MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_008532	ATC	2	6	1151865	1151870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628011
17503	NC_008532	AGT	2	6	1151946	1151951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628011
17504	NC_008532	TCA	2	6	1152046	1152051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628011
17505	NC_008532	ATA	2	6	1152061	1152066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628011
17506	NC_008532	TCT	2	6	1152067	1152072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628011
17507	NC_008532	GTC	2	6	1152093	1152098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628011
17508	NC_008532	CAA	2	6	1152155	1152160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628011
17509	NC_008532	TGG	2	6	1152165	1152170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628011
17510	NC_008532	GCTA	2	8	1152171	1152178	25 %	25 %	25 %	25 %	116628011
17511	NC_008532	CGT	2	6	1152315	1152320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628011
17512	NC_008532	AAC	2	6	1152396	1152401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628011
17513	NC_008532	T	6	6	1152465	1152470	0 %	100 %	0 %	0 %	116628011
17514	NC_008532	GCC	2	6	1152484	1152489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628011
17515	NC_008532	ATG	2	6	1152521	1152526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628011
17516	NC_008532	T	6	6	1152596	1152601	0 %	100 %	0 %	0 %	116628011
17517	NC_008532	CTT	2	6	1152609	1152614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628011
17518	NC_008532	TCCAA	2	10	1152616	1152625	40 %	20 %	0 %	40 %	116628011
17519	NC_008532	CAA	2	6	1152752	1152757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628011
17520	NC_008532	CTT	2	6	1152773	1152778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628011
17521	NC_008532	GAT	2	6	1152797	1152802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628011
17522	NC_008532	TCA	2	6	1152841	1152846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628011
17523	NC_008532	TCA	2	6	1152880	1152885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628011
17524	NC_008532	CAA	2	6	1152998	1153003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628011
17525	NC_008532	GCT	2	6	1153135	1153140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628011
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17527	NC_008532	CCCAG	2	10	1153163	1153172	20 %	0 %	20 %	60 %	116628011
17528	NC_008532	ATC	2	6	1153189	1153194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628011
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17530	NC_008532	TAG	2	6	1153233	1153238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628011
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17532	NC_008532	ATA	2	6	1153291	1153296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628011
17533	NC_008532	TGG	2	6	1153305	1153310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628011
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17538	NC_008532	ATCAG	2	10	1153627	1153636	40 %	20 %	20 %	20 %	116628011
17539	NC_008532	T	7	7	1153668	1153674	0 %	100 %	0 %	0 %	116628011
17540	NC_008532	GGA	2	6	1153676	1153681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628011
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17542	NC_008532	TTC	2	6	1153716	1153721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628011
17543	NC_008532	CAT	2	6	1153730	1153735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628011
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17547	NC_008532	A	7	7	1154199	1154205	100 %	0 %	0 %	0 %	116628012
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17551	NC_008532	A	6	6	1154261	1154266	100 %	0 %	0 %	0 %	116628012
17552	NC_008532	CTG	2	6	1154294	1154299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628012
17553	NC_008532	TAT	2	6	1154453	1154458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628013
17554	NC_008532	A	6	6	1154465	1154470	100 %	0 %	0 %	0 %	116628013
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17558	NC_008532	TTGA	2	8	1154634	1154641	25 %	50 %	25 %	0 %	116628013
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17567	NC_008532	AAGA	2	8	1155255	1155262	75 %	0 %	25 %	0 %	116628013
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17572	NC_008532	AT	3	6	1155530	1155535	50 %	50 %	0 %	0 %	116628013
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17596	NC_008532	CCTT	2	8	1157247	1157254	0 %	50 %	0 %	50 %	116628014
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17612	NC_008532	GATT	2	8	1159762	1159769	25 %	50 %	25 %	0 %	116628015
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17616	NC_008532	AAT	2	6	1160020	1160025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628015
17617	NC_008532	TGC	2	6	1160066	1160071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628015
17618	NC_008532	GCA	2	6	1160109	1160114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628015
17619	NC_008532	GAA	2	6	1160211	1160216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628015
