MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008322	GCCT	2	8	865483	865490	0 %	25 %	25 %	50 %	114046266
13002	NC_008322	TTGT	2	8	865610	865617	0 %	75 %	25 %	0 %	114046266
13003	NC_008322	GAT	2	6	865796	865801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046266
13004	NC_008322	ATA	2	6	865842	865847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046266
13005	NC_008322	GAA	2	6	865850	865855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046266
13006	NC_008322	AGA	2	6	865867	865872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046266
13007	NC_008322	GCG	2	6	865925	865930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046267
13008	NC_008322	GAA	2	6	865938	865943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046267
13009	NC_008322	TCA	2	6	865969	865974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046267
13010	NC_008322	GCG	2	6	866021	866026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046267
13011	NC_008322	ATT	2	6	866028	866033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046267
13012	NC_008322	TGAG	2	8	866041	866048	25 %	25 %	50 %	0 %	114046267
13013	NC_008322	A	6	6	866076	866081	100 %	0 %	0 %	0 %	114046267
13014	NC_008322	G	6	6	866212	866217	0 %	0 %	100 %	0 %	114046267
13015	NC_008322	CGC	2	6	866240	866245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046267
13016	NC_008322	GC	3	6	866262	866267	0 %	0 %	50 %	50 %	114046267
13017	NC_008322	TAT	2	6	866287	866292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046267
13018	NC_008322	AG	3	6	866451	866456	50 %	0 %	50 %	0 %	114046267
13019	NC_008322	CTTG	2	8	866477	866484	0 %	50 %	25 %	25 %	114046267
13020	NC_008322	CTGGAG	2	12	866496	866507	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114046267
13021	NC_008322	ATC	2	6	866556	866561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046267
13022	NC_008322	CAG	2	6	866678	866683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046267
13023	NC_008322	CGC	2	6	866705	866710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046267
13024	NC_008322	A	6	6	866724	866729	100 %	0 %	0 %	0 %	114046267
13025	NC_008322	TGG	2	6	866737	866742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046267
13026	NC_008322	TGA	2	6	866753	866758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046267
13027	NC_008322	TGG	3	9	866785	866793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046267
13028	NC_008322	GTC	2	6	866902	866907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046267
13029	NC_008322	CGT	2	6	866973	866978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046267
13030	NC_008322	TGA	2	6	867031	867036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046267
13031	NC_008322	TGA	2	6	867053	867058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046267
13032	NC_008322	GC	3	6	867108	867113	0 %	0 %	50 %	50 %	114046267
13033	NC_008322	AGA	2	6	867179	867184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046267
13034	NC_008322	CGC	2	6	867258	867263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046267
13035	NC_008322	AAGA	2	8	867279	867286	75 %	0 %	25 %	0 %	114046267
13036	NC_008322	CGA	2	6	867314	867319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046267
13037	NC_008322	CGC	2	6	867321	867326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046267
13038	NC_008322	TTG	2	6	867334	867339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046267
13039	NC_008322	CGAG	2	8	867382	867389	25 %	0 %	50 %	25 %	114046267
13040	NC_008322	GGCG	2	8	867473	867480	0 %	0 %	75 %	25 %	114046267
13041	NC_008322	GGC	2	6	867518	867523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046267
13042	NC_008322	TATT	2	8	867526	867533	25 %	75 %	0 %	0 %	114046267
13043	NC_008322	CGAC	2	8	867556	867563	25 %	0 %	25 %	50 %	114046267
13044	NC_008322	GAG	2	6	867584	867589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046267
13045	NC_008322	CAC	2	6	867605	867610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046267
13046	NC_008322	GCA	2	6	867641	867646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046267
13047	NC_008322	CCG	2	6	867768	867773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046267
13048	NC_008322	CCG	2	6	867789	867794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046267
13049	NC_008322	GAGC	2	8	867927	867934	25 %	0 %	50 %	25 %	114046267
13050	NC_008322	GAA	2	6	867945	867950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046267
13051	NC_008322	TGA	2	6	867952	867957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046267
13052	NC_008322	GGGC	2	8	868000	868007	0 %	0 %	75 %	25 %	114046267
13053	NC_008322	GTG	2	6	868051	868056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046267
13054	NC_008322	GTC	2	6	868348	868353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046268
13055	NC_008322	CAC	2	6	868389	868394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046268
13056	NC_008322	GTA	2	6	868513	868518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046268
