MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_008532	ATA	2	6	1250415	1250420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628096
19003	NC_008532	TTC	2	6	1250428	1250433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628096
19004	NC_008532	CTT	2	6	1250441	1250446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628096
19005	NC_008532	ATC	2	6	1250490	1250495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628096
19006	NC_008532	GAAA	2	8	1250503	1250510	75 %	0 %	25 %	0 %	116628096
19007	NC_008532	T	6	6	1250539	1250544	0 %	100 %	0 %	0 %	116628096
19008	NC_008532	CTT	2	6	1251135	1251140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628097
19009	NC_008532	GTTT	2	8	1251242	1251249	0 %	75 %	25 %	0 %	116628097
19010	NC_008532	ACT	2	6	1251277	1251282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628097
19011	NC_008532	AGG	2	6	1251563	1251568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628097
19012	NC_008532	ACC	2	6	1251608	1251613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628097
19013	NC_008532	TAGAC	2	10	1251720	1251729	40 %	20 %	20 %	20 %	116628097
19014	NC_008532	GTT	2	6	1251744	1251749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628097
19015	NC_008532	GTT	2	6	1251771	1251776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628097
19016	NC_008532	A	6	6	1251779	1251784	100 %	0 %	0 %	0 %	116628097
19017	NC_008532	TGT	2	6	1251863	1251868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628097
19018	NC_008532	ATCA	2	8	1251888	1251895	50 %	25 %	0 %	25 %	116628097
19019	NC_008532	TGA	2	6	1251922	1251927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628097
19020	NC_008532	CAG	2	6	1251956	1251961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628097
19021	NC_008532	ACC	2	6	1252015	1252020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628097
19022	NC_008532	ACT	2	6	1252125	1252130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628097
19023	NC_008532	TCACT	2	10	1252148	1252157	20 %	40 %	0 %	40 %	116628097
19024	NC_008532	GA	3	6	1252202	1252207	50 %	0 %	50 %	0 %	116628097
19025	NC_008532	ATC	2	6	1252209	1252214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628097
19026	NC_008532	GAT	2	6	1252241	1252246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628097
19027	NC_008532	GAG	2	6	1252340	1252345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628097
19028	NC_008532	CTC	2	6	1252410	1252415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628097
19029	NC_008532	CAAG	2	8	1252425	1252432	50 %	0 %	25 %	25 %	116628097
19030	NC_008532	CAA	2	6	1252490	1252495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628097
19031	NC_008532	TTC	2	6	1252506	1252511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628097
19032	NC_008532	TCA	2	6	1252529	1252534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628097
19033	NC_008532	TTG	2	6	1252597	1252602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628097
19034	NC_008532	CTCA	2	8	1252617	1252624	25 %	25 %	0 %	50 %	116628097
19035	NC_008532	TCT	2	6	1252654	1252659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628097
19036	NC_008532	TTC	2	6	1252755	1252760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628097
19037	NC_008532	AAT	2	6	1252773	1252778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628097
19038	NC_008532	TAA	2	6	1252804	1252809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628097
19039	NC_008532	CTC	2	6	1252914	1252919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628097
19040	NC_008532	T	6	6	1253025	1253030	0 %	100 %	0 %	0 %	116628097
19041	NC_008532	GAT	2	6	1253112	1253117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628097
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19043	NC_008532	T	6	6	1253207	1253212	0 %	100 %	0 %	0 %	116628097
19044	NC_008532	T	6	6	1253219	1253224	0 %	100 %	0 %	0 %	116628097
19045	NC_008532	ATT	2	6	1253954	1253959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628098
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19047	NC_008532	TCTTT	2	10	1254068	1254077	0 %	80 %	0 %	20 %	116628098
19048	NC_008532	AAT	2	6	1254104	1254109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628098
19049	NC_008532	TAG	2	6	1254177	1254182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628098
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19051	NC_008532	GTA	2	6	1254231	1254236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628098
19052	NC_008532	CGT	2	6	1254259	1254264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628098
19053	NC_008532	TCA	2	6	1254323	1254328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628098
19054	NC_008532	AAT	2	6	1254461	1254466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628098
19055	NC_008532	TAA	2	6	1254514	1254519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628098
19056	NC_008532	CAA	2	6	1254539	1254544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628098
19057	NC_008532	T	6	6	1254568	1254573	0 %	100 %	0 %	0 %	116628098
19058	NC_008532	TAT	3	9	1254577	1254585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628098
19059	NC_008532	TAT	2	6	1254709	1254714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628098
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19062	NC_008532	TAT	4	12	1254829	1254840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628098
19063	NC_008532	TTG	2	6	1254845	1254850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628098
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19067	NC_008532	ATCAGG	2	12	1255040	1255051	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116628099
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19072	NC_008532	ATTT	2	8	1255181	1255188	25 %	75 %	0 %	0 %	116628099
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19088	NC_008532	TA	3	6	1256542	1256547	50 %	50 %	0 %	0 %	116628101
19089	NC_008532	AGC	2	6	1256556	1256561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628101
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19234	NC_008532	ATCA	2	8	1264049	1264056	50 %	25 %	0 %	25 %	116628110
