MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008322	GAC	2	6	168287	168292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045659
2502	NC_008322	AGA	2	6	168302	168307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045659
2503	NC_008322	TAA	2	6	168440	168445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045659
2504	NC_008322	CAGT	2	8	168545	168552	25 %	25 %	25 %	25 %	114045659
2505	NC_008322	GCC	2	6	168555	168560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045659
2506	NC_008322	TCA	2	6	168610	168615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045659
2507	NC_008322	CCG	2	6	168680	168685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045659
2508	NC_008322	CGA	2	6	168704	168709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045659
2509	NC_008322	GC	3	6	169255	169260	0 %	0 %	50 %	50 %	114045660
2510	NC_008322	GCC	2	6	169299	169304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045660
2511	NC_008322	CCAG	2	8	169308	169315	25 %	0 %	25 %	50 %	114045660
2512	NC_008322	TCA	2	6	169358	169363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045660
2513	NC_008322	GAA	2	6	169395	169400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045660
2514	NC_008322	GC	3	6	169403	169408	0 %	0 %	50 %	50 %	114045660
2515	NC_008322	AG	3	6	169485	169490	50 %	0 %	50 %	0 %	114045660
2516	NC_008322	GGT	2	6	169531	169536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045660
2517	NC_008322	TGCG	2	8	169572	169579	0 %	25 %	50 %	25 %	114045660
2518	NC_008322	TCT	2	6	169597	169602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045660
2519	NC_008322	GCT	2	6	169656	169661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045660
2520	NC_008322	AGC	2	6	169781	169786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045660
2521	NC_008322	GAA	2	6	169896	169901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045660
2522	NC_008322	AGT	2	6	169905	169910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045660
2523	NC_008322	GCA	2	6	169967	169972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045660
2524	NC_008322	CTT	2	6	169998	170003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045660
2525	NC_008322	CCG	2	6	170066	170071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045660
2526	NC_008322	TGA	2	6	170123	170128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045660
2527	NC_008322	TTC	2	6	170160	170165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045660
2528	NC_008322	GAT	2	6	170169	170174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045660
2529	NC_008322	GTC	2	6	170215	170220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045660
2530	NC_008322	CTGG	2	8	170228	170235	0 %	25 %	50 %	25 %	114045660
2531	NC_008322	ACAA	2	8	170272	170279	75 %	0 %	0 %	25 %	114045660
2532	NC_008322	CGC	2	6	170477	170482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045660
2533	NC_008322	ATCC	2	8	170540	170547	25 %	25 %	0 %	50 %	114045660
2534	NC_008322	CTG	2	6	170756	170761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045661
2535	NC_008322	TGC	2	6	170792	170797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045661
2536	NC_008322	TCT	2	6	170979	170984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045661
2537	NC_008322	TGG	2	6	171046	171051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045661
2538	NC_008322	TCT	2	6	171090	171095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045661
2539	NC_008322	GCTT	2	8	171129	171136	0 %	50 %	25 %	25 %	114045661
2540	NC_008322	GGTA	2	8	171161	171168	25 %	25 %	50 %	0 %	114045661
2541	NC_008322	CTGA	2	8	171175	171182	25 %	25 %	25 %	25 %	114045661
2542	NC_008322	AGT	2	6	171187	171192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045661
2543	NC_008322	CA	3	6	171197	171202	50 %	0 %	0 %	50 %	114045661
2544	NC_008322	GCT	2	6	171204	171209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045661
2545	NC_008322	TCG	2	6	171315	171320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045661
2546	NC_008322	TGC	2	6	171357	171362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045661
2547	NC_008322	TAA	2	6	171452	171457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045661
2548	NC_008322	CGC	2	6	171464	171469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045661
2549	NC_008322	CAG	2	6	171482	171487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045661
2550	NC_008322	GGGT	2	8	171500	171507	0 %	25 %	75 %	0 %	114045661
2551	NC_008322	CAC	2	6	171559	171564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045661
