MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_008532	CTT	2	6	1280744	1280749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628121
19503	NC_008532	TAA	2	6	1280988	1280993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628122
19504	NC_008532	TGA	2	6	1281048	1281053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628122
19505	NC_008532	TAA	2	6	1281081	1281086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628122
19506	NC_008532	A	7	7	1281090	1281096	100 %	0 %	0 %	0 %	116628122
19507	NC_008532	ATT	2	6	1281115	1281120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628122
19508	NC_008532	GAA	2	6	1281133	1281138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628122
19509	NC_008532	CTA	2	6	1281156	1281161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628122
19510	NC_008532	A	6	6	1281185	1281190	100 %	0 %	0 %	0 %	116628122
19511	NC_008532	AGGAG	2	10	1281249	1281258	40 %	0 %	60 %	0 %	116628122
19512	NC_008532	A	6	6	1281321	1281326	100 %	0 %	0 %	0 %	116628122
19513	NC_008532	TTG	2	6	1281338	1281343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628122
19514	NC_008532	TAC	2	6	1281378	1281383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628122
19515	NC_008532	TAA	2	6	1281438	1281443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628122
19516	NC_008532	A	6	6	1281467	1281472	100 %	0 %	0 %	0 %	116628122
19517	NC_008532	ATC	2	6	1281490	1281495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628122
19518	NC_008532	ACT	2	6	1281524	1281529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628122
19519	NC_008532	CTT	2	6	1281601	1281606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628122
19520	NC_008532	GAC	2	6	1281718	1281723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628122
19521	NC_008532	TCC	2	6	1281771	1281776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628122
19522	NC_008532	AGA	2	6	1281801	1281806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628122
19523	NC_008532	ATT	2	6	1281843	1281848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628122
19524	NC_008532	TTTGA	2	10	1284419	1284428	20 %	60 %	20 %	0 %	116628123
19525	NC_008532	AATC	2	8	1284442	1284449	50 %	25 %	0 %	25 %	116628123
19526	NC_008532	AAT	2	6	1284552	1284557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628123
19527	NC_008532	TCAT	2	8	1284690	1284697	25 %	50 %	0 %	25 %	116628124
19528	NC_008532	CTT	2	6	1286937	1286942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628125
19529	NC_008532	TCA	2	6	1287115	1287120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628125
19530	NC_008532	CTA	2	6	1287136	1287141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628125
19531	NC_008532	TAT	2	6	1287288	1287293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628125
19532	NC_008532	AACTA	2	10	1287320	1287329	60 %	20 %	0 %	20 %	116628125
19533	NC_008532	AGCT	2	8	1287445	1287452	25 %	25 %	25 %	25 %	116628125
19534	NC_008532	ACT	2	6	1287457	1287462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628125
19535	NC_008532	TTCC	2	8	1287554	1287561	0 %	50 %	0 %	50 %	116628125
19536	NC_008532	AGA	2	6	1287620	1287625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628125
19537	NC_008532	AGAA	2	8	1287676	1287683	75 %	0 %	25 %	0 %	116628125
19538	NC_008532	TTCC	2	8	1287725	1287732	0 %	50 %	0 %	50 %	116628125
19539	NC_008532	ACCT	2	8	1287747	1287754	25 %	25 %	0 %	50 %	116628125
19540	NC_008532	ACT	2	6	1287807	1287812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628125
19541	NC_008532	CCTT	2	8	1287841	1287848	0 %	50 %	0 %	50 %	116628125
19542	NC_008532	CT	3	6	1287918	1287923	0 %	50 %	0 %	50 %	116628125
19543	NC_008532	ATC	2	6	1288015	1288020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628125
19544	NC_008532	CT	3	6	1288071	1288076	0 %	50 %	0 %	50 %	116628125
19545	NC_008532	GACTG	2	10	1288155	1288164	20 %	20 %	40 %	20 %	116628125
19546	NC_008532	TAA	2	6	1288367	1288372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628125
19547	NC_008532	AAG	2	6	1288383	1288388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628125
19548	NC_008532	AGGA	2	8	1288444	1288451	50 %	0 %	50 %	0 %	116628125
19549	NC_008532	CTA	2	6	1288457	1288462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628125
19550	NC_008532	TTG	2	6	1288486	1288491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628125
19551	NC_008532	AACT	2	8	1288505	1288512	50 %	25 %	0 %	25 %	116628125
19552	NC_008532	AGA	2	6	1288589	1288594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628125
19553	NC_008532	TTG	2	6	1288606	1288611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628125
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19555	NC_008532	AC	3	6	1288712	1288717	50 %	0 %	0 %	50 %	116628125
19556	NC_008532	AAC	2	6	1288810	1288815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628125
19557	NC_008532	TGA	2	6	1288844	1288849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628125
19558	NC_008532	A	6	6	1288865	1288870	100 %	0 %	0 %	0 %	116628125
19559	NC_008532	CGT	2	6	1288881	1288886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628125
