MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_008322	CTGG	2	8	1128114	1128121	0 %	25 %	50 %	25 %	114046486
17002	NC_008322	T	6	6	1128139	1128144	0 %	100 %	0 %	0 %	114046486
17003	NC_008322	GCA	2	6	1128188	1128193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046486
17004	NC_008322	GTT	2	6	1128252	1128257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046486
17005	NC_008322	AAG	2	6	1128398	1128403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046486
17006	NC_008322	GACA	2	8	1128423	1128430	50 %	0 %	25 %	25 %	114046486
17007	NC_008322	CCAA	2	8	1128493	1128500	50 %	0 %	0 %	50 %	114046486
17008	NC_008322	TAAG	2	8	1128578	1128585	50 %	25 %	25 %	0 %	114046486
17009	NC_008322	TCA	2	6	1128613	1128618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046486
17010	NC_008322	TGAGC	2	10	1128702	1128711	20 %	20 %	40 %	20 %	114046486
17011	NC_008322	ACCG	2	8	1128762	1128769	25 %	0 %	25 %	50 %	114046486
17012	NC_008322	ATG	2	6	1128770	1128775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046486
17013	NC_008322	GCA	2	6	1128786	1128791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046486
17014	NC_008322	ATT	2	6	1128842	1128847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046486
17015	NC_008322	GAA	2	6	1128853	1128858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046486
17016	NC_008322	GAT	2	6	1128975	1128980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046486
17017	NC_008322	AAGA	2	8	1129015	1129022	75 %	0 %	25 %	0 %	114046486
17018	NC_008322	CTA	2	6	1129071	1129076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046486
17019	NC_008322	AGT	2	6	1129103	1129108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046486
17020	NC_008322	TTA	2	6	1129149	1129154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046487
17021	NC_008322	TCA	2	6	1129186	1129191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046487
17022	NC_008322	GAAG	2	8	1129206	1129213	50 %	0 %	50 %	0 %	114046487
17023	NC_008322	TGA	2	6	1129259	1129264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046487
17024	NC_008322	AAGCGT	2	12	1129275	1129286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114046487
17025	NC_008322	AGA	2	6	1129298	1129303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046487
17026	NC_008322	GC	3	6	1129305	1129310	0 %	0 %	50 %	50 %	114046487
17027	NC_008322	GTG	2	6	1129738	1129743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046488
17028	NC_008322	ATCC	2	8	1129860	1129867	25 %	25 %	0 %	50 %	114046488
17029	NC_008322	TAT	2	6	1129904	1129909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046488
17030	NC_008322	AAC	2	6	1130006	1130011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046488
17031	NC_008322	TGAAGA	2	12	1130091	1130102	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	114046488
17032	NC_008322	CAG	2	6	1130128	1130133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046488
17033	NC_008322	AAG	2	6	1130216	1130221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046489
17034	NC_008322	GAAC	2	8	1130313	1130320	50 %	0 %	25 %	25 %	114046489
17035	NC_008322	GAT	2	6	1130347	1130352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046489
17036	NC_008322	TGC	2	6	1130459	1130464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046489
17037	NC_008322	GAT	2	6	1130497	1130502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046489
17038	NC_008322	TG	3	6	1130522	1130527	0 %	50 %	50 %	0 %	114046489
17039	NC_008322	A	6	6	1130533	1130538	100 %	0 %	0 %	0 %	114046489
17040	NC_008322	TTGA	2	8	1130623	1130630	25 %	50 %	25 %	0 %	114046489
17041	NC_008322	GATG	2	8	1130965	1130972	25 %	25 %	50 %	0 %	114046490
17042	NC_008322	AT	3	6	1130975	1130980	50 %	50 %	0 %	0 %	114046490
17043	NC_008322	TCG	2	6	1131016	1131021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046490
17044	NC_008322	CTT	2	6	1131036	1131041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046490
17045	NC_008322	AAAG	2	8	1131069	1131076	75 %	0 %	25 %	0 %	114046490
17046	NC_008322	TAA	2	6	1131077	1131082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046490
17047	NC_008322	TTG	2	6	1131154	1131159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046490
17048	NC_008322	ATT	2	6	1131270	1131275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046490
17049	NC_008322	TGG	2	6	1131411	1131416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046490
17050	NC_008322	AGG	2	6	1131418	1131423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046490
17051	NC_008322	TTGT	2	8	1131441	1131448	0 %	75 %	25 %	0 %	114046490
17052	NC_008322	TGG	2	6	1131539	1131544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046490
17053	NC_008322	TGA	2	6	1131622	1131627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046490
17054	NC_008322	CCG	2	6	1131675	1131680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046490
17055	NC_008322	ACA	2	6	1131743	1131748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046490
17056	NC_008322	TTG	2	6	1131922	1131927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046490
17057	NC_008322	CGATG	2	10	1132007	1132016	20 %	20 %	40 %	20 %	114046490
17058	NC_008322	GCA	2	6	1132124	1132129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046490
17059	NC_008322	GATG	2	8	1132178	1132185	25 %	25 %	50 %	0 %	114046490
17060	NC_008322	GT	3	6	1132194	1132199	0 %	50 %	50 %	0 %	114046490