2552	NC_008322	ATC	2	6	171609	171614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045661
2553	NC_008322	TCG	2	6	171677	171682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045662
2554	NC_008322	ATT	2	6	171716	171721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045662
2555	NC_008322	TTC	2	6	171782	171787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045662
2556	NC_008322	T	7	7	171833	171839	0 %	100 %	0 %	0 %	114045662
2557	NC_008322	GCC	2	6	171941	171946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045662
2558	NC_008322	TTA	2	6	172306	172311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045663
2559	NC_008322	TGGTT	2	10	172372	172381	0 %	60 %	40 %	0 %	114045663
2560	NC_008322	CT	3	6	172609	172614	0 %	50 %	0 %	50 %	114045663
2561	NC_008322	GTG	2	6	172630	172635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045663
2562	NC_008322	CCG	2	6	172643	172648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045663
2563	NC_008322	AAG	2	6	172739	172744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045663
2564	NC_008322	ATC	2	6	172762	172767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045663
2565	NC_008322	CGT	2	6	173007	173012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045663
2566	NC_008322	AAGC	2	8	173053	173060	50 %	0 %	25 %	25 %	114045663
2567	NC_008322	ATG	2	6	173134	173139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045663
2568	NC_008322	CAT	2	6	173169	173174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045663
2569	NC_008322	AAT	2	6	173247	173252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045664
2570	NC_008322	TGGC	2	8	173294	173301	0 %	25 %	50 %	25 %	114045664
2571	NC_008322	TTTG	2	8	173323	173330	0 %	75 %	25 %	0 %	114045664
2572	NC_008322	CAT	2	6	173412	173417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045664
2573	NC_008322	CGACC	2	10	173421	173430	20 %	0 %	20 %	60 %	114045664
2574	NC_008322	TTC	2	6	173491	173496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045664
2575	NC_008322	TCG	2	6	173528	173533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045664
2576	NC_008322	TCA	2	6	173549	173554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045664
2577	NC_008322	AACGAC	2	12	173602	173613	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	114045664
2578	NC_008322	TGA	2	6	173625	173630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045664
2579	NC_008322	GTT	2	6	173685	173690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045664
2580	NC_008322	GCCGC	2	10	173765	173774	0 %	0 %	40 %	60 %	114045664
2581	NC_008322	AGTT	2	8	173786	173793	25 %	50 %	25 %	0 %	114045664
2582	NC_008322	GTG	2	6	173839	173844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045664
2583	NC_008322	CG	3	6	173899	173904	0 %	0 %	50 %	50 %	114045664
2584	NC_008322	CGA	2	6	173952	173957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045664
2585	NC_008322	GTG	2	6	173981	173986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045664
2586	NC_008322	GCC	2	6	173996	174001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045664
2587	NC_008322	CGT	2	6	174172	174177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045664
2588	NC_008322	CGC	2	6	174283	174288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045664
2589	NC_008322	GCGG	2	8	174370	174377	0 %	0 %	75 %	25 %	114045664
2590	NC_008322	GGCA	2	8	174434	174441	25 %	0 %	50 %	25 %	114045664
2591	NC_008322	AAG	2	6	174662	174667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045664
2592	NC_008322	TCG	2	6	174677	174682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045664
2593	NC_008322	ACA	2	6	174725	174730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045664
2594	NC_008322	GTG	2	6	174781	174786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045664
2595	NC_008322	AAG	2	6	174830	174835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045664
2596	NC_008322	ACC	2	6	174892	174897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045664
2597	NC_008322	GTG	2	6	174925	174930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045664
2598	NC_008322	GGT	2	6	174934	174939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045664
2599	NC_008322	GAA	2	6	174949	174954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045664
2600	NC_008322	TCT	2	6	175021	175026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045664
2601	NC_008322	AAG	2	6	175033	175038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045664
2602	NC_008322	TGA	2	6	175052	175057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045664
