MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_008532	TCAA	2	8	1184164	1184171	50 %	25 %	0 %	25 %	116628033
18003	NC_008532	CAT	2	6	1184183	1184188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628033
18004	NC_008532	ATCC	2	8	1184198	1184205	25 %	25 %	0 %	50 %	116628033
18005	NC_008532	TTCAA	2	10	1184609	1184618	40 %	40 %	0 %	20 %	116628034
18006	NC_008532	AGC	2	6	1184689	1184694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628034
18007	NC_008532	GAG	2	6	1184701	1184706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628034
18008	NC_008532	AAC	2	6	1184716	1184721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628034
18009	NC_008532	TGC	2	6	1184857	1184862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628034
18010	NC_008532	TCA	2	6	1184879	1184884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628034
18011	NC_008532	CTT	2	6	1184895	1184900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628034
18012	NC_008532	AGAC	2	8	1184913	1184920	50 %	0 %	25 %	25 %	116628034
18013	NC_008532	TGAG	2	8	1184923	1184930	25 %	25 %	50 %	0 %	116628034
18014	NC_008532	TTC	2	6	1185019	1185024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628034
18015	NC_008532	CTT	2	6	1185091	1185096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628034
18016	NC_008532	CCA	2	6	1185101	1185106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628034
18017	NC_008532	CTT	2	6	1185159	1185164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628034
18018	NC_008532	GAT	2	6	1185232	1185237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628034
18019	NC_008532	CCA	2	6	1185276	1185281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628034
18020	NC_008532	ATA	2	6	1185314	1185319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628034
18021	NC_008532	ACT	2	6	1185410	1185415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628034
18022	NC_008532	CCA	2	6	1185461	1185466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628034
18023	NC_008532	CGT	2	6	1185508	1185513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628034
18024	NC_008532	TTC	2	6	1185514	1185519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628034
18025	NC_008532	GTG	2	6	1185603	1185608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628034
18026	NC_008532	TTC	2	6	1185610	1185615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628034
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18028	NC_008532	AAT	2	6	1186072	1186077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628035
18029	NC_008532	TTA	2	6	1186131	1186136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628035
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18031	NC_008532	ATA	2	6	1186287	1186292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628035
18032	NC_008532	CCA	2	6	1186316	1186321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628035
18033	NC_008532	CTT	3	9	1186376	1186384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628035
18034	NC_008532	AT	3	6	1186407	1186412	50 %	50 %	0 %	0 %	116628035
18035	NC_008532	TGC	2	6	1186431	1186436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628035
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18038	NC_008532	CT	3	6	1186493	1186498	0 %	50 %	0 %	50 %	116628035
18039	NC_008532	T	7	7	1186519	1186525	0 %	100 %	0 %	0 %	116628035
18040	NC_008532	CATG	2	8	1186929	1186936	25 %	25 %	25 %	25 %	116628036
18041	NC_008532	TTCA	2	8	1187056	1187063	25 %	50 %	0 %	25 %	116628036
18042	NC_008532	GATA	2	8	1187064	1187071	50 %	25 %	25 %	0 %	116628036
18043	NC_008532	GTC	2	6	1187081	1187086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628036
18044	NC_008532	TAG	2	6	1187108	1187113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628036
18045	NC_008532	GCATAA	2	12	1187120	1187131	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116628036
18046	NC_008532	CTA	2	6	1187157	1187162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628036
18047	NC_008532	TCT	2	6	1187247	1187252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628036
18048	NC_008532	AT	3	6	1187266	1187271	50 %	50 %	0 %	0 %	116628036
18049	NC_008532	ATC	2	6	1187318	1187323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628036
18050	NC_008532	TCA	2	6	1188211	1188216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628037
18051	NC_008532	TCA	2	6	1188235	1188240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628037
18052	NC_008532	CT	3	6	1188276	1188281	0 %	50 %	0 %	50 %	116628037
18053	NC_008532	GAA	2	6	1188512	1188517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628038
18054	NC_008532	ATG	2	6	1188547	1188552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628038
18055	NC_008532	ACA	2	6	1188587	1188592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628038
18056	NC_008532	CTA	2	6	1188596	1188601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628038
