MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008322	ATT	2	6	1025447	1025452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046401
15502	NC_008322	GCCA	2	8	1025556	1025563	25 %	0 %	25 %	50 %	114046401
15503	NC_008322	CAA	2	6	1025618	1025623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046401
15504	NC_008322	GCG	2	6	1025655	1025660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046401
15505	NC_008322	TCG	2	6	1025779	1025784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046401
15506	NC_008322	AT	3	6	1025799	1025804	50 %	50 %	0 %	0 %	114046401
15507	NC_008322	ATT	2	6	1025827	1025832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046401
15508	NC_008322	ATT	2	6	1025873	1025878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046401
15509	NC_008322	AGC	2	6	1025879	1025884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046401
15510	NC_008322	CGC	2	6	1025917	1025922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046401
15511	NC_008322	AGC	2	6	1025938	1025943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046401
15512	NC_008322	GAA	2	6	1026385	1026390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046402
15513	NC_008322	TGC	2	6	1026400	1026405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046402
15514	NC_008322	ATT	2	6	1026410	1026415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046402
15515	NC_008322	T	6	6	1026638	1026643	0 %	100 %	0 %	0 %	114046402
15516	NC_008322	ATGG	2	8	1026665	1026672	25 %	25 %	50 %	0 %	114046402
15517	NC_008322	T	6	6	1026730	1026735	0 %	100 %	0 %	0 %	114046402
15518	NC_008322	GAA	2	6	1026887	1026892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046402
15519	NC_008322	CAA	2	6	1026963	1026968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046402
15520	NC_008322	CAT	2	6	1027048	1027053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046402
15521	NC_008322	CTCA	2	8	1027154	1027161	25 %	25 %	0 %	50 %	114046402
15522	NC_008322	GAA	2	6	1027172	1027177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046402
15523	NC_008322	AAAG	2	8	1027298	1027305	75 %	0 %	25 %	0 %	114046402
15524	NC_008322	GGC	2	6	1027312	1027317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046402
15525	NC_008322	A	6	6	1027365	1027370	100 %	0 %	0 %	0 %	114046402
15526	NC_008322	TCT	2	6	1027416	1027421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046402
15527	NC_008322	CGC	2	6	1027509	1027514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046402
15528	NC_008322	CAA	2	6	1027541	1027546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046402
15529	NC_008322	GCTG	2	8	1027735	1027742	0 %	25 %	50 %	25 %	114046402
15530	NC_008322	CAC	2	6	1027782	1027787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046402
15531	NC_008322	GCC	2	6	1027798	1027803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046402
15532	NC_008322	ACA	2	6	1027840	1027845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046402
15533	NC_008322	CTTAGC	2	12	1027873	1027884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114046402
15534	NC_008322	CTGG	2	8	1027892	1027899	0 %	25 %	50 %	25 %	114046402
15535	NC_008322	ACTG	2	8	1027981	1027988	25 %	25 %	25 %	25 %	114046402
15536	NC_008322	TGA	2	6	1028088	1028093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046402
15537	NC_008322	GCGA	2	8	1028102	1028109	25 %	0 %	50 %	25 %	114046402
15538	NC_008322	GAA	2	6	1028110	1028115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046402
15539	NC_008322	GTTTAG	2	12	1028225	1028236	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	114046403
15540	NC_008322	GTT	2	6	1028277	1028282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046403
15541	NC_008322	GCG	2	6	1028335	1028340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046403
15542	NC_008322	GTGA	2	8	1028347	1028354	25 %	25 %	50 %	0 %	114046403
15543	NC_008322	CTA	2	6	1028356	1028361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046403
15544	NC_008322	T	6	6	1028426	1028431	0 %	100 %	0 %	0 %	114046403
15545	NC_008322	ATT	2	6	1028526	1028531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046403
15546	NC_008322	AAT	2	6	1028678	1028683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046403
15547	NC_008322	GCG	2	6	1028703	1028708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046403
15548	NC_008322	GCT	2	6	1028849	1028854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046403
15549	NC_008322	ATC	2	6	1028910	1028915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046403
15550	NC_008322	AAT	2	6	1028957	1028962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046403
15551	NC_008322	TGA	2	6	1029005	1029010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046403
15552	NC_008322	CTCAG	2	10	1029022	1029031	20 %	20 %	20 %	40 %	114046403
15553	NC_008322	GCA	2	6	1029071	1029076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046403
15554	NC_008322	ATC	2	6	1029105	1029110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046403
15555	NC_008322	TCC	2	6	1029157	1029162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046403
15556	NC_008322	ATAA	2	8	1029227	1029234	75 %	25 %	0 %	0 %	114046403
15557	NC_008322	TGGC	2	8	1029238	1029245	0 %	25 %	50 %	25 %	114046403
15558	NC_008322	TAA	2	6	1029284	1029289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046403
15559	NC_008322	GCT	2	6	1029378	1029383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046403
15560	NC_008322	CGG	2	6	1029446	1029451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046403
