MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22013	NC_008532	TGA	2	6	1434904	1434909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628259
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22120	NC_008532	AAC	2	6	1440575	1440580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628263
22121	NC_008532	ATC	2	6	1440665	1440670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628263
22122	NC_008532	TTG	2	6	1440708	1440713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628263
22123	NC_008532	TGG	2	6	1440775	1440780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628263
22124	NC_008532	TAG	2	6	1440837	1440842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628263
22125	NC_008532	CAT	2	6	1441069	1441074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628263
22126	NC_008532	CAA	2	6	1441084	1441089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628263
22127	NC_008532	TGA	2	6	1441248	1441253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628264
22128	NC_008532	A	7	7	1441274	1441280	100 %	0 %	0 %	0 %	116628264
22129	NC_008532	AGA	2	6	1441311	1441316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628264
22130	NC_008532	GAA	2	6	1441335	1441340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628264
22131	NC_008532	ATG	2	6	1441737	1441742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628265
22132	NC_008532	GAT	2	6	1441793	1441798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628265
22133	NC_008532	CCA	2	6	1441800	1441805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628265
22134	NC_008532	GA	4	8	1441915	1441922	50 %	0 %	50 %	0 %	116628265
22135	NC_008532	CAAA	2	8	1441938	1441945	75 %	0 %	0 %	25 %	116628265
22136	NC_008532	ATC	2	6	1441984	1441989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628266
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22138	NC_008532	GATT	2	8	1442228	1442235	25 %	50 %	25 %	0 %	116628266
22139	NC_008532	TCA	2	6	1442263	1442268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628266
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22141	NC_008532	CTT	2	6	1442335	1442340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628267
22142	NC_008532	ATGT	2	8	1442380	1442387	25 %	50 %	25 %	0 %	116628267
22143	NC_008532	GAT	2	6	1442437	1442442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628267
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22146	NC_008532	AGC	2	6	1442744	1442749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628268
22147	NC_008532	T	6	6	1442773	1442778	0 %	100 %	0 %	0 %	116628268
22148	NC_008532	GAA	2	6	1442792	1442797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628268
22149	NC_008532	GTGAT	2	10	1442896	1442905	20 %	40 %	40 %	0 %	116628268
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22151	NC_008532	TAT	2	6	1442953	1442958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628268
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22154	NC_008532	TCA	2	6	1443204	1443209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628268
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22157	NC_008532	TTC	2	6	1443434	1443439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628268
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22173	NC_008532	CTG	2	6	1444494	1444499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628270
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22208	NC_008532	GCTTTT	2	12	1447152	1447163	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116628272
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22212	NC_008532	TCA	2	6	1447379	1447384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628272
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22219	NC_008532	CTTGG	2	10	1447846	1447855	0 %	40 %	40 %	20 %	116628273
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22221	NC_008532	CTG	2	6	1448112	1448117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628273
22222	NC_008532	TGA	2	6	1448218	1448223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628273
22223	NC_008532	TCT	2	6	1448327	1448332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628273
22224	NC_008532	TCA	3	9	1448396	1448404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628273
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22226	NC_008532	CTG	2	6	1448538	1448543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628273
22227	NC_008532	CCA	2	6	1448549	1448554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628273
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22229	NC_008532	GA	3	6	1448792	1448797	50 %	0 %	50 %	0 %	116628274
22230	NC_008532	TTGT	2	8	1448828	1448835	0 %	75 %	25 %	0 %	116628274
22231	NC_008532	AAG	2	6	1449108	1449113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628275
22232	NC_008532	GGA	2	6	1449131	1449136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628275
22233	NC_008532	CAG	2	6	1449326	1449331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628275
22234	NC_008532	CAT	2	6	1449347	1449352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628275
22235	NC_008532	ACCA	2	8	1449363	1449370	50 %	0 %	0 %	50 %	116628275
22236	NC_008532	TGA	2	6	1449371	1449376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628275
22237	NC_008532	TGA	2	6	1449440	1449445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628275
22238	NC_008532	ATG	2	6	1449508	1449513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628275
22239	NC_008532	TGA	2	6	1449529	1449534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628275
22240	NC_008532	GCC	2	6	1449538	1449543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628275
22241	NC_008532	AAGTC	2	10	1449671	1449680	40 %	20 %	20 %	20 %	116628275
22242	NC_008532	CTG	2	6	1449809	1449814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628275
22243	NC_008532	ATG	2	6	1449860	1449865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628275
22244	NC_008532	AGCT	2	8	1449978	1449985	25 %	25 %	25 %	25 %	116628275
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22246	NC_008532	ACA	2	6	1450186	1450191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628275
22247	NC_008532	CTG	2	6	1450202	1450207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628275
22248	NC_008532	TTG	2	6	1450245	1450250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628275
22249	NC_008532	AGGG	2	8	1450380	1450387	25 %	0 %	75 %	0 %	116628275
22250	NC_008532	TCA	2	6	1450408	1450413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628275
22251	NC_008532	AAC	2	6	1450491	1450496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628275
