MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_008532	TTC	2	6	1629538	1629543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628459
25003	NC_008532	AC	3	6	1629677	1629682	50 %	0 %	0 %	50 %	116628459
25004	NC_008532	ATC	2	6	1629756	1629761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628459
25005	NC_008532	AAG	2	6	1629817	1629822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628459
25006	NC_008532	GAA	2	6	1629828	1629833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628459
25007	NC_008532	ACT	2	6	1629898	1629903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628459
25008	NC_008532	CAA	2	6	1629906	1629911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628459
25009	NC_008532	ACT	2	6	1629957	1629962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628459
25010	NC_008532	ATTTT	2	10	1630197	1630206	20 %	80 %	0 %	0 %	116628460
25011	NC_008532	CAT	2	6	1630224	1630229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628460
25012	NC_008532	T	7	7	1630248	1630254	0 %	100 %	0 %	0 %	116628460
25013	NC_008532	TGA	2	6	1630275	1630280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628460
25014	NC_008532	AAC	2	6	1630397	1630402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628460
25015	NC_008532	CCTT	2	8	1630604	1630611	0 %	50 %	0 %	50 %	116628460
25016	NC_008532	GAA	2	6	1630714	1630719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628460
25017	NC_008532	GCC	2	6	1630846	1630851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628460
25018	NC_008532	GAA	2	6	1630882	1630887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628460
25019	NC_008532	CTTG	2	8	1630914	1630921	0 %	50 %	25 %	25 %	116628460
25020	NC_008532	ATA	2	6	1631045	1631050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628460
25021	NC_008532	CAAG	2	8	1631137	1631144	50 %	0 %	25 %	25 %	116628460
25022	NC_008532	ATT	2	6	1631203	1631208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628460
25023	NC_008532	GGT	2	6	1631242	1631247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628460
25024	NC_008532	TTA	2	6	1631270	1631275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628460
25025	NC_008532	ATT	2	6	1631281	1631286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628460
25026	NC_008532	ATT	2	6	1631338	1631343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628460
25027	NC_008532	AGC	2	6	1631346	1631351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628460
25028	NC_008532	ACGGG	2	10	1631356	1631365	20 %	0 %	60 %	20 %	116628460
25029	NC_008532	TCG	2	6	1631370	1631375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628460
25030	NC_008532	GAAC	2	8	1631379	1631386	50 %	0 %	25 %	25 %	116628460
25031	NC_008532	ATC	2	6	1631485	1631490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628460
25032	NC_008532	TTGG	2	8	1631514	1631521	0 %	50 %	50 %	0 %	116628460
25033	NC_008532	TAC	2	6	1631550	1631555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628460
25034	NC_008532	TGA	2	6	1631634	1631639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628460
25035	NC_008532	TAGC	2	8	1631702	1631709	25 %	25 %	25 %	25 %	116628460
25036	NC_008532	A	6	6	1631749	1631754	100 %	0 %	0 %	0 %	116628460
25037	NC_008532	CTG	2	6	1631819	1631824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628460
25038	NC_008532	GCT	2	6	1631842	1631847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628460
25039	NC_008532	CAA	2	6	1631895	1631900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628460
25040	NC_008532	CAAT	2	8	1631946	1631953	50 %	25 %	0 %	25 %	116628460
25041	NC_008532	TTC	2	6	1631971	1631976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628460
25042	NC_008532	TATC	2	8	1632126	1632133	25 %	50 %	0 %	25 %	116628460
25043	NC_008532	TACC	2	8	1632360	1632367	25 %	25 %	0 %	50 %	116628460
25044	NC_008532	TCAA	2	8	1632452	1632459	50 %	25 %	0 %	25 %	116628460
25045	NC_008532	ATCC	2	8	1632524	1632531	25 %	25 %	0 %	50 %	116628460
25046	NC_008532	TTA	2	6	1632539	1632544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628460
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25048	NC_008532	GAA	2	6	1632616	1632621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628460
25049	NC_008532	T	6	6	1632676	1632681	0 %	100 %	0 %	0 %	116628460
25050	NC_008532	AAC	3	9	1632682	1632690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628460
25051	NC_008532	TCCA	2	8	1632857	1632864	25 %	25 %	0 %	50 %	116628461
25052	NC_008532	GA	3	6	1632908	1632913	50 %	0 %	50 %	0 %	116628461
25053	NC_008532	GGTA	2	8	1632938	1632945	25 %	25 %	50 %	0 %	116628461
25054	NC_008532	AAC	2	6	1632958	1632963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628461
25055	NC_008532	GGA	2	6	1633002	1633007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628461
25056	NC_008532	CA	3	6	1633075	1633080	50 %	0 %	0 %	50 %	116628462
25057	NC_008532	TAC	2	6	1633082	1633087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628462
