MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008532	TGG	2	6	210936	210941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162139703
3002	NC_008532	AGA	2	6	211053	211058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139703
3003	NC_008532	GAA	2	6	211066	211071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139703
3004	NC_008532	GAAT	2	8	211077	211084	50 %	25 %	25 %	0 %	162139703
3005	NC_008532	TGGT	2	8	211093	211100	0 %	50 %	50 %	0 %	162139703
3006	NC_008532	CAA	2	6	211163	211168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162139703
3007	NC_008532	AC	3	6	211175	211180	50 %	0 %	0 %	50 %	162139703
3008	NC_008532	AAG	3	9	211202	211210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139703
3009	NC_008532	GCT	2	6	211255	211260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139703
3010	NC_008532	AGA	2	6	211275	211280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139703
3011	NC_008532	CTG	2	6	211307	211312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139703
3012	NC_008532	AGT	2	6	211323	211328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139703
3013	NC_008532	CTT	2	6	211333	211338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162139703
3014	NC_008532	AGA	2	6	211410	211415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139703
3015	NC_008532	TGT	2	6	211524	211529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162139703
3016	NC_008532	AAG	2	6	211616	211621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139703
3017	NC_008532	CAA	2	6	211836	211841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162139703
3018	NC_008532	ATG	2	6	211904	211909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162139703
3019	NC_008532	GCT	2	6	211972	211977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139703
3020	NC_008532	TTGA	2	8	212161	212168	25 %	50 %	25 %	0 %	162139703
3021	NC_008532	AAC	2	6	212184	212189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162139703
3022	NC_008532	TTA	2	6	212394	212399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627141
3023	NC_008532	GAA	2	6	212824	212829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627142
3024	NC_008532	ATG	2	6	212843	212848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627142
3025	NC_008532	TCCT	2	8	212938	212945	0 %	50 %	0 %	50 %	116627142
3026	NC_008532	GAA	2	6	212972	212977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627142
3027	NC_008532	ATG	2	6	213087	213092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627142
3028	NC_008532	CAG	2	6	213114	213119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627142
3029	NC_008532	TGG	2	6	213217	213222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627142
3030	NC_008532	TTG	2	6	213272	213277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627142
3031	NC_008532	A	6	6	213299	213304	100 %	0 %	0 %	0 %	116627142
3032	NC_008532	GAA	2	6	213353	213358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627142
3033	NC_008532	TTA	2	6	213396	213401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627142
3034	NC_008532	TCA	2	6	213410	213415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627142
3035	NC_008532	TGA	2	6	213447	213452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627142
3036	NC_008532	TGT	2	6	213544	213549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627142
3037	NC_008532	GTC	2	6	213618	213623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627142
3038	NC_008532	TGT	2	6	213703	213708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627142
3039	NC_008532	TGA	2	6	213760	213765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627142
3040	NC_008532	A	6	6	213806	213811	100 %	0 %	0 %	0 %	116627142
3041	NC_008532	TGC	2	6	213988	213993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627142
3042	NC_008532	GGT	2	6	214046	214051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627142
3043	NC_008532	ATT	2	6	214130	214135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627142
3044	NC_008532	TC	3	6	214188	214193	0 %	50 %	0 %	50 %	116627142
3045	NC_008532	ATA	2	6	214203	214208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627142
3046	NC_008532	GTG	2	6	214251	214256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627142
3047	NC_008532	GTTG	2	8	214300	214307	0 %	50 %	50 %	0 %	116627142
3048	NC_008532	AAT	2	6	214463	214468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627142
3049	NC_008532	GGTACA	2	12	214490	214501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116627142
3050	NC_008532	TGGCT	2	10	214510	214519	0 %	40 %	40 %	20 %	116627142
3051	NC_008532	ATC	2	6	214523	214528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627142
3052	NC_008532	CTTG	2	8	214672	214679	0 %	50 %	25 %	25 %	116627143
3053	NC_008532	ATC	2	6	214682	214687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627143
3054	NC_008532	AATC	2	8	214720	214727	50 %	25 %	0 %	25 %	116627143
3055	NC_008532	AGG	2	6	214747	214752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627143
3056	NC_008532	AGT	2	6	214758	214763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627143
3057	NC_008532	ACA	2	6	214779	214784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627144
3058	NC_008532	TGA	2	6	214910	214915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627144
3059	NC_008532	TGA	2	6	214941	214946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627144
3060	NC_008532	TTG	2	6	214957	214962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627144
3061	NC_008532	GAA	2	6	215065	215070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627144
3062	NC_008532	TCG	2	6	215088	215093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627144
3063	NC_008532	CTT	2	6	215109	215114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627144
3064	NC_008532	TCTTGG	2	12	215169	215180	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116627144
3065	NC_008532	TGC	2	6	215279	215284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627144
3066	NC_008532	CAG	2	6	215297	215302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627144
3067	NC_008532	TTG	2	6	215351	215356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627144