19235	NC_008532	ATTT	2	8	1264096	1264103	25 %	75 %	0 %	0 %	116628110
19236	NC_008532	ATA	2	6	1264176	1264181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628110
19237	NC_008532	ACT	2	6	1264409	1264414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628111
19238	NC_008532	AAAT	2	8	1264488	1264495	75 %	25 %	0 %	0 %	116628111
19239	NC_008532	T	6	6	1264571	1264576	0 %	100 %	0 %	0 %	116628111
19240	NC_008532	TTGG	2	8	1264907	1264914	0 %	50 %	50 %	0 %	116628113
19241	NC_008532	CAT	2	6	1265050	1265055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628113
19242	NC_008532	TAT	2	6	1265113	1265118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628113
19243	NC_008532	TTTC	2	8	1265131	1265138	0 %	75 %	0 %	25 %	116628113
19244	NC_008532	TGA	2	6	1265174	1265179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628113
19245	NC_008532	TCT	2	6	1265196	1265201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628113
19246	NC_008532	TTGT	2	8	1265204	1265211	0 %	75 %	25 %	0 %	116628113
19247	NC_008532	TCC	2	6	1265631	1265636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628114
19248	NC_008532	TGA	2	6	1265683	1265688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628114
19249	NC_008532	CTT	2	6	1265710	1265715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628114
19250	NC_008532	TGA	2	6	1265734	1265739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628114
19251	NC_008532	TCG	2	6	1265823	1265828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628114
19252	NC_008532	CAA	2	6	1265842	1265847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628114
19253	NC_008532	CAC	2	6	1265920	1265925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628114
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19255	NC_008532	TTG	2	6	1266089	1266094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628114
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19264	NC_008532	GTTG	2	8	1266640	1266647	0 %	50 %	50 %	0 %	116628114
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19266	NC_008532	T	8	8	1266836	1266843	0 %	100 %	0 %	0 %	116628114
19267	NC_008532	ATA	2	6	1266917	1266922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628114
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19269	NC_008532	CTTTT	2	10	1267133	1267142	0 %	80 %	0 %	20 %	116628114
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19342	NC_008532	TTCACT	2	12	1271931	1271942	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116628116
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19346	NC_008532	AAAT	2	8	1272230	1272237	75 %	25 %	0 %	0 %	116628116
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19350	NC_008532	TTC	2	6	1272423	1272428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628116
19351	NC_008532	CATA	2	8	1272446	1272453	50 %	25 %	0 %	25 %	116628116
19352	NC_008532	TGTAA	2	10	1272468	1272477	40 %	40 %	20 %	0 %	116628116
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19354	NC_008532	TCA	2	6	1272778	1272783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628116
19355	NC_008532	CA	3	6	1272782	1272787	50 %	0 %	0 %	50 %	116628116
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19470	NC_008532	AGA	2	6	1278937	1278942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628120
19471	NC_008532	AAC	2	6	1279013	1279018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628120
19472	NC_008532	TGC	2	6	1279027	1279032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628120
19473	NC_008532	TTGC	2	8	1279276	1279283	0 %	50 %	25 %	25 %	116628120
19474	NC_008532	GAT	2	6	1279367	1279372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628120
19475	NC_008532	TTC	2	6	1279379	1279384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628120
19476	NC_008532	TCAA	2	8	1279443	1279450	50 %	25 %	0 %	25 %	116628120
19477	NC_008532	CCAA	2	8	1279488	1279495	50 %	0 %	0 %	50 %	116628120
19478	NC_008532	TTTG	2	8	1279505	1279512	0 %	75 %	25 %	0 %	116628120
19479	NC_008532	CTT	2	6	1279603	1279608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628120
19480	NC_008532	ACC	2	6	1279632	1279637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628121
19481	NC_008532	CTT	2	6	1279679	1279684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628121
19482	NC_008532	T	6	6	1279704	1279709	0 %	100 %	0 %	0 %	116628121
19483	NC_008532	CTTTGT	2	12	1279721	1279732	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116628121
19484	NC_008532	CACC	2	8	1279750	1279757	25 %	0 %	0 %	75 %	116628121
19485	NC_008532	CTT	2	6	1279793	1279798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628121
19486	NC_008532	TG	4	8	1279809	1279816	0 %	50 %	50 %	0 %	116628121
19487	NC_008532	CTG	2	6	1280078	1280083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628121
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19489	NC_008532	ACG	2	6	1280130	1280135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628121
19490	NC_008532	ATG	2	6	1280149	1280154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628121
19491	NC_008532	GTTT	2	8	1280299	1280306	0 %	75 %	25 %	0 %	116628121
19492	NC_008532	CAA	2	6	1280357	1280362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628121
19493	NC_008532	CAAT	2	8	1280369	1280376	50 %	25 %	0 %	25 %	116628121
19494	NC_008532	GAT	4	12	1280386	1280397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628121
19495	NC_008532	AATC	2	8	1280450	1280457	50 %	25 %	0 %	25 %	116628121
19496	NC_008532	CTT	2	6	1280468	1280473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628121
19497	NC_008532	GAA	2	6	1280483	1280488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628121
19498	NC_008532	GAT	2	6	1280553	1280558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628121
19499	NC_008532	GAA	2	6	1280583	1280588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628121
19500	NC_008532	TCA	2	6	1280602	1280607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628121

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