17620	NC_008532	ATC	2	6	1160234	1160239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628015
17621	NC_008532	CTA	2	6	1160301	1160306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628015
17622	NC_008532	TCA	2	6	1160391	1160396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628015
17623	NC_008532	GCT	2	6	1160424	1160429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628015
17624	NC_008532	AGC	2	6	1160432	1160437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628015
17625	NC_008532	ATGT	2	8	1160502	1160509	25 %	50 %	25 %	0 %	116628015
17626	NC_008532	AAAG	2	8	1160656	1160663	75 %	0 %	25 %	0 %	116628016
17627	NC_008532	AGAC	2	8	1160797	1160804	50 %	0 %	25 %	25 %	116628016
17628	NC_008532	TGG	2	6	1160809	1160814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628016
17629	NC_008532	CAC	2	6	1160868	1160873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628016
17630	NC_008532	TTA	2	6	1160942	1160947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628016
17631	NC_008532	ATG	2	6	1160995	1161000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628016
17632	NC_008532	ATTG	2	8	1161066	1161073	25 %	50 %	25 %	0 %	116628017
17633	NC_008532	TCA	2	6	1161218	1161223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628017
17634	NC_008532	GTTG	2	8	1161239	1161246	0 %	50 %	50 %	0 %	116628017
17635	NC_008532	T	6	6	1161317	1161322	0 %	100 %	0 %	0 %	116628017
17636	NC_008532	AAT	2	6	1161393	1161398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628017
17637	NC_008532	CCA	2	6	1161515	1161520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628017
17638	NC_008532	GACT	2	8	1161559	1161566	25 %	25 %	25 %	25 %	116628017
17639	NC_008532	CTTA	2	8	1161646	1161653	25 %	50 %	0 %	25 %	116628017
17640	NC_008532	TTA	2	6	1161662	1161667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628017
17641	NC_008532	TTA	2	6	1161701	1161706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628017
17642	NC_008532	CAA	2	6	1161723	1161728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628017
17643	NC_008532	AAC	2	6	1161736	1161741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628017
17644	NC_008532	TTC	2	6	1161858	1161863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628018
17645	NC_008532	CAAAG	2	10	1161873	1161882	60 %	0 %	20 %	20 %	116628018
17646	NC_008532	ATC	2	6	1161900	1161905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628018
17647	NC_008532	GA	3	6	1161947	1161952	50 %	0 %	50 %	0 %	116628018
17648	NC_008532	ATA	2	6	1161973	1161978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628018
17649	NC_008532	ATA	2	6	1162000	1162005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628018
17650	NC_008532	TCA	2	6	1162009	1162014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628018
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17652	NC_008532	CTT	2	6	1162157	1162162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628018
17653	NC_008532	GCT	2	6	1162177	1162182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628018
17654	NC_008532	CAG	2	6	1162229	1162234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628018
17655	NC_008532	AAT	3	9	1162299	1162307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628018
17656	NC_008532	TTC	2	6	1162308	1162313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628018
17657	NC_008532	AAG	2	6	1162327	1162332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628018
17658	NC_008532	TCA	2	6	1162345	1162350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628018
17659	NC_008532	CTT	2	6	1162406	1162411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628018
17660	NC_008532	TCG	2	6	1162471	1162476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628018
17661	NC_008532	TTG	2	6	1162606	1162611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628018
17662	NC_008532	TAAAG	2	10	1162616	1162625	60 %	20 %	20 %	0 %	116628018
17663	NC_008532	TTG	2	6	1162640	1162645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628018
17664	NC_008532	GTC	2	6	1162665	1162670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628018
17665	NC_008532	AT	3	6	1162747	1162752	50 %	50 %	0 %	0 %	116628018
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17668	NC_008532	AAC	2	6	1162815	1162820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628018
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17670	NC_008532	TGA	2	6	1162889	1162894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628018
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17680	NC_008532	ACG	2	6	1163367	1163372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628018
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17727	NC_008532	AAG	2	6	1165640	1165645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628020
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17731	NC_008532	ATAG	2	8	1165921	1165928	50 %	25 %	25 %	0 %	116628020
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