MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_008532	AGA	2	6	1565813	1565818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628399
24002	NC_008532	GA	3	6	1565853	1565858	50 %	0 %	50 %	0 %	116628399
24003	NC_008532	GAA	2	6	1565861	1565866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628399
24004	NC_008532	GTCAA	2	10	1565888	1565897	40 %	20 %	20 %	20 %	116628399
24005	NC_008532	TCT	2	6	1566033	1566038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628399
24006	NC_008532	GCTG	2	8	1566054	1566061	0 %	25 %	50 %	25 %	116628399
24007	NC_008532	ATC	2	6	1566070	1566075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628399
24008	NC_008532	TAGC	2	8	1566092	1566099	25 %	25 %	25 %	25 %	116628399
24009	NC_008532	GA	3	6	1566203	1566208	50 %	0 %	50 %	0 %	116628399
24010	NC_008532	ATC	2	6	1566251	1566256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628399
24011	NC_008532	ATC	2	6	1566545	1566550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628400
24012	NC_008532	AGG	2	6	1566571	1566576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628400
24013	NC_008532	GGA	2	6	1566584	1566589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628400
24014	NC_008532	AGA	2	6	1566610	1566615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628400
24015	NC_008532	TAT	2	6	1566676	1566681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628400
24016	NC_008532	ATC	2	6	1566731	1566736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628400
24017	NC_008532	TTG	2	6	1566743	1566748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628400
24018	NC_008532	TCA	2	6	1566762	1566767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628400
24019	NC_008532	CAAG	2	8	1566814	1566821	50 %	0 %	25 %	25 %	116628400
24020	NC_008532	GGTC	2	8	1567807	1567814	0 %	25 %	50 %	25 %	116628401
24021	NC_008532	AAG	3	9	1567844	1567852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628401
24022	NC_008532	GAT	2	6	1567862	1567867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628401
24023	NC_008532	GAC	2	6	1567874	1567879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628401
24024	NC_008532	TCT	2	6	1567884	1567889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628401
24025	NC_008532	TCT	2	6	1567902	1567907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628401
24026	NC_008532	ACG	2	6	1567931	1567936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628401
24027	NC_008532	TAG	2	6	1567991	1567996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628401
24028	NC_008532	ATC	2	6	1568027	1568032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628401
24029	NC_008532	AGAA	2	8	1568084	1568091	75 %	0 %	25 %	0 %	116628401
24030	NC_008532	T	6	6	1568149	1568154	0 %	100 %	0 %	0 %	116628401
24031	NC_008532	AGGT	2	8	1568291	1568298	25 %	25 %	50 %	0 %	116628401
24032	NC_008532	TAGA	2	8	1568386	1568393	50 %	25 %	25 %	0 %	116628401
24033	NC_008532	TCA	2	6	1568394	1568399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628401
24034	NC_008532	CTG	2	6	1568407	1568412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628401
24035	NC_008532	CTC	2	6	1568450	1568455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628401
24036	NC_008532	CAA	2	6	1568461	1568466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628401
24037	NC_008532	AATCC	2	10	1568519	1568528	40 %	20 %	0 %	40 %	116628401
24038	NC_008532	ATT	2	6	1568570	1568575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628401
24039	NC_008532	CTG	2	6	1568594	1568599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628401
24040	NC_008532	TCT	2	6	1568641	1568646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628401
24041	NC_008532	TCT	2	6	1568682	1568687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628401
24042	NC_008532	AAGGTC	2	12	1568727	1568738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116628401
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24044	NC_008532	ATA	2	6	1568829	1568834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628401
24045	NC_008532	AAT	2	6	1568999	1569004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628401
24046	NC_008532	ATCA	2	8	1569008	1569015	50 %	25 %	0 %	25 %	116628401
24047	NC_008532	GCAAG	2	10	1569070	1569079	40 %	0 %	40 %	20 %	116628401
24048	NC_008532	ATA	2	6	1569134	1569139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628401
24049	NC_008532	AG	3	6	1569226	1569231	50 %	0 %	50 %	0 %	116628401
24050	NC_008532	AAG	2	6	1569296	1569301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628401
24051	NC_008532	ATT	2	6	1569416	1569421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628401
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24053	NC_008532	GCT	2	6	1569638	1569643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628401
24054	NC_008532	CTT	2	6	1569661	1569666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628401
24055	NC_008532	TCA	2	6	1569687	1569692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628401
24056	NC_008532	TAT	2	6	1569694	1569699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628401
