MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_008322	CGA	2	6	1095729	1095734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046459
16502	NC_008322	GAT	2	6	1095757	1095762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046459
16503	NC_008322	AGC	2	6	1095779	1095784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046459
16504	NC_008322	TGC	2	6	1095842	1095847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046459
16505	NC_008322	CAATCG	2	12	1096064	1096075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114046460
16506	NC_008322	CAG	2	6	1096152	1096157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046460
16507	NC_008322	ATA	2	6	1096189	1096194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046460
16508	NC_008322	CG	3	6	1096221	1096226	0 %	0 %	50 %	50 %	114046460
16509	NC_008322	TGT	2	6	1096295	1096300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046460
16510	NC_008322	CG	3	6	1096353	1096358	0 %	0 %	50 %	50 %	114046460
16511	NC_008322	TGA	2	6	1096394	1096399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046460
16512	NC_008322	CTTA	2	8	1096413	1096420	25 %	50 %	0 %	25 %	114046460
16513	NC_008322	TTG	3	9	1096437	1096445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046460
16514	NC_008322	ACC	2	6	1096461	1096466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046460
16515	NC_008322	CAG	2	6	1096578	1096583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046460
16516	NC_008322	GAC	2	6	1096599	1096604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046460
16517	NC_008322	TAA	2	6	1096661	1096666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046460
16518	NC_008322	CTTGGC	2	12	1096694	1096705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046460
16519	NC_008322	AGT	2	6	1096732	1096737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046460
16520	NC_008322	GCA	2	6	1096807	1096812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046460
16521	NC_008322	AAT	2	6	1096827	1096832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046460
16522	NC_008322	CGG	2	6	1096934	1096939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046460
16523	NC_008322	GGC	2	6	1096980	1096985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046460
16524	NC_008322	GCA	2	6	1097080	1097085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046460
16525	NC_008322	GCCA	2	8	1097091	1097098	25 %	0 %	25 %	50 %	114046460
16526	NC_008322	AAT	2	6	1097121	1097126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046460
16527	NC_008322	CCG	2	6	1097143	1097148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046460
16528	NC_008322	TTGA	2	8	1097166	1097173	25 %	50 %	25 %	0 %	114046460
16529	NC_008322	ATA	2	6	1097186	1097191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046460
16530	NC_008322	AAT	2	6	1097202	1097207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046460
16531	NC_008322	TCT	2	6	1097936	1097941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046461
16532	NC_008322	GTC	2	6	1097957	1097962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046461
16533	NC_008322	CA	3	6	1097993	1097998	50 %	0 %	0 %	50 %	114046461
16534	NC_008322	ATTT	2	8	1098015	1098022	25 %	75 %	0 %	0 %	114046461
16535	NC_008322	AAG	2	6	1098054	1098059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046461
16536	NC_008322	ATTA	2	8	1098122	1098129	50 %	50 %	0 %	0 %	114046461
16537	NC_008322	ATC	2	6	1098215	1098220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046461
16538	NC_008322	GAT	2	6	1098311	1098316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046461
16539	NC_008322	GTCT	2	8	1098321	1098328	0 %	50 %	25 %	25 %	114046461
16540	NC_008322	AAGACA	2	12	1098375	1098386	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	114046461
16541	NC_008322	TTC	2	6	1098662	1098667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046461
16542	NC_008322	TGG	2	6	1098701	1098706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046461
16543	NC_008322	GTG	2	6	1098735	1098740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046461
16544	NC_008322	A	6	6	1098789	1098794	100 %	0 %	0 %	0 %	114046461
16545	NC_008322	AAG	2	6	1098801	1098806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046461
16546	NC_008322	CATA	2	8	1098921	1098928	50 %	25 %	0 %	25 %	114046462
16547	NC_008322	GCC	2	6	1098966	1098971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046462
16548	NC_008322	ATT	2	6	1098988	1098993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046462