2603	NC_008322	TCA	2	6	175061	175066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045664
2604	NC_008322	CCA	2	6	175070	175075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045664
2605	NC_008322	AGC	2	6	175148	175153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045664
2606	NC_008322	GCG	2	6	175160	175165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045664
2607	NC_008322	GAA	2	6	175201	175206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045664
2608	NC_008322	AATC	2	8	175210	175217	50 %	25 %	0 %	25 %	114045664
2609	NC_008322	GCC	2	6	175227	175232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045664
2610	NC_008322	AAG	2	6	175262	175267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045664
2611	NC_008322	TGA	2	6	175424	175429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045665
2612	NC_008322	CAG	2	6	175442	175447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045665
2613	NC_008322	CTTTGC	2	12	175463	175474	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	114045665
2614	NC_008322	GC	3	6	175566	175571	0 %	0 %	50 %	50 %	114045665
2615	NC_008322	GCA	2	6	175667	175672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045665
2616	NC_008322	GAT	3	9	175755	175763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045665
2617	NC_008322	TAT	2	6	175769	175774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045665
2618	NC_008322	AGA	2	6	175811	175816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045665
2619	NC_008322	GAAG	2	8	175886	175893	50 %	0 %	50 %	0 %	114045665
2620	NC_008322	TTG	2	6	175923	175928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045665
2621	NC_008322	GTG	2	6	176067	176072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045665
2622	NC_008322	CGA	2	6	176150	176155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045665
2623	NC_008322	TCG	2	6	176162	176167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045665
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2734	NC_008322	GC	3	6	181504	181509	0 %	0 %	50 %	50 %	114045672
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2737	NC_008322	GATGC	2	10	181646	181655	20 %	20 %	40 %	20 %	114045672
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2741	NC_008322	GCCT	2	8	181872	181879	0 %	25 %	25 %	50 %	114045672
2742	NC_008322	CGA	2	6	181924	181929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045672
2743	NC_008322	GTCG	2	8	181933	181940	0 %	25 %	50 %	25 %	114045672
2744	NC_008322	GC	3	6	182015	182020	0 %	0 %	50 %	50 %	114045672
2745	NC_008322	GT	3	6	182055	182060	0 %	50 %	50 %	0 %	114045672
2746	NC_008322	TTGTC	2	10	182133	182142	0 %	60 %	20 %	20 %	114045672
2747	NC_008322	TCA	2	6	182167	182172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045672
2748	NC_008322	CAA	2	6	182222	182227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045672
2749	NC_008322	GTG	2	6	182228	182233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045672
2750	NC_008322	GTG	2	6	182307	182312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045672
2751	NC_008322	T	6	6	182318	182323	0 %	100 %	0 %	0 %	114045672
2752	NC_008322	CGT	2	6	182474	182479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045672
2753	NC_008322	ATGG	2	8	182486	182493	25 %	25 %	50 %	0 %	114045672
2754	NC_008322	GAG	2	6	182542	182547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045672
2755	NC_008322	TGG	2	6	182574	182579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045673
2756	NC_008322	CG	3	6	182593	182598	0 %	0 %	50 %	50 %	114045673
2757	NC_008322	AGC	2	6	182599	182604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045673
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2759	NC_008322	GCA	3	9	182711	182719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045673
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2762	NC_008322	ATT	2	6	182920	182925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045673
2763	NC_008322	A	6	6	182943	182948	100 %	0 %	0 %	0 %	114045673
2764	NC_008322	GGCT	2	8	182990	182997	0 %	25 %	50 %	25 %	114045673
2765	NC_008322	A	8	8	183058	183065	100 %	0 %	0 %	0 %	114045674
2766	NC_008322	TTTA	2	8	183084	183091	25 %	75 %	0 %	0 %	114045674
2767	NC_008322	CTGC	2	8	183143	183150	0 %	25 %	25 %	50 %	114045674
2768	NC_008322	GAGT	2	8	183168	183175	25 %	25 %	50 %	0 %	114045674
2769	NC_008322	GCA	2	6	183192	183197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045674
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2774	NC_008322	CTG	2	6	183452	183457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045674
