MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_008532	AACA	2	8	1122846	1122853	75 %	0 %	0 %	25 %	116627985
17002	NC_008532	CTTAT	2	10	1123049	1123058	20 %	60 %	0 %	20 %	116627986
17003	NC_008532	CTT	2	6	1123076	1123081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627986
17004	NC_008532	GAT	2	6	1123103	1123108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627986
17005	NC_008532	AAT	2	6	1123127	1123132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627986
17006	NC_008532	TAC	2	6	1123138	1123143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627986
17007	NC_008532	TACAAA	2	12	1123154	1123165	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116627986
17008	NC_008532	TCG	2	6	1123182	1123187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627986
17009	NC_008532	TAT	2	6	1123273	1123278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627986
17010	NC_008532	CTC	2	6	1123279	1123284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627986
17011	NC_008532	TGAT	2	8	1123289	1123296	25 %	50 %	25 %	0 %	116627986
17012	NC_008532	ATC	2	6	1123340	1123345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627986
17013	NC_008532	ACC	2	6	1123814	1123819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627987
17014	NC_008532	GTTT	2	8	1123823	1123830	0 %	75 %	25 %	0 %	116627987
17015	NC_008532	GAA	2	6	1123836	1123841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627987
17016	NC_008532	A	7	7	1123845	1123851	100 %	0 %	0 %	0 %	116627987
17017	NC_008532	TTG	2	6	1123860	1123865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627987
17018	NC_008532	AAG	2	6	1123873	1123878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627987
17019	NC_008532	TCT	2	6	1123905	1123910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627987
17020	NC_008532	GCT	2	6	1123941	1123946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627987
17021	NC_008532	ATTTG	2	10	1123979	1123988	20 %	60 %	20 %	0 %	116627987
17022	NC_008532	CTT	2	6	1124001	1124006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627987
17023	NC_008532	GTT	2	6	1124023	1124028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627987
17024	NC_008532	CTTC	2	8	1124045	1124052	0 %	50 %	0 %	50 %	116627987
17025	NC_008532	ATT	2	6	1124217	1124222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627988
17026	NC_008532	CTT	2	6	1124229	1124234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627988
17027	NC_008532	CTT	2	6	1124262	1124267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627988
17028	NC_008532	CCA	2	6	1124278	1124283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627988
17029	NC_008532	TTC	2	6	1124314	1124319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627988
17030	NC_008532	TTC	2	6	1124362	1124367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627988
17031	NC_008532	TTG	2	6	1124376	1124381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627988
17032	NC_008532	T	6	6	1124454	1124459	0 %	100 %	0 %	0 %	116627988
17033	NC_008532	TTG	2	6	1124483	1124488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627988
17034	NC_008532	AAGT	2	8	1124513	1124520	50 %	25 %	25 %	0 %	116627988
17035	NC_008532	GTT	2	6	1124692	1124697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627988
17036	NC_008532	TTG	2	6	1124712	1124717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627988
17037	NC_008532	GAAC	2	8	1124732	1124739	50 %	0 %	25 %	25 %	116627988
17038	NC_008532	AGC	2	6	1124764	1124769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627988
17039	NC_008532	TGA	2	6	1124776	1124781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627988
17040	NC_008532	TGA	2	6	1124788	1124793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627988
17041	NC_008532	CTG	2	6	1124811	1124816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627988
17042	NC_008532	TGG	2	6	1124900	1124905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627988
17043	NC_008532	AGC	2	6	1124926	1124931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627988
17044	NC_008532	GT	3	6	1124940	1124945	0 %	50 %	50 %	0 %	116627988
17045	NC_008532	AGC	2	6	1125043	1125048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627988
17046	NC_008532	TCAGCA	2	12	1125065	1125076	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116627988
17047	NC_008532	CAA	2	6	1125084	1125089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627988
17048	NC_008532	TTC	2	6	1125115	1125120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627988
17049	NC_008532	GAT	2	6	1125180	1125185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627988
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17051	NC_008532	ACG	2	6	1125239	1125244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627988
17052	NC_008532	T	6	6	1125264	1125269	0 %	100 %	0 %	0 %	116627988
17053	NC_008532	TCT	2	6	1125700	1125705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627989
17054	NC_008532	TCC	2	6	1125769	1125774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627989
17055	NC_008532	AGT	2	6	1125851	1125856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627989