19560	NC_008532	GGT	2	6	1288905	1288910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628125
19561	NC_008532	CCA	2	6	1289035	1289040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628125
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19563	NC_008532	CAT	2	6	1290493	1290498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628126
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19567	NC_008532	TTC	2	6	1290570	1290575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628126
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19569	NC_008532	GAC	2	6	1290611	1290616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628126
19570	NC_008532	CTT	2	6	1290668	1290673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628126
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19572	NC_008532	TAA	2	6	1290791	1290796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628126
19573	NC_008532	TCA	2	6	1290817	1290822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628126
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19579	NC_008532	GAT	2	6	1291077	1291082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628126
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19583	NC_008532	ACGC	2	8	1291224	1291231	25 %	0 %	25 %	50 %	116628126
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19589	NC_008532	GAT	2	6	1291428	1291433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628126
19590	NC_008532	TTA	2	6	1291558	1291563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628126
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19593	NC_008532	GCA	2	6	1291684	1291689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628126
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19598	NC_008532	GACT	2	8	1291876	1291883	25 %	25 %	25 %	25 %	116628126
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19604	NC_008532	TCAGGT	2	12	1292113	1292124	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116628126
19605	NC_008532	CTT	2	6	1292138	1292143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628126
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19607	NC_008532	TCG	2	6	1292188	1292193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628126
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19612	NC_008532	GAAA	2	8	1292436	1292443	75 %	0 %	25 %	0 %	116628126
19613	NC_008532	ACC	3	9	1292472	1292480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628126
19614	NC_008532	CCAT	2	8	1292554	1292561	25 %	25 %	0 %	50 %	116628126
19615	NC_008532	AGA	2	6	1292599	1292604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628126
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19968	NC_008532	TCA	2	6	1313541	1313546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628146
19969	NC_008532	ACGTTG	2	12	1313594	1313605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116628146
19970	NC_008532	CTC	2	6	1313642	1313647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628146
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19972	NC_008532	CTT	2	6	1313659	1313664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628146
19973	NC_008532	TGA	2	6	1313665	1313670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628146
19974	NC_008532	TTC	2	6	1313693	1313698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628146
19975	NC_008532	TTCA	2	8	1313762	1313769	25 %	50 %	0 %	25 %	116628146
19976	NC_008532	ATC	2	6	1313793	1313798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628146
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19979	NC_008532	AAT	2	6	1313867	1313872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628146
19980	NC_008532	TTG	2	6	1313967	1313972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628146
19981	NC_008532	A	6	6	1313976	1313981	100 %	0 %	0 %	0 %	116628146
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19983	NC_008532	CTTC	2	8	1314012	1314019	0 %	50 %	0 %	50 %	116628146
19984	NC_008532	T	6	6	1314039	1314044	0 %	100 %	0 %	0 %	116628146
19985	NC_008532	TCC	2	6	1314073	1314078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628147
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19987	NC_008532	AATC	2	8	1314236	1314243	50 %	25 %	0 %	25 %	116628147
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19991	NC_008532	ATC	2	6	1314339	1314344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628147
19992	NC_008532	AAGC	2	8	1314366	1314373	50 %	0 %	25 %	25 %	116628147
19993	NC_008532	ACG	2	6	1314478	1314483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628147
19994	NC_008532	CTC	2	6	1314522	1314527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628147
19995	NC_008532	GTT	2	6	1314583	1314588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628147
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19997	NC_008532	GGCAAT	2	12	1314627	1314638	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116628147
19998	NC_008532	CCA	2	6	1314658	1314663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628147
19999	NC_008532	T	7	7	1314740	1314746	0 %	100 %	0 %	0 %	116628147
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