MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78501	NC_008345	GCT	2	6	4841879	4841884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565212
78502	NC_008345	CTT	2	6	4841931	4841936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565212
78503	NC_008345	TGC	2	6	4841974	4841979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565212
78504	NC_008345	ACC	2	6	4842139	4842144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565212
78505	NC_008345	A	6	6	4842196	4842201	100 %	0 %	0 %	0 %	114565212
78506	NC_008345	ATCA	2	8	4842217	4842224	50 %	25 %	0 %	25 %	114565212
78507	NC_008345	AAT	2	6	4842286	4842291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565212
78508	NC_008345	ATG	2	6	4842332	4842337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565212
78509	NC_008345	TGT	2	6	4842385	4842390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565212
78510	NC_008345	ATAA	2	8	4842505	4842512	75 %	25 %	0 %	0 %	114565213
78511	NC_008345	CTG	2	6	4842517	4842522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565213
78512	NC_008345	TG	3	6	4842521	4842526	0 %	50 %	50 %	0 %	114565213
78513	NC_008345	AAG	2	6	4842581	4842586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565213
78514	NC_008345	CAT	2	6	4842616	4842621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565213
78515	NC_008345	TTG	2	6	4842642	4842647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565213
78516	NC_008345	T	6	6	4842663	4842668	0 %	100 %	0 %	0 %	114565213
78517	NC_008345	TAG	2	6	4842781	4842786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565213
78518	NC_008345	TCTT	2	8	4842860	4842867	0 %	75 %	0 %	25 %	114565213
78519	NC_008345	CAT	2	6	4842877	4842882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565213
78520	NC_008345	TCA	2	6	4842905	4842910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565213
78521	NC_008345	ACC	2	6	4843000	4843005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565213
78522	NC_008345	ACGG	2	8	4843006	4843013	25 %	0 %	50 %	25 %	114565213
78523	NC_008345	AAT	2	6	4843027	4843032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565213
78524	NC_008345	TGAT	2	8	4843057	4843064	25 %	50 %	25 %	0 %	114565213
78525	NC_008345	ACC	2	6	4843098	4843103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565213
78526	NC_008345	AAG	2	6	4843106	4843111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565213
78527	NC_008345	CAA	2	6	4843119	4843124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565213
78528	NC_008345	T	6	6	4843166	4843171	0 %	100 %	0 %	0 %	114565213
78529	NC_008345	CAC	2	6	4843233	4843238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565213
78530	NC_008345	CCA	2	6	4843259	4843264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565213
78531	NC_008345	GGC	2	6	4843304	4843309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565213
78532	NC_008345	TGT	2	6	4843331	4843336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565213
78533	NC_008345	ACC	2	6	4843351	4843356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565213
78534	NC_008345	CAC	3	9	4843437	4843445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565213
78535	NC_008345	CAT	3	9	4843456	4843464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565213
78536	NC_008345	GCT	2	6	4843465	4843470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565213
78537	NC_008345	CAT	2	6	4843563	4843568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565213
78538	NC_008345	CTG	2	6	4843617	4843622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565213
78539	NC_008345	GCT	2	6	4843694	4843699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565213
78540	NC_008345	ACT	2	6	4843711	4843716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565213
78541	NC_008345	ACT	2	6	4843798	4843803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565213
78542	NC_008345	CAC	2	6	4843848	4843853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565213
78543	NC_008345	TAA	2	6	4843896	4843901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565213
78544	NC_008345	AT	3	6	4843938	4843943	50 %	50 %	0 %	0 %	114565213
78545	NC_008345	TGT	2	6	4843967	4843972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565213
78546	NC_008345	GGC	2	6	4843975	4843980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565213
78547	NC_008345	TTG	2	6	4844038	4844043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565213
78548	NC_008345	CAG	2	6	4844065	4844070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565213
78549	NC_008345	AT	3	6	4844082	4844087	50 %	50 %	0 %	0 %	114565213
78550	NC_008345	TATT	2	8	4844108	4844115	25 %	75 %	0 %	0 %	114565214
78551	NC_008345	G	6	6	4844132	4844137	0 %	0 %	100 %	0 %	114565214
78552	NC_008345	CCG	2	6	4844150	4844155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565214
78553	NC_008345	ATA	2	6	4844242	4844247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565214
78554	NC_008345	TTTCCA	2	12	4844393	4844404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	114565215
78555	NC_008345	ATATCT	2	12	4844431	4844442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	114565215
78556	NC_008345	CAG	2	6	4844591	4844596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565215
78557	NC_008345	GATTG	2	10	4844607	4844616	20 %	40 %	40 %	0 %	114565215
78558	NC_008345	ACG	3	9	4844727	4844735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565216
78559	NC_008345	GCC	2	6	4844751	4844756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565216
78560	NC_008345	ATG	2	6	4844833	4844838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565216

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.