MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 78560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_008345	ACG	2	6	394442	394447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561553
6503	NC_008345	CGG	2	6	394466	394471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561553
6504	NC_008345	T	7	7	394505	394511	0 %	100 %	0 %	0 %	114561553
6505	NC_008345	CAAT	2	8	394530	394537	50 %	25 %	0 %	25 %	114561553
6506	NC_008345	TAA	2	6	394672	394677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561553
6507	NC_008345	TGT	2	6	394686	394691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561553
6508	NC_008345	TGA	2	6	394784	394789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561553
6509	NC_008345	TGAT	2	8	395211	395218	25 %	50 %	25 %	0 %	114561554
6510	NC_008345	ATT	2	6	395277	395282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561554
6511	NC_008345	TTG	2	6	395295	395300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561554
6512	NC_008345	GCT	2	6	395310	395315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561554
6513	NC_008345	TAAT	2	8	395335	395342	50 %	50 %	0 %	0 %	114561554
6514	NC_008345	TGCC	2	8	395365	395372	0 %	25 %	25 %	50 %	114561554
6515	NC_008345	ATG	2	6	395401	395406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561554
6516	NC_008345	TGT	2	6	395438	395443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561554
6517	NC_008345	TTTG	2	8	395510	395517	0 %	75 %	25 %	0 %	114561554
6518	NC_008345	TGG	2	6	395528	395533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561554
6519	NC_008345	ATC	2	6	395629	395634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561554
6520	NC_008345	TGA	2	6	395714	395719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561554
6521	NC_008345	GTC	2	6	395721	395726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561554
6522	NC_008345	CTG	2	6	395752	395757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561554
6523	NC_008345	AGC	2	6	395767	395772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561554
6524	NC_008345	ATG	3	9	395779	395787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561554
6525	NC_008345	CA	4	8	395819	395826	50 %	0 %	0 %	50 %	114561554
6526	NC_008345	CGT	2	6	395881	395886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561554
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6528	NC_008345	CAAA	2	8	395988	395995	75 %	0 %	0 %	25 %	114561554
6529	NC_008345	TAT	2	6	396026	396031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561554
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6531	NC_008345	TGA	2	6	396113	396118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561554
6532	NC_008345	CAA	3	9	396129	396137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561554
6533	NC_008345	TG	3	6	396424	396429	0 %	50 %	50 %	0 %	114561554
6534	NC_008345	CTT	2	6	396680	396685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561555
6535	NC_008345	GTGA	2	8	396687	396694	25 %	25 %	50 %	0 %	114561555
6536	NC_008345	TGC	2	6	396767	396772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561555
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6538	NC_008345	GGC	2	6	396962	396967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561555
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6540	NC_008345	GTTTGT	2	12	397132	397143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561555
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6544	NC_008345	GCA	3	9	397401	397409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561555
6545	NC_008345	ATT	2	6	397437	397442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561555
6546	NC_008345	ATT	2	6	397519	397524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561555
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6549	NC_008345	ATTTC	2	10	397843	397852	20 %	60 %	0 %	20 %	114561556
6550	NC_008345	TGA	2	6	397909	397914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561556
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6552	NC_008345	TAA	2	6	398017	398022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561556
6553	NC_008345	CTGT	2	8	398024	398031	0 %	50 %	25 %	25 %	114561556
6554	NC_008345	CAGT	2	8	398050	398057	25 %	25 %	25 %	25 %	114561556
6555	NC_008345	TGC	2	6	398062	398067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561556
6556	NC_008345	TTTG	2	8	398079	398086	0 %	75 %	25 %	0 %	114561556
6557	NC_008345	TGAT	2	8	398109	398116	25 %	50 %	25 %	0 %	114561556
6558	NC_008345	ATT	2	6	398144	398149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561556
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6561	NC_008345	GCAAA	2	10	398241	398250	60 %	0 %	20 %	20 %	114561556
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6569	NC_008345	CAA	2	6	398657	398662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561557
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6584	NC_008345	ATTGA	2	10	399795	399804	40 %	40 %	20 %	0 %	114561557
6585	NC_008345	CGA	2	6	399827	399832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561557
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6589	NC_008345	GCTT	2	8	399964	399971	0 %	50 %	25 %	25 %	114561557
6590	NC_008345	TTCCA	2	10	400027	400036	20 %	40 %	0 %	40 %	114561557
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6593	NC_008345	CGGC	2	8	400100	400107	0 %	0 %	50 %	50 %	114561557
6594	NC_008345	CGTT	2	8	400128	400135	0 %	50 %	25 %	25 %	114561557
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6605	NC_008345	AAGA	2	8	400716	400723	75 %	0 %	25 %	0 %	114561557
6606	NC_008345	TTTC	2	8	400724	400731	0 %	75 %	0 %	25 %	114561557
6607	NC_008345	AT	3	6	400741	400746	50 %	50 %	0 %	0 %	114561557
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6609	NC_008345	TGT	2	6	400821	400826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561557
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6612	NC_008345	A	6	6	400881	400886	100 %	0 %	0 %	0 %	114561557
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6614	NC_008345	ATTA	2	8	400914	400921	50 %	50 %	0 %	0 %	114561557
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6987	NC_008345	CAA	2	6	422172	422177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561579
6988	NC_008345	TCT	2	6	422215	422220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561579
6989	NC_008345	GCA	2	6	422222	422227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561579
6990	NC_008345	ATC	2	6	422258	422263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561579
6991	NC_008345	ATT	2	6	422282	422287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561579
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6995	NC_008345	TGA	2	6	422490	422495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561579
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