MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_008345	AGAC	2	8	509671	509678	50 %	0 %	25 %	25 %	114561631
8503	NC_008345	TTA	2	6	509702	509707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561631
8504	NC_008345	TGG	2	6	509791	509796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561631
8505	NC_008345	TGT	2	6	509806	509811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561631
8506	NC_008345	AAC	2	6	509832	509837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561631
8507	NC_008345	T	7	7	509979	509985	0 %	100 %	0 %	0 %	114561632
8508	NC_008345	TTG	2	6	510045	510050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561632
8509	NC_008345	GCC	2	6	510056	510061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561632
8510	NC_008345	AGATTT	2	12	510071	510082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	114561632
8511	NC_008345	GTT	2	6	510142	510147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561632
8512	NC_008345	AGCCA	2	10	510280	510289	40 %	0 %	20 %	40 %	114561632
8513	NC_008345	A	7	7	510306	510312	100 %	0 %	0 %	0 %	114561632
8514	NC_008345	A	6	6	510316	510321	100 %	0 %	0 %	0 %	114561632
8515	NC_008345	TATT	2	8	510324	510331	25 %	75 %	0 %	0 %	114561632
8516	NC_008345	TTAT	2	8	510350	510357	25 %	75 %	0 %	0 %	114561632
8517	NC_008345	TG	3	6	510387	510392	0 %	50 %	50 %	0 %	114561632
8518	NC_008345	AGC	2	6	510438	510443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561632
8519	NC_008345	GCG	2	6	510535	510540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561632
8520	NC_008345	CAG	2	6	510541	510546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561632
8521	NC_008345	GCA	2	6	510582	510587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561632
8522	NC_008345	TGG	2	6	510638	510643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561632
8523	NC_008345	GACCG	2	10	510689	510698	20 %	0 %	40 %	40 %	114561632
8524	NC_008345	ATG	2	6	510712	510717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561632
8525	NC_008345	AGCA	2	8	510795	510802	50 %	0 %	25 %	25 %	114561633
8526	NC_008345	ATG	2	6	510842	510847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561633
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8529	NC_008345	T	7	7	510913	510919	0 %	100 %	0 %	0 %	114561633
8530	NC_008345	TTA	2	6	510935	510940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561633
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8532	NC_008345	A	6	6	511165	511170	100 %	0 %	0 %	0 %	114561633
8533	NC_008345	TTA	2	6	511261	511266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561633
8534	NC_008345	GTTT	2	8	511299	511306	0 %	75 %	25 %	0 %	114561633
8535	NC_008345	TGA	2	6	511345	511350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561633
8536	NC_008345	CGT	2	6	511436	511441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561633
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8538	NC_008345	TGA	2	6	511563	511568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561634
8539	NC_008345	ACTG	2	8	511574	511581	25 %	25 %	25 %	25 %	114561634
8540	NC_008345	CGT	2	6	511661	511666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561634
8541	NC_008345	TCAAC	2	10	511688	511697	40 %	20 %	0 %	40 %	114561634
8542	NC_008345	ATCTTT	2	12	511768	511779	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	114561634
8543	NC_008345	T	6	6	511810	511815	0 %	100 %	0 %	0 %	114561634
8544	NC_008345	TGGATG	2	12	511896	511907	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	114561634
8545	NC_008345	GAT	2	6	511937	511942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561634
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8553	NC_008345	AGC	2	6	512588	512593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561635
8554	NC_008345	TAA	2	6	512603	512608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561635
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8557	NC_008345	GCA	2	6	512652	512657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561635
8558	NC_008345	GC	3	6	512713	512718	0 %	0 %	50 %	50 %	114561635
8559	NC_008345	TTA	2	6	512740	512745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561635
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8563	NC_008345	TGA	2	6	512832	512837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561635
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8598	NC_008345	AC	3	6	514943	514948	50 %	0 %	0 %	50 %	114561638
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8600	NC_008345	CG	3	6	514971	514976	0 %	0 %	50 %	50 %	114561638
8601	NC_008345	TACC	2	8	515023	515030	25 %	25 %	0 %	50 %	114561638
8602	NC_008345	GCTT	2	8	515072	515079	0 %	50 %	25 %	25 %	114561638
8603	NC_008345	CGT	2	6	515131	515136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561638
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8606	NC_008345	GTT	2	6	515178	515183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561638
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8609	NC_008345	ATTG	2	8	515230	515237	25 %	50 %	25 %	0 %	114561638
8610	NC_008345	T	7	7	515409	515415	0 %	100 %	0 %	0 %	114561638
8611	NC_008345	T	7	7	515460	515466	0 %	100 %	0 %	0 %	114561638
8612	NC_008345	TGT	2	6	515503	515508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561638
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8618	NC_008345	TGGCCA	2	12	516435	516446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114561639
8619	NC_008345	TTA	2	6	516482	516487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561639
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