MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_008345	GAA	2	6	1103835	1103840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562121
18002	NC_008345	CAA	2	6	1103847	1103852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562121
18003	NC_008345	TA	3	6	1103911	1103916	50 %	50 %	0 %	0 %	114562121
18004	NC_008345	TGA	3	9	1104019	1104027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562121
18005	NC_008345	T	7	7	1104049	1104055	0 %	100 %	0 %	0 %	114562121
18006	NC_008345	ATTA	2	8	1104202	1104209	50 %	50 %	0 %	0 %	114562121
18007	NC_008345	CGT	2	6	1104299	1104304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562122
18008	NC_008345	CCG	2	6	1104333	1104338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114562122
18009	NC_008345	T	6	6	1104356	1104361	0 %	100 %	0 %	0 %	114562122
18010	NC_008345	AGC	2	6	1104370	1104375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562122
18011	NC_008345	GTT	2	6	1104380	1104385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562122
18012	NC_008345	ATG	2	6	1104387	1104392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562122
18013	NC_008345	AGC	2	6	1104442	1104447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562122
18014	NC_008345	GTTA	2	8	1104599	1104606	25 %	50 %	25 %	0 %	114562122
18015	NC_008345	TGA	3	9	1104647	1104655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562122
18016	NC_008345	TGT	2	6	1104716	1104721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562122
18017	NC_008345	GCA	2	6	1104797	1104802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562122
18018	NC_008345	ATT	2	6	1104873	1104878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562122
18019	NC_008345	TAC	2	6	1104885	1104890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562122
18020	NC_008345	TTAA	2	8	1104893	1104900	50 %	50 %	0 %	0 %	114562122
18021	NC_008345	TGTC	2	8	1105170	1105177	0 %	50 %	25 %	25 %	114562123
18022	NC_008345	TCA	2	6	1105252	1105257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562123
18023	NC_008345	GCC	2	6	1105261	1105266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114562123
18024	NC_008345	TAGT	2	8	1105296	1105303	25 %	50 %	25 %	0 %	114562123
18025	NC_008345	AGC	2	6	1105317	1105322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562123
18026	NC_008345	GGTAAT	2	12	1105464	1105475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562123
18027	NC_008345	CTG	2	6	1105653	1105658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562124
18028	NC_008345	CAA	2	6	1105690	1105695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562124
18029	NC_008345	A	6	6	1105782	1105787	100 %	0 %	0 %	0 %	114562124
18030	NC_008345	GTAA	2	8	1105915	1105922	50 %	25 %	25 %	0 %	114562124
18031	NC_008345	CAT	2	6	1105949	1105954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562124
18032	NC_008345	ATT	2	6	1105955	1105960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562124
18033	NC_008345	GCC	2	6	1105978	1105983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114562124
18034	NC_008345	TCA	2	6	1105993	1105998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562124
18035	NC_008345	CGG	2	6	1106046	1106051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562124
18036	NC_008345	GGA	2	6	1106067	1106072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114562124
18037	NC_008345	TAA	2	6	1106142	1106147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562124
18038	NC_008345	AGA	2	6	1106163	1106168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562124
18039	NC_008345	AAG	2	6	1106218	1106223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562124
18040	NC_008345	GCT	2	6	1106296	1106301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562124
18041	NC_008345	TAC	2	6	1106356	1106361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562124
18042	NC_008345	TAT	2	6	1106362	1106367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562124
18043	NC_008345	CTGG	2	8	1106369	1106376	0 %	25 %	50 %	25 %	114562124
18044	NC_008345	ATCA	2	8	1106476	1106483	50 %	25 %	0 %	25 %	114562124
18045	NC_008345	GAT	2	6	1106494	1106499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562124
18046	NC_008345	GATG	2	8	1106523	1106530	25 %	25 %	50 %	0 %	114562124
18047	NC_008345	GAT	2	6	1106605	1106610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562124
18048	NC_008345	AGA	2	6	1106709	1106714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562124
18049	NC_008345	GAC	2	6	1106737	1106742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562124
18050	NC_008345	TTA	2	6	1106851	1106856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562125
18051	NC_008345	TTTG	2	8	1107018	1107025	0 %	75 %	25 %	0 %	114562125
18052	NC_008345	ATT	2	6	1107067	1107072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562125
18053	NC_008345	AAAGT	2	10	1107134	1107143	60 %	20 %	20 %	0 %	114562125
18054	NC_008345	CATT	2	8	1107244	1107251	25 %	50 %	0 %	25 %	114562125
18055	NC_008345	GAT	2	6	1107276	1107281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562125
18056	NC_008345	TGC	2	6	1107285	1107290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562125
18057	NC_008345	ATG	2	6	1107311	1107316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562125
18058	NC_008345	AATCG	2	10	1107353	1107362	40 %	20 %	20 %	20 %	114562125
18059	NC_008345	ACC	2	6	1107564	1107569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562126
18060	NC_008345	AGC	2	6	1107589	1107594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562126