16549	NC_008322	AGATC	2	10	1099079	1099088	40 %	20 %	20 %	20 %	114046462
16550	NC_008322	CGCCAA	2	12	1099107	1099118	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114046462
16551	NC_008322	CAG	2	6	1099122	1099127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046462
16552	NC_008322	GGTT	2	8	1099164	1099171	0 %	50 %	50 %	0 %	114046462
16553	NC_008322	TGG	2	6	1099174	1099179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046462
16554	NC_008322	ATG	2	6	1099180	1099185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046462
16555	NC_008322	CGG	2	6	1099280	1099285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046462
16556	NC_008322	CAGT	2	8	1099452	1099459	25 %	25 %	25 %	25 %	114046462
16557	NC_008322	CAG	2	6	1099631	1099636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046463
16558	NC_008322	GCG	2	6	1099767	1099772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046463
16559	NC_008322	GAT	2	6	1099774	1099779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046463
16560	NC_008322	GCT	2	6	1099816	1099821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046463
16561	NC_008322	TGTGC	2	10	1100020	1100029	0 %	40 %	40 %	20 %	114046463
16562	NC_008322	ATT	2	6	1100125	1100130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046463
16563	NC_008322	GC	3	6	1100194	1100199	0 %	0 %	50 %	50 %	114046463
16564	NC_008322	GC	3	6	1100212	1100217	0 %	0 %	50 %	50 %	114046463
16565	NC_008322	GCC	2	6	1100261	1100266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046463
16566	NC_008322	CAG	2	6	1100276	1100281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046463
16567	NC_008322	A	6	6	1100373	1100378	100 %	0 %	0 %	0 %	114046464
16568	NC_008322	ATC	2	6	1100412	1100417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046464
16569	NC_008322	TGC	2	6	1100455	1100460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046464
16570	NC_008322	TGC	2	6	1100545	1100550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046464
16571	NC_008322	GGCT	2	8	1100553	1100560	0 %	25 %	50 %	25 %	114046464
16572	NC_008322	A	6	6	1100616	1100621	100 %	0 %	0 %	0 %	114046464
16573	NC_008322	AC	3	6	1100735	1100740	50 %	0 %	0 %	50 %	114046464
16574	NC_008322	GGC	2	6	1100763	1100768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046464
16575	NC_008322	TGGC	2	8	1100771	1100778	0 %	25 %	50 %	25 %	114046464
16576	NC_008322	CGGC	2	8	1100789	1100796	0 %	0 %	50 %	50 %	114046464
16577	NC_008322	GCA	2	6	1100804	1100809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046464
16578	NC_008322	CTT	2	6	1100934	1100939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046465
16579	NC_008322	TGC	2	6	1100949	1100954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046465
16580	NC_008322	GAC	2	6	1100971	1100976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046465
16581	NC_008322	GATT	2	8	1101045	1101052	25 %	50 %	25 %	0 %	114046465
16582	NC_008322	CAT	2	6	1101219	1101224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046465
16583	NC_008322	ACC	2	6	1101314	1101319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046465
16584	NC_008322	GGC	2	6	1101361	1101366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046465
16585	NC_008322	GCT	2	6	1101492	1101497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046465
16586	NC_008322	GCG	2	6	1101608	1101613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046465
16587	NC_008322	CTCAT	2	10	1101614	1101623	20 %	40 %	0 %	40 %	114046465
16588	NC_008322	CCG	2	6	1101627	1101632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046465
16589	NC_008322	TGG	3	9	1101678	1101686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046465
16590	NC_008322	TTTGG	2	10	1101727	1101736	0 %	60 %	40 %	0 %	114046465
16591	NC_008322	TGC	2	6	1101758	1101763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046465
16592	NC_008322	GTG	2	6	1101986	1101991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046465
16593	NC_008322	CAG	2	6	1102035	1102040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046465
16594	NC_008322	T	6	6	1102084	1102089	0 %	100 %	0 %	0 %	114046465
16595	NC_008322	TTA	2	6	1102127	1102132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046465
16596	NC_008322	T	6	6	1102133	1102138	0 %	100 %	0 %	0 %	114046465
16597	NC_008322	TGA	2	6	1102146	1102151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046465
16598	NC_008322	TGG	2	6	1102200	1102205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046465