18057	NC_008532	CAG	2	6	1188670	1188675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628038
18058	NC_008532	GTA	2	6	1188682	1188687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628038
18059	NC_008532	GTA	2	6	1188700	1188705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628038
18060	NC_008532	ATG	2	6	1188734	1188739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628038
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18062	NC_008532	TAA	2	6	1188784	1188789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628038
18063	NC_008532	ATAAG	2	10	1188803	1188812	60 %	20 %	20 %	0 %	116628038
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18067	NC_008532	CAT	2	6	1189278	1189283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628038
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18083	NC_008532	GATA	2	8	1190375	1190382	50 %	25 %	25 %	0 %	116628039
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18089	NC_008532	ATG	2	6	1190628	1190633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628039
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18101	NC_008532	T	6	6	1191687	1191692	0 %	100 %	0 %	0 %	116628039
18102	NC_008532	ATAA	2	8	1191713	1191720	75 %	25 %	0 %	0 %	116628039
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18105	NC_008532	CAG	2	6	1191996	1192001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628040
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18108	NC_008532	CACC	2	8	1192095	1192102	25 %	0 %	0 %	75 %	116628040
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18113	NC_008532	A	6	6	1192271	1192276	100 %	0 %	0 %	0 %	116628040
18114	NC_008532	CTT	2	6	1192311	1192316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628040
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18354	NC_008532	GTT	2	6	1207432	1207437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628056
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18467	NC_008532	T	6	6	1213519	1213524	0 %	100 %	0 %	0 %	116628063
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18470	NC_008532	AAACC	2	10	1213662	1213671	60 %	0 %	0 %	40 %	116628063
18471	NC_008532	GAA	2	6	1213695	1213700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628063
18472	NC_008532	ATC	2	6	1213769	1213774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628063
18473	NC_008532	AAT	2	6	1213885	1213890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628063
18474	NC_008532	ATA	2	6	1214041	1214046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628063
18475	NC_008532	T	6	6	1214057	1214062	0 %	100 %	0 %	0 %	116628063
18476	NC_008532	AAACA	2	10	1214216	1214225	80 %	0 %	0 %	20 %	116628064
18477	NC_008532	GGC	2	6	1214240	1214245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116628064
18478	NC_008532	TGAG	2	8	1214252	1214259	25 %	25 %	50 %	0 %	116628064
18479	NC_008532	TGA	2	6	1214380	1214385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628064
18480	NC_008532	GAC	2	6	1214470	1214475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628064
18481	NC_008532	TCA	2	6	1214494	1214499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628064
18482	NC_008532	ACG	2	6	1214606	1214611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628064
18483	NC_008532	CTG	2	6	1214674	1214679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628064
18484	NC_008532	T	7	7	1214830	1214836	0 %	100 %	0 %	0 %	116628064
18485	NC_008532	ATA	2	6	1214862	1214867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628064
18486	NC_008532	TTA	2	6	1215005	1215010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628065
18487	NC_008532	AATG	2	8	1215037	1215044	50 %	25 %	25 %	0 %	116628065
18488	NC_008532	CTAATA	2	12	1215075	1215086	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116628065
18489	NC_008532	GAC	2	6	1215138	1215143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628065
18490	NC_008532	TAT	2	6	1215244	1215249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628065
18491	NC_008532	CCA	2	6	1215270	1215275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628065
18492	NC_008532	ATG	2	6	1215315	1215320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628065
18493	NC_008532	AAAGA	2	10	1215395	1215404	80 %	0 %	20 %	0 %	116628065
18494	NC_008532	CTT	2	6	1215421	1215426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628065
18495	NC_008532	ATC	2	6	1215464	1215469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628065
18496	NC_008532	AG	3	6	1215544	1215549	50 %	0 %	50 %	0 %	116628065
18497	NC_008532	AAT	2	6	1215582	1215587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628065
18498	NC_008532	GCT	2	6	1215594	1215599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628065
18499	NC_008532	TTGAT	2	10	1215609	1215618	20 %	60 %	20 %	0 %	116628065
18500	NC_008532	TAG	2	6	1215633	1215638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628065

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