MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_008532	CTC	3	9	1215665	1215673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628065
18502	NC_008532	ATG	2	6	1215813	1215818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628065
18503	NC_008532	GAA	2	6	1215853	1215858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628065
18504	NC_008532	CTG	2	6	1215862	1215867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628065
18505	NC_008532	A	6	6	1215879	1215884	100 %	0 %	0 %	0 %	116628065
18506	NC_008532	CAAA	2	8	1215886	1215893	75 %	0 %	0 %	25 %	116628065
18507	NC_008532	GAT	2	6	1215899	1215904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628065
18508	NC_008532	CAT	2	6	1215977	1215982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628065
18509	NC_008532	CTT	2	6	1216047	1216052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628066
18510	NC_008532	AG	4	8	1216074	1216081	50 %	0 %	50 %	0 %	116628066
18511	NC_008532	ATC	2	6	1216086	1216091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628066
18512	NC_008532	AAG	2	6	1216096	1216101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628066
18513	NC_008532	ATTC	2	8	1216184	1216191	25 %	50 %	0 %	25 %	116628066
18514	NC_008532	AT	3	6	1216258	1216263	50 %	50 %	0 %	0 %	116628066
18515	NC_008532	GTC	2	6	1216362	1216367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628066
18516	NC_008532	CCCA	2	8	1216368	1216375	25 %	0 %	0 %	75 %	116628066
18517	NC_008532	ATTG	2	8	1216377	1216384	25 %	50 %	25 %	0 %	116628066
18518	NC_008532	ATA	2	6	1216426	1216431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628066
18519	NC_008532	TTC	2	6	1216518	1216523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628066
18520	NC_008532	ATA	2	6	1216538	1216543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628066
18521	NC_008532	CAA	2	6	1216559	1216564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628066
18522	NC_008532	AAC	2	6	1216566	1216571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628066
18523	NC_008532	TTG	2	6	1216605	1216610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628066
18524	NC_008532	TCG	2	6	1216621	1216626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628066
18525	NC_008532	TAA	2	6	1216635	1216640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628066
18526	NC_008532	TC	3	6	1219086	1219091	0 %	50 %	0 %	50 %	116628067
18527	NC_008532	TTC	2	6	1219110	1219115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628067
18528	NC_008532	T	7	7	1219247	1219253	0 %	100 %	0 %	0 %	116628067
18529	NC_008532	CTT	2	6	1219256	1219261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628067
18530	NC_008532	ATT	2	6	1219491	1219496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628067
18531	NC_008532	TTC	2	6	1219596	1219601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628067
18532	NC_008532	G	6	6	1219643	1219648	0 %	0 %	100 %	0 %	116628067
18533	NC_008532	A	6	6	1219750	1219755	100 %	0 %	0 %	0 %	116628067
18534	NC_008532	TGG	2	6	1219811	1219816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628067
18535	NC_008532	TCT	2	6	1219840	1219845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628067
18536	NC_008532	ATCC	2	8	1219873	1219880	25 %	25 %	0 %	50 %	116628067
18537	NC_008532	TCA	2	6	1219895	1219900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628067
18538	NC_008532	GGC	2	6	1219901	1219906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116628067
18539	NC_008532	ATT	2	6	1219968	1219973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628067
18540	NC_008532	TTCT	2	8	1220067	1220074	0 %	75 %	0 %	25 %	116628067
18541	NC_008532	CTT	2	6	1220162	1220167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628067
18542	NC_008532	TCT	2	6	1220288	1220293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628067
18543	NC_008532	CAT	2	6	1220412	1220417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628067
18544	NC_008532	AAGT	2	8	1220800	1220807	50 %	25 %	25 %	0 %	116628068
18545	NC_008532	CTT	2	6	1220817	1220822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628068
18546	NC_008532	C	7	7	1220881	1220887	0 %	0 %	0 %	100 %	116628068
18547	NC_008532	TCT	2	6	1220978	1220983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628068
18548	NC_008532	GA	3	6	1221015	1221020	50 %	0 %	50 %	0 %	116628068
18549	NC_008532	GCCA	2	8	1221027	1221034	25 %	0 %	25 %	50 %	116628068
18550	NC_008532	AG	3	6	1221066	1221071	50 %	0 %	50 %	0 %	116628068
18551	NC_008532	GTTCT	2	10	1221141	1221150	0 %	60 %	20 %	20 %	116628068
18552	NC_008532	ACTT	2	8	1221187	1221194	25 %	50 %	0 %	25 %	116628068
18553	NC_008532	TCC	2	6	1221200	1221205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628068
18554	NC_008532	TTC	2	6	1221287	1221292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628068
18555	NC_008532	CAG	2	6	1221318	1221323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628068
18556	NC_008532	CAA	2	6	1221343	1221348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628068
18557	NC_008532	GAT	2	6	1221403	1221408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628068
18558	NC_008532	CAT	2	6	1221462	1221467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628068