16599	NC_008322	GCT	2	6	1102315	1102320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046465
16600	NC_008322	CTT	2	6	1102341	1102346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046465
16601	NC_008322	AAT	2	6	1102409	1102414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046465
16602	NC_008322	GTG	2	6	1102442	1102447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046465
16603	NC_008322	GCATC	2	10	1102455	1102464	20 %	20 %	20 %	40 %	114046465
16604	NC_008322	GCC	2	6	1102766	1102771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046466
16605	NC_008322	AGT	2	6	1102774	1102779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046466
16606	NC_008322	TTCA	2	8	1102796	1102803	25 %	50 %	0 %	25 %	114046466
16607	NC_008322	GAA	2	6	1102847	1102852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046466
16608	NC_008322	GCT	2	6	1102958	1102963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046466
16609	NC_008322	GC	3	6	1102978	1102983	0 %	0 %	50 %	50 %	114046466
16610	NC_008322	CAG	2	6	1102988	1102993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046466
16611	NC_008322	TGA	2	6	1103107	1103112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046466
16612	NC_008322	CCA	2	6	1103208	1103213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046466
16613	NC_008322	TTTG	2	8	1103233	1103240	0 %	75 %	25 %	0 %	114046466
16614	NC_008322	GGC	2	6	1103363	1103368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046466
16615	NC_008322	A	6	6	1103459	1103464	100 %	0 %	0 %	0 %	114046466
16616	NC_008322	TGCC	2	8	1103530	1103537	0 %	25 %	25 %	50 %	114046466
16617	NC_008322	ACG	2	6	1103544	1103549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046466
16618	NC_008322	AAAT	2	8	1103561	1103568	75 %	25 %	0 %	0 %	114046466
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16632	NC_008322	A	6	6	1104517	1104522	100 %	0 %	0 %	0 %	114046467
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16732	NC_008322	TAT	2	6	1111600	1111605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046472
16733	NC_008322	CTT	2	6	1111720	1111725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046473
16734	NC_008322	CGG	2	6	1111870	1111875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046473
16735	NC_008322	AAT	2	6	1111970	1111975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046473
16736	NC_008322	AAG	2	6	1112055	1112060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046473
16737	NC_008322	CGC	2	6	1112083	1112088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
16738	NC_008322	GCA	2	6	1112185	1112190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
16739	NC_008322	ATA	2	6	1112429	1112434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046473
16740	NC_008322	GCA	2	6	1112497	1112502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
16741	NC_008322	CAG	2	6	1112531	1112536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046473
16742	NC_008322	GGT	2	6	1112579	1112584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046473
16743	NC_008322	GCCA	2	8	1112592	1112599	25 %	0 %	25 %	50 %	114046473
16744	NC_008322	CTG	2	6	1112670	1112675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046473
16745	NC_008322	GGC	2	6	1112774	1112779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046473
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16750	NC_008322	ATA	2	6	1113038	1113043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046473
16751	NC_008322	GCT	2	6	1113047	1113052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046473
16752	NC_008322	GCC	2	6	1113063	1113068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
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16755	NC_008322	GCC	2	6	1113189	1113194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
16756	NC_008322	TAAGGC	2	12	1113200	1113211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114046473
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16758	NC_008322	GCC	2	6	1113231	1113236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
16759	NC_008322	TCGC	2	8	1113245	1113252	0 %	25 %	25 %	50 %	114046473
16760	NC_008322	GCC	2	6	1113455	1113460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046473
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16784	NC_008322	TGC	2	6	1114794	1114799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046473
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16812	NC_008322	GCA	2	6	1116600	1116605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046475