24057	NC_008532	CCA	2	6	1569982	1569987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628401
24058	NC_008532	TAGA	2	8	1570006	1570013	50 %	25 %	25 %	0 %	116628401
24059	NC_008532	CCA	2	6	1570060	1570065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628401
24060	NC_008532	TTC	2	6	1570112	1570117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628401
24061	NC_008532	TAGG	2	8	1570234	1570241	25 %	25 %	50 %	0 %	116628401
24062	NC_008532	ATC	2	6	1570244	1570249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628401
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24070	NC_008532	CTTGGC	2	12	1570505	1570516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628401
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24072	NC_008532	TCCTT	2	10	1570785	1570794	0 %	60 %	0 %	40 %	116628401
24073	NC_008532	AC	3	6	1570882	1570887	50 %	0 %	0 %	50 %	116628401
24074	NC_008532	GAAA	2	8	1570977	1570984	75 %	0 %	25 %	0 %	116628401
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24081	NC_008532	CTTC	2	8	1571435	1571442	0 %	50 %	0 %	50 %	116628402
24082	NC_008532	TTGAT	2	10	1571518	1571527	20 %	60 %	20 %	0 %	116628402
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24085	NC_008532	TCC	2	6	1571644	1571649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628402
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24088	NC_008532	CAA	2	6	1571948	1571953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628402
24089	NC_008532	AAT	2	6	1571991	1571996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628402
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24098	NC_008532	CTC	2	6	1572306	1572311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628402
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24100	NC_008532	GTC	2	6	1572361	1572366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628402
24101	NC_008532	TTC	2	6	1572393	1572398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628402
24102	NC_008532	GTC	2	6	1572442	1572447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628402
24103	NC_008532	ACT	2	6	1572564	1572569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628402
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24106	NC_008532	AGC	2	6	1572756	1572761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628402
24107	NC_008532	CTC	2	6	1572864	1572869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628402
24108	NC_008532	T	6	6	1572972	1572977	0 %	100 %	0 %	0 %	116628402
24109	NC_008532	GTC	2	6	1573056	1573061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628402
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24113	NC_008532	ATA	2	6	1573395	1573400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628402
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24116	NC_008532	TTC	2	6	1573545	1573550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628402
24117	NC_008532	ATA	2	6	1573560	1573565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628402
24118	NC_008532	CTC	2	6	1573614	1573619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628402
24119	NC_008532	CAAG	2	8	1573625	1573632	50 %	0 %	25 %	25 %	116628402
24120	NC_008532	CTT	3	9	1573700	1573708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628402
24121	NC_008532	GAC	2	6	1573802	1573807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628402
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24123	NC_008532	TGG	2	6	1573978	1573983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628402
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24129	NC_008532	CTG	2	6	1574241	1574246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628402
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24132	NC_008532	CAA	2	6	1574337	1574342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628402
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24137	NC_008532	AATC	2	8	1575114	1575121	50 %	25 %	0 %	25 %	116628403
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24145	NC_008532	GAAGA	2	10	1575557	1575566	60 %	0 %	40 %	0 %	116628403
24146	NC_008532	GAA	2	6	1575588	1575593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628403
24147	NC_008532	AATT	2	8	1575790	1575797	50 %	50 %	0 %	0 %	116628403
24148	NC_008532	TAG	2	6	1575849	1575854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628404
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24151	NC_008532	AACT	2	8	1576139	1576146	50 %	25 %	0 %	25 %	116628404
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24215	NC_008532	TC	3	6	1579785	1579790	0 %	50 %	0 %	50 %	116628409
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24217	NC_008532	CTTC	2	8	1579983	1579990	0 %	50 %	0 %	50 %	116628409
24218	NC_008532	CTGA	2	8	1579993	1580000	25 %	25 %	25 %	25 %	116628409
24219	NC_008532	T	6	6	1580005	1580010	0 %	100 %	0 %	0 %	116628409
24220	NC_008532	A	6	6	1580062	1580067	100 %	0 %	0 %	0 %	116628409
24221	NC_008532	GTCA	2	8	1580225	1580232	25 %	25 %	25 %	25 %	116628410
24222	NC_008532	A	7	7	1580354	1580360	100 %	0 %	0 %	0 %	116628410
24223	NC_008532	ATG	2	6	1580382	1580387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628410