15561	NC_008322	CCAG	2	8	1029499	1029506	25 %	0 %	25 %	50 %	114046403
15562	NC_008322	TGC	2	6	1029517	1029522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046403
15563	NC_008322	GTT	2	6	1029560	1029565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046403
15564	NC_008322	GTC	2	6	1029610	1029615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046403
15565	NC_008322	TGA	2	6	1029659	1029664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046403
15566	NC_008322	AGTAA	2	10	1029688	1029697	60 %	20 %	20 %	0 %	114046403
15567	NC_008322	CCG	2	6	1030050	1030055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046404
15568	NC_008322	AGGGTG	2	12	1030088	1030099	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	114046404
15569	NC_008322	ATC	2	6	1030108	1030113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046404
15570	NC_008322	AC	3	6	1030122	1030127	50 %	0 %	0 %	50 %	114046404
15571	NC_008322	TCA	2	6	1030154	1030159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046404
15572	NC_008322	GTC	2	6	1030171	1030176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046404
15573	NC_008322	T	6	6	1030200	1030205	0 %	100 %	0 %	0 %	114046404
15574	NC_008322	TCC	2	6	1030208	1030213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046404
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15577	NC_008322	GAG	2	6	1030433	1030438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046404
15578	NC_008322	A	6	6	1030483	1030488	100 %	0 %	0 %	0 %	114046404
15579	NC_008322	GT	3	6	1030569	1030574	0 %	50 %	50 %	0 %	114046404
15580	NC_008322	GTT	2	6	1030576	1030581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046404
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15584	NC_008322	CCG	2	6	1031337	1031342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046405
15585	NC_008322	AGA	2	6	1031406	1031411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046405
15586	NC_008322	TGC	2	6	1031443	1031448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046405
15587	NC_008322	GCG	2	6	1031517	1031522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046405
15588	NC_008322	GGT	2	6	1031543	1031548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046405
15589	NC_008322	GCC	2	6	1031609	1031614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046405
15590	NC_008322	GCC	2	6	1031706	1031711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046405
15591	NC_008322	ATT	2	6	1031783	1031788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046405
15592	NC_008322	GCA	2	6	1031863	1031868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046405
15593	NC_008322	GCCC	2	8	1031929	1031936	0 %	0 %	25 %	75 %	114046405
15594	NC_008322	TGA	2	6	1031937	1031942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046405
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15598	NC_008322	TTC	2	6	1032253	1032258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046406
15599	NC_008322	GC	3	6	1032275	1032280	0 %	0 %	50 %	50 %	114046406
15600	NC_008322	TTG	2	6	1032314	1032319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046406
15601	NC_008322	GAT	2	6	1032349	1032354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046406
15602	NC_008322	ATT	2	6	1032394	1032399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046406
15603	NC_008322	CAT	2	6	1032472	1032477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046406
15604	NC_008322	TGG	2	6	1032532	1032537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046406
15605	NC_008322	GC	3	6	1032539	1032544	0 %	0 %	50 %	50 %	114046406
15606	NC_008322	CG	3	6	1032563	1032568	0 %	0 %	50 %	50 %	114046406
15607	NC_008322	CAC	2	6	1032599	1032604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046406
15608	NC_008322	AT	3	6	1032724	1032729	50 %	50 %	0 %	0 %	114046406
15609	NC_008322	GCC	2	6	1032767	1032772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046406
15610	NC_008322	GTG	2	6	1032792	1032797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046406
15611	NC_008322	CGA	2	6	1032814	1032819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046406
15612	NC_008322	GAA	2	6	1032836	1032841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046406
15613	NC_008322	GGT	2	6	1032862	1032867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046406
15614	NC_008322	GTT	2	6	1032885	1032890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046406
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15616	NC_008322	A	6	6	1032933	1032938	100 %	0 %	0 %	0 %	114046406
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15728	NC_008322	TGC	2	6	1040580	1040585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046413
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15732	NC_008322	A	6	6	1041028	1041033	100 %	0 %	0 %	0 %	114046414
15733	NC_008322	GAC	2	6	1041387	1041392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046414
15734	NC_008322	CT	3	6	1041394	1041399	0 %	50 %	0 %	50 %	114046414
15735	NC_008322	GCG	2	6	1041430	1041435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046414
15736	NC_008322	GCG	2	6	1041495	1041500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046414
15737	NC_008322	TTG	2	6	1041514	1041519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046414
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15739	NC_008322	ATT	2	6	1041599	1041604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046414
15740	NC_008322	GGT	2	6	1041678	1041683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046414
15741	NC_008322	GCG	2	6	1041789	1041794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046414