18061	NC_008345	TAA	2	6	1107664	1107669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562126
18062	NC_008345	TACC	2	8	1107756	1107763	25 %	25 %	0 %	50 %	114562126
18063	NC_008345	CA	3	6	1107787	1107792	50 %	0 %	0 %	50 %	114562126
18064	NC_008345	TTTTC	2	10	1107834	1107843	0 %	80 %	0 %	20 %	114562126
18065	NC_008345	ACA	2	6	1107862	1107867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562126
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18067	NC_008345	TGG	2	6	1108045	1108050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562126
18068	NC_008345	TGC	2	6	1108183	1108188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562126
18069	NC_008345	CAA	2	6	1108214	1108219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562126
18070	NC_008345	TCA	2	6	1108244	1108249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562126
18071	NC_008345	AAG	2	6	1108251	1108256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562126
18072	NC_008345	CAG	2	6	1108320	1108325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562126
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18074	NC_008345	CAA	2	6	1108436	1108441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562126
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18080	NC_008345	GC	3	6	1108634	1108639	0 %	0 %	50 %	50 %	114562126
18081	NC_008345	TGA	3	9	1108720	1108728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562126
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18083	NC_008345	TAAAT	2	10	1108783	1108792	60 %	40 %	0 %	0 %	114562126
18084	NC_008345	TGC	2	6	1108879	1108884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562126
18085	NC_008345	TGA	2	6	1108894	1108899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562126
18086	NC_008345	AACA	2	8	1109001	1109008	75 %	0 %	0 %	25 %	114562126
18087	NC_008345	AAG	2	6	1109013	1109018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562126
18088	NC_008345	CAA	2	6	1109048	1109053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562126
18089	NC_008345	TGT	2	6	1109179	1109184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562126
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18092	NC_008345	GC	3	6	1109449	1109454	0 %	0 %	50 %	50 %	114562126
18093	NC_008345	CGC	2	6	1109482	1109487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114562126
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18096	NC_008345	TCAG	2	8	1110350	1110357	25 %	25 %	25 %	25 %	114562127
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18098	NC_008345	TGAT	2	8	1110454	1110461	25 %	50 %	25 %	0 %	114562127
18099	NC_008345	CTG	2	6	1110523	1110528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562127
18100	NC_008345	TGC	2	6	1110566	1110571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562127
18101	NC_008345	AGA	2	6	1110602	1110607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562127
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18103	NC_008345	TCA	2	6	1110755	1110760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562127
18104	NC_008345	TTC	2	6	1110763	1110768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562127
18105	NC_008345	A	6	6	1110891	1110896	100 %	0 %	0 %	0 %	114562127
18106	NC_008345	ACTG	2	8	1110938	1110945	25 %	25 %	25 %	25 %	114562127
18107	NC_008345	TGA	2	6	1110947	1110952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562127
18108	NC_008345	CGGT	2	8	1110955	1110962	0 %	25 %	50 %	25 %	114562127
18109	NC_008345	ATC	2	6	1111039	1111044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562127
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18112	NC_008345	TCGT	2	8	1111127	1111134	0 %	50 %	25 %	25 %	114562127
18113	NC_008345	CGG	2	6	1111184	1111189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562127
18114	NC_008345	CTAC	2	8	1111248	1111255	25 %	25 %	0 %	50 %	114562127
18115	NC_008345	CT	3	6	1111275	1111280	0 %	50 %	0 %	50 %	114562127
18116	NC_008345	GAA	2	6	1111326	1111331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562127
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18118	NC_008345	TGG	2	6	1111671	1111676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562128
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18224	NC_008345	TCT	2	6	1116582	1116587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562133
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18229	NC_008345	AGC	2	6	1117176	1117181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562134
18230	NC_008345	TTA	2	6	1117192	1117197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562134
18231	NC_008345	TA	3	6	1117225	1117230	50 %	50 %	0 %	0 %	114562134
18232	NC_008345	A	6	6	1117233	1117238	100 %	0 %	0 %	0 %	114562134
18233	NC_008345	TGG	2	6	1117260	1117265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562134
18234	NC_008345	TGTGAC	2	12	1117294	1117305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114562134
18235	NC_008345	AAACGC	2	12	1117318	1117329	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	114562134
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18239	NC_008345	T	6	6	1117694	1117699	0 %	100 %	0 %	0 %	114562135
18240	NC_008345	A	6	6	1117755	1117760	100 %	0 %	0 %	0 %	114562135
18241	NC_008345	ACCTA	2	10	1117823	1117832	40 %	20 %	0 %	40 %	114562135
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18248	NC_008345	TTA	2	6	1118142	1118147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562136
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18256	NC_008345	ATT	2	6	1119006	1119011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562137