25058	NC_008532	ATG	2	6	1633143	1633148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628462
25059	NC_008532	ACT	2	6	1633232	1633237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628462
25060	NC_008532	CCAAA	2	10	1633273	1633282	60 %	0 %	0 %	40 %	116628462
25061	NC_008532	CAAC	2	8	1633317	1633324	50 %	0 %	0 %	50 %	116628462
25062	NC_008532	GAC	2	6	1633329	1633334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628462
25063	NC_008532	CCAAA	2	10	1633340	1633349	60 %	0 %	0 %	40 %	116628462
25064	NC_008532	ATT	2	6	1633361	1633366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628462
25065	NC_008532	ATG	2	6	1633397	1633402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628462
25066	NC_008532	TAA	2	6	1633415	1633420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628462
25067	NC_008532	GTT	2	6	1633494	1633499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628462
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25069	NC_008532	CA	3	6	1633588	1633593	50 %	0 %	0 %	50 %	116628462
25070	NC_008532	GAGCC	2	10	1633603	1633612	20 %	0 %	40 %	40 %	116628462
25071	NC_008532	CA	3	6	1633627	1633632	50 %	0 %	0 %	50 %	116628462
25072	NC_008532	CGAA	2	8	1633739	1633746	50 %	0 %	25 %	25 %	116628462
25073	NC_008532	AC	3	6	1633753	1633758	50 %	0 %	0 %	50 %	116628462
25074	NC_008532	TTC	2	6	1633811	1633816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628463
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25076	NC_008532	GCT	3	9	1633890	1633898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628463
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25078	NC_008532	TTC	2	6	1633967	1633972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628463
25079	NC_008532	CAA	3	9	1634017	1634025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628463
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25081	NC_008532	GGAA	2	8	1634095	1634102	50 %	0 %	50 %	0 %	116628463
25082	NC_008532	TCT	2	6	1634112	1634117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628463
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25085	NC_008532	TCA	2	6	1634262	1634267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628463
25086	NC_008532	TC	3	6	1634269	1634274	0 %	50 %	0 %	50 %	116628463
25087	NC_008532	CTG	2	6	1634278	1634283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628463
25088	NC_008532	CAA	2	6	1634353	1634358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628463
25089	NC_008532	TG	3	6	1634396	1634401	0 %	50 %	50 %	0 %	116628463
25090	NC_008532	AGG	2	6	1634424	1634429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628463
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25093	NC_008532	CCAA	2	8	1634541	1634548	50 %	0 %	0 %	50 %	116628463
25094	NC_008532	CCAA	2	8	1634556	1634563	50 %	0 %	0 %	50 %	116628463
25095	NC_008532	TACAGC	2	12	1634579	1634590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116628463
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25099	NC_008532	CCA	2	6	1634691	1634696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628463
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25101	NC_008532	T	6	6	1634754	1634759	0 %	100 %	0 %	0 %	116628463
25102	NC_008532	AT	3	6	1634805	1634810	50 %	50 %	0 %	0 %	116628463
25103	NC_008532	TCC	2	6	1634852	1634857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628464
25104	NC_008532	ATA	2	6	1634869	1634874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628464
25105	NC_008532	AAGA	2	8	1634953	1634960	75 %	0 %	25 %	0 %	116628464
25106	NC_008532	CTC	2	6	1634974	1634979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628464
25107	NC_008532	TCA	2	6	1634988	1634993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628464
25108	NC_008532	ACTG	2	8	1634994	1635001	25 %	25 %	25 %	25 %	116628464
25109	NC_008532	A	6	6	1635080	1635085	100 %	0 %	0 %	0 %	116628464
25110	NC_008532	CAA	2	6	1635087	1635092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628464
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25113	NC_008532	ACC	2	6	1635149	1635154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628464
25114	NC_008532	TGAGC	2	10	1635207	1635216	20 %	20 %	40 %	20 %	116628464
25115	NC_008532	ACT	2	6	1635226	1635231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628464
25116	NC_008532	TCC	2	6	1635294	1635299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628465
25117	NC_008532	AGG	2	6	1635347	1635352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628465
25118	NC_008532	GCA	2	6	1635513	1635518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628465
25119	NC_008532	GAT	2	6	1635530	1635535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628465
25120	NC_008532	ATT	2	6	1635569	1635574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628465
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25125	NC_008532	TCACTG	2	12	1635829	1635840	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116628465