17056	NC_008532	GTT	2	6	1126098	1126103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627989
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17058	NC_008532	AACC	2	8	1126180	1126187	50 %	0 %	0 %	50 %	116627989
17059	NC_008532	CAAG	2	8	1126220	1126227	50 %	0 %	25 %	25 %	116627989
17060	NC_008532	A	6	6	1126269	1126274	100 %	0 %	0 %	0 %	116627989
17061	NC_008532	ATTC	2	8	1126324	1126331	25 %	50 %	0 %	25 %	116627990
17062	NC_008532	AGC	2	6	1126454	1126459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627990
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17065	NC_008532	TCAAC	2	10	1126513	1126522	40 %	20 %	0 %	40 %	116627990
17066	NC_008532	TAAG	2	8	1126541	1126548	50 %	25 %	25 %	0 %	116627990
17067	NC_008532	CAT	2	6	1126618	1126623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627990
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17069	NC_008532	ATC	3	9	1126703	1126711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627990
17070	NC_008532	CAA	2	6	1126717	1126722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627990
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17072	NC_008532	TCA	2	6	1126857	1126862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627990
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17082	NC_008532	AAAG	2	8	1127561	1127568	75 %	0 %	25 %	0 %	116627991
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17089	NC_008532	TCAA	2	8	1128009	1128016	50 %	25 %	0 %	25 %	116627991
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17093	NC_008532	AAT	2	6	1128128	1128133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627991
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17101	NC_008532	TAA	2	6	1129563	1129568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627992
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17103	NC_008532	GACTT	2	10	1129716	1129725	20 %	40 %	20 %	20 %	116627992
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17107	NC_008532	GAC	2	6	1129941	1129946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627992
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17112	NC_008532	CAA	2	6	1130426	1130431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627993
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17469	NC_008532	TCTT	2	8	1150350	1150357	0 %	75 %	0 %	25 %	116628010
17470	NC_008532	T	6	6	1150387	1150392	0 %	100 %	0 %	0 %	116628010
17471	NC_008532	CTT	2	6	1150447	1150452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628010
17472	NC_008532	CGC	2	6	1150565	1150570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116628010
17473	NC_008532	ATTCA	2	10	1150583	1150592	40 %	40 %	0 %	20 %	116628010
17474	NC_008532	GAA	2	6	1150603	1150608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628010
17475	NC_008532	ATTTCA	2	12	1150632	1150643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116628010
17476	NC_008532	TGA	2	6	1150747	1150752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628010
17477	NC_008532	TA	3	6	1150828	1150833	50 %	50 %	0 %	0 %	116628010
17478	NC_008532	GAA	2	6	1150858	1150863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628010
17479	NC_008532	CAG	2	6	1150997	1151002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628010
17480	NC_008532	TTA	2	6	1151028	1151033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628010
17481	NC_008532	ATATC	2	10	1151049	1151058	40 %	40 %	0 %	20 %	116628010
17482	NC_008532	TCA	2	6	1151076	1151081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628010
17483	NC_008532	ATA	2	6	1151082	1151087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628010
17484	NC_008532	TGT	2	6	1151141	1151146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628010
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17488	NC_008532	TAA	2	6	1151288	1151293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628011
17489	NC_008532	CAT	2	6	1151294	1151299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628011
17490	NC_008532	CAT	2	6	1151403	1151408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628011
17491	NC_008532	TAC	2	6	1151451	1151456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628011
17492	NC_008532	CCATA	2	10	1151507	1151516	40 %	20 %	0 %	40 %	116628011
17493	NC_008532	CTT	2	6	1151552	1151557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628011
17494	NC_008532	AGC	2	6	1151568	1151573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628011
17495	NC_008532	AT	3	6	1151577	1151582	50 %	50 %	0 %	0 %	116628011
17496	NC_008532	CCA	2	6	1151614	1151619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628011
17497	NC_008532	CAT	2	6	1151673	1151678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628011
17498	NC_008532	ACG	2	6	1151694	1151699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628011
17499	NC_008532	TGC	2	6	1151754	1151759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628011
17500	NC_008532	TGT	2	6	1151802	1151807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628011

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