17061	NC_008322	ACA	2	6	1132232	1132237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046490
17062	NC_008322	GC	3	6	1132300	1132305	0 %	0 %	50 %	50 %	114046490
17063	NC_008322	TCA	2	6	1132426	1132431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046490
17064	NC_008322	AGC	2	6	1132443	1132448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046490
17065	NC_008322	ACCAA	2	10	1132495	1132504	60 %	0 %	0 %	40 %	114046490
17066	NC_008322	GGC	2	6	1132532	1132537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046490
17067	NC_008322	GCGG	2	8	1132538	1132545	0 %	0 %	75 %	25 %	114046490
17068	NC_008322	GTG	2	6	1132569	1132574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046490
17069	NC_008322	CAG	2	6	1132776	1132781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046490
17070	NC_008322	CAG	2	6	1132812	1132817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046490
17071	NC_008322	GCGT	2	8	1132855	1132862	0 %	25 %	50 %	25 %	114046490
17072	NC_008322	TCAT	2	8	1133134	1133141	25 %	50 %	0 %	25 %	114046491
17073	NC_008322	TGC	2	6	1133162	1133167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046491
17074	NC_008322	GCTG	2	8	1133207	1133214	0 %	25 %	50 %	25 %	114046491
17075	NC_008322	CGG	2	6	1133216	1133221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046491
17076	NC_008322	TCA	2	6	1133242	1133247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046491
17077	NC_008322	GCA	2	6	1133372	1133377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046491
17078	NC_008322	CGG	2	6	1133539	1133544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046491
17079	NC_008322	GAT	2	6	1133811	1133816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046491
17080	NC_008322	GGT	2	6	1133981	1133986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046491
17081	NC_008322	ACC	2	6	1134015	1134020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046491
17082	NC_008322	GTG	2	6	1134048	1134053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046491
17083	NC_008322	ATT	2	6	1134392	1134397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046492
17084	NC_008322	CTT	2	6	1134540	1134545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046492
17085	NC_008322	TAGA	2	8	1134601	1134608	50 %	25 %	25 %	0 %	114046492
17086	NC_008322	GAGC	2	8	1134756	1134763	25 %	0 %	50 %	25 %	114046492
17087	NC_008322	CTT	2	6	1134785	1134790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046492
17088	NC_008322	TGAG	2	8	1134818	1134825	25 %	25 %	50 %	0 %	114046492
17089	NC_008322	GCA	2	6	1134884	1134889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046492
17090	NC_008322	TCA	2	6	1134920	1134925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046492
17091	NC_008322	GC	3	6	1135012	1135017	0 %	0 %	50 %	50 %	114046492
17092	NC_008322	TTCA	2	8	1135023	1135030	25 %	50 %	0 %	25 %	114046492
17093	NC_008322	ACC	2	6	1135101	1135106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046492
17094	NC_008322	TTG	2	6	1135171	1135176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046492
17095	NC_008322	CCATA	2	10	1135275	1135284	40 %	20 %	0 %	40 %	114046492
17096	NC_008322	CGC	2	6	1135307	1135312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046492
17097	NC_008322	CTT	2	6	1135337	1135342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046492
17098	NC_008322	CTT	2	6	1135418	1135423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046492
17099	NC_008322	AGC	2	6	1135435	1135440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046492
17100	NC_008322	TCG	2	6	1135465	1135470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046492
17101	NC_008322	ACG	2	6	1135642	1135647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046492
17102	NC_008322	GTT	2	6	1135724	1135729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046492
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17104	NC_008322	GTC	2	6	1136150	1136155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046493
17105	NC_008322	TGA	2	6	1136182	1136187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046493
17106	NC_008322	TGA	2	6	1136311	1136316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046493
17107	NC_008322	GCC	2	6	1136354	1136359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046493
17108	NC_008322	GCG	2	6	1136450	1136455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493
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17110	NC_008322	TTC	2	6	1136758	1136763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046493
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17113	NC_008322	CTT	2	6	1136836	1136841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046493
17114	NC_008322	GCG	2	6	1136874	1136879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493
17115	NC_008322	GCG	2	6	1136895	1136900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493
17116	NC_008322	GGC	2	6	1136927	1136932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493
17117	NC_008322	CGG	2	6	1137162	1137167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493
17118	NC_008322	GTT	2	6	1137178	1137183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046493
17119	NC_008322	GTT	2	6	1137216	1137221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046493
