MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_008532	TCA	2	6	1371697	1371702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628201
21002	NC_008532	AGC	2	6	1371708	1371713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628201
21003	NC_008532	CCTCAG	2	12	1371743	1371754	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116628201
21004	NC_008532	TTA	2	6	1371766	1371771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628201
21005	NC_008532	CAA	2	6	1371773	1371778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628201
21006	NC_008532	GGA	2	6	1371920	1371925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628201
21007	NC_008532	AACC	2	8	1371938	1371945	50 %	0 %	0 %	50 %	116628201
21008	NC_008532	TCAA	2	8	1371961	1371968	50 %	25 %	0 %	25 %	116628201
21009	NC_008532	CT	3	6	1371994	1371999	0 %	50 %	0 %	50 %	116628201
21010	NC_008532	TGC	2	6	1372071	1372076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628201
21011	NC_008532	TTG	2	6	1372094	1372099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628201
21012	NC_008532	CCAA	2	8	1372120	1372127	50 %	0 %	0 %	50 %	116628201
21013	NC_008532	CCA	2	6	1372246	1372251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628201
21014	NC_008532	CCA	2	6	1372255	1372260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628201
21015	NC_008532	TAA	2	6	1372301	1372306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628201
21016	NC_008532	CTC	2	6	1372370	1372375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628201
21017	NC_008532	ACC	2	6	1372497	1372502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628201
21018	NC_008532	ACG	2	6	1372542	1372547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628201
21019	NC_008532	CCATC	2	10	1372556	1372565	20 %	20 %	0 %	60 %	116628201
21020	NC_008532	CCA	2	6	1372567	1372572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628201
21021	NC_008532	TAC	2	6	1372758	1372763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628202
21022	NC_008532	A	6	6	1372800	1372805	100 %	0 %	0 %	0 %	116628202
21023	NC_008532	CTC	2	6	1372962	1372967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628203
21024	NC_008532	GCTG	2	8	1373167	1373174	0 %	25 %	50 %	25 %	116628203
21025	NC_008532	ATA	2	6	1373233	1373238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628203
21026	NC_008532	CTT	2	6	1373274	1373279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628203
21027	NC_008532	ATT	2	6	1373310	1373315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628203
21028	NC_008532	AGA	3	9	1373323	1373331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628203
21029	NC_008532	TTTA	2	8	1373454	1373461	25 %	75 %	0 %	0 %	116628203
21030	NC_008532	TCA	2	6	1373527	1373532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628203
21031	NC_008532	CTT	2	6	1373580	1373585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628203
21032	NC_008532	CTTGA	2	10	1373598	1373607	20 %	40 %	20 %	20 %	116628203
21033	NC_008532	CTT	2	6	1374034	1374039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628204
21034	NC_008532	CT	3	6	1374117	1374122	0 %	50 %	0 %	50 %	116628204
21035	NC_008532	ACC	2	6	1374173	1374178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628204
21036	NC_008532	AT	3	6	1374250	1374255	50 %	50 %	0 %	0 %	116628204
21037	NC_008532	TAT	2	6	1374264	1374269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628204
21038	NC_008532	A	6	6	1374289	1374294	100 %	0 %	0 %	0 %	116628204
21039	NC_008532	CAT	2	6	1374340	1374345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628204
21040	NC_008532	ATC	2	6	1374352	1374357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628204
21041	NC_008532	AAG	2	6	1374367	1374372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628204
21042	NC_008532	CTG	2	6	1374382	1374387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628204
21043	NC_008532	T	6	6	1374553	1374558	0 %	100 %	0 %	0 %	116628205
21044	NC_008532	CCT	2	6	1374559	1374564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628205
21045	NC_008532	CA	3	6	1374611	1374616	50 %	0 %	0 %	50 %	116628205
21046	NC_008532	AAT	2	6	1374661	1374666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628205
21047	NC_008532	TAAA	2	8	1374742	1374749	75 %	25 %	0 %	0 %	116628205
21048	NC_008532	ACC	2	6	1374752	1374757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628205
21049	NC_008532	AAT	2	6	1374772	1374777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628205
21050	NC_008532	ACC	2	6	1374792	1374797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628205
21051	NC_008532	AGT	2	6	1374800	1374805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628205
21052	NC_008532	TTC	2	6	1374833	1374838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628205
21053	NC_008532	AC	3	6	1374853	1374858	50 %	0 %	0 %	50 %	116628205
21054	NC_008532	A	7	7	1375016	1375022	100 %	0 %	0 %	0 %	116628206
21055	NC_008532	TTC	2	6	1375023	1375028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628206
21056	NC_008532	A	6	6	1375047	1375052	100 %	0 %	0 %	0 %	116628206
21057	NC_008532	CTT	2	6	1375120	1375125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628206
21058	NC_008532	CTC	2	6	1375154	1375159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628206
21059	NC_008532	AGC	2	6	1375627	1375632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628207
21060	NC_008532	TCA	2	6	1375661	1375666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628207
21061	NC_008532	TCT	2	6	1375667	1375672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628207
21062	NC_008532	TCA	3	9	1375673	1375681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628207
21063	NC_008532	CTT	2	6	1375701	1375706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628207
21064	NC_008532	AGTTAA	2	12	1375726	1375737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116628207
21065	NC_008532	ATC	2	6	1375990	1375995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628208
21066	NC_008532	CTGC	2	8	1376015	1376022	0 %	25 %	25 %	50 %	116628208
21067	NC_008532	CTT	3	9	1376115	1376123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628208
21068	NC_008532	TCT	2	6	1376136	1376141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628208
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21070	NC_008532	TAT	2	6	1376214	1376219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628208
21071	NC_008532	ACT	2	6	1376254	1376259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628208
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21077	NC_008532	GCT	2	6	1376773	1376778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628208
