MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_008345	TGT	2	6	1163127	1163132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562172
19003	NC_008345	TTTCT	2	10	1163176	1163185	0 %	80 %	0 %	20 %	114562172
19004	NC_008345	ATT	2	6	1163219	1163224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562172
19005	NC_008345	AAT	2	6	1163259	1163264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562172
19006	NC_008345	CAT	2	6	1163269	1163274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562172
19007	NC_008345	ATA	2	6	1163313	1163318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562172
19008	NC_008345	TGG	3	9	1163368	1163376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562172
19009	NC_008345	TGCTG	2	10	1163403	1163412	0 %	40 %	40 %	20 %	114562172
19010	NC_008345	CTA	2	6	1163455	1163460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562172
19011	NC_008345	A	6	6	1163477	1163482	100 %	0 %	0 %	0 %	114562172
19012	NC_008345	GTTT	3	12	1163504	1163515	0 %	75 %	25 %	0 %	114562172
19013	NC_008345	TGC	2	6	1164022	1164027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562173
19014	NC_008345	AGCA	2	8	1164034	1164041	50 %	0 %	25 %	25 %	114562173
19015	NC_008345	A	6	6	1164077	1164082	100 %	0 %	0 %	0 %	114562173
19016	NC_008345	CTT	2	6	1164103	1164108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562173
19017	NC_008345	A	6	6	1164132	1164137	100 %	0 %	0 %	0 %	114562173
19018	NC_008345	TGC	2	6	1164142	1164147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562173
19019	NC_008345	TGG	2	6	1164160	1164165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562173
19020	NC_008345	TTC	2	6	1164167	1164172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562173
19021	NC_008345	GTC	2	6	1164183	1164188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562173
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19024	NC_008345	GAT	2	6	1164328	1164333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562173
19025	NC_008345	CAG	2	6	1164342	1164347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562173
19026	NC_008345	GCG	2	6	1164389	1164394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562173
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19032	NC_008345	GTT	3	9	1164578	1164586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562173
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19040	NC_008345	CGT	2	6	1165130	1165135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562173
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19042	NC_008345	CGA	2	6	1165354	1165359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562173
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19045	NC_008345	GCGGT	2	10	1165653	1165662	0 %	20 %	60 %	20 %	114562173
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19053	NC_008345	TTC	2	6	1165860	1165865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562173
19054	NC_008345	TGA	2	6	1165903	1165908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562173
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19058	NC_008345	CTG	2	6	1166028	1166033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562173
19059	NC_008345	GTAAT	2	10	1166035	1166044	40 %	40 %	20 %	0 %	114562173
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19087	NC_008345	GC	3	6	1167408	1167413	0 %	0 %	50 %	50 %	114562175
19088	NC_008345	TCA	2	6	1167414	1167419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562175
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19094	NC_008345	TGA	2	6	1167727	1167732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562175
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19108	NC_008345	A	6	6	1169012	1169017	100 %	0 %	0 %	0 %	114562176
19109	NC_008345	TGAT	2	8	1169029	1169036	25 %	50 %	25 %	0 %	114562176
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19232	NC_008345	CGT	2	6	1176184	1176189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562182
19233	NC_008345	ATTA	2	8	1176265	1176272	50 %	50 %	0 %	0 %	114562182
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19236	NC_008345	TGT	2	6	1176785	1176790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562183
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19330	NC_008345	ATG	2	6	1181698	1181703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562187
19331	NC_008345	GTAA	2	8	1181735	1181742	50 %	25 %	25 %	0 %	114562187
19332	NC_008345	TAACC	2	10	1181752	1181761	40 %	20 %	0 %	40 %	114562187
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19334	NC_008345	ATC	2	6	1181889	1181894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562187
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19340	NC_008345	CAC	2	6	1182062	1182067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562187
19341	NC_008345	ATTC	2	8	1182114	1182121	25 %	50 %	0 %	25 %	114562187
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19343	NC_008345	TTC	2	6	1182180	1182185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562187
19344	NC_008345	TC	3	6	1182209	1182214	0 %	50 %	0 %	50 %	114562187
19345	NC_008345	AC	3	6	1182260	1182265	50 %	0 %	0 %	50 %	114562187
19346	NC_008345	CTT	2	6	1182311	1182316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562187
19347	NC_008345	CGA	2	6	1182350	1182355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562187
19348	NC_008345	CTT	2	6	1182359	1182364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562187
19349	NC_008345	AGATG	2	10	1182414	1182423	40 %	20 %	40 %	0 %	114562187
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19351	NC_008345	GTT	2	6	1182527	1182532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562187
19352	NC_008345	ATT	2	6	1182562	1182567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562187
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19464	NC_008345	CTGC	2	8	1190133	1190140	0 %	25 %	25 %	50 %	114562195
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