MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008345	CAT	2	6	986009	986014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562015
16002	NC_008345	T	7	7	986168	986174	0 %	100 %	0 %	0 %	114562016
16003	NC_008345	ATTG	2	8	986184	986191	25 %	50 %	25 %	0 %	114562016
16004	NC_008345	A	6	6	986236	986241	100 %	0 %	0 %	0 %	114562016
16005	NC_008345	AGA	2	6	986270	986275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562016
16006	NC_008345	AAC	2	6	986527	986532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562016
16007	NC_008345	AGC	2	6	986624	986629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562016
16008	NC_008345	GCC	2	6	986747	986752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114562016
16009	NC_008345	CGAT	2	8	986771	986778	25 %	25 %	25 %	25 %	114562016
16010	NC_008345	GCA	2	6	986802	986807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562016
16011	NC_008345	CAC	2	6	986821	986826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562016
16012	NC_008345	AGC	2	6	986921	986926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562017
16013	NC_008345	CCA	2	6	987004	987009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562017
16014	NC_008345	T	6	6	987044	987049	0 %	100 %	0 %	0 %	114562017
16015	NC_008345	TA	3	6	987121	987126	50 %	50 %	0 %	0 %	114562017
16016	NC_008345	T	6	6	987173	987178	0 %	100 %	0 %	0 %	114562017
16017	NC_008345	ATA	2	6	987225	987230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562017
16018	NC_008345	T	7	7	987249	987255	0 %	100 %	0 %	0 %	114562017
16019	NC_008345	CTT	2	6	987271	987276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562017
16020	NC_008345	GTT	2	6	987342	987347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562017
16021	NC_008345	T	6	6	987570	987575	0 %	100 %	0 %	0 %	114562018
16022	NC_008345	ACA	2	6	987581	987586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562018
16023	NC_008345	TCA	2	6	987598	987603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562018
16024	NC_008345	ATAA	2	8	987741	987748	75 %	25 %	0 %	0 %	114562018
16025	NC_008345	TTC	2	6	987807	987812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562018
16026	NC_008345	GTT	2	6	987881	987886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562018
16027	NC_008345	AAT	2	6	987888	987893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562018
16028	NC_008345	TCAT	2	8	987895	987902	25 %	50 %	0 %	25 %	114562018
16029	NC_008345	CTG	2	6	988174	988179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562019
16030	NC_008345	ATG	2	6	988195	988200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562019
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16032	NC_008345	CCA	2	6	988404	988409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562019
16033	NC_008345	TGGC	2	8	988436	988443	0 %	25 %	50 %	25 %	114562019
16034	NC_008345	GAA	2	6	988503	988508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562019
16035	NC_008345	TGAAG	2	10	988536	988545	40 %	20 %	40 %	0 %	114562019
16036	NC_008345	TGC	2	6	988562	988567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562019
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16038	NC_008345	GCT	2	6	988653	988658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114562019
16039	NC_008345	GAT	2	6	988670	988675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562019
16040	NC_008345	AGCT	2	8	988699	988706	25 %	25 %	25 %	25 %	114562019
16041	NC_008345	CAC	2	6	988740	988745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114562019
16042	NC_008345	AAG	2	6	988772	988777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562019
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16044	NC_008345	CTT	2	6	989060	989065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562020
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16052	NC_008345	CAT	2	6	989543	989548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562020
16053	NC_008345	GAA	2	6	989562	989567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562020
16054	NC_008345	TGG	2	6	989568	989573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562020
16055	NC_008345	GCA	2	6	989584	989589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562020
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16059	NC_008345	AACT	2	8	989901	989908	50 %	25 %	0 %	25 %	114562020
16060	NC_008345	CACGC	2	10	989997	990006	20 %	0 %	20 %	60 %	114562020
16061	NC_008345	CTT	2	6	990026	990031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562020
16062	NC_008345	TTGG	2	8	990188	990195	0 %	50 %	50 %	0 %	114562020
16063	NC_008345	ATA	3	9	990199	990207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562020
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16094	NC_008345	AAAG	2	8	991761	991768	75 %	0 %	25 %	0 %	114562021
16095	NC_008345	TGA	2	6	991809	991814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562021
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16102	NC_008345	ATTG	2	8	992412	992419	25 %	50 %	25 %	0 %	114562022
