MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008532	CAAT	2	8	277628	277635	50 %	25 %	0 %	25 %	116627203
4002	NC_008532	GTTTA	2	10	277671	277680	20 %	60 %	20 %	0 %	116627203
4003	NC_008532	CAG	2	6	277703	277708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627203
4004	NC_008532	TGG	2	6	277734	277739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627203
4005	NC_008532	TGGTA	2	10	277747	277756	20 %	40 %	40 %	0 %	116627203
4006	NC_008532	AAG	2	6	277813	277818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627203
4007	NC_008532	A	6	6	277961	277966	100 %	0 %	0 %	0 %	116627204
4008	NC_008532	TGA	2	6	277967	277972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627204
4009	NC_008532	ACG	2	6	277998	278003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627204
4010	NC_008532	ATC	2	6	278027	278032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627204
4011	NC_008532	GATG	2	8	278103	278110	25 %	25 %	50 %	0 %	116627204
4012	NC_008532	GGT	2	6	278298	278303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627205
4013	NC_008532	TGC	2	6	278345	278350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627205
4014	NC_008532	CAG	2	6	278443	278448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627205
4015	NC_008532	CGT	2	6	278514	278519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627205
4016	NC_008532	GTT	2	6	278781	278786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627206
4017	NC_008532	ATT	2	6	278793	278798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627206
4018	NC_008532	CAT	2	6	278810	278815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627206
4019	NC_008532	TAT	2	6	278828	278833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627206
4020	NC_008532	TTG	2	6	278866	278871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627206
4021	NC_008532	GGT	2	6	278883	278888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627206
4022	NC_008532	TGT	2	6	278918	278923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627206
4023	NC_008532	TGC	2	6	278945	278950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627206
4024	NC_008532	CTG	2	6	278968	278973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627206
4025	NC_008532	CTG	2	6	279004	279009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627206
4026	NC_008532	TGG	3	9	279053	279061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627206
4027	NC_008532	GTA	2	6	279079	279084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627206
4028	NC_008532	CAA	2	6	279088	279093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627206
4029	NC_008532	TGA	2	6	279140	279145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627206
4030	NC_008532	GCA	2	6	279225	279230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627206
4031	NC_008532	AC	3	6	279240	279245	50 %	0 %	0 %	50 %	116627206
4032	NC_008532	TGG	3	9	279416	279424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627206
4033	NC_008532	CAT	2	6	279472	279477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627206
4034	NC_008532	TAC	2	6	279500	279505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627206
4035	NC_008532	GTT	2	6	279521	279526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627206
4036	NC_008532	ATGGTT	2	12	279531	279542	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116627206
4037	NC_008532	CAC	2	6	279546	279551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627206
4038	NC_008532	AGA	2	6	279569	279574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627206
4039	NC_008532	AAAC	2	8	279603	279610	75 %	0 %	0 %	25 %	116627206
4040	NC_008532	AGA	2	6	279620	279625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627206
4041	NC_008532	TTC	2	6	279628	279633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627206
4042	NC_008532	AGT	2	6	279695	279700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627206
4043	NC_008532	GTT	2	6	279706	279711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627206
4044	NC_008532	ATA	2	6	279775	279780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627206
4045	NC_008532	GGT	2	6	279936	279941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627206
4046	NC_008532	TC	3	6	280063	280068	0 %	50 %	0 %	50 %	116627206
4047	NC_008532	AGA	2	6	280094	280099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627206
4048	NC_008532	TTC	2	6	280120	280125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627206
4049	NC_008532	TGA	3	9	280226	280234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627206
4050	NC_008532	CAT	2	6	280264	280269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627206
4051	NC_008532	A	7	7	280529	280535	100 %	0 %	0 %	0 %	116627207
4052	NC_008532	GAAT	2	8	280561	280568	50 %	25 %	25 %	0 %	116627207
4053	NC_008532	T	6	6	280616	280621	0 %	100 %	0 %	0 %	116627207
4054	NC_008532	GAT	2	6	280625	280630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627207
4055	NC_008532	ATTT	2	8	280763	280770	25 %	75 %	0 %	0 %	116627207
4056	NC_008532	GAA	2	6	280829	280834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627207
4057	NC_008532	GAT	2	6	281016	281021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627208