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2848	NC_008322	CTG	2	6	188499	188504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045681
2849	NC_008322	AGTC	2	8	188517	188524	25 %	25 %	25 %	25 %	114045681
2850	NC_008322	GCCTT	2	10	188707	188716	0 %	40 %	20 %	40 %	114045681
2851	NC_008322	CG	3	6	188736	188741	0 %	0 %	50 %	50 %	114045681
2852	NC_008322	CCG	2	6	188754	188759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045681
2853	NC_008322	AAG	2	6	188817	188822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045681
2854	NC_008322	CTGGTT	2	12	188867	188878	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	114045681
2855	NC_008322	GTG	2	6	188946	188951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045681
2856	NC_008322	GCT	3	9	188954	188962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045681
2857	NC_008322	TGC	2	6	189040	189045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045681
2858	NC_008322	TCC	2	6	189098	189103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045681
2859	NC_008322	GCCGA	2	10	189150	189159	20 %	0 %	40 %	40 %	114045681
2860	NC_008322	CTT	2	6	189182	189187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045681
2861	NC_008322	GGT	2	6	189204	189209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045681
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2863	NC_008322	GTT	2	6	189323	189328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045681
2864	NC_008322	G	7	7	189345	189351	0 %	0 %	100 %	0 %	114045681
2865	NC_008322	CTGG	2	8	189352	189359	0 %	25 %	50 %	25 %	114045681
2866	NC_008322	CTG	2	6	189381	189386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045681
2867	NC_008322	TGA	2	6	189391	189396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045681
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2869	NC_008322	GTGACT	2	12	189486	189497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114045681
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2871	NC_008322	TTCGT	2	10	189598	189607	0 %	60 %	20 %	20 %	114045681
2872	NC_008322	CGC	2	6	189682	189687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045681
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2880	NC_008322	TGCT	2	8	190276	190283	0 %	50 %	25 %	25 %	114045682
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2887	NC_008322	CTT	2	6	190704	190709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045682
2888	NC_008322	CGT	2	6	190712	190717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045682
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2894	NC_008322	TGT	2	6	190967	190972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045682
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2970	NC_008322	GTC	2	6	195707	195712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045687
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2983	NC_008322	CAC	2	6	196324	196329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045687
2984	NC_008322	ATT	2	6	196359	196364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045688
2985	NC_008322	TTCT	2	8	196428	196435	0 %	75 %	0 %	25 %	114045688
2986	NC_008322	ACG	2	6	196513	196518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045688
2987	NC_008322	AGT	2	6	196705	196710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045688
2988	NC_008322	CAA	2	6	196725	196730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045688
2989	NC_008322	GGC	2	6	203243	203248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045689
2990	NC_008322	GAT	2	6	203267	203272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045689
2991	NC_008322	GT	3	6	203292	203297	0 %	50 %	50 %	0 %	114045689
2992	NC_008322	CACT	2	8	203329	203336	25 %	25 %	0 %	50 %	114045689
2993	NC_008322	AGTTC	2	10	203377	203386	20 %	40 %	20 %	20 %	114045689
2994	NC_008322	TGC	2	6	203446	203451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045689
2995	NC_008322	TAC	2	6	203548	203553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045689
2996	NC_008322	CCG	2	6	203622	203627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045689
2997	NC_008322	TGAGG	2	10	203734	203743	20 %	20 %	60 %	0 %	114045689
2998	NC_008322	ACCCA	2	10	203755	203764	40 %	0 %	0 %	60 %	114045689
2999	NC_008322	GAA	2	6	203765	203770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045689
3000	NC_008322	GCG	2	6	203813	203818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045689

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