MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_008532	GCT	2	6	1061360	1061365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627919
16003	NC_008532	CAA	2	6	1061394	1061399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627919
16004	NC_008532	CAT	2	6	1061415	1061420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627919
16005	NC_008532	AGC	2	6	1061479	1061484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627919
16006	NC_008532	GTC	2	6	1061570	1061575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627919
16007	NC_008532	GTT	2	6	1061683	1061688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627919
16008	NC_008532	ATA	2	6	1061692	1061697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627919
16009	NC_008532	AGA	2	6	1061793	1061798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627919
16010	NC_008532	AAT	2	6	1061807	1061812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627919
16011	NC_008532	T	6	6	1061812	1061817	0 %	100 %	0 %	0 %	116627919
16012	NC_008532	TTC	2	6	1061952	1061957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627920
16013	NC_008532	GTT	2	6	1061999	1062004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627920
16014	NC_008532	AAT	2	6	1062011	1062016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627920
16015	NC_008532	A	6	6	1062132	1062137	100 %	0 %	0 %	0 %	116627920
16016	NC_008532	TGC	2	6	1062181	1062186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627920
16017	NC_008532	TTCC	2	8	1062197	1062204	0 %	50 %	0 %	50 %	116627920
16018	NC_008532	ATC	2	6	1062259	1062264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627920
16019	NC_008532	GCAA	2	8	1062303	1062310	50 %	0 %	25 %	25 %	116627920
16020	NC_008532	CTT	2	6	1062387	1062392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627920
16021	NC_008532	A	6	6	1062406	1062411	100 %	0 %	0 %	0 %	116627920
16022	NC_008532	CCAT	2	8	1062483	1062490	25 %	25 %	0 %	50 %	116627920
16023	NC_008532	GAA	2	6	1062530	1062535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627920
16024	NC_008532	C	6	6	1062577	1062582	0 %	0 %	0 %	100 %	116627920
16025	NC_008532	GAA	2	6	1062590	1062595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627920
16026	NC_008532	GATA	2	8	1062653	1062660	50 %	25 %	25 %	0 %	116627920
16027	NC_008532	AAC	2	6	1062687	1062692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627920
16028	NC_008532	TGA	2	6	1062693	1062698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627920
16029	NC_008532	A	7	7	1062711	1062717	100 %	0 %	0 %	0 %	116627920
16030	NC_008532	TTAA	2	8	1062843	1062850	50 %	50 %	0 %	0 %	116627921
16031	NC_008532	AAC	2	6	1062862	1062867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627921
16032	NC_008532	GAA	2	6	1062870	1062875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627921
16033	NC_008532	GTTTG	2	10	1062888	1062897	0 %	60 %	40 %	0 %	116627921
16034	NC_008532	CAT	2	6	1062918	1062923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627921
16035	NC_008532	CAG	2	6	1063002	1063007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627921
16036	NC_008532	ATCA	2	8	1063189	1063196	50 %	25 %	0 %	25 %	116627921
16037	NC_008532	AAG	2	6	1063225	1063230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627921
16038	NC_008532	GAA	2	6	1063377	1063382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627921
16039	NC_008532	ATC	2	6	1063445	1063450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627921
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16041	NC_008532	GCT	2	6	1063499	1063504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627921
16042	NC_008532	TTTGA	2	10	1063552	1063561	20 %	60 %	20 %	0 %	116627921
16043	NC_008532	T	6	6	1063587	1063592	0 %	100 %	0 %	0 %	116627921
16044	NC_008532	AAT	2	6	1063633	1063638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627921
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16049	NC_008532	CTTCTG	2	12	1063890	1063901	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116627921
16050	NC_008532	TGTT	2	8	1063906	1063913	0 %	75 %	25 %	0 %	116627921
16051	NC_008532	GTA	2	6	1063999	1064004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627921
16052	NC_008532	AGC	2	6	1064011	1064016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627921
16053	NC_008532	GTCC	2	8	1064059	1064066	0 %	25 %	25 %	50 %	116627921
16054	NC_008532	CAT	2	6	1064127	1064132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627921
16055	NC_008532	ATT	2	6	1064170	1064175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627921
16056	NC_008532	TTA	2	6	1064180	1064185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627921
16057	NC_008532	T	6	6	1064195	1064200	0 %	100 %	0 %	0 %	116627921
16058	NC_008532	TGA	2	6	1064230	1064235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627921
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16062	NC_008532	GTA	2	6	1064705	1064710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627922
