MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008322	CCA	2	6	740880	740885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046143
11002	NC_008322	TTG	3	9	740915	740923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046143
11003	NC_008322	ATG	2	6	740943	740948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046143
11004	NC_008322	TAA	2	6	740983	740988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046143
11005	NC_008322	GAT	2	6	740995	741000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046143
11006	NC_008322	TGG	2	6	741033	741038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046143
11007	NC_008322	AGT	2	6	741057	741062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046143
11008	NC_008322	GCG	3	9	741080	741088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046143
11009	NC_008322	GAC	2	6	741182	741187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046143
11010	NC_008322	TGGGC	2	10	741246	741255	0 %	20 %	60 %	20 %	114046143
11011	NC_008322	TTA	2	6	741282	741287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046143
11012	NC_008322	AAT	2	6	741338	741343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046143
11013	NC_008322	GTA	2	6	741350	741355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046143
11014	NC_008322	TAA	2	6	741420	741425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046143
11015	NC_008322	GCC	2	6	741437	741442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046143
11016	NC_008322	AGC	3	9	741916	741924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046144
11017	NC_008322	TGGCG	2	10	741930	741939	0 %	20 %	60 %	20 %	114046144
11018	NC_008322	GCC	2	6	741945	741950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046144
11019	NC_008322	GGCG	2	8	741966	741973	0 %	0 %	75 %	25 %	114046144
11020	NC_008322	GAC	2	6	742073	742078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046144
11021	NC_008322	GCT	2	6	742091	742096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046144
11022	NC_008322	GCC	2	6	742237	742242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046144
11023	NC_008322	GCA	2	6	742257	742262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046144
11024	NC_008322	GAA	2	6	742277	742282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046144
11025	NC_008322	TC	3	6	742321	742326	0 %	50 %	0 %	50 %	114046145
11026	NC_008322	TTC	2	6	742394	742399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046145
11027	NC_008322	AGG	2	6	742690	742695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046145
11028	NC_008322	TTAGAC	2	12	742732	742743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114046145
11029	NC_008322	TCG	2	6	742749	742754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046145
11030	NC_008322	TGG	2	6	742840	742845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046145
11031	NC_008322	TCG	2	6	742953	742958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046145
11032	NC_008322	AAG	2	6	743010	743015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046145
11033	NC_008322	GC	3	6	743023	743028	0 %	0 %	50 %	50 %	114046145
11034	NC_008322	CAT	2	6	743239	743244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046145
11035	NC_008322	AGT	2	6	743337	743342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046145
11036	NC_008322	GC	3	6	743369	743374	0 %	0 %	50 %	50 %	114046145
11037	NC_008322	GAA	2	6	743378	743383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046145
11038	NC_008322	CGG	2	6	743398	743403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046145
11039	NC_008322	GGT	2	6	743537	743542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046145
11040	NC_008322	TGT	2	6	743595	743600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046145
11041	NC_008322	GCTC	2	8	743602	743609	0 %	25 %	25 %	50 %	114046145
11042	NC_008322	TGC	2	6	743671	743676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046145
11043	NC_008322	ATC	2	6	743837	743842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046145
11044	NC_008322	CG	3	6	743861	743866	0 %	0 %	50 %	50 %	114046145
11045	NC_008322	CGG	2	6	743929	743934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046145
11046	NC_008322	ATA	2	6	743976	743981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046145
11047	NC_008322	GCC	2	6	743990	743995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046145
11048	NC_008322	CAC	2	6	744028	744033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046145
11049	NC_008322	GTT	2	6	744060	744065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046145
11050	NC_008322	ATA	2	6	744083	744088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046145
11051	NC_008322	GT	3	6	744102	744107	0 %	50 %	50 %	0 %	114046145
11052	NC_008322	CA	3	6	744178	744183	50 %	0 %	0 %	50 %	114046145
11053	NC_008322	ACA	2	6	744342	744347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046145
11054	NC_008322	GGTT	2	8	744375	744382	0 %	50 %	50 %	0 %	114046145
11055	NC_008322	G	6	6	744404	744409	0 %	0 %	100 %	0 %	114046145
11056	NC_008322	GTA	2	6	744412	744417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046145
11057	NC_008322	GCT	2	6	744420	744425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046145
11058	NC_008322	GAT	2	6	744611	744616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046146
