MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_008345	TGA	2	6	1134218	1134223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562149
18503	NC_008345	TTA	2	6	1134300	1134305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562149
18504	NC_008345	TGCG	2	8	1134366	1134373	0 %	25 %	50 %	25 %	114562149
18505	NC_008345	GCA	2	6	1134442	1134447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562149
18506	NC_008345	TTAA	2	8	1134546	1134553	50 %	50 %	0 %	0 %	114562149
18507	NC_008345	GCG	2	6	1134570	1134575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562149
18508	NC_008345	GC	3	6	1134669	1134674	0 %	0 %	50 %	50 %	114562149
18509	NC_008345	AGC	2	6	1134728	1134733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562149
18510	NC_008345	CG	3	6	1134765	1134770	0 %	0 %	50 %	50 %	114562149
18511	NC_008345	AGCG	2	8	1134916	1134923	25 %	0 %	50 %	25 %	114562149
18512	NC_008345	TCG	2	6	1134944	1134949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562149
18513	NC_008345	TAA	2	6	1135002	1135007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562149
18514	NC_008345	ACA	2	6	1135122	1135127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562150
18515	NC_008345	GTTG	2	8	1135169	1135176	0 %	50 %	50 %	0 %	114562150
18516	NC_008345	TGT	2	6	1135215	1135220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562150
18517	NC_008345	GCA	2	6	1135237	1135242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562150
18518	NC_008345	A	6	6	1135281	1135286	100 %	0 %	0 %	0 %	114562150
18519	NC_008345	TCAA	2	8	1135464	1135471	50 %	25 %	0 %	25 %	114562150
18520	NC_008345	TC	3	6	1135539	1135544	0 %	50 %	0 %	50 %	114562150
18521	NC_008345	TAT	2	6	1135657	1135662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562150
18522	NC_008345	TTG	2	6	1135701	1135706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562150
18523	NC_008345	GCGG	2	8	1135778	1135785	0 %	0 %	75 %	25 %	114562150
18524	NC_008345	CA	3	6	1135821	1135826	50 %	0 %	0 %	50 %	114562150
18525	NC_008345	GCTA	2	8	1136046	1136053	25 %	25 %	25 %	25 %	114562151
18526	NC_008345	GTC	2	6	1136062	1136067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562151
18527	NC_008345	CTG	2	6	1136116	1136121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562151
18528	NC_008345	AAAG	2	8	1136154	1136161	75 %	0 %	25 %	0 %	114562151
18529	NC_008345	GTC	2	6	1136206	1136211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562151
18530	NC_008345	AAG	2	6	1136218	1136223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562151
18531	NC_008345	AAG	2	6	1136227	1136232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562151
18532	NC_008345	CTG	2	6	1136233	1136238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562151
18533	NC_008345	GCT	2	6	1136244	1136249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562151
18534	NC_008345	GTAC	2	8	1136376	1136383	25 %	25 %	25 %	25 %	114562151
18535	NC_008345	TCA	2	6	1136401	1136406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562151
18536	NC_008345	GTG	2	6	1136407	1136412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562151
18537	NC_008345	CTG	2	6	1136446	1136451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562151
18538	NC_008345	GTT	2	6	1136630	1136635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562151
18539	NC_008345	AATGA	2	10	1136708	1136717	60 %	20 %	20 %	0 %	114562152
18540	NC_008345	CAA	2	6	1136792	1136797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562152
18541	NC_008345	ATA	2	6	1136801	1136806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562152
18542	NC_008345	ATT	2	6	1136966	1136971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562152
18543	NC_008345	A	6	6	1136989	1136994	100 %	0 %	0 %	0 %	114562152
18544	NC_008345	GTG	2	6	1137077	1137082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562152
18545	NC_008345	ATGTG	2	10	1137111	1137120	20 %	40 %	40 %	0 %	114562152
18546	NC_008345	AAT	2	6	1137172	1137177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562152
18547	NC_008345	CAT	2	6	1137185	1137190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562152
18548	NC_008345	A	6	6	1137197	1137202	100 %	0 %	0 %	0 %	114562152
18549	NC_008345	AC	3	6	1137367	1137372	50 %	0 %	0 %	50 %	114562152
18550	NC_008345	GGC	2	6	1137457	1137462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562152
18551	NC_008345	GCA	2	6	1137502	1137507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562152
18552	NC_008345	TACTCG	2	12	1137729	1137740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114562153
18553	NC_008345	TGC	2	6	1137775	1137780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562153
18554	NC_008345	ATG	2	6	1137909	1137914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562153
18555	NC_008345	CATG	2	8	1137938	1137945	25 %	25 %	25 %	25 %	114562153
18556	NC_008345	ATT	2	6	1137953	1137958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562153
18557	NC_008345	CAAC	2	8	1137991	1137998	50 %	0 %	0 %	50 %	114562153
18558	NC_008345	AAT	2	6	1138025	1138030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562153
18559	NC_008345	AACT	2	8	1138062	1138069	50 %	25 %	0 %	25 %	114562153