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25139	NC_008532	CTTGCT	2	12	1636724	1636735	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116628467
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25144	NC_008532	TTGT	2	8	1636905	1636912	0 %	75 %	25 %	0 %	116628467
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25151	NC_008532	CAA	2	6	1637144	1637149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628467
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25153	NC_008532	GCT	2	6	1637159	1637164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628467
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25220	NC_008532	CAC	3	9	1642632	1642640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628471
25221	NC_008532	GAT	2	6	1642642	1642647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628471
25222	NC_008532	GTT	2	6	1642662	1642667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628471
25223	NC_008532	TCCAT	2	10	1642735	1642744	20 %	40 %	0 %	40 %	116628471
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25230	NC_008532	ACC	2	6	1643092	1643097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628471
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25232	NC_008532	AAG	2	6	1643164	1643169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628471
25233	NC_008532	TTCT	2	8	1643314	1643321	0 %	75 %	0 %	25 %	116628471
25234	NC_008532	GCT	2	6	1643390	1643395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628471
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25463	NC_008532	CTTT	2	8	1656081	1656088	0 %	75 %	0 %	25 %	116628486
25464	NC_008532	T	7	7	1656095	1656101	0 %	100 %	0 %	0 %	116628486
25465	NC_008532	AT	3	6	1656102	1656107	50 %	50 %	0 %	0 %	116628486
25466	NC_008532	AAG	2	6	1656203	1656208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628486
25467	NC_008532	GGAAC	2	10	1656228	1656237	40 %	0 %	40 %	20 %	116628486
25468	NC_008532	TCT	2	6	1656286	1656291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628486
25469	NC_008532	GT	3	6	1656329	1656334	0 %	50 %	50 %	0 %	116628486
25470	NC_008532	CCA	2	6	1656346	1656351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628486
25471	NC_008532	CAT	2	6	1656356	1656361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628486
25472	NC_008532	TTG	2	6	1656377	1656382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628486
25473	NC_008532	TG	3	6	1656381	1656386	0 %	50 %	50 %	0 %	116628486
25474	NC_008532	ACGACC	2	12	1656387	1656398	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116628486
25475	NC_008532	AG	3	6	1656512	1656517	50 %	0 %	50 %	0 %	116628486
25476	NC_008532	TTC	2	6	1656525	1656530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628486
25477	NC_008532	ATC	2	6	1656594	1656599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628486
25478	NC_008532	TAA	2	6	1656654	1656659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628486
25479	NC_008532	A	6	6	1656664	1656669	100 %	0 %	0 %	0 %	116628486
25480	NC_008532	ATA	2	6	1656712	1656717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628486
25481	NC_008532	CAA	2	6	1656821	1656826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628486
25482	NC_008532	T	7	7	1656852	1656858	0 %	100 %	0 %	0 %	116628486
25483	NC_008532	ACA	2	6	1656889	1656894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628486
25484	NC_008532	CAT	2	6	1656896	1656901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628486
25485	NC_008532	ATA	2	6	1656909	1656914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628486
25486	NC_008532	TTC	2	6	1656938	1656943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628486
25487	NC_008532	TC	3	6	1657221	1657226	0 %	50 %	0 %	50 %	116628487
25488	NC_008532	GA	3	6	1657236	1657241	50 %	0 %	50 %	0 %	116628487
25489	NC_008532	CTT	2	6	1657330	1657335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628487
25490	NC_008532	ATT	2	6	1657361	1657366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628487
25491	NC_008532	CGA	2	6	1657380	1657385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628487
25492	NC_008532	A	6	6	1657389	1657394	100 %	0 %	0 %	0 %	116628487
25493	NC_008532	ATA	2	6	1657544	1657549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628487
25494	NC_008532	CAG	2	6	1657594	1657599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628487
25495	NC_008532	CTT	2	6	1657615	1657620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628487
25496	NC_008532	CAT	2	6	1657625	1657630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628487
25497	NC_008532	AAC	2	6	1657631	1657636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628487
25498	NC_008532	TCAA	2	8	1657662	1657669	50 %	25 %	0 %	25 %	116628487
25499	NC_008532	TCA	2	6	1657848	1657853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628487
25500	NC_008532	TTA	2	6	1657944	1657949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628487

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