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16107	NC_008345	GACA	2	8	992626	992633	50 %	0 %	25 %	25 %	114562022
16108	NC_008345	CACT	2	8	992667	992674	25 %	25 %	0 %	50 %	114562022
16109	NC_008345	CAGCT	2	10	992680	992689	20 %	20 %	20 %	40 %	114562022
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16119	NC_008345	CTT	2	6	993156	993161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562022
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16242	NC_008345	GTT	2	6	999311	999316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562028
16243	NC_008345	CAA	2	6	999326	999331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114562028
16244	NC_008345	ATC	2	6	999333	999338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562028
16245	NC_008345	ACG	2	6	999384	999389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562028
16246	NC_008345	TTGG	2	8	999405	999412	0 %	50 %	50 %	0 %	114562028
16247	NC_008345	TTG	2	6	999438	999443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562028
16248	NC_008345	ATCT	2	8	999450	999457	25 %	50 %	0 %	25 %	114562028
16249	NC_008345	A	7	7	999516	999522	100 %	0 %	0 %	0 %	114562028
16250	NC_008345	TGA	2	6	999828	999833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562029
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16256	NC_008345	A	6	6	1000080	1000085	100 %	0 %	0 %	0 %	114562029
16257	NC_008345	GTG	2	6	1000151	1000156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114562029
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16260	NC_008345	GCA	2	6	1000205	1000210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114562029
16261	NC_008345	ATT	2	6	1000360	1000365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562029
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16281	NC_008345	GTA	2	6	1001935	1001940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562031
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16315	NC_008345	TAT	2	6	1003247	1003252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562032
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16344	NC_008345	ATG	2	6	1005391	1005396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114562035
16345	NC_008345	TCA	2	6	1005400	1005405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562035
16346	NC_008345	A	7	7	1005473	1005479	100 %	0 %	0 %	0 %	114562035
16347	NC_008345	AAG	2	6	1005487	1005492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562035
16348	NC_008345	GAA	2	6	1005508	1005513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114562035
16349	NC_008345	TAA	2	6	1005555	1005560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114562035
16350	NC_008345	TAT	2	6	1005565	1005570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114562035
16351	NC_008345	A	6	6	1005610	1005615	100 %	0 %	0 %	0 %	114562035
16352	NC_008345	TGT	2	6	1005681	1005686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562035
16353	NC_008345	TAC	2	6	1005688	1005693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562035
16354	NC_008345	A	6	6	1005743	1005748	100 %	0 %	0 %	0 %	114562035
16355	NC_008345	TGAT	2	8	1005800	1005807	25 %	50 %	25 %	0 %	114562035
16356	NC_008345	TGT	2	6	1005830	1005835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562035
16357	NC_008345	CTT	2	6	1005975	1005980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562036
16358	NC_008345	TCA	2	6	1006067	1006072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562036
16359	NC_008345	GGCAT	2	10	1006094	1006103	20 %	20 %	40 %	20 %	114562036
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16363	NC_008345	GCAT	2	8	1006367	1006374	25 %	25 %	25 %	25 %	114562036
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16385	NC_008345	GGCAT	2	10	1007631	1007640	20 %	20 %	40 %	20 %	114562037
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16468	NC_008345	AG	3	6	1012655	1012660	50 %	0 %	50 %	0 %	114562039
16469	NC_008345	CGC	2	6	1012730	1012735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114562039
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16472	NC_008345	A	6	6	1012861	1012866	100 %	0 %	0 %	0 %	114562039
16473	NC_008345	TTC	2	6	1012883	1012888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114562039
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16475	NC_008345	ATC	2	6	1013058	1013063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562039
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16477	NC_008345	ATC	2	6	1013725	1013730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114562040
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16481	NC_008345	CT	3	6	1013811	1013816	0 %	50 %	0 %	50 %	114562040
16482	NC_008345	GTT	2	6	1013828	1013833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114562040
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16492	NC_008345	AATGT	2	10	1014420	1014429	40 %	40 %	20 %	0 %	114562040
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16499	NC_008345	AG	3	6	1014759	1014764	50 %	0 %	50 %	0 %	114562040
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