18559	NC_008532	TGTT	2	8	1221473	1221480	0 %	75 %	25 %	0 %	116628068
18560	NC_008532	TGA	2	6	1221495	1221500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628068
18561	NC_008532	A	6	6	1221506	1221511	100 %	0 %	0 %	0 %	116628068
18562	NC_008532	TC	3	6	1221522	1221527	0 %	50 %	0 %	50 %	116628068
18563	NC_008532	CAT	2	6	1221546	1221551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628068
18564	NC_008532	CTGA	2	8	1221583	1221590	25 %	25 %	25 %	25 %	116628068
18565	NC_008532	GTC	2	6	1221605	1221610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628068
18566	NC_008532	ACT	2	6	1221613	1221618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628068
18567	NC_008532	AC	3	6	1221648	1221653	50 %	0 %	0 %	50 %	116628068
18568	NC_008532	GA	3	6	1221663	1221668	50 %	0 %	50 %	0 %	116628068
18569	NC_008532	CCA	2	6	1221695	1221700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628068
18570	NC_008532	AGAT	2	8	1221704	1221711	50 %	25 %	25 %	0 %	116628068
18571	NC_008532	ATT	2	6	1221718	1221723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628068
18572	NC_008532	GA	3	6	1221917	1221922	50 %	0 %	50 %	0 %	116628069
18573	NC_008532	GGAA	2	8	1221978	1221985	50 %	0 %	50 %	0 %	116628069
18574	NC_008532	ATG	2	6	1221990	1221995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628069
18575	NC_008532	ACTG	2	8	1222018	1222025	25 %	25 %	25 %	25 %	116628069
18576	NC_008532	TTA	2	6	1222104	1222109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628069
18577	NC_008532	AATTGT	2	12	1222127	1222138	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116628069
18578	NC_008532	GTACTG	2	12	1222159	1222170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116628069
18579	NC_008532	ATT	2	6	1222184	1222189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628069
18580	NC_008532	TTA	2	6	1222269	1222274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628069
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18582	NC_008532	CTG	2	6	1222396	1222401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628069
18583	NC_008532	T	6	6	1222538	1222543	0 %	100 %	0 %	0 %	116628069
18584	NC_008532	ATTG	2	8	1222558	1222565	25 %	50 %	25 %	0 %	116628069
18585	NC_008532	TAC	2	6	1222571	1222576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628069
18586	NC_008532	CCA	2	6	1222579	1222584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628069
18587	NC_008532	TG	3	6	1222680	1222685	0 %	50 %	50 %	0 %	116628069
18588	NC_008532	ACC	2	6	1222691	1222696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628069
18589	NC_008532	TGC	2	6	1222901	1222906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628069
18590	NC_008532	T	6	6	1222984	1222989	0 %	100 %	0 %	0 %	116628069
18591	NC_008532	AT	3	6	1223004	1223009	50 %	50 %	0 %	0 %	116628069
18592	NC_008532	AAT	2	6	1223030	1223035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628069
18593	NC_008532	GAA	2	6	1223150	1223155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628069
18594	NC_008532	CCT	2	6	1223184	1223189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628069
18595	NC_008532	T	7	7	1223189	1223195	0 %	100 %	0 %	0 %	116628069
18596	NC_008532	ACTG	2	8	1224317	1224324	25 %	25 %	25 %	25 %	116628070
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18599	NC_008532	TGA	2	6	1224410	1224415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628070
18600	NC_008532	A	6	6	1224444	1224449	100 %	0 %	0 %	0 %	116628070
18601	NC_008532	GA	3	6	1225429	1225434	50 %	0 %	50 %	0 %	116628071
18602	NC_008532	GAT	2	6	1225440	1225445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628071
18603	NC_008532	GAA	2	6	1225517	1225522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628071
18604	NC_008532	AAAGA	2	10	1225594	1225603	80 %	0 %	20 %	0 %	116628071
18605	NC_008532	TGA	2	6	1225608	1225613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628071
18606	NC_008532	GAA	2	6	1225694	1225699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628071
18607	NC_008532	ATAC	2	8	1225753	1225760	50 %	25 %	0 %	25 %	116628071
18608	NC_008532	AC	3	6	1225811	1225816	50 %	0 %	0 %	50 %	116628071
18609	NC_008532	TCG	2	6	1225846	1225851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628071
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18611	NC_008532	GA	3	6	1226025	1226030	50 %	0 %	50 %	0 %	116628071
18612	NC_008532	CCA	2	6	1226056	1226061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628071
18613	NC_008532	ACT	2	6	1226164	1226169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628071
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18616	NC_008532	AAG	2	6	1226432	1226437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628071
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18618	NC_008532	GGAT	2	8	1226466	1226473	25 %	25 %	50 %	0 %	116628071
18619	NC_008532	CA	3	6	1226514	1226519	50 %	0 %	0 %	50 %	116628071
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18622	NC_008532	CTG	2	6	1227187	1227192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628072
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18732	NC_008532	C	6	6	1233176	1233181	0 %	0 %	0 %	100 %	116628078
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