MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_008322	TGT	2	6	1227537	1227542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046568
18502	NC_008322	GCG	2	6	1227548	1227553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046568
18503	NC_008322	TGT	2	6	1227753	1227758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046568
18504	NC_008322	ATGA	2	8	1227938	1227945	50 %	25 %	25 %	0 %	114046569
18505	NC_008322	AGT	2	6	1227950	1227955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046569
18506	NC_008322	CTA	2	6	1227959	1227964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046569
18507	NC_008322	TTAA	2	8	1227980	1227987	50 %	50 %	0 %	0 %	114046569
18508	NC_008322	ATTT	2	8	1228035	1228042	25 %	75 %	0 %	0 %	114046569
18509	NC_008322	AGTGG	2	10	1228249	1228258	20 %	20 %	60 %	0 %	114046569
18510	NC_008322	TCA	2	6	1228497	1228502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046570
18511	NC_008322	GCG	2	6	1228529	1228534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046570
18512	NC_008322	TCG	3	9	1228579	1228587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046570
18513	NC_008322	GTCGAT	2	12	1228746	1228757	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114046570
18514	NC_008322	GCA	2	6	1228856	1228861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046570
18515	NC_008322	ACG	3	9	1228942	1228950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046570
18516	NC_008322	T	6	6	1229013	1229018	0 %	100 %	0 %	0 %	114046571
18517	NC_008322	ACG	2	6	1229019	1229024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046571
18518	NC_008322	CAG	2	6	1229040	1229045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046571
18519	NC_008322	CAC	2	6	1229048	1229053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046571
18520	NC_008322	AGCAGT	2	12	1229056	1229067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114046571
18521	NC_008322	TCG	2	6	1229117	1229122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046571
18522	NC_008322	TCA	2	6	1229176	1229181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046571
18523	NC_008322	GTT	2	6	1229199	1229204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046571
18524	NC_008322	GC	3	6	1229209	1229214	0 %	0 %	50 %	50 %	114046571
18525	NC_008322	GC	3	6	1229239	1229244	0 %	0 %	50 %	50 %	114046571
18526	NC_008322	TGC	2	6	1229263	1229268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046571
18527	NC_008322	CAG	2	6	1229316	1229321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046571
18528	NC_008322	GCT	2	6	1229351	1229356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046571
18529	NC_008322	AGG	2	6	1229444	1229449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046571
18530	NC_008322	GAA	2	6	1229463	1229468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046571
18531	NC_008322	TGC	2	6	1229546	1229551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046571
18532	NC_008322	TGC	2	6	1229578	1229583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046571
18533	NC_008322	TAA	2	6	1229642	1229647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046571
18534	NC_008322	TGA	2	6	1229654	1229659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046571
18535	NC_008322	TGAC	2	8	1229873	1229880	25 %	25 %	25 %	25 %	114046571
18536	NC_008322	TGA	2	6	1229933	1229938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046571
18537	NC_008322	AAT	2	6	1230036	1230041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046571
18538	NC_008322	TCA	2	6	1230107	1230112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046571
18539	NC_008322	GGC	2	6	1230285	1230290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046571
18540	NC_008322	GAA	2	6	1230378	1230383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046571
18541	NC_008322	GATA	2	8	1230440	1230447	50 %	25 %	25 %	0 %	114046571
18542	NC_008322	TTG	2	6	1230537	1230542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046571
18543	NC_008322	GTTA	2	8	1230558	1230565	25 %	50 %	25 %	0 %	114046571
18544	NC_008322	TGA	2	6	1230686	1230691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046572
18545	NC_008322	AATTC	2	10	1230697	1230706	40 %	40 %	0 %	20 %	114046572
18546	NC_008322	ACC	2	6	1230765	1230770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046572
18547	NC_008322	TTC	2	6	1230810	1230815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046572
18548	NC_008322	CGA	2	6	1230926	1230931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046572
18549	NC_008322	TTC	2	6	1230933	1230938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046572
18550	NC_008322	CCG	2	6	1230973	1230978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046572
18551	NC_008322	TCG	2	6	1230982	1230987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046572
18552	NC_008322	CT	3	6	1231051	1231056	0 %	50 %	0 %	50 %	114046572
18553	NC_008322	ACG	2	6	1231063	1231068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046572
18554	NC_008322	ATA	2	6	1231279	1231284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046572
18555	NC_008322	GCT	2	6	1231358	1231363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046572
18556	NC_008322	ATCA	2	8	1231371	1231378	50 %	25 %	0 %	25 %	114046572
18557	NC_008322	CTTT	2	8	1231445	1231452	0 %	75 %	0 %	25 %	114046572
18558	NC_008322	G	6	6	1231468	1231473	0 %	0 %	100 %	0 %	114046572
18559	NC_008322	ATT	2	6	1231526	1231531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046573
18560	NC_008322	TGAGT	2	10	1231568	1231577	20 %	40 %	40 %	0 %	114046573
18561	NC_008322	CTT	2	6	1231601	1231606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046573
18562	NC_008322	TG	3	6	1231658	1231663	0 %	50 %	50 %	0 %	114046573
18563	NC_008322	ACA	2	6	1231784	1231789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046573
18564	NC_008322	CGA	2	6	1231850	1231855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046573
18565	NC_008322	CAT	2	6	1232082	1232087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046574
18566	NC_008322	CAA	2	6	1232094	1232099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046574
18567	NC_008322	GAA	2	6	1232140	1232145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046574
18568	NC_008322	TGGCG	2	10	1232184	1232193	0 %	20 %	60 %	20 %	114046574
