MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20001	NC_008345	TGA	2	6	1219482	1219487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562212
20002	NC_008345	AGCA	2	8	1219493	1219500	50 %	0 %	25 %	25 %	114562212
20003	NC_008345	ATCAA	2	10	1219510	1219519	60 %	20 %	0 %	20 %	114562212
20004	NC_008345	GC	3	6	1219524	1219529	0 %	0 %	50 %	50 %	114562212
20005	NC_008345	GTGAA	2	10	1219541	1219550	40 %	20 %	40 %	0 %	114562212
20006	NC_008345	TGA	2	6	1219571	1219576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562212
20007	NC_008345	TGA	2	6	1219586	1219591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562212
20008	NC_008345	AT	3	6	1219608	1219613	50 %	50 %	0 %	0 %	114562212
20009	NC_008345	ATG	2	6	1219784	1219789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562213
20010	NC_008345	ACA	2	6	1219826	1219831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562213
20011	NC_008345	ATT	2	6	1219877	1219882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562213
20012	NC_008345	ATC	2	6	1219893	1219898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562213
20013	NC_008345	CTG	2	6	1219962	1219967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562213
20014	NC_008345	CAC	2	6	1220019	1220024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562213
20015	NC_008345	TTAA	2	8	1220039	1220046	50 %	50 %	0 %	0 %	114562213
20016	NC_008345	GCC	2	6	1220237	1220242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114562213
20017	NC_008345	GCA	2	6	1220300	1220305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562213
20018	NC_008345	GAT	2	6	1220375	1220380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562213
20019	NC_008345	ATT	2	6	1220503	1220508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562213
20020	NC_008345	TTCAA	2	10	1220509	1220518	40 %	40 %	0 %	20 %	114562213
20021	NC_008345	TTC	2	6	1220592	1220597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562213
20022	NC_008345	CTGCA	2	10	1220823	1220832	20 %	20 %	20 %	40 %	114562213
20023	NC_008345	TGA	2	6	1220839	1220844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562213
20024	NC_008345	ACGTA	2	10	1220845	1220854	40 %	20 %	20 %	20 %	114562213
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20027	NC_008345	GTT	2	6	1221114	1221119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562214
20028	NC_008345	AT	3	6	1221148	1221153	50 %	50 %	0 %	0 %	114562214
20029	NC_008345	AGGCA	2	10	1221308	1221317	40 %	0 %	40 %	20 %	114562214
20030	NC_008345	TGAA	2	8	1221406	1221413	50 %	25 %	25 %	0 %	114562214
20031	NC_008345	CTG	2	6	1221454	1221459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562214
20032	NC_008345	TGG	2	6	1221472	1221477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562214
20033	NC_008345	CG	3	6	1221521	1221526	0 %	0 %	50 %	50 %	114562214
20034	NC_008345	T	6	6	1221611	1221616	0 %	100 %	0 %	0 %	114562214
20035	NC_008345	CATAG	2	10	1221757	1221766	40 %	20 %	20 %	20 %	114562215
20036	NC_008345	GATG	2	8	1221810	1221817	25 %	25 %	50 %	0 %	114562215
20037	NC_008345	AG	3	6	1221826	1221831	50 %	0 %	50 %	0 %	114562215
20038	NC_008345	CAG	2	6	1221872	1221877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562215
20039	NC_008345	CAG	2	6	1221943	1221948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562215
20040	NC_008345	CGA	2	6	1221992	1221997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562215
20041	NC_008345	GCT	2	6	1222075	1222080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562215
20042	NC_008345	GCTG	2	8	1222207	1222214	0 %	25 %	50 %	25 %	114562215
20043	NC_008345	TTG	2	6	1222232	1222237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562215
20044	NC_008345	GC	3	6	1222264	1222269	0 %	0 %	50 %	50 %	114562215
20045	NC_008345	ACTAC	2	10	1222446	1222455	40 %	20 %	0 %	40 %	114562215
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20049	NC_008345	TA	3	6	1222837	1222842	50 %	50 %	0 %	0 %	114562215
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20051	NC_008345	GAC	2	6	1223110	1223115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562216
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20053	NC_008345	TGC	2	6	1223160	1223165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562216
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20070	NC_008345	GCA	2	6	1224333	1224338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562218
