MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_008345	TTGT	2	8	1045316	1045323	0 %	75 %	25 %	0 %	114562067
17003	NC_008345	AGG	2	6	1045376	1045381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114562067
17004	NC_008345	ACA	2	6	1045405	1045410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562067
17005	NC_008345	CGC	2	6	1045427	1045432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114562067
17006	NC_008345	TCA	3	9	1045483	1045491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562067
17007	NC_008345	GTT	2	6	1045492	1045497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562067
17008	NC_008345	TAG	2	6	1045541	1045546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562067
17009	NC_008345	ATT	2	6	1045625	1045630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562067
17010	NC_008345	TCA	2	6	1045633	1045638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562067
17011	NC_008345	TAT	2	6	1045822	1045827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562068
17012	NC_008345	GTT	2	6	1045855	1045860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562068
17013	NC_008345	TGA	2	6	1045915	1045920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562068
17014	NC_008345	TTA	2	6	1045943	1045948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562068
17015	NC_008345	CAA	3	9	1045967	1045975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562068
17016	NC_008345	AATGC	2	10	1046024	1046033	40 %	20 %	20 %	20 %	114562068
17017	NC_008345	T	8	8	1046078	1046085	0 %	100 %	0 %	0 %	114562068
17018	NC_008345	TATT	2	8	1046096	1046103	25 %	75 %	0 %	0 %	114562068
17019	NC_008345	AATT	2	8	1046106	1046113	50 %	50 %	0 %	0 %	114562068
17020	NC_008345	GT	3	6	1046209	1046214	0 %	50 %	50 %	0 %	114562068
17021	NC_008345	CAG	2	6	1046235	1046240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562068
17022	NC_008345	ATC	2	6	1046304	1046309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562068
17023	NC_008345	TGA	2	6	1046389	1046394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562068
17024	NC_008345	TGA	2	6	1046422	1046427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562068
17025	NC_008345	CAAA	2	8	1046437	1046444	75 %	0 %	0 %	25 %	114562068
17026	NC_008345	TTA	2	6	1046522	1046527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562068
17027	NC_008345	AATAA	2	10	1046531	1046540	80 %	20 %	0 %	0 %	114562068
17028	NC_008345	TGT	2	6	1046586	1046591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562068
17029	NC_008345	TAC	2	6	1046683	1046688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562068
17030	NC_008345	TGG	2	6	1046691	1046696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562068
17031	NC_008345	CA	3	6	1046714	1046719	50 %	0 %	0 %	50 %	114562068
17032	NC_008345	GGT	2	6	1046783	1046788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562068
17033	NC_008345	TTAA	2	8	1046930	1046937	50 %	50 %	0 %	0 %	114562068
17034	NC_008345	TATTCG	2	12	1047035	1047046	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	114562068
17035	NC_008345	CAT	2	6	1047085	1047090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562068
17036	NC_008345	A	6	6	1047362	1047367	100 %	0 %	0 %	0 %	114562068
17037	NC_008345	GCA	2	6	1047368	1047373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562068
17038	NC_008345	GCAAGG	2	12	1047564	1047575	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114562069
17039	NC_008345	GCA	2	6	1047595	1047600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562069
17040	NC_008345	GCT	2	6	1047622	1047627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562069
17041	NC_008345	TAT	2	6	1047636	1047641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562069
17042	NC_008345	CCG	2	6	1047791	1047796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114562069
17043	NC_008345	TAA	2	6	1047945	1047950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562069
17044	NC_008345	CGA	2	6	1048106	1048111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562069
17045	NC_008345	TGT	2	6	1048125	1048130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562069
17046	NC_008345	TGAT	2	8	1048131	1048138	25 %	50 %	25 %	0 %	114562069
17047	NC_008345	TGT	2	6	1048232	1048237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562069
17048	NC_008345	TTGT	2	8	1048299	1048306	0 %	75 %	25 %	0 %	114562069
17049	NC_008345	A	7	7	1048313	1048319	100 %	0 %	0 %	0 %	114562069
17050	NC_008345	GTG	2	6	1048333	1048338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562069
17051	NC_008345	TAAT	2	8	1048378	1048385	50 %	50 %	0 %	0 %	114562069
17052	NC_008345	CGC	2	6	1048497	1048502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114562069
17053	NC_008345	ATT	2	6	1048530	1048535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562069
17054	NC_008345	ATG	2	6	1048590	1048595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562069
17055	NC_008345	TGC	2	6	1048939	1048944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562070
17056	NC_008345	GAT	2	6	1048985	1048990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562070
17057	NC_008345	TTGGGT	2	12	1049062	1049073	0 %	50 %	50 %	0 %	114562070
17058	NC_008345	AATT	2	8	1049190	1049197	50 %	50 %	0 %	0 %	114562070
17059	NC_008345	GCA	2	6	1049284	1049289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562070
17060	NC_008345	GTT	2	6	1049315	1049320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562070
17061	NC_008345	ATCCC	2	10	1049358	1049367	20 %	20 %	0 %	60 %	114562070
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17063	NC_008345	CTG	2	6	1049419	1049424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562070
17064	NC_008345	ATAA	2	8	1049455	1049462	75 %	25 %	0 %	0 %	114562070
17065	NC_008345	A	6	6	1049484	1049489	100 %	0 %	0 %	0 %	114562070
17066	NC_008345	T	6	6	1049506	1049511	0 %	100 %	0 %	0 %	114562070
17067	NC_008345	T	6	6	1049516	1049521	0 %	100 %	0 %	0 %	114562070
17068	NC_008345	TTA	2	6	1049560	1049565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562070
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17083	NC_008345	GCCA	2	8	1050177	1050184	25 %	0 %	25 %	50 %	114562071
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17088	NC_008345	CTTGC	2	10	1050373	1050382	0 %	40 %	20 %	40 %	114562071
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17097	NC_008345	T	6	6	1051079	1051084	0 %	100 %	0 %	0 %	114562072
17098	NC_008345	AACC	2	8	1051189	1051196	50 %	0 %	0 %	50 %	114562072
17099	NC_008345	CAG	2	6	1051227	1051232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562072
17100	NC_008345	TGG	2	6	1051262	1051267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562072
17101	NC_008345	ATG	2	6	1051282	1051287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562072
17102	NC_008345	GAT	2	6	1051322	1051327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562072
17103	NC_008345	TTAAC	2	10	1051345	1051354	40 %	40 %	0 %	20 %	114562072
17104	NC_008345	A	6	6	1051437	1051442	100 %	0 %	0 %	0 %	114562072
17105	NC_008345	AGCA	2	8	1051468	1051475	50 %	0 %	25 %	25 %	114562072
17106	NC_008345	ATT	2	6	1051481	1051486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562072
17107	NC_008345	GCTG	2	8	1051507	1051514	0 %	25 %	50 %	25 %	114562072
17108	NC_008345	AAT	2	6	1051588	1051593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562072
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17111	NC_008345	TGA	2	6	1051818	1051823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562073
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17116	NC_008345	TGG	2	6	1051971	1051976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562073
17117	NC_008345	TTA	2	6	1051977	1051982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562073
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17230	NC_008345	ACC	2	6	1059893	1059898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562078
17231	NC_008345	TAT	2	6	1059921	1059926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562078
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17467	NC_008345	TAT	2	6	1072418	1072423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562090
17468	NC_008345	TAC	2	6	1072507	1072512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562090
17469	NC_008345	AGA	2	6	1072514	1072519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562090
17470	NC_008345	GTTC	2	8	1072603	1072610	0 %	50 %	25 %	25 %	114562090
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