21078	NC_008532	TCT	2	6	1376783	1376788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628208
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21085	NC_008532	AAT	2	6	1377065	1377070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628209
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21088	NC_008532	ATA	2	6	1378196	1378201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628210
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21090	NC_008532	TCA	2	6	1378408	1378413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628210
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21092	NC_008532	TG	3	6	1378533	1378538	0 %	50 %	50 %	0 %	116628210
21093	NC_008532	TTA	2	6	1378589	1378594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628210
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21096	NC_008532	TCA	2	6	1378772	1378777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628210
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21098	NC_008532	T	6	6	1378903	1378908	0 %	100 %	0 %	0 %	116628211
21099	NC_008532	ATT	2	6	1378912	1378917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628211
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21101	NC_008532	TAT	2	6	1378953	1378958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628211
21102	NC_008532	CT	3	6	1379045	1379050	0 %	50 %	0 %	50 %	116628211
21103	NC_008532	CAG	2	6	1379052	1379057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628211
21104	NC_008532	AT	3	6	1379093	1379098	50 %	50 %	0 %	0 %	116628211
21105	NC_008532	T	7	7	1379160	1379166	0 %	100 %	0 %	0 %	116628212
21106	NC_008532	A	6	6	1379237	1379242	100 %	0 %	0 %	0 %	116628212
21107	NC_008532	T	6	6	1379247	1379252	0 %	100 %	0 %	0 %	116628212
21108	NC_008532	ATT	2	6	1379265	1379270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628212
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21113	NC_008532	ATA	2	6	1379575	1379580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628212
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21235	NC_008532	GA	3	6	1384641	1384646	50 %	0 %	50 %	0 %	116628214
21236	NC_008532	CT	3	6	1384786	1384791	0 %	50 %	0 %	50 %	116628214
21237	NC_008532	ACC	2	6	1384819	1384824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628214
21238	NC_008532	ACCT	2	8	1384834	1384841	25 %	25 %	0 %	50 %	116628214
21239	NC_008532	TTG	2	6	1384886	1384891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628214
21240	NC_008532	AATG	2	8	1384893	1384900	50 %	25 %	25 %	0 %	116628214
21241	NC_008532	CTT	3	9	1385061	1385069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628214
21242	NC_008532	TAA	2	6	1385098	1385103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628214
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21244	NC_008532	TTC	2	6	1385323	1385328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628215
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21249	NC_008532	T	6	6	1385501	1385506	0 %	100 %	0 %	0 %	116628215
21250	NC_008532	TTG	2	6	1385589	1385594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628215
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21259	NC_008532	TTG	2	6	1385969	1385974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628215
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21271	NC_008532	TCT	2	6	1386590	1386595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628215
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21352	NC_008532	GT	3	6	1390326	1390331	0 %	50 %	50 %	0 %	116628218
21353	NC_008532	A	7	7	1390333	1390339	100 %	0 %	0 %	0 %	116628218
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21450	NC_008532	CTT	2	6	1397670	1397675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628225
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21453	NC_008532	AGTTT	2	10	1397885	1397894	20 %	60 %	20 %	0 %	116628225
21454	NC_008532	GA	3	6	1397950	1397955	50 %	0 %	50 %	0 %	116628225
21455	NC_008532	CAT	2	6	1397986	1397991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628225
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21457	NC_008532	TAT	2	6	1398060	1398065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628225
21458	NC_008532	GAATA	2	10	1398096	1398105	60 %	20 %	20 %	0 %	116628225
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21460	NC_008532	ACC	2	6	1398256	1398261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628225
21461	NC_008532	GAA	2	6	1398445	1398450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628225
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21463	NC_008532	CAT	2	6	1398493	1398498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628225
21464	NC_008532	CTC	2	6	1398500	1398505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628226
21465	NC_008532	TC	3	6	1398509	1398514	0 %	50 %	0 %	50 %	116628226
21466	NC_008532	ATA	2	6	1398527	1398532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628226
21467	NC_008532	AGA	2	6	1398543	1398548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628226
21468	NC_008532	AGAGA	2	10	1398551	1398560	60 %	0 %	40 %	0 %	116628226
21469	NC_008532	AAG	2	6	1398660	1398665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628226
21470	NC_008532	ATA	2	6	1398717	1398722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628226
21471	NC_008532	CAA	2	6	1398875	1398880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628226
21472	NC_008532	CTG	2	6	1398995	1399000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628226
21473	NC_008532	TGCT	2	8	1399005	1399012	0 %	50 %	25 %	25 %	116628226
21474	NC_008532	AAT	2	6	1399043	1399048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628226
21475	NC_008532	AAG	2	6	1399080	1399085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628226
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21489	NC_008532	GTT	2	6	1399791	1399796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628227
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21491	NC_008532	ATG	2	6	1399859	1399864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628227
21492	NC_008532	AAGT	2	8	1399898	1399905	50 %	25 %	25 %	0 %	116628227
21493	NC_008532	AAG	2	6	1399916	1399921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628227
21494	NC_008532	A	6	6	1399960	1399965	100 %	0 %	0 %	0 %	116628227
21495	NC_008532	AGC	2	6	1399976	1399981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628227
21496	NC_008532	AAG	2	6	1400017	1400022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628227
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21499	NC_008532	TTC	2	6	1400117	1400122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628228
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