20071	NC_008345	TAAT	2	8	1224504	1224511	50 %	50 %	0 %	0 %	114562218
20072	NC_008345	ATT	2	6	1224516	1224521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562218
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20117	NC_008345	TTA	2	6	1226891	1226896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562221
20118	NC_008345	CGAC	2	8	1226996	1227003	25 %	0 %	25 %	50 %	114562221
20119	NC_008345	T	6	6	1227070	1227075	0 %	100 %	0 %	0 %	114562221
20120	NC_008345	TGT	2	6	1227210	1227215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562221
20121	NC_008345	ACGACT	2	12	1227310	1227321	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114562221
20122	NC_008345	TGG	2	6	1227360	1227365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562221
20123	NC_008345	GTT	2	6	1227372	1227377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562221
20124	NC_008345	ATTC	2	8	1227423	1227430	25 %	50 %	0 %	25 %	114562221
20125	NC_008345	TGA	2	6	1227440	1227445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562221
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20130	NC_008345	TCA	2	6	1227704	1227709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562221
20131	NC_008345	TGTTCT	2	12	1227779	1227790	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	114562221
20132	NC_008345	TCA	2	6	1227794	1227799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562221
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20146	NC_008345	GGTAA	2	10	1228945	1228954	40 %	20 %	40 %	0 %	114562222
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20219	NC_008345	TGC	2	6	1232484	1232489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562225
20220	NC_008345	AGCC	2	8	1232515	1232522	25 %	0 %	25 %	50 %	114562225
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20222	NC_008345	ATA	2	6	1232703	1232708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562225
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20225	NC_008345	AT	3	6	1232770	1232775	50 %	50 %	0 %	0 %	114562225
20226	NC_008345	TTG	2	6	1232792	1232797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562225
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20230	NC_008345	ATT	2	6	1232910	1232915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562225
20231	NC_008345	GTTT	2	8	1232979	1232986	0 %	75 %	25 %	0 %	114562225
20232	NC_008345	ATAG	2	8	1233060	1233067	50 %	25 %	25 %	0 %	114562225
20233	NC_008345	GGC	2	6	1233095	1233100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562225
20234	NC_008345	CAA	2	6	1233169	1233174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562225
20235	NC_008345	TGC	2	6	1233178	1233183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562225
20236	NC_008345	TTG	2	6	1233318	1233323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562225
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20349	NC_008345	CG	3	6	1240179	1240184	0 %	0 %	50 %	50 %	114562230
20350	NC_008345	TGC	2	6	1240339	1240344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562230
20351	NC_008345	CAAAG	2	10	1240441	1240450	60 %	0 %	20 %	20 %	114562230
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20353	NC_008345	ATC	2	6	1240592	1240597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562230
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20358	NC_008345	TGC	2	6	1240876	1240881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562230
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20361	NC_008345	GAA	2	6	1240949	1240954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562230
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20430	NC_008345	AATGTT	2	12	1244721	1244732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	114562235
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20432	NC_008345	GACT	2	8	1244885	1244892	25 %	25 %	25 %	25 %	114562235
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20449	NC_008345	A	6	6	1245866	1245871	100 %	0 %	0 %	0 %	114562237
20450	NC_008345	TAAAG	2	10	1245881	1245890	60 %	20 %	20 %	0 %	114562237
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20452	NC_008345	TA	3	6	1246095	1246100	50 %	50 %	0 %	0 %	114562237
20453	NC_008345	CAG	2	6	1246138	1246143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562237
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