11059	NC_008322	AGC	2	6	744639	744644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046146
11060	NC_008322	TTC	2	6	744667	744672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046146
11061	NC_008322	GTC	2	6	744702	744707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046146
11062	NC_008322	AGC	2	6	744716	744721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046146
11063	NC_008322	ATTT	2	8	744722	744729	25 %	75 %	0 %	0 %	114046146
11064	NC_008322	AATC	2	8	744932	744939	50 %	25 %	0 %	25 %	114046146
11065	NC_008322	TGG	2	6	744951	744956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046146
11066	NC_008322	AAG	2	6	745008	745013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046146
11067	NC_008322	GCA	2	6	745033	745038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046146
11068	NC_008322	AAT	2	6	745185	745190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046147
11069	NC_008322	TGAC	2	8	745225	745232	25 %	25 %	25 %	25 %	114046147
11070	NC_008322	GAA	2	6	745245	745250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046147
11071	NC_008322	GCG	2	6	745272	745277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046147
11072	NC_008322	CGG	2	6	745352	745357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046147
11073	NC_008322	GGCT	2	8	745406	745413	0 %	25 %	50 %	25 %	114046147
11074	NC_008322	AGC	2	6	745462	745467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046147
11075	NC_008322	GATA	2	8	745541	745548	50 %	25 %	25 %	0 %	114046147
11076	NC_008322	T	6	6	745557	745562	0 %	100 %	0 %	0 %	114046147
11077	NC_008322	GCC	2	6	745617	745622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046147
11078	NC_008322	TGC	2	6	745681	745686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046147
11079	NC_008322	GCG	2	6	745720	745725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046147
11080	NC_008322	CCA	2	6	745763	745768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046147
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11082	NC_008322	GCC	2	6	745824	745829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046147
11083	NC_008322	GCC	2	6	745842	745847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046147
11084	NC_008322	GTT	2	6	745872	745877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046147
11085	NC_008322	CCG	2	6	745880	745885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046147
11086	NC_008322	GCCA	2	8	745956	745963	25 %	0 %	25 %	50 %	114046147
11087	NC_008322	GAC	2	6	745988	745993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046147
11088	NC_008322	GCG	2	6	746032	746037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046147
11089	NC_008322	TCT	2	6	746068	746073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046147
11090	NC_008322	CAA	2	6	746417	746422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046148
11091	NC_008322	TGC	2	6	746469	746474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046148
11092	NC_008322	ATT	2	6	746514	746519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046148
11093	NC_008322	CGC	2	6	746533	746538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046148
11094	NC_008322	CAC	2	6	746548	746553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046148
11095	NC_008322	T	6	6	746564	746569	0 %	100 %	0 %	0 %	114046148
11096	NC_008322	ATG	2	6	746570	746575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046148
11097	NC_008322	ATG	2	6	746585	746590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046148
11098	NC_008322	AAT	2	6	746624	746629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046148
11099	NC_008322	GCA	2	6	746644	746649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046148
11100	NC_008322	GCTTAG	2	12	746685	746696	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114046148
11101	NC_008322	GTTT	2	8	746745	746752	0 %	75 %	25 %	0 %	114046148
11102	NC_008322	CTG	2	6	746792	746797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046148
11103	NC_008322	TGA	2	6	746826	746831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046148
11104	NC_008322	GCC	2	6	746843	746848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046148
11105	NC_008322	TGA	2	6	746907	746912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046148
11106	NC_008322	CCAG	2	8	746997	747004	25 %	0 %	25 %	50 %	114046148
11107	NC_008322	GCA	2	6	747087	747092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046148
11108	NC_008322	CAT	2	6	747166	747171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046148
11109	NC_008322	TTA	2	6	747177	747182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046148
11110	NC_008322	TTTA	2	8	747239	747246	25 %	75 %	0 %	0 %	114046148
11111	NC_008322	GGCA	2	8	747267	747274	25 %	0 %	50 %	25 %	114046148
11112	NC_008322	CTA	2	6	747292	747297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046148
11113	NC_008322	TGG	2	6	747351	747356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046148
11114	NC_008322	GGCT	2	8	747416	747423	0 %	25 %	50 %	25 %	114046148
11115	NC_008322	ATT	2	6	747512	747517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046148
11116	NC_008322	CGC	2	6	747637	747642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046148
11117	NC_008322	TTGCCG	2	12	747648	747659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046148
