MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_008532	CAA	2	6	1502617	1502622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628330
23003	NC_008532	TC	3	6	1502632	1502637	0 %	50 %	0 %	50 %	116628330
23004	NC_008532	TCA	2	6	1502676	1502681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628330
23005	NC_008532	CGA	2	6	1502689	1502694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628330
23006	NC_008532	TTC	2	6	1502696	1502701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628330
23007	NC_008532	ACCAG	2	10	1502721	1502730	40 %	0 %	20 %	40 %	116628330
23008	NC_008532	CAC	2	6	1502734	1502739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628330
23009	NC_008532	TCA	2	6	1502745	1502750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628330
23010	NC_008532	ATT	2	6	1502768	1502773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628330
23011	NC_008532	GTC	2	6	1502798	1502803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628330
23012	NC_008532	TCAT	2	8	1502835	1502842	25 %	50 %	0 %	25 %	116628330
23013	NC_008532	T	6	6	1502897	1502902	0 %	100 %	0 %	0 %	116628330
23014	NC_008532	GA	3	6	1502956	1502961	50 %	0 %	50 %	0 %	116628330
23015	NC_008532	GCTTT	2	10	1502963	1502972	0 %	60 %	20 %	20 %	116628330
23016	NC_008532	TCA	2	6	1503063	1503068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628330
23017	NC_008532	TTC	2	6	1503098	1503103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628330
23018	NC_008532	TCA	2	6	1503147	1503152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628330
23019	NC_008532	CAT	2	6	1503172	1503177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628330
23020	NC_008532	GGTT	2	8	1503208	1503215	0 %	50 %	50 %	0 %	116628330
23021	NC_008532	AAT	2	6	1503263	1503268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628330
23022	NC_008532	ACC	2	6	1503363	1503368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628330
23023	NC_008532	CTG	2	6	1503385	1503390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628330
23024	NC_008532	AG	3	6	1503446	1503451	50 %	0 %	50 %	0 %	116628330
23025	NC_008532	AAG	2	6	1503504	1503509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628330
23026	NC_008532	CTT	2	6	1503559	1503564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628330
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23028	NC_008532	ATA	2	6	1503670	1503675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628330
23029	NC_008532	T	6	6	1503700	1503705	0 %	100 %	0 %	0 %	116628330
23030	NC_008532	TTCC	2	8	1503971	1503978	0 %	50 %	0 %	50 %	116628331
23031	NC_008532	TCA	2	6	1504064	1504069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628331
23032	NC_008532	A	6	6	1504100	1504105	100 %	0 %	0 %	0 %	116628331
23033	NC_008532	AAG	2	6	1504169	1504174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628331
23034	NC_008532	CT	3	6	1504234	1504239	0 %	50 %	0 %	50 %	116628331
23035	NC_008532	TTTG	2	8	1504256	1504263	0 %	75 %	25 %	0 %	116628331
23036	NC_008532	CAT	2	6	1504293	1504298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628331
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23038	NC_008532	TCAC	2	8	1504406	1504413	25 %	25 %	0 %	50 %	116628331
23039	NC_008532	ATG	2	6	1504493	1504498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628331
23040	NC_008532	TCA	2	6	1504499	1504504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628331
23041	NC_008532	ATT	2	6	1504546	1504551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628331
23042	NC_008532	GAC	2	6	1504558	1504563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628331
23043	NC_008532	TTCT	2	8	1505208	1505215	0 %	75 %	0 %	25 %	116628332
23044	NC_008532	ATCAT	2	10	1505240	1505249	40 %	40 %	0 %	20 %	116628332
23045	NC_008532	AT	3	6	1505248	1505253	50 %	50 %	0 %	0 %	116628332
23046	NC_008532	GAT	2	6	1505359	1505364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628332
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23050	NC_008532	TAAA	2	8	1505566	1505573	75 %	25 %	0 %	0 %	116628332
23051	NC_008532	CAG	2	6	1505697	1505702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628332
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23053	NC_008532	CAT	2	6	1505880	1505885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628332
23054	NC_008532	CT	3	6	1505989	1505994	0 %	50 %	0 %	50 %	116628332
23055	NC_008532	CAT	2	6	1506000	1506005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628332
23056	NC_008532	TGGT	2	8	1506029	1506036	0 %	50 %	50 %	0 %	116628332
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23059	NC_008532	T	7	7	1506237	1506243	0 %	100 %	0 %	0 %	116628332
23060	NC_008532	AAG	2	6	1506340	1506345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628332
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23062	NC_008532	T	7	7	1506504	1506510	0 %	100 %	0 %	0 %	116628332
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23065	NC_008532	CTG	2	6	1506636	1506641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628332
23066	NC_008532	A	7	7	1506665	1506671	100 %	0 %	0 %	0 %	116628332
23067	NC_008532	CCAA	2	8	1506698	1506705	50 %	0 %	0 %	50 %	116628332
23068	NC_008532	A	6	6	1506704	1506709	100 %	0 %	0 %	0 %	116628332
23069	NC_008532	CCA	2	6	1506710	1506715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628332
