MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 28637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_008532	AAT	2	6	1000438	1000443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627850
15003	NC_008532	CTG	2	6	1000488	1000493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627850
15004	NC_008532	TTC	2	6	1000543	1000548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627850
15005	NC_008532	AG	3	6	1000655	1000660	50 %	0 %	50 %	0 %	116627850
15006	NC_008532	CTT	2	6	1000662	1000667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627850
15007	NC_008532	GTT	2	6	1000722	1000727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627850
15008	NC_008532	ATT	2	6	1000843	1000848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627850
15009	NC_008532	CAA	2	6	1001057	1001062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627851
15010	NC_008532	CGA	2	6	1001084	1001089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627851
15011	NC_008532	TTA	2	6	1001095	1001100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627851
15012	NC_008532	CCATT	2	10	1001102	1001111	20 %	40 %	0 %	40 %	116627851
15013	NC_008532	CAA	2	6	1001126	1001131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627851
15014	NC_008532	TTA	2	6	1001173	1001178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627851
15015	NC_008532	AAT	2	6	1001199	1001204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627851
15016	NC_008532	TTC	2	6	1001209	1001214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627851
15017	NC_008532	ATG	2	6	1001255	1001260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627851
15018	NC_008532	AAC	2	6	1001313	1001318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627851
15019	NC_008532	TCA	2	6	1001365	1001370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627851
15020	NC_008532	T	6	6	1001408	1001413	0 %	100 %	0 %	0 %	116627851
15021	NC_008532	CAC	2	6	1001426	1001431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627851
15022	NC_008532	GTTGA	2	10	1001448	1001457	20 %	40 %	40 %	0 %	116627851
15023	NC_008532	TCG	2	6	1001467	1001472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627851
15024	NC_008532	ATC	2	6	1001505	1001510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627851
15025	NC_008532	GCTT	2	8	1001542	1001549	0 %	50 %	25 %	25 %	116627851
15026	NC_008532	GTT	2	6	1001551	1001556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627851
15027	NC_008532	CGT	2	6	1001565	1001570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627851
15028	NC_008532	CTA	2	6	1001576	1001581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627851
15029	NC_008532	TCC	2	6	1001593	1001598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627851
15030	NC_008532	CGA	2	6	1001605	1001610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627851
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15032	NC_008532	CAA	2	6	1001675	1001680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627851
15033	NC_008532	CAG	2	6	1001684	1001689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627851
15034	NC_008532	T	6	6	1001707	1001712	0 %	100 %	0 %	0 %	116627851
15035	NC_008532	GGT	2	6	1002029	1002034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627852
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15037	NC_008532	A	6	6	1002044	1002049	100 %	0 %	0 %	0 %	116627852
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15039	NC_008532	AGT	2	6	1002155	1002160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627852
15040	NC_008532	CAA	2	6	1002178	1002183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627852
15041	NC_008532	CAT	2	6	1002193	1002198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627852
15042	NC_008532	TGA	2	6	1002200	1002205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627852
15043	NC_008532	TTAA	2	8	1002240	1002247	50 %	50 %	0 %	0 %	116627852
15044	NC_008532	TCAT	2	8	1002448	1002455	25 %	50 %	0 %	25 %	116627853
15045	NC_008532	T	6	6	1003079	1003084	0 %	100 %	0 %	0 %	116627854
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15049	NC_008532	AAC	2	6	1003168	1003173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627854
15050	NC_008532	TGA	2	6	1003198	1003203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627854
15051	NC_008532	TCT	2	6	1003375	1003380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627854
15052	NC_008532	T	6	6	1003757	1003762	0 %	100 %	0 %	0 %	116627855
15053	NC_008532	CTT	2	6	1003790	1003795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627855
15054	NC_008532	ATT	2	6	1003827	1003832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627855
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15056	NC_008532	TGA	2	6	1003911	1003916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627855
15057	NC_008532	CT	3	6	1003994	1003999	0 %	50 %	0 %	50 %	116627855
15058	NC_008532	TTC	2	6	1004109	1004114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627855
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15060	NC_008532	ATA	2	6	1004293	1004298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627855
15061	NC_008532	TTC	2	6	1004310	1004315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627855
15062	NC_008532	T	7	7	1004360	1004366	0 %	100 %	0 %	0 %	116627856
15063	NC_008532	ATAG	2	8	1004380	1004387	50 %	25 %	25 %	0 %	116627856
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15065	NC_008532	CTGT	2	8	1004556	1004563	0 %	50 %	25 %	25 %	116627856
15066	NC_008532	AAG	2	6	1004578	1004583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627856
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15085	NC_008532	ATC	2	6	1005676	1005681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627856
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15088	NC_008532	AGA	2	6	1006040	1006045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627857