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18349	NC_008345	GGAT	2	8	1125476	1125483	25 %	25 %	50 %	0 %	114562143
18350	NC_008345	TTG	2	6	1125497	1125502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562143
18351	NC_008345	GTT	2	6	1125527	1125532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562143
18352	NC_008345	ATT	2	6	1125543	1125548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562143
18353	NC_008345	T	6	6	1125595	1125600	0 %	100 %	0 %	0 %	114562143
18354	NC_008345	GT	3	6	1125668	1125673	0 %	50 %	50 %	0 %	114562143
18355	NC_008345	CTT	2	6	1125675	1125680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562143
18356	NC_008345	TGC	2	6	1125750	1125755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562143
18357	NC_008345	ATT	2	6	1125765	1125770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562143
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18359	NC_008345	T	6	6	1125879	1125884	0 %	100 %	0 %	0 %	114562143
18360	NC_008345	ATT	2	6	1125889	1125894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562143
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18376	NC_008345	TTTA	2	8	1126621	1126628	25 %	75 %	0 %	0 %	114562143
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18419	NC_008345	GGC	2	6	1130571	1130576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562147
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18424	NC_008345	CGT	2	6	1130730	1130735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562147
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18432	NC_008345	TAT	2	6	1131008	1131013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562147
18433	NC_008345	CTG	3	9	1131025	1131033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562147
18434	NC_008345	AAG	2	6	1131054	1131059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562147
18435	NC_008345	TTG	2	6	1131073	1131078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562147
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18437	NC_008345	ATC	2	6	1131117	1131122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562147
18438	NC_008345	GGT	2	6	1131189	1131194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562147
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18442	NC_008345	CTG	2	6	1131367	1131372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562147
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18444	NC_008345	TTG	2	6	1131523	1131528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562147
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18446	NC_008345	TAAC	2	8	1131565	1131572	50 %	25 %	0 %	25 %	114562147
18447	NC_008345	TTC	2	6	1131573	1131578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562147
18448	NC_008345	TGA	2	6	1131608	1131613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562147
18449	NC_008345	GCG	2	6	1131630	1131635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562147
18450	NC_008345	TGA	2	6	1131727	1131732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562147
18451	NC_008345	GAA	2	6	1131746	1131751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562147
18452	NC_008345	CAC	2	6	1131752	1131757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562147
18453	NC_008345	GAC	2	6	1131795	1131800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562147
18454	NC_008345	AAGC	2	8	1131843	1131850	50 %	0 %	25 %	25 %	114562147
18455	NC_008345	CAA	2	6	1131857	1131862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562147
18456	NC_008345	CAC	2	6	1131901	1131906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562147
18457	NC_008345	CTT	2	6	1132015	1132020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562147
18458	NC_008345	TGA	2	6	1132031	1132036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562147
18459	NC_008345	TGA	2	6	1132076	1132081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562147
18460	NC_008345	AGTT	2	8	1132099	1132106	25 %	50 %	25 %	0 %	114562147
18461	NC_008345	A	6	6	1132146	1132151	100 %	0 %	0 %	0 %	114562147
18462	NC_008345	GAA	2	6	1132158	1132163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562147
18463	NC_008345	CTAG	2	8	1132176	1132183	25 %	25 %	25 %	25 %	114562147
18464	NC_008345	CGA	2	6	1132184	1132189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562147
18465	NC_008345	AAAAG	2	10	1132190	1132199	80 %	0 %	20 %	0 %	114562147
18466	NC_008345	AAG	2	6	1132249	1132254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562147
18467	NC_008345	CTG	2	6	1132372	1132377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562147
18468	NC_008345	ATG	2	6	1132378	1132383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562147
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18472	NC_008345	ATT	2	6	1132552	1132557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562148
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18481	NC_008345	GC	3	6	1132875	1132880	0 %	0 %	50 %	50 %	114562148
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18491	NC_008345	AGC	2	6	1133360	1133365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562148
18492	NC_008345	GGC	2	6	1133370	1133375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114562148
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18495	NC_008345	A	7	7	1133597	1133603	100 %	0 %	0 %	0 %	114562148
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18499	NC_008345	ATC	2	6	1133991	1133996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562149
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