3068	NC_008532	TCG	2	6	215450	215455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627144
3069	NC_008532	A	7	7	215471	215477	100 %	0 %	0 %	0 %	116627144
3070	NC_008532	ATC	2	6	215762	215767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627145
3071	NC_008532	GAA	2	6	215777	215782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627145
3072	NC_008532	AGA	2	6	215785	215790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627145
3073	NC_008532	A	6	6	215790	215795	100 %	0 %	0 %	0 %	116627145
3074	NC_008532	AAC	2	6	215833	215838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627145
3075	NC_008532	ATTG	2	8	215893	215900	25 %	50 %	25 %	0 %	116627145
3076	NC_008532	TTG	2	6	215931	215936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627145
3077	NC_008532	TCA	2	6	216092	216097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627146
3078	NC_008532	GCA	2	6	216107	216112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627146
3079	NC_008532	GTG	2	6	216120	216125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627146
3080	NC_008532	TGT	2	6	216178	216183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627146
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3082	NC_008532	ATG	2	6	216219	216224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627146
3083	NC_008532	AAC	2	6	216331	216336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627146
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3085	NC_008532	CGT	2	6	216416	216421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627146
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3087	NC_008532	TAA	2	6	216484	216489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627146
3088	NC_008532	TGC	2	6	216508	216513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627146
3089	NC_008532	ATG	2	6	216576	216581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627146
3090	NC_008532	A	6	6	216690	216695	100 %	0 %	0 %	0 %	116627146
3091	NC_008532	AT	3	6	216718	216723	50 %	50 %	0 %	0 %	116627146
3092	NC_008532	TGAC	2	8	216729	216736	25 %	25 %	25 %	25 %	116627146
3093	NC_008532	TTC	2	6	216762	216767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627146
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3095	NC_008532	GTC	2	6	216795	216800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627146
3096	NC_008532	ATT	2	6	216809	216814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627146
3097	NC_008532	GAC	2	6	216818	216823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627146
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3099	NC_008532	TTA	2	6	216963	216968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627146
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3101	NC_008532	GGT	2	6	217184	217189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627146
3102	NC_008532	TTA	2	6	217197	217202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627146
3103	NC_008532	GAA	2	6	217286	217291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627146
3104	NC_008532	TAG	2	6	217296	217301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627146
3105	NC_008532	TGG	3	9	217303	217311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627146
3106	NC_008532	TCC	2	6	217389	217394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627146
3107	NC_008532	GAA	2	6	217403	217408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627146
3108	NC_008532	GAA	2	6	217468	217473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627146
3109	NC_008532	TGC	2	6	217579	217584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627146
3110	NC_008532	ACA	2	6	217607	217612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627146
3111	NC_008532	CAG	2	6	217650	217655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627146
3112	NC_008532	ATG	2	6	217676	217681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627146
3113	NC_008532	AAAG	2	8	219141	219148	75 %	0 %	25 %	0 %	116627147
3114	NC_008532	TTTCT	2	10	219157	219166	0 %	80 %	0 %	20 %	116627147
3115	NC_008532	AAT	2	6	219196	219201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627147
3116	NC_008532	TGGTA	2	10	219310	219319	20 %	40 %	40 %	0 %	116627147
3117	NC_008532	ATG	2	6	219332	219337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627147
3118	NC_008532	GTTT	2	8	219340	219347	0 %	75 %	25 %	0 %	116627147
3119	NC_008532	TTTCT	2	10	219352	219361	0 %	80 %	0 %	20 %	116627147
3120	NC_008532	CTT	2	6	219364	219369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627147
3121	NC_008532	AAG	2	6	219382	219387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627147
3122	NC_008532	TGTT	2	8	219391	219398	0 %	75 %	25 %	0 %	116627147
3123	NC_008532	GCT	2	6	219750	219755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627148
3124	NC_008532	A	6	6	219801	219806	100 %	0 %	0 %	0 %	116627148
3125	NC_008532	CAATC	2	10	219808	219817	40 %	20 %	0 %	40 %	116627148
3126	NC_008532	TTG	2	6	219818	219823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627148
3127	NC_008532	ATG	2	6	220281	220286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627149
3128	NC_008532	ACC	2	6	220319	220324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627149
3129	NC_008532	ACC	2	6	220391	220396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627149
3130	NC_008532	CAT	2	6	220415	220420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627149
3131	NC_008532	GTGA	2	8	220819	220826	25 %	25 %	50 %	0 %	116627150
3132	NC_008532	GAT	2	6	220859	220864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627150
3133	NC_008532	TGA	2	6	220868	220873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627150
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3135	NC_008532	ATC	2	6	221141	221146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627150
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3139	NC_008532	GAT	2	6	221341	221346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627150
3140	NC_008532	AG	3	6	221361	221366	50 %	0 %	50 %	0 %	116627150
3141	NC_008532	TTA	2	6	221402	221407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627150