13057	NC_008322	AAGT	2	8	868595	868602	50 %	25 %	25 %	0 %	114046268
13058	NC_008322	ACC	2	6	868651	868656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046268
13059	NC_008322	AACTT	2	10	868673	868682	40 %	40 %	0 %	20 %	114046268
13060	NC_008322	TGT	2	6	868722	868727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046268
13061	NC_008322	TAG	2	6	868742	868747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046268
13062	NC_008322	AGT	2	6	868816	868821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046268
13063	NC_008322	TCG	2	6	868829	868834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046268
13064	NC_008322	AGT	2	6	868881	868886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046268
13065	NC_008322	TAAG	2	8	869038	869045	50 %	25 %	25 %	0 %	114046268
13066	NC_008322	AAC	2	6	869110	869115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046268
13067	NC_008322	AG	3	6	869159	869164	50 %	0 %	50 %	0 %	114046268
13068	NC_008322	GTT	2	6	869167	869172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046268
13069	NC_008322	GTT	2	6	869191	869196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046268
13070	NC_008322	GCCAGT	2	12	869324	869335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114046268
13071	NC_008322	GTC	2	6	869840	869845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046269
13072	NC_008322	TGT	2	6	869952	869957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046269
13073	NC_008322	TCAC	2	8	869967	869974	25 %	25 %	0 %	50 %	114046269
13074	NC_008322	AACT	2	8	870053	870060	50 %	25 %	0 %	25 %	114046269
13075	NC_008322	ATC	2	6	870071	870076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046269
13076	NC_008322	GGC	2	6	870086	870091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046269
13077	NC_008322	GTC	2	6	870131	870136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046269
13078	NC_008322	GCA	2	6	870243	870248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046269
13079	NC_008322	GTA	2	6	870251	870256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046269
13080	NC_008322	TCA	2	6	870364	870369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046269
13081	NC_008322	AAT	2	6	870412	870417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046269
13082	NC_008322	CAG	2	6	870430	870435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046269
13083	NC_008322	CAAA	2	8	870484	870491	75 %	0 %	0 %	25 %	114046269
13084	NC_008322	TTTG	2	8	870596	870603	0 %	75 %	25 %	0 %	114046269
13085	NC_008322	GTT	2	6	870698	870703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046269
13086	NC_008322	TGA	2	6	871284	871289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046270
13087	NC_008322	TGG	2	6	871312	871317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046270
13088	NC_008322	TGG	2	6	871371	871376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046270
13089	NC_008322	TGG	2	6	871387	871392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046270
13090	NC_008322	GCG	2	6	871406	871411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046270
13091	NC_008322	TGAT	2	8	871449	871456	25 %	50 %	25 %	0 %	114046270
13092	NC_008322	GAT	2	6	871460	871465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046270
13093	NC_008322	CGA	2	6	871509	871514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046270
13094	NC_008322	TTA	2	6	871596	871601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046270
13095	NC_008322	GCA	2	6	871694	871699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046270
13096	NC_008322	A	6	6	871722	871727	100 %	0 %	0 %	0 %	114046270
13097	NC_008322	TGG	2	6	871744	871749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046270
13098	NC_008322	GCGG	2	8	871751	871758	0 %	0 %	75 %	25 %	114046270
13099	NC_008322	AGTT	2	8	871914	871921	25 %	50 %	25 %	0 %	114046270
13100	NC_008322	GCA	3	9	871947	871955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046270
13101	NC_008322	GGC	2	6	872041	872046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046270
13102	NC_008322	GCGA	2	8	872093	872100	25 %	0 %	50 %	25 %	114046270
13103	NC_008322	ATA	2	6	872101	872106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046270
13104	NC_008322	GT	3	6	872268	872273	0 %	50 %	50 %	0 %	114046271
13105	NC_008322	GGC	2	6	872379	872384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046271
13106	NC_008322	GGC	2	6	872391	872396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046271
13107	NC_008322	TGG	2	6	872432	872437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046271
13108	NC_008322	AAG	2	6	872440	872445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046271
13109	NC_008322	ATT	2	6	872550	872555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046271
13110	NC_008322	GA	3	6	872590	872595	50 %	0 %	50 %	0 %	114046271
13111	NC_008322	TTGA	2	8	872610	872617	25 %	50 %	25 %	0 %	114046271
13112	NC_008322	TTC	2	6	872751	872756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046271
