MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008345	CCA	2	6	834843	834848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561892
13502	NC_008345	AGC	2	6	834892	834897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561892
13503	NC_008345	AGA	2	6	835070	835075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561892
13504	NC_008345	GTC	2	6	835106	835111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561893
13505	NC_008345	TTC	2	6	835115	835120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561893
13506	NC_008345	GCG	2	6	835163	835168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561893
13507	NC_008345	TTG	2	6	835200	835205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561893
13508	NC_008345	ATGC	2	8	835243	835250	25 %	25 %	25 %	25 %	114561893
13509	NC_008345	TTC	2	6	835277	835282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561893
13510	NC_008345	T	7	7	835364	835370	0 %	100 %	0 %	0 %	114561893
13511	NC_008345	TTC	2	6	835427	835432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561893
13512	NC_008345	CCA	2	6	835467	835472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561893
13513	NC_008345	ACA	2	6	835482	835487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561893
13514	NC_008345	TCA	2	6	835596	835601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561893
13515	NC_008345	AAC	2	6	835673	835678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561893
13516	NC_008345	ATG	2	6	835773	835778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561893
13517	NC_008345	TGA	2	6	835840	835845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561893
13518	NC_008345	AAT	2	6	835911	835916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561893
13519	NC_008345	CTT	2	6	835940	835945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561893
13520	NC_008345	G	6	6	835962	835967	0 %	0 %	100 %	0 %	114561893
13521	NC_008345	ATA	2	6	835980	835985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561893
13522	NC_008345	TTTA	2	8	836022	836029	25 %	75 %	0 %	0 %	114561894
13523	NC_008345	CAA	2	6	836065	836070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561894
13524	NC_008345	CTT	2	6	836101	836106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561894
13525	NC_008345	ATA	2	6	836112	836117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561894
13526	NC_008345	TG	3	6	836158	836163	0 %	50 %	50 %	0 %	114561894
13527	NC_008345	CTT	2	6	836200	836205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561894
13528	NC_008345	CCA	2	6	836209	836214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561894
13529	NC_008345	AAT	2	6	836241	836246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561894
13530	NC_008345	GGC	2	6	836262	836267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561894
13531	NC_008345	GCT	2	6	836329	836334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561894
13532	NC_008345	CAA	2	6	836350	836355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561894
13533	NC_008345	CTA	2	6	836371	836376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561894
13534	NC_008345	TTTG	2	8	836382	836389	0 %	75 %	25 %	0 %	114561894
13535	NC_008345	TTG	2	6	836584	836589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561895
13536	NC_008345	CAA	2	6	836622	836627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561895
13537	NC_008345	AAT	2	6	836842	836847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561895
13538	NC_008345	CAT	2	6	836853	836858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561895
13539	NC_008345	GTCC	2	8	836864	836871	0 %	25 %	25 %	50 %	114561895
13540	NC_008345	AGCG	2	8	836881	836888	25 %	0 %	50 %	25 %	114561895
13541	NC_008345	CGC	2	6	836904	836909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561895
13542	NC_008345	CAT	2	6	836941	836946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561895
13543	NC_008345	CAT	2	6	836958	836963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561895
13544	NC_008345	A	6	6	837011	837016	100 %	0 %	0 %	0 %	114561895
13545	NC_008345	TAG	2	6	837052	837057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561895
13546	NC_008345	ACG	2	6	837061	837066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561895
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13548	NC_008345	CCG	2	6	837093	837098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561895
13549	NC_008345	TACCTG	2	12	837120	837131	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114561895
13550	NC_008345	AC	3	6	837180	837185	50 %	0 %	0 %	50 %	114561895
13551	NC_008345	GTC	2	6	837244	837249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561895
13552	NC_008345	CTT	2	6	837279	837284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561895
13553	NC_008345	CAC	2	6	837298	837303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561895
13554	NC_008345	CAA	2	6	837364	837369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561895
13555	NC_008345	CAA	2	6	837402	837407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561895