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22253	NC_008532	CCT	2	6	1450544	1450549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628275
22254	NC_008532	AG	3	6	1450599	1450604	50 %	0 %	50 %	0 %	116628275
22255	NC_008532	ATA	2	6	1450659	1450664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628275
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22258	NC_008532	TCAAAA	2	12	1450841	1450852	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116628275
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22262	NC_008532	TCT	2	6	1450999	1451004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628275
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22265	NC_008532	AAC	2	6	1451145	1451150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628275
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22272	NC_008532	GATA	2	8	1451489	1451496	50 %	25 %	25 %	0 %	116628276
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22339	NC_008532	AG	3	6	1455472	1455477	50 %	0 %	50 %	0 %	116628281
22340	NC_008532	ATA	2	6	1455507	1455512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628281
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22343	NC_008532	CCAA	2	8	1455624	1455631	50 %	0 %	0 %	50 %	116628281
22344	NC_008532	AACC	2	8	1455721	1455728	50 %	0 %	0 %	50 %	116628281
22345	NC_008532	ACC	2	6	1455851	1455856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628281
22346	NC_008532	TGC	2	6	1455857	1455862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628281
22347	NC_008532	GTT	2	6	1455879	1455884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628281
22348	NC_008532	CCA	2	6	1455912	1455917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628281
22349	NC_008532	GCAC	2	8	1455981	1455988	25 %	0 %	25 %	50 %	116628281
22350	NC_008532	AAGG	2	8	1456037	1456044	50 %	0 %	50 %	0 %	116628281
22351	NC_008532	TTTC	2	8	1456147	1456154	0 %	75 %	0 %	25 %	116628281
22352	NC_008532	CAA	2	6	1456255	1456260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628282
22353	NC_008532	CT	3	6	1456308	1456313	0 %	50 %	0 %	50 %	116628282
22354	NC_008532	ATC	2	6	1456373	1456378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628282
22355	NC_008532	CAA	2	6	1456420	1456425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628282
22356	NC_008532	CAT	2	6	1456453	1456458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628282
22357	NC_008532	TTTG	2	8	1456507	1456514	0 %	75 %	25 %	0 %	116628282
22358	NC_008532	CATG	2	8	1456516	1456523	25 %	25 %	25 %	25 %	116628282
22359	NC_008532	AGCCA	2	10	1456532	1456541	40 %	0 %	20 %	40 %	116628282
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22363	NC_008532	TCA	2	6	1456716	1456721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628282
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22454	NC_008532	CTT	2	6	1463612	1463617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628288
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22457	NC_008532	ATA	2	6	1463862	1463867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628288
22458	NC_008532	T	6	6	1463950	1463955	0 %	100 %	0 %	0 %	116628288
22459	NC_008532	TCT	2	6	1463965	1463970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628288
22460	NC_008532	CT	3	6	1463969	1463974	0 %	50 %	0 %	50 %	116628288
22461	NC_008532	ATG	2	6	1464299	1464304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628289
22462	NC_008532	ATG	2	6	1464317	1464322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628289
22463	NC_008532	AAGC	2	8	1464323	1464330	50 %	0 %	25 %	25 %	116628289
22464	NC_008532	A	6	6	1464354	1464359	100 %	0 %	0 %	0 %	116628289
22465	NC_008532	GCT	2	6	1464374	1464379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628289
22466	NC_008532	A	6	6	1464437	1464442	100 %	0 %	0 %	0 %	116628289
22467	NC_008532	TGT	2	6	1464469	1464474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628289
22468	NC_008532	TGA	2	6	1464481	1464486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628289
22469	NC_008532	CGA	2	6	1464544	1464549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628289
22470	NC_008532	CTA	2	6	1464552	1464557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628289
22471	NC_008532	A	6	6	1464557	1464562	100 %	0 %	0 %	0 %	116628289
22472	NC_008532	ACTT	2	8	1464754	1464761	25 %	50 %	0 %	25 %	116628290
22473	NC_008532	T	6	6	1464790	1464795	0 %	100 %	0 %	0 %	116628290
22474	NC_008532	TGG	2	6	1464880	1464885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628290
22475	NC_008532	TCA	2	6	1464898	1464903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628290
22476	NC_008532	CCA	2	6	1464918	1464923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628290
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22479	NC_008532	AAG	2	6	1465425	1465430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628291
22480	NC_008532	ATG	2	6	1465471	1465476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628291
22481	NC_008532	ATC	2	6	1465519	1465524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628291
22482	NC_008532	GATCT	2	10	1465621	1465630	20 %	40 %	20 %	20 %	116628291
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22484	NC_008532	TGATT	2	10	1465683	1465692	20 %	60 %	20 %	0 %	116628291
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22488	NC_008532	CTG	2	6	1465842	1465847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628291
22489	NC_008532	T	6	6	1466693	1466698	0 %	100 %	0 %	0 %	116628292
22490	NC_008532	T	7	7	1466726	1466732	0 %	100 %	0 %	0 %	116628292
22491	NC_008532	TCT	2	6	1466740	1466745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628292
22492	NC_008532	T	6	6	1466759	1466764	0 %	100 %	0 %	0 %	116628292
22493	NC_008532	TCA	2	6	1466803	1466808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628292
22494	NC_008532	CTT	2	6	1466825	1466830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628292
22495	NC_008532	TTG	2	6	1466856	1466861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628292
22496	NC_008532	CTG	2	6	1466862	1466867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628292
22497	NC_008532	ATTG	2	8	1466915	1466922	25 %	50 %	25 %	0 %	116628292
22498	NC_008532	AAC	2	6	1467010	1467015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628292
22499	NC_008532	GTT	2	6	1467020	1467025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628292
22500	NC_008532	TCA	2	6	1467034	1467039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628292

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