13113	NC_008322	CGAT	2	8	872764	872771	25 %	25 %	25 %	25 %	114046271
13114	NC_008322	ACT	2	6	872799	872804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046271
13115	NC_008322	TCG	2	6	872872	872877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046271
13116	NC_008322	CTC	2	6	872913	872918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046271
13117	NC_008322	GC	3	6	872933	872938	0 %	0 %	50 %	50 %	114046271
13118	NC_008322	GCC	2	6	872941	872946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046271
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13120	NC_008322	GCCC	2	8	872999	873006	0 %	0 %	25 %	75 %	114046271
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13240	NC_008322	TACT	2	8	880531	880538	25 %	50 %	0 %	25 %	114046277
13241	NC_008322	CA	3	6	880674	880679	50 %	0 %	0 %	50 %	114046277
13242	NC_008322	TTG	2	6	880685	880690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046277
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13342	NC_008322	TGA	2	6	886677	886682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046283
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13347	NC_008322	GGGCTT	2	12	887051	887062	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114046284
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13349	NC_008322	TGT	2	6	887163	887168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046284
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13353	NC_008322	CATCG	2	10	887510	887519	20 %	20 %	20 %	40 %	114046285
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13357	NC_008322	TTC	2	6	887771	887776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046285
13358	NC_008322	TGT	2	6	887935	887940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046285
13359	NC_008322	AGC	2	6	887943	887948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046285
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13361	NC_008322	AAG	2	6	888066	888071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046285
13362	NC_008322	GTT	2	6	888079	888084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046285
13363	NC_008322	GTTCA	2	10	888086	888095	20 %	40 %	20 %	20 %	114046285
13364	NC_008322	GGC	2	6	888113	888118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046285
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13372	NC_008322	GAT	2	6	888518	888523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046285
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13374	NC_008322	GTC	2	6	888557	888562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046285
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13377	NC_008322	TTC	2	6	888803	888808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046285
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13389	NC_008322	ATC	2	6	890024	890029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046287
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13479	NC_008322	GC	3	6	897894	897899	0 %	0 %	50 %	50 %	114046294
13480	NC_008322	CTT	3	9	897957	897965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046294
13481	NC_008322	GAA	2	6	898000	898005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046294
13482	NC_008322	CTT	2	6	898041	898046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046294
13483	NC_008322	TTC	2	6	898204	898209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046294
13484	NC_008322	CCA	2	6	898225	898230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046294
13485	NC_008322	GTC	2	6	898270	898275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046294
13486	NC_008322	ACC	2	6	898315	898320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046294
13487	NC_008322	CAT	2	6	898332	898337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046294
13488	NC_008322	GAA	2	6	898351	898356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046294
13489	NC_008322	GGT	2	6	898358	898363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046294
13490	NC_008322	GGTTG	2	10	898399	898408	0 %	40 %	60 %	0 %	114046294
13491	NC_008322	GC	3	6	898461	898466	0 %	0 %	50 %	50 %	114046294
13492	NC_008322	ATC	2	6	898528	898533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046294
13493	NC_008322	GCA	2	6	898613	898618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046294
13494	NC_008322	GCTT	2	8	898619	898626	0 %	50 %	25 %	25 %	114046294
13495	NC_008322	CAC	2	6	898753	898758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046294
13496	NC_008322	TTC	2	6	898813	898818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046294
13497	NC_008322	AGA	2	6	898839	898844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046294
13498	NC_008322	TTGC	2	8	898880	898887	0 %	50 %	25 %	25 %	114046294
13499	NC_008322	TTGG	2	8	898977	898984	0 %	50 %	50 %	0 %	114046294
13500	NC_008322	CCAGT	2	10	899033	899042	20 %	20 %	20 %	40 %	114046294

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