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16830	NC_008322	CGT	2	6	1117844	1117849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046477
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16834	NC_008322	T	7	7	1118059	1118065	0 %	100 %	0 %	0 %	114046477
16835	NC_008322	TGGC	2	8	1118103	1118110	0 %	25 %	50 %	25 %	114046477
16836	NC_008322	TGG	2	6	1118118	1118123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046477
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16838	NC_008322	G	6	6	1118202	1118207	0 %	0 %	100 %	0 %	114046477
16839	NC_008322	TAA	2	6	1118214	1118219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046477
16840	NC_008322	TAT	2	6	1118431	1118436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046477
16841	NC_008322	GCC	2	6	1118485	1118490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046477
16842	NC_008322	GGCGC	2	10	1118530	1118539	0 %	0 %	60 %	40 %	114046477
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16844	NC_008322	GTG	2	6	1118620	1118625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046477
16845	NC_008322	CCCG	2	8	1118637	1118644	0 %	0 %	25 %	75 %	114046477
16846	NC_008322	CAG	2	6	1118674	1118679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046477
16847	NC_008322	ATG	2	6	1118710	1118715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046477
16848	NC_008322	CAGC	2	8	1118790	1118797	25 %	0 %	25 %	50 %	114046477
16849	NC_008322	CGTG	2	8	1119020	1119027	0 %	25 %	50 %	25 %	114046478
16850	NC_008322	GCGAT	2	10	1119055	1119064	20 %	20 %	40 %	20 %	114046478
16851	NC_008322	AGCG	2	8	1119111	1119118	25 %	0 %	50 %	25 %	114046478
16852	NC_008322	TTTG	2	8	1119140	1119147	0 %	75 %	25 %	0 %	114046478
16853	NC_008322	ATC	2	6	1119163	1119168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046478
16854	NC_008322	ATT	2	6	1119189	1119194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046478
16855	NC_008322	AGCG	2	8	1119252	1119259	25 %	0 %	50 %	25 %	114046478
16856	NC_008322	CGC	2	6	1119407	1119412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046478
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16862	NC_008322	TGC	2	6	1119947	1119952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046479
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16871	NC_008322	GCA	2	6	1120407	1120412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046479
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16874	NC_008322	GCA	2	6	1120534	1120539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046479
16875	NC_008322	ATT	2	6	1120675	1120680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046479
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16885	NC_008322	TGGG	2	8	1121270	1121277	0 %	25 %	75 %	0 %	114046479
16886	NC_008322	CAATTG	2	12	1121398	1121409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114046479
16887	NC_008322	GGC	2	6	1121451	1121456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046479
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16944	NC_008322	TTTA	2	8	1124994	1125001	25 %	75 %	0 %	0 %	114046482
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16948	NC_008322	AAG	2	6	1125200	1125205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046482
16949	NC_008322	TGA	2	6	1125211	1125216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046482
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16951	NC_008322	AAG	2	6	1125348	1125353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046482
16952	NC_008322	CAA	3	9	1125447	1125455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046483
16953	NC_008322	AGC	2	6	1125601	1125606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046483
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16955	NC_008322	ATT	2	6	1125631	1125636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046483
16956	NC_008322	CT	3	6	1125639	1125644	0 %	50 %	0 %	50 %	114046483
16957	NC_008322	TGC	2	6	1125665	1125670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046483
16958	NC_008322	GCTTAT	2	12	1125673	1125684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	114046483
16959	NC_008322	TCG	2	6	1125710	1125715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046483
16960	NC_008322	ATG	2	6	1125781	1125786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046483
16961	NC_008322	ATGG	2	8	1125793	1125800	25 %	25 %	50 %	0 %	114046483
16962	NC_008322	CGTG	2	8	1125849	1125856	0 %	25 %	50 %	25 %	114046483
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