15742	NC_008322	ATG	2	6	1041805	1041810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046414
15743	NC_008322	ATG	2	6	1041907	1041912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046414
15744	NC_008322	GAT	2	6	1041936	1041941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046414
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15746	NC_008322	GCA	2	6	1041966	1041971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046414
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15753	NC_008322	GTC	2	6	1042431	1042436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046415
15754	NC_008322	GGC	2	6	1042515	1042520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046415
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15758	NC_008322	A	7	7	1042715	1042721	100 %	0 %	0 %	0 %	114046415
15759	NC_008322	GTGC	2	8	1042773	1042780	0 %	25 %	50 %	25 %	114046415
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15831	NC_008322	TC	3	6	1048551	1048556	0 %	50 %	0 %	50 %	114046420
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15840	NC_008322	TTATTT	2	12	1049103	1049114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	114046421
15841	NC_008322	A	6	6	1049131	1049136	100 %	0 %	0 %	0 %	114046421
15842	NC_008322	GTT	2	6	1049193	1049198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046421
15843	NC_008322	ACAA	2	8	1049202	1049209	75 %	0 %	0 %	25 %	114046421
15844	NC_008322	AAT	2	6	1049408	1049413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046421
15845	NC_008322	T	6	6	1049713	1049718	0 %	100 %	0 %	0 %	114046422
15846	NC_008322	GTG	2	6	1049727	1049732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046422
15847	NC_008322	TGC	2	6	1049734	1049739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046422
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15849	NC_008322	GCA	2	6	1050086	1050091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046423
15850	NC_008322	CTT	2	6	1050119	1050124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046423
15851	NC_008322	AAT	2	6	1050136	1050141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046423
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15864	NC_008322	CGAG	3	12	1051080	1051091	25 %	0 %	50 %	25 %	114046424
15865	NC_008322	AAT	2	6	1051135	1051140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046424
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15954	NC_008322	TTG	2	6	1056550	1056555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046431
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15965	NC_008322	TTA	2	6	1057007	1057012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046431
15966	NC_008322	CTT	2	6	1057013	1057018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046431
15967	NC_008322	TGC	2	6	1057027	1057032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046431
15968	NC_008322	ATC	2	6	1057044	1057049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046431
15969	NC_008322	TGA	2	6	1057078	1057083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046431
15970	NC_008322	CTG	2	6	1057113	1057118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046431
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15973	NC_008322	TAT	2	6	1057289	1057294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046431
15974	NC_008322	GC	3	6	1057296	1057301	0 %	0 %	50 %	50 %	114046431
15975	NC_008322	TGG	2	6	1057348	1057353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046431
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15977	NC_008322	TGG	2	6	1057406	1057411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046431
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15980	NC_008322	TAT	2	6	1057577	1057582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046431
15981	NC_008322	TGG	2	6	1057624	1057629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046431
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15983	NC_008322	CAT	2	6	1057826	1057831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046431
15984	NC_008322	CGG	2	6	1057834	1057839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046431
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15987	NC_008322	TCA	2	6	1058131	1058136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046432
15988	NC_008322	ATTT	2	8	1058231	1058238	25 %	75 %	0 %	0 %	114046432
15989	NC_008322	TGG	2	6	1058321	1058326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046432
15990	NC_008322	GTT	2	6	1058352	1058357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046432
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15992	NC_008322	GGC	2	6	1058448	1058453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046432
15993	NC_008322	GAT	2	6	1058512	1058517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046432
15994	NC_008322	CAG	2	6	1058521	1058526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046432
15995	NC_008322	A	6	6	1058539	1058544	100 %	0 %	0 %	0 %	114046432
15996	NC_008322	GCC	2	6	1058545	1058550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046432
15997	NC_008322	GAT	2	6	1058563	1058568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046432
15998	NC_008322	CTT	2	6	1058787	1058792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046432
15999	NC_008322	GAA	2	6	1058884	1058889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046432
16000	NC_008322	GCG	2	6	1059037	1059042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046432

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