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23102	NC_008532	CA	3	6	1508395	1508400	50 %	0 %	0 %	50 %	116628335
23103	NC_008532	CCA	2	6	1508415	1508420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628335
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23106	NC_008532	TTC	2	6	1508557	1508562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628335
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23118	NC_008532	TCTTT	2	10	1509570	1509579	0 %	80 %	0 %	20 %	116628336
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23224	NC_008532	TA	3	6	1516973	1516978	50 %	50 %	0 %	0 %	116628345
23225	NC_008532	TAC	2	6	1517074	1517079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628345
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23229	NC_008532	ACACC	2	10	1517442	1517451	40 %	0 %	0 %	60 %	116628345
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23231	NC_008532	A	6	6	1517536	1517541	100 %	0 %	0 %	0 %	116628345
23232	NC_008532	AAT	2	6	1517560	1517565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628345
23233	NC_008532	ATTA	2	8	1517581	1517588	50 %	50 %	0 %	0 %	116628345
23234	NC_008532	ACTG	2	8	1517943	1517950	25 %	25 %	25 %	25 %	116628346
23235	NC_008532	GAAA	2	8	1517951	1517958	75 %	0 %	25 %	0 %	116628346
23236	NC_008532	GT	3	6	1517965	1517970	0 %	50 %	50 %	0 %	116628346
23237	NC_008532	AC	3	6	1517992	1517997	50 %	0 %	0 %	50 %	116628346
23238	NC_008532	ATG	2	6	1518001	1518006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628346
23239	NC_008532	TGA	2	6	1518008	1518013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628346
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23348	NC_008532	TCC	2	6	1525358	1525363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628352
23349	NC_008532	TG	3	6	1525410	1525415	0 %	50 %	50 %	0 %	116628352
23350	NC_008532	GCA	2	6	1525566	1525571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628352
23351	NC_008532	TCA	2	6	1525593	1525598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628352
23352	NC_008532	CTA	2	6	1525626	1525631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628352
23353	NC_008532	AAG	2	6	1525637	1525642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628352
23354	NC_008532	ATA	2	6	1525679	1525684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628352
23355	NC_008532	AGA	2	6	1525729	1525734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628352
23356	NC_008532	CTAG	2	8	1525770	1525777	25 %	25 %	25 %	25 %	116628352
23357	NC_008532	AGT	2	6	1525828	1525833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628352
23358	NC_008532	CAT	2	6	1525852	1525857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628352
23359	NC_008532	TGTT	2	8	1525919	1525926	0 %	75 %	25 %	0 %	116628352
23360	NC_008532	ATT	2	6	1525938	1525943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628352
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23362	NC_008532	ACTT	2	8	1526113	1526120	25 %	50 %	0 %	25 %	116628353
23363	NC_008532	GATA	2	8	1526152	1526159	50 %	25 %	25 %	0 %	116628353
23364	NC_008532	TTC	2	6	1526167	1526172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628353
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23367	NC_008532	TCAAAG	2	12	1526223	1526234	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116628353
23368	NC_008532	T	8	8	1526269	1526276	0 %	100 %	0 %	0 %	116628353
23369	NC_008532	ATC	2	6	1526317	1526322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628353
23370	NC_008532	ATC	2	6	1526413	1526418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628353
23371	NC_008532	TTA	2	6	1526471	1526476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628353
23372	NC_008532	CTC	2	6	1526521	1526526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628353
23373	NC_008532	CAGT	2	8	1526555	1526562	25 %	25 %	25 %	25 %	116628353
23374	NC_008532	TAT	2	6	1526640	1526645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628353
23375	NC_008532	GT	3	6	1526661	1526666	0 %	50 %	50 %	0 %	116628353
23376	NC_008532	AG	3	6	1527433	1527438	50 %	0 %	50 %	0 %	116628354
23377	NC_008532	ACC	2	6	1527502	1527507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628354
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23379	NC_008532	AGC	2	6	1527632	1527637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628354
23380	NC_008532	CAG	2	6	1527715	1527720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628354
23381	NC_008532	TTG	2	6	1527728	1527733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628354
23382	NC_008532	AGT	2	6	1527751	1527756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628354
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23385	NC_008532	GGA	2	6	1527787	1527792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628354
23386	NC_008532	ACGATT	2	12	1527833	1527844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116628354
23387	NC_008532	TCA	2	6	1527855	1527860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628354
23388	NC_008532	CTG	2	6	1527871	1527876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628354
23389	NC_008532	GCA	2	6	1528032	1528037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628354