13556	NC_008345	AAT	2	6	837430	837435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561895
13557	NC_008345	GTT	2	6	837459	837464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561895
13558	NC_008345	TGT	2	6	837468	837473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561895
13559	NC_008345	GGC	2	6	837501	837506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561895
13560	NC_008345	TGG	2	6	837537	837542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561895
13561	NC_008345	CTTG	2	8	837765	837772	0 %	50 %	25 %	25 %	114561896
13562	NC_008345	CATTT	2	10	837817	837826	20 %	60 %	0 %	20 %	114561896
13563	NC_008345	CAC	2	6	837828	837833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561896
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13565	NC_008345	TTC	2	6	837968	837973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561896
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13568	NC_008345	TTC	2	6	838084	838089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561896
13569	NC_008345	CAT	2	6	838098	838103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561896
13570	NC_008345	CTG	2	6	838113	838118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561896
13571	NC_008345	TAAAGC	2	12	838146	838157	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	114561896
13572	NC_008345	AAT	2	6	838231	838236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561896
13573	NC_008345	CGA	2	6	838280	838285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561896
13574	NC_008345	AAT	2	6	838490	838495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561896
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13576	NC_008345	TTCAC	2	10	838565	838574	20 %	40 %	0 %	40 %	114561896
13577	NC_008345	GGC	2	6	838585	838590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561896
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13579	NC_008345	AGAA	2	8	838665	838672	75 %	0 %	25 %	0 %	114561896
13580	NC_008345	TACT	2	8	838676	838683	25 %	50 %	0 %	25 %	114561896
13581	NC_008345	ATCA	2	8	838774	838781	50 %	25 %	0 %	25 %	114561896
13582	NC_008345	CGC	2	6	838791	838796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561896
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13586	NC_008345	AAT	2	6	838921	838926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561896
13587	NC_008345	AGC	2	6	839018	839023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561896
13588	NC_008345	TCGC	2	8	839036	839043	0 %	25 %	25 %	50 %	114561896
13589	NC_008345	GTC	2	6	839071	839076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561896
13590	NC_008345	TAA	2	6	839077	839082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561896
13591	NC_008345	TGA	2	6	839095	839100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561896
13592	NC_008345	TCAT	2	8	839108	839115	25 %	50 %	0 %	25 %	114561896
13593	NC_008345	T	6	6	839143	839148	0 %	100 %	0 %	0 %	114561896
13594	NC_008345	TCA	2	6	839151	839156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561896
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13596	NC_008345	TTG	2	6	839355	839360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561897
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13599	NC_008345	ATT	2	6	839526	839531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561897
13600	NC_008345	AGC	2	6	839532	839537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561897
13601	NC_008345	TCG	2	6	839543	839548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561897
13602	NC_008345	ATG	2	6	839644	839649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561897
13603	NC_008345	TTCA	2	8	839883	839890	25 %	50 %	0 %	25 %	114561898
13604	NC_008345	ATG	2	6	839924	839929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561898
13605	NC_008345	GTT	2	6	839935	839940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561898
13606	NC_008345	GGC	2	6	839941	839946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561898
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13608	NC_008345	GCT	2	6	840120	840125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561898
13609	NC_008345	T	6	6	840229	840234	0 %	100 %	0 %	0 %	114561898
13610	NC_008345	CAA	2	6	840265	840270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561898
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13614	NC_008345	CGC	2	6	840503	840508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561898
13615	NC_008345	CAAT	2	8	840511	840518	50 %	25 %	0 %	25 %	114561898
13616	NC_008345	GCA	2	6	840525	840530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561898
13617	NC_008345	CAA	2	6	840742	840747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561898
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13619	NC_008345	TTA	2	6	840767	840772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561898
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13980	NC_008345	GTT	2	6	865547	865552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561921
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