15089	NC_008532	A	6	6	1006048	1006053	100 %	0 %	0 %	0 %	116627857
15090	NC_008532	TGAAA	2	10	1006166	1006175	60 %	20 %	20 %	0 %	116627857
15091	NC_008532	ATC	2	6	1006187	1006192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627857
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15100	NC_008532	GT	3	6	1008125	1008130	0 %	50 %	50 %	0 %	116627859
15101	NC_008532	T	6	6	1008130	1008135	0 %	100 %	0 %	0 %	116627859
15102	NC_008532	ATT	2	6	1008183	1008188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627860
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15111	NC_008532	TCA	2	6	1008674	1008679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627860
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15114	NC_008532	AAT	2	6	1008886	1008891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627861
15115	NC_008532	T	8	8	1008891	1008898	0 %	100 %	0 %	0 %	116627861
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15117	NC_008532	GTA	2	6	1008944	1008949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627861
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15227	NC_008532	TTTA	2	8	1015526	1015533	25 %	75 %	0 %	0 %	116627869
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15231	NC_008532	GTTT	2	8	1015651	1015658	0 %	75 %	25 %	0 %	116627869
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15233	NC_008532	ACG	2	6	1015854	1015859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627869
15234	NC_008532	CAT	2	6	1015928	1015933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627869
15235	NC_008532	TTA	2	6	1015942	1015947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627869
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15239	NC_008532	CAT	2	6	1016269	1016274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627870
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15245	NC_008532	GAC	2	6	1016404	1016409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627870
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15247	NC_008532	TAG	2	6	1016563	1016568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627870
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15262	NC_008532	TCT	2	6	1017619	1017624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627871
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15351	NC_008532	GATT	2	8	1022602	1022609	25 %	50 %	25 %	0 %	116627877
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15354	NC_008532	CAT	2	6	1022766	1022771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627877
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15465	NC_008532	CAT	2	6	1030431	1030436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627885
15466	NC_008532	CTT	2	6	1030524	1030529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627885
15467	NC_008532	CAT	2	6	1030545	1030550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627885
15468	NC_008532	GAA	2	6	1030551	1030556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627885
15469	NC_008532	ACA	2	6	1030674	1030679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627885
15470	NC_008532	TATAGG	2	12	1030686	1030697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627885
15471	NC_008532	AT	3	6	1030713	1030718	50 %	50 %	0 %	0 %	116627885
15472	NC_008532	CAA	2	6	1030759	1030764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627885
15473	NC_008532	GAT	2	6	1030847	1030852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627885
15474	NC_008532	T	7	7	1030859	1030865	0 %	100 %	0 %	0 %	116627885
15475	NC_008532	TAGC	2	8	1030923	1030930	25 %	25 %	25 %	25 %	116627885
15476	NC_008532	CT	3	6	1030998	1031003	0 %	50 %	0 %	50 %	116627885
15477	NC_008532	CAA	2	6	1031070	1031075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627885
15478	NC_008532	TTC	2	6	1031139	1031144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627886
15479	NC_008532	TAA	2	6	1031148	1031153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627886
15480	NC_008532	ACG	2	6	1031162	1031167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627886
15481	NC_008532	AT	3	6	1031175	1031180	50 %	50 %	0 %	0 %	116627886
15482	NC_008532	T	6	6	1031206	1031211	0 %	100 %	0 %	0 %	116627886
15483	NC_008532	GAC	2	6	1031218	1031223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627886
15484	NC_008532	TCAAC	2	10	1031356	1031365	40 %	20 %	0 %	40 %	116627886
15485	NC_008532	T	6	6	1031378	1031383	0 %	100 %	0 %	0 %	116627886
15486	NC_008532	CAA	2	6	1031386	1031391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627886
15487	NC_008532	CT	3	6	1031451	1031456	0 %	50 %	0 %	50 %	116627886
15488	NC_008532	ACG	2	6	1031483	1031488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627886
15489	NC_008532	CAA	2	6	1031510	1031515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627886
15490	NC_008532	GTC	2	6	1031546	1031551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627886
15491	NC_008532	GT	3	6	1031617	1031622	0 %	50 %	50 %	0 %	116627886
15492	NC_008532	T	6	6	1031702	1031707	0 %	100 %	0 %	0 %	116627886
15493	NC_008532	CCT	2	6	1031764	1031769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627886
15494	NC_008532	TGA	2	6	1031785	1031790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627886
15495	NC_008532	TCA	3	9	1031808	1031816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627886
15496	NC_008532	T	7	7	1031827	1031833	0 %	100 %	0 %	0 %	116627886
15497	NC_008532	AATA	2	8	1032387	1032394	75 %	25 %	0 %	0 %	116627887
15498	NC_008532	TTCTGG	2	12	1032470	1032481	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116627887
15499	NC_008532	CGA	2	6	1032524	1032529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627887
15500	NC_008532	AAGA	2	8	1032753	1032760	75 %	0 %	25 %	0 %	116627887

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