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17121	NC_008322	CGC	2	6	1137335	1137340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046493
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17124	NC_008322	GCG	2	6	1137440	1137445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046493
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17221	NC_008322	CGC	2	6	1144071	1144076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046497
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17225	NC_008322	TGAT	2	8	1144276	1144283	25 %	50 %	25 %	0 %	114046497
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17228	NC_008322	GT	3	6	1144506	1144511	0 %	50 %	50 %	0 %	114046497
17229	NC_008322	TGG	2	6	1144531	1144536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046497
17230	NC_008322	GCT	2	6	1144628	1144633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046497
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17232	NC_008322	GAT	2	6	1144791	1144796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046497
17233	NC_008322	CGC	2	6	1144802	1144807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046497
17234	NC_008322	GCT	2	6	1144836	1144841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046497
17235	NC_008322	GGC	2	6	1144875	1144880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046497
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17240	NC_008322	TCT	2	6	1145388	1145393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046498
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17332	NC_008322	GAA	2	6	1149777	1149782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046502
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17345	NC_008322	GAA	2	6	1150499	1150504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046502
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17462	NC_008322	GCT	2	6	1159769	1159774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046510
17463	NC_008322	CGA	2	6	1159778	1159783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046510
17464	NC_008322	ATC	2	6	1159845	1159850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046510
17465	NC_008322	GT	3	6	1159851	1159856	0 %	50 %	50 %	0 %	114046510
17466	NC_008322	GACA	2	8	1159928	1159935	50 %	0 %	25 %	25 %	114046510
17467	NC_008322	GGT	2	6	1159998	1160003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046510
17468	NC_008322	ATC	2	6	1160049	1160054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046510
17469	NC_008322	CGC	2	6	1160126	1160131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046510
17470	NC_008322	CGGT	2	8	1160140	1160147	0 %	25 %	50 %	25 %	114046510
17471	NC_008322	TGA	2	6	1160164	1160169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046510
17472	NC_008322	TGG	2	6	1160180	1160185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046510
17473	NC_008322	AGCC	2	8	1160206	1160213	25 %	0 %	25 %	50 %	114046510
17474	NC_008322	CGT	2	6	1160222	1160227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046510
17475	NC_008322	TGCG	2	8	1160488	1160495	0 %	25 %	50 %	25 %	114046510
17476	NC_008322	GCT	2	6	1160621	1160626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046510
17477	NC_008322	GGT	3	9	1160853	1160861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046510
17478	NC_008322	CTG	2	6	1160897	1160902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046510
17479	NC_008322	TG	3	6	1160901	1160906	0 %	50 %	50 %	0 %	114046510
17480	NC_008322	CAT	2	6	1160945	1160950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046510
17481	NC_008322	AGA	2	6	1161026	1161031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046510
17482	NC_008322	GGT	2	6	1161084	1161089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046510
17483	NC_008322	GGC	2	6	1161122	1161127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046510
17484	NC_008322	ATT	2	6	1161138	1161143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046510
17485	NC_008322	AGC	2	6	1161220	1161225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046510
17486	NC_008322	CAC	2	6	1161242	1161247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046510
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17488	NC_008322	GTT	2	6	1161294	1161299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046510
17489	NC_008322	CG	3	6	1161324	1161329	0 %	0 %	50 %	50 %	114046510
17490	NC_008322	CCT	2	6	1161546	1161551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046510
17491	NC_008322	TGA	2	6	1161631	1161636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046510
17492	NC_008322	GAA	2	6	1161653	1161658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046510
17493	NC_008322	GCC	2	6	1161750	1161755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046510
17494	NC_008322	GAA	2	6	1161798	1161803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046510
17495	NC_008322	AAG	2	6	1161829	1161834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046510
17496	NC_008322	AGGTG	2	10	1161899	1161908	20 %	20 %	60 %	0 %	114046510
17497	NC_008322	TGGGCG	2	12	1161910	1161921	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114046510
17498	NC_008322	CT	3	6	1161991	1161996	0 %	50 %	0 %	50 %	114046510
17499	NC_008322	TTGA	2	8	1162047	1162054	25 %	50 %	25 %	0 %	114046510
17500	NC_008322	CCAC	2	8	1162075	1162082	25 %	0 %	0 %	75 %	114046510

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