4058	NC_008532	AAG	2	6	281041	281046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627208
4059	NC_008532	CAGT	2	8	281057	281064	25 %	25 %	25 %	25 %	116627208
4060	NC_008532	ATG	2	6	281101	281106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627208
4061	NC_008532	TAT	2	6	281139	281144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627208
4062	NC_008532	CGA	2	6	281386	281391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627208
4063	NC_008532	A	6	6	281473	281478	100 %	0 %	0 %	0 %	116627208
4064	NC_008532	ATT	2	6	281639	281644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627209
4065	NC_008532	TGG	2	6	281650	281655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627209
4066	NC_008532	ACG	2	6	281698	281703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627209
4067	NC_008532	TTA	2	6	281727	281732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627209
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4069	NC_008532	TGG	2	6	281818	281823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627209
4070	NC_008532	GTG	2	6	281928	281933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627209
4071	NC_008532	TAT	2	6	281986	281991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627209
4072	NC_008532	A	6	6	282009	282014	100 %	0 %	0 %	0 %	116627209
4073	NC_008532	GAT	2	6	282037	282042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627209
4074	NC_008532	AAT	2	6	282167	282172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627209
4075	NC_008532	AGA	2	6	282193	282198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627209
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4079	NC_008532	TAA	2	6	282437	282442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627210
4080	NC_008532	ACCT	2	8	282473	282480	25 %	25 %	0 %	50 %	116627210
4081	NC_008532	ACA	2	6	282512	282517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627210
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4085	NC_008532	ATT	2	6	282700	282705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627210
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4087	NC_008532	CTG	2	6	282970	282975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627210
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4089	NC_008532	CAT	2	6	282989	282994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627210
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4091	NC_008532	GAG	2	6	283067	283072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627210
4092	NC_008532	A	6	6	283075	283080	100 %	0 %	0 %	0 %	116627210
4093	NC_008532	A	7	7	283194	283200	100 %	0 %	0 %	0 %	116627211
4094	NC_008532	TCCT	2	8	283233	283240	0 %	50 %	0 %	50 %	116627211
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4103	NC_008532	TTCA	2	8	283919	283926	25 %	50 %	0 %	25 %	116627211
4104	NC_008532	TGC	2	6	283988	283993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627211
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4109	NC_008532	T	6	6	284308	284313	0 %	100 %	0 %	0 %	116627212
4110	NC_008532	A	7	7	284342	284348	100 %	0 %	0 %	0 %	116627212
4111	NC_008532	GTT	2	6	284356	284361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627212
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4113	NC_008532	CTTT	2	8	284419	284426	0 %	75 %	0 %	25 %	116627212
4114	NC_008532	TTA	2	6	284458	284463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627212
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4116	NC_008532	GGC	2	6	284621	284626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116627212
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4119	NC_008532	CTGG	2	8	284773	284780	0 %	25 %	50 %	25 %	116627212
4120	NC_008532	TAG	2	6	284793	284798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627212
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4122	NC_008532	A	7	7	284872	284878	100 %	0 %	0 %	0 %	116627213
4123	NC_008532	TTA	2	6	284970	284975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627213
4124	NC_008532	GAA	2	6	284991	284996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627213
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4167	NC_008532	GTT	2	6	286942	286947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627216
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4245	NC_008532	GAG	2	6	289923	289928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627217
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4490	NC_008532	GAA	2	6	305549	305554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627229
4491	NC_008532	GTT	2	6	305591	305596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627229
4492	NC_008532	CAG	3	9	305604	305612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627229
4493	NC_008532	TTC	2	6	305766	305771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627229
4494	NC_008532	TCG	3	9	305782	305790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627229
4495	NC_008532	GCA	2	6	305807	305812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627229
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4500	NC_008532	AAT	2	6	306225	306230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627230

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