	A	6	6	846158	846163	100 %	0 %	0 %	0 %	116515519
14041	NC_008533	T	6	6	846183	846188	0 %	100 %	0 %	0 %	116515519
14042	NC_008533	GAA	2	6	846287	846292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515519
14043	NC_008533	TTA	2	6	846317	846322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515519
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14052	NC_008533	ATA	2	6	846850	846855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116517217
14053	NC_008533	AG	3	6	846877	846882	50 %	0 %	50 %	0 %	116517217
14054	NC_008533	TGA	2	6	846884	846889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517217
14055	NC_008533	CAG	2	6	846904	846909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116517217
14056	NC_008533	GGTT	2	8	846926	846933	0 %	50 %	50 %	0 %	116517217
14057	NC_008533	GAA	2	6	846957	846962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517217
14058	NC_008533	GAAA	2	8	846966	846973	75 %	0 %	25 %	0 %	116517217
14059	NC_008533	TGAT	2	8	847120	847127	25 %	50 %	25 %	0 %	116517217
14060	NC_008533	TGAG	2	8	847132	847139	25 %	25 %	50 %	0 %	116517217
14061	NC_008533	GAA	2	6	847140	847145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517217
14062	NC_008533	TGA	2	6	847175	847180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517217
14063	NC_008533	GAA	2	6	847274	847279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116517217
14064	NC_008533	TAT	2	6	847285	847290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116517217
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14071	NC_008533	GAA	2	6	847605	847610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516415
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14079	NC_008533	AG	3	6	847906	847911	50 %	0 %	50 %	0 %	116516415
14080	NC_008533	GCT	2	6	847962	847967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516415
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14104	NC_008533	CTG	2	6	849582	849587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516642
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14113	NC_008533	AGA	2	6	849964	849969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516642
14114	NC_008533	AAAAG	2	10	849991	850000	80 %	0 %	20 %	0 %	116516642
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14482	NC_008533	GTCAAG	2	12	872202	872213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116516762
14483	NC_008533	AGA	2	6	872386	872391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515925
14484	NC_008533	GAT	2	6	872420	872425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515925
14485	NC_008533	CGT	2	6	872487	872492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515925
14486	NC_008533	T	6	6	872506	872511	0 %	100 %	0 %	0 %	116515925
14487	NC_008533	GACA	2	8	872516	872523	50 %	0 %	25 %	25 %	116515925
14488	NC_008533	TTTC	2	8	872606	872613	0 %	75 %	0 %	25 %	116515925
14489	NC_008533	TGG	2	6	872624	872629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515925
14490	NC_008533	A	6	6	872712	872717	100 %	0 %	0 %	0 %	116515925
14491	NC_008533	AGACC	2	10	872810	872819	40 %	0 %	20 %	40 %	116515925
14492	NC_008533	CAG	2	6	872905	872910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515925
14493	NC_008533	AAG	2	6	872911	872916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515925
14494	NC_008533	GACCA	2	10	872931	872940	40 %	0 %	20 %	40 %	116515925
14495	NC_008533	CCA	2	6	872977	872982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515925
14496	NC_008533	TCA	2	6	873032	873037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515925
14497	NC_008533	CAT	2	6	873080	873085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515925
14498	NC_008533	AGG	2	6	873138	873143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116515925
14499	NC_008533	ATC	2	6	873158	873163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516997
14500	NC_008533	GTC	2	6	873251	873256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516997

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