3142	NC_008532	CTT	2	6	221448	221453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627150
3143	NC_008532	T	6	6	221500	221505	0 %	100 %	0 %	0 %	116627150
3144	NC_008532	GAG	2	6	221539	221544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627150
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3149	NC_008532	AAG	2	6	221802	221807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627151
3150	NC_008532	TGA	2	6	221810	221815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627151
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3152	NC_008532	TCT	2	6	222058	222063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627151
3153	NC_008532	GAC	2	6	222074	222079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627151
3154	NC_008532	CTA	2	6	222112	222117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627151
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3157	NC_008532	TCC	2	6	222277	222282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627151
3158	NC_008532	TGG	3	9	222308	222316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627151
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3160	NC_008532	ACAG	2	8	222365	222372	50 %	0 %	25 %	25 %	116627151
3161	NC_008532	TTCT	3	12	222393	222404	0 %	75 %	0 %	25 %	116627151
3162	NC_008532	AGCA	2	8	222426	222433	50 %	0 %	25 %	25 %	116627151
3163	NC_008532	AAT	2	6	222456	222461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627151
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3165	NC_008532	TGC	2	6	222524	222529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627151
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3168	NC_008532	GAT	2	6	222654	222659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627151
3169	NC_008532	GCTGAT	2	12	222675	222686	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116627151
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3174	NC_008532	GATG	2	8	222854	222861	25 %	25 %	50 %	0 %	116627151
3175	NC_008532	GCA	2	6	222881	222886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627151
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3180	NC_008532	TGG	2	6	223184	223189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627151
3181	NC_008532	TGA	2	6	223199	223204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627151
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3194	NC_008532	A	6	6	224064	224069	100 %	0 %	0 %	0 %	116627152
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3228	NC_008532	ATGGG	2	10	227844	227853	20 %	20 %	60 %	0 %	116627157
3229	NC_008532	CAACA	2	10	227990	227999	60 %	0 %	0 %	40 %	116627157
3230	NC_008532	ACT	2	6	228007	228012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627157
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3233	NC_008532	GTG	2	6	228151	228156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627157
3234	NC_008532	GCAAC	2	10	228272	228281	40 %	0 %	20 %	40 %	116627157
3235	NC_008532	TAG	2	6	228415	228420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627157
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3237	NC_008532	GCTA	2	8	228603	228610	25 %	25 %	25 %	25 %	116627157
3238	NC_008532	GAA	2	6	228717	228722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627157
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3241	NC_008532	AGA	2	6	228782	228787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627157
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3243	NC_008532	A	6	6	228838	228843	100 %	0 %	0 %	0 %	116627157
3244	NC_008532	CCAATC	2	12	228897	228908	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116627157
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3343	NC_008532	TGGTT	2	10	236129	236138	0 %	60 %	40 %	0 %	116627164
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3345	NC_008532	CCATG	2	10	236272	236281	20 %	20 %	20 %	40 %	116627164
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3353	NC_008532	TGA	3	9	236808	236816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627165
3354	NC_008532	TTGACG	2	12	236849	236860	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116627165
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3357	NC_008532	AACG	2	8	237066	237073	50 %	0 %	25 %	25 %	116627165
3358	NC_008532	CTTT	2	8	237109	237116	0 %	75 %	0 %	25 %	116627165
3359	NC_008532	ACC	2	6	237207	237212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627165
3360	NC_008532	TCA	2	6	237239	237244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627165
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3362	NC_008532	AGTA	2	8	237344	237351	50 %	25 %	25 %	0 %	116627165
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3485	NC_008532	CAT	2	6	244372	244377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627171
3486	NC_008532	GAT	2	6	244393	244398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627171
3487	NC_008532	TG	3	6	244409	244414	0 %	50 %	50 %	0 %	116627171
3488	NC_008532	T	6	6	244422	244427	0 %	100 %	0 %	0 %	116627171
3489	NC_008532	TAT	2	6	244468	244473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627171
3490	NC_008532	A	6	6	244476	244481	100 %	0 %	0 %	0 %	116627171
3491	NC_008532	AGG	2	6	244487	244492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627171
3492	NC_008532	TGG	2	6	244563	244568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627171
3493	NC_008532	AG	3	6	244578	244583	50 %	0 %	50 %	0 %	116627171
3494	NC_008532	GAT	2	6	244600	244605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627171
3495	NC_008532	TGG	2	6	244663	244668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627171
3496	NC_008532	GTTTAC	2	12	244670	244681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116627171
3497	NC_008532	GTT	2	6	244708	244713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627171
3498	NC_008532	TAT	2	6	244756	244761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627171
3499	NC_008532	GAT	2	6	244845	244850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627171
3500	NC_008532	AAT	2	6	244891	244896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627171

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