24224	NC_008532	TCA	2	6	1580394	1580399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628410
24225	NC_008532	GAA	2	6	1580420	1580425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628410
24226	NC_008532	TCG	2	6	1580492	1580497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628410
24227	NC_008532	TC	3	6	1580530	1580535	0 %	50 %	0 %	50 %	116628410
24228	NC_008532	CGA	2	6	1580554	1580559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628410
24229	NC_008532	TGA	2	6	1580589	1580594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628410
24230	NC_008532	ATG	2	6	1580595	1580600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628410
24231	NC_008532	CA	3	6	1580657	1580662	50 %	0 %	0 %	50 %	116628410
24232	NC_008532	CAT	3	9	1580683	1580691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628410
24233	NC_008532	CTG	2	6	1580718	1580723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628410
24234	NC_008532	AAT	2	6	1580761	1580766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628410
24235	NC_008532	ATC	2	6	1580771	1580776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628410
24236	NC_008532	ATC	2	6	1580810	1580815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628410
24237	NC_008532	GTC	2	6	1580846	1580851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628410
24238	NC_008532	CAC	2	6	1580880	1580885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628410
24239	NC_008532	TGT	2	6	1580929	1580934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628410
24240	NC_008532	GGGGT	2	10	1580988	1580997	0 %	20 %	80 %	0 %	116628410
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24243	NC_008532	CTC	2	6	1581062	1581067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628410
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24245	NC_008532	A	7	7	1581332	1581338	100 %	0 %	0 %	0 %	116628412
24246	NC_008532	CAT	2	6	1581373	1581378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628412
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24248	NC_008532	AAC	2	6	1581398	1581403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628412
24249	NC_008532	ATC	2	6	1581448	1581453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628412
24250	NC_008532	CCTG	2	8	1581523	1581530	0 %	25 %	25 %	50 %	116628412
24251	NC_008532	AAG	2	6	1581682	1581687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628412
24252	NC_008532	CGT	2	6	1581705	1581710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628412
24253	NC_008532	AAG	2	6	1581877	1581882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628412
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24263	NC_008532	GA	3	6	1582320	1582325	50 %	0 %	50 %	0 %	116628412
24264	NC_008532	ACTTTT	2	12	1582344	1582355	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116628412
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24271	NC_008532	AT	3	6	1582958	1582963	50 %	50 %	0 %	0 %	116628413
24272	NC_008532	CTT	2	6	1582977	1582982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628413
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24290	NC_008532	TACT	2	8	1583925	1583932	25 %	50 %	0 %	25 %	116628414
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24345	NC_008532	TCT	2	6	1586808	1586813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628417
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24467	NC_008532	T	6	6	1594904	1594909	0 %	100 %	0 %	0 %	116628424
24468	NC_008532	CTGTTG	2	12	1595086	1595097	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116628425
24469	NC_008532	TCA	2	6	1595149	1595154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628425
24470	NC_008532	CAT	2	6	1595167	1595172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628425
24471	NC_008532	GTT	2	6	1595237	1595242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628425
24472	NC_008532	TTA	2	6	1595310	1595315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628425
24473	NC_008532	CAA	2	6	1595317	1595322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628425
24474	NC_008532	CCT	2	6	1595359	1595364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628425
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24476	NC_008532	CAT	2	6	1595434	1595439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628425
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24479	NC_008532	CTG	2	6	1595638	1595643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628425
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24481	NC_008532	CAT	2	6	1595650	1595655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628425
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24483	NC_008532	GAA	2	6	1595707	1595712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628425
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24486	NC_008532	ACG	2	6	1595951	1595956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628425
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24490	NC_008532	CTT	2	6	1596100	1596105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628425
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