23390	NC_008532	CAT	2	6	1528100	1528105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628354
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23393	NC_008532	TCAT	2	8	1528281	1528288	25 %	50 %	0 %	25 %	116628354
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23395	NC_008532	TC	3	6	1528488	1528493	0 %	50 %	0 %	50 %	116628355
23396	NC_008532	AGAC	2	8	1528596	1528603	50 %	0 %	25 %	25 %	116628355
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23420	NC_008532	AC	3	6	1529991	1529996	50 %	0 %	0 %	50 %	116628355
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23433	NC_008532	T	6	6	1531126	1531131	0 %	100 %	0 %	0 %	116628356
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23440	NC_008532	TAATA	2	10	1532312	1532321	60 %	40 %	0 %	0 %	116628359
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23447	NC_008532	AAAT	2	8	1532866	1532873	75 %	25 %	0 %	0 %	116628360
23448	NC_008532	CAT	2	6	1532912	1532917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628360
23449	NC_008532	CGT	2	6	1532951	1532956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628360
23450	NC_008532	CTG	2	6	1532972	1532977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628360
23451	NC_008532	TCC	2	6	1532995	1533000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628360
23452	NC_008532	GCT	2	6	1533031	1533036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628360
23453	NC_008532	GTT	2	6	1533083	1533088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628360
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23455	NC_008532	TCA	2	6	1533200	1533205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628360
23456	NC_008532	T	7	7	1533224	1533230	0 %	100 %	0 %	0 %	116628360
23457	NC_008532	CAT	2	6	1533231	1533236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628360
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23459	NC_008532	GGT	2	6	1533481	1533486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628361
23460	NC_008532	CCT	2	6	1533515	1533520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628361
23461	NC_008532	CAC	2	6	1533551	1533556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628361
23462	NC_008532	TTAC	2	8	1533624	1533631	25 %	50 %	0 %	25 %	116628362
23463	NC_008532	TAT	2	6	1533639	1533644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628362
23464	NC_008532	AAT	2	6	1533686	1533691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628362
23465	NC_008532	A	8	8	1533693	1533700	100 %	0 %	0 %	0 %	116628362
23466	NC_008532	ATA	2	6	1533727	1533732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628362
23467	NC_008532	TGT	2	6	1533739	1533744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628362
23468	NC_008532	A	6	6	1533746	1533751	100 %	0 %	0 %	0 %	116628362
23469	NC_008532	TTC	2	6	1533820	1533825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628362
23470	NC_008532	TCT	2	6	1533826	1533831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628362
23471	NC_008532	ATT	2	6	1533836	1533841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628362
23472	NC_008532	AT	3	6	1533855	1533860	50 %	50 %	0 %	0 %	116628362
23473	NC_008532	CAACCA	2	12	1533861	1533872	50 %	0 %	0 %	50 %	116628362
23474	NC_008532	AG	3	6	1533876	1533881	50 %	0 %	50 %	0 %	116628362
23475	NC_008532	GAT	2	6	1533911	1533916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628362
23476	NC_008532	A	8	8	1533937	1533944	100 %	0 %	0 %	0 %	116628362
23477	NC_008532	ACT	2	6	1533965	1533970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628362
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23480	NC_008532	CTGCAG	2	12	1534124	1534135	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116628363
23481	NC_008532	CA	3	6	1534172	1534177	50 %	0 %	0 %	50 %	116628363
23482	NC_008532	TCC	2	6	1534203	1534208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628363
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23484	NC_008532	TGA	2	6	1534668	1534673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628364
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23487	NC_008532	GCA	2	6	1534865	1534870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628364
23488	NC_008532	AAG	2	6	1535295	1535300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628365
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23490	NC_008532	ACT	2	6	1535516	1535521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628366
23491	NC_008532	AAGA	2	8	1535556	1535563	75 %	0 %	25 %	0 %	116628366
23492	NC_008532	CAA	2	6	1535636	1535641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628366
23493	NC_008532	CAT	2	6	1535658	1535663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628366
23494	NC_008532	T	6	6	1535679	1535684	0 %	100 %	0 %	0 %	116628366
23495	NC_008532	CTCTT	2	10	1535703	1535712	0 %	60 %	0 %	40 %	116628366
23496	NC_008532	TCT	2	6	1535786	1535791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628367
23497	NC_008532	TCT	2	6	1535804	1535809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628367
23498	NC_008532	TCT	2	6	1535822	1535827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628367
23499	NC_008532	A	6	6	1535881	1535886	100 %	0 %	0 %	0 %	116628367
23500	NC_008532	TCAAA	2	10	1535927	1535936	60 %	20 %	0 %	20 %	116628367

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