18560	NC_008345	TAT	2	6	1138105	1138110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562153
18561	NC_008345	GCG	2	6	1138145	1138150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562153
18562	NC_008345	ACC	2	6	1138196	1138201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562153
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18564	NC_008345	CAG	2	6	1138266	1138271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562153
18565	NC_008345	GTTG	2	8	1138333	1138340	0 %	50 %	50 %	0 %	114562153
18566	NC_008345	TGTGA	2	10	1138349	1138358	20 %	40 %	40 %	0 %	114562153
18567	NC_008345	GTA	2	6	1138361	1138366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562153
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18570	NC_008345	TCA	2	6	1138576	1138581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562153
18571	NC_008345	TGA	2	6	1138623	1138628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562153
18572	NC_008345	TGC	2	6	1138651	1138656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562153
18573	NC_008345	AGT	2	6	1138854	1138859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562153
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18575	NC_008345	GAA	2	6	1138996	1139001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562154
18576	NC_008345	CAA	2	6	1139036	1139041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562154
18577	NC_008345	GACC	2	8	1139046	1139053	25 %	0 %	25 %	50 %	114562154
18578	NC_008345	CAT	2	6	1139109	1139114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562154
18579	NC_008345	CGA	2	6	1139144	1139149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562154
18580	NC_008345	TGGG	2	8	1139150	1139157	0 %	25 %	75 %	0 %	114562154
18581	NC_008345	GC	3	6	1139174	1139179	0 %	0 %	50 %	50 %	114562154
18582	NC_008345	TGG	2	6	1139363	1139368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562154
18583	NC_008345	CGTC	2	8	1139386	1139393	0 %	25 %	25 %	50 %	114562154
18584	NC_008345	GCG	2	6	1139411	1139416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562154
18585	NC_008345	ACA	2	6	1139429	1139434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562154
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18588	NC_008345	TGA	2	6	1139499	1139504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562154
18589	NC_008345	TTGG	2	8	1139513	1139520	0 %	50 %	50 %	0 %	114562154
18590	NC_008345	TAT	2	6	1139565	1139570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562154
18591	NC_008345	CTT	2	6	1139681	1139686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562154
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18596	NC_008345	ACT	2	6	1140341	1140346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562154
18597	NC_008345	TGC	2	6	1140477	1140482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562154
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18599	NC_008345	ATT	2	6	1140614	1140619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562154
18600	NC_008345	TGC	2	6	1140630	1140635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562154
18601	NC_008345	CAT	2	6	1140666	1140671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562154
18602	NC_008345	AGA	2	6	1140747	1140752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562154
18603	NC_008345	GGT	2	6	1140805	1140810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562154
18604	NC_008345	CG	3	6	1140828	1140833	0 %	0 %	50 %	50 %	114562154
18605	NC_008345	ATT	2	6	1140859	1140864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562154
18606	NC_008345	AGA	2	6	1140894	1140899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562154
18607	NC_008345	AGC	2	6	1140941	1140946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562154
18608	NC_008345	A	6	6	1140995	1141000	100 %	0 %	0 %	0 %	114562154
18609	NC_008345	GTTG	2	8	1141011	1141018	0 %	50 %	50 %	0 %	114562154
18610	NC_008345	ACAA	2	8	1141067	1141074	75 %	0 %	0 %	25 %	114562154
18611	NC_008345	TAC	2	6	1141079	1141084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562154
18612	NC_008345	CTT	2	6	1141140	1141145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562154
18613	NC_008345	GAT	2	6	1141147	1141152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562154
18614	NC_008345	TG	4	8	1141176	1141183	0 %	50 %	50 %	0 %	114562154
18615	NC_008345	TGG	2	6	1141196	1141201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562154
18616	NC_008345	GCTA	2	8	1141458	1141465	25 %	25 %	25 %	25 %	114562154
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18963	NC_008345	ATGA	2	8	1159899	1159906	50 %	25 %	25 %	0 %	114562170
18964	NC_008345	TTA	2	6	1159914	1159919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562170
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18991	NC_008345	TCT	2	6	1162404	1162409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562172
18992	NC_008345	AT	3	6	1162412	1162417	50 %	50 %	0 %	0 %	114562172
18993	NC_008345	TGGA	2	8	1162439	1162446	25 %	25 %	50 %	0 %	114562172
18994	NC_008345	GCT	2	6	1162509	1162514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562172
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