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16065	NC_008532	TC	3	6	1064847	1064852	0 %	50 %	0 %	50 %	116627922
16066	NC_008532	TCA	2	6	1064862	1064867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627922
16067	NC_008532	AAGAGC	2	12	1064925	1064936	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116627922
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16071	NC_008532	TCAA	2	8	1065045	1065052	50 %	25 %	0 %	25 %	116627922
16072	NC_008532	CTC	2	6	1065062	1065067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627922
16073	NC_008532	TA	3	6	1065070	1065075	50 %	50 %	0 %	0 %	116627922
16074	NC_008532	GAG	2	6	1065154	1065159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627922
16075	NC_008532	CAG	2	6	1065214	1065219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627922
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16087	NC_008532	TACTGC	2	12	1066180	1066191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116627923
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16089	NC_008532	GGAA	2	8	1066203	1066210	50 %	0 %	50 %	0 %	116627923
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16099	NC_008532	GCT	2	6	1067003	1067008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627924
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16101	NC_008532	AGG	2	6	1067099	1067104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627924
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16114	NC_008532	AT	3	6	1068923	1068928	50 %	50 %	0 %	0 %	116627927
16115	NC_008532	TCCA	2	8	1068931	1068938	25 %	25 %	0 %	50 %	116627927
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16235	NC_008532	GGTCA	2	10	1076071	1076080	20 %	20 %	40 %	20 %	116627933
16236	NC_008532	TCA	2	6	1076088	1076093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627933
16237	NC_008532	GCA	2	6	1076102	1076107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627933
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16239	NC_008532	CT	3	6	1076160	1076165	0 %	50 %	0 %	50 %	116627933
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16241	NC_008532	T	7	7	1076247	1076253	0 %	100 %	0 %	0 %	116627933
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16466	NC_008532	TC	3	6	1090277	1090282	0 %	50 %	0 %	50 %	116627946
16467	NC_008532	AAT	2	6	1090329	1090334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627946
16468	NC_008532	TCC	2	6	1090371	1090376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627947
16469	NC_008532	TTC	2	6	1090379	1090384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627947
16470	NC_008532	GCT	2	6	1090419	1090424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627947
16471	NC_008532	CTGA	2	8	1090429	1090436	25 %	25 %	25 %	25 %	116627947
16472	NC_008532	TCA	3	9	1090455	1090463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627947
16473	NC_008532	TGA	2	6	1090513	1090518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627947
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16479	NC_008532	CTAC	2	8	1090605	1090612	25 %	25 %	0 %	50 %	116627947
16480	NC_008532	TTCT	2	8	1090751	1090758	0 %	75 %	0 %	25 %	116627947
16481	NC_008532	ATTTT	2	10	1090767	1090776	20 %	80 %	0 %	0 %	116627947
16482	NC_008532	TCTT	2	8	1090809	1090816	0 %	75 %	0 %	25 %	116627947
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16485	NC_008532	CTT	2	6	1090856	1090861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627948
16486	NC_008532	CAT	2	6	1090877	1090882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627948
16487	NC_008532	GAG	2	6	1090886	1090891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627948
16488	NC_008532	TCT	2	6	1090898	1090903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627948
16489	NC_008532	ACC	2	6	1090935	1090940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627948
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16491	NC_008532	GCCT	2	8	1091070	1091077	0 %	25 %	25 %	50 %	116627948
16492	NC_008532	CAA	2	6	1091099	1091104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627948
16493	NC_008532	AG	3	6	1091155	1091160	50 %	0 %	50 %	0 %	116627948
16494	NC_008532	ATG	2	6	1091186	1091191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627948
16495	NC_008532	ATC	2	6	1091259	1091264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627948
16496	NC_008532	AACT	2	8	1091280	1091287	50 %	25 %	0 %	25 %	116627948
16497	NC_008532	TCC	2	6	1091436	1091441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627948
16498	NC_008532	CAT	2	6	1091489	1091494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627948
16499	NC_008532	T	6	6	1091498	1091503	0 %	100 %	0 %	0 %	116627948
16500	NC_008532	AAC	2	6	1091541	1091546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627948

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