18569	NC_008322	GTCT	2	8	1232221	1232228	0 %	50 %	25 %	25 %	114046574
18570	NC_008322	CG	3	6	1232251	1232256	0 %	0 %	50 %	50 %	114046574
18571	NC_008322	GTG	2	6	1232303	1232308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046574
18572	NC_008322	AAT	2	6	1232326	1232331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046574
18573	NC_008322	GCG	2	6	1232370	1232375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046574
18574	NC_008322	AAG	2	6	1232495	1232500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046574
18575	NC_008322	GCGGG	2	10	1232525	1232534	0 %	0 %	80 %	20 %	114046574
18576	NC_008322	CTT	2	6	1232553	1232558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046574
18577	NC_008322	CGG	3	9	1232577	1232585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046574
18578	NC_008322	TTGG	2	8	1232671	1232678	0 %	50 %	50 %	0 %	114046574
18579	NC_008322	TAA	2	6	1232691	1232696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046574
18580	NC_008322	ATAA	2	8	1232714	1232721	75 %	25 %	0 %	0 %	114046574
18581	NC_008322	GTC	2	6	1232740	1232745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046574
18582	NC_008322	CTT	2	6	1232763	1232768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046574
18583	NC_008322	GCT	2	6	1232841	1232846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046574
18584	NC_008322	TAAG	2	8	1232847	1232854	50 %	25 %	25 %	0 %	114046574
18585	NC_008322	GTT	2	6	1232902	1232907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046574
18586	NC_008322	CAACGC	2	12	1232922	1232933	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114046574
18587	NC_008322	CGG	2	6	1232987	1232992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046574
18588	NC_008322	TGTTTG	2	12	1233342	1233353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046575
18589	NC_008322	GCG	2	6	1233380	1233385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046575
18590	NC_008322	CAC	2	6	1233403	1233408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046575
18591	NC_008322	CAA	2	6	1233445	1233450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046575
18592	NC_008322	TGGC	2	8	1233482	1233489	0 %	25 %	50 %	25 %	114046575
18593	NC_008322	GAC	2	6	1233500	1233505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046575
18594	NC_008322	GTT	2	6	1233509	1233514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046575
18595	NC_008322	CAT	2	6	1233587	1233592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046575
18596	NC_008322	GGC	2	6	1233595	1233600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046575
18597	NC_008322	TTG	2	6	1233614	1233619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046575
18598	NC_008322	GTT	2	6	1233649	1233654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046575
18599	NC_008322	T	6	6	1233653	1233658	0 %	100 %	0 %	0 %	114046575
18600	NC_008322	GC	3	6	1233707	1233712	0 %	0 %	50 %	50 %	114046575
18601	NC_008322	TAAAGC	2	12	1233721	1233732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	114046575
18602	NC_008322	TCT	2	6	1233780	1233785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046575
18603	NC_008322	CGG	2	6	1233855	1233860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046575
18604	NC_008322	ATA	2	6	1233984	1233989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046575
18605	NC_008322	TGG	2	6	1234015	1234020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046575
18606	NC_008322	GCC	2	6	1234088	1234093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046575
18607	NC_008322	CAC	2	6	1234105	1234110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046575
18608	NC_008322	GAT	2	6	1234184	1234189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046575
18609	NC_008322	GTC	2	6	1234190	1234195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046575
18610	NC_008322	CTT	2	6	1234210	1234215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046575
18611	NC_008322	CAC	2	6	1234216	1234221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046575
18612	NC_008322	CAC	2	6	1234232	1234237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046575
18613	NC_008322	TGC	2	6	1234255	1234260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046575
18614	NC_008322	GC	3	6	1234299	1234304	0 %	0 %	50 %	50 %	114046575
18615	NC_008322	ACG	2	6	1234370	1234375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046575
18616	NC_008322	ACC	2	6	1234484	1234489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046575
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18728	NC_008322	GA	3	6	1243384	1243389	50 %	0 %	50 %	0 %	114046584
18729	NC_008322	ATC	2	6	1243496	1243501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046584
18730	NC_008322	CGA	2	6	1243603	1243608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046584
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18732	NC_008322	ATT	2	6	1243730	1243735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046584
18733	NC_008322	TG	3	6	1244076	1244081	0 %	50 %	50 %	0 %	114046585
18734	NC_008322	ATC	2	6	1244085	1244090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046585
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18849	NC_008322	TGG	2	6	1251115	1251120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046591
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18965	NC_008322	GGT	2	6	1258216	1258221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046597
18966	NC_008322	CTT	2	6	1258275	1258280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046597
18967	NC_008322	CGC	2	6	1258296	1258301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046597
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18969	NC_008322	GTA	2	6	1258345	1258350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046597
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18992	NC_008322	TGT	2	6	1259306	1259311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046597
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18998	NC_008322	CAG	2	6	1259721	1259726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046598
18999	NC_008322	GCA	2	6	1259729	1259734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046598
19000	NC_008322	AGCT	2	8	1259737	1259744	25 %	25 %	25 %	25 %	114046598

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