11118	NC_008322	TCA	2	6	747752	747757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046148
11119	NC_008322	CG	3	6	747983	747988	0 %	0 %	50 %	50 %	114046149
11120	NC_008322	CAA	2	6	747989	747994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046149
11121	NC_008322	TAA	2	6	748057	748062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046149
11122	NC_008322	TCC	2	6	748189	748194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046149
11123	NC_008322	GTTT	2	8	748222	748229	0 %	75 %	25 %	0 %	114046149
11124	NC_008322	CGC	2	6	748230	748235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046149
11125	NC_008322	TGGT	2	8	748309	748316	0 %	50 %	50 %	0 %	114046149
11126	NC_008322	TAA	2	6	748368	748373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046149
11127	NC_008322	GCA	2	6	748480	748485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046150
11128	NC_008322	TAA	2	6	748501	748506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046150
11129	NC_008322	CTA	2	6	748549	748554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046150
11130	NC_008322	AGC	2	6	748561	748566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046150
11131	NC_008322	TGT	2	6	748573	748578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046150
11132	NC_008322	CGG	2	6	748615	748620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046150
11133	NC_008322	ATC	2	6	748728	748733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046150
11134	NC_008322	TGG	2	6	748818	748823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046150
11135	NC_008322	ATA	2	6	748872	748877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046150
11136	NC_008322	AAT	4	12	749152	749163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046151
11137	NC_008322	TCG	2	6	749179	749184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046151
11138	NC_008322	T	6	6	749188	749193	0 %	100 %	0 %	0 %	114046151
11139	NC_008322	GCA	2	6	749219	749224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046151
11140	NC_008322	TGA	3	9	749260	749268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046151
11141	NC_008322	GTG	2	6	749307	749312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046151
11142	NC_008322	CTG	2	6	749361	749366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046151
11143	NC_008322	TGTCA	2	10	749596	749605	20 %	40 %	20 %	20 %	114046151
11144	NC_008322	GCG	2	6	749651	749656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046151
11145	NC_008322	GTG	2	6	749675	749680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046151
11146	NC_008322	CGG	2	6	749713	749718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046151
11147	NC_008322	CTG	2	6	749774	749779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046151
11148	NC_008322	TTA	2	6	749859	749864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046151
11149	NC_008322	GAC	2	6	749873	749878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046151
11150	NC_008322	CGAAGG	2	12	749926	749937	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114046151
11151	NC_008322	AAG	2	6	749955	749960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046151
11152	NC_008322	CG	3	6	750078	750083	0 %	0 %	50 %	50 %	114046151
11153	NC_008322	AGC	2	6	750099	750104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046151
11154	NC_008322	GCG	2	6	750299	750304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046151
11155	NC_008322	GCC	2	6	750365	750370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046151
11156	NC_008322	GCG	2	6	750401	750406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046151
11157	NC_008322	CTG	2	6	750461	750466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046151
11158	NC_008322	GTG	2	6	750566	750571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046151
11159	NC_008322	ATC	2	6	750661	750666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046151
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11162	NC_008322	CAA	2	6	751302	751307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046152
11163	NC_008322	TCCG	2	8	751357	751364	0 %	25 %	25 %	50 %	114046152
11164	NC_008322	TGGCG	2	10	751383	751392	0 %	20 %	60 %	20 %	114046152
11165	NC_008322	AAG	2	6	751434	751439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046152
11166	NC_008322	TAC	2	6	751476	751481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046152
11167	NC_008322	AAGCA	2	10	751497	751506	60 %	0 %	20 %	20 %	114046152
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11181	NC_008322	GGC	2	6	752213	752218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046153
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11184	NC_008322	ATC	2	6	752314	752319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046153
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11187	NC_008322	CTG	2	6	752461	752466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046153
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11190	NC_008322	GCA	2	6	752710	752715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046153
11191	NC_008322	GGC	2	6	752725	752730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046153
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11197	NC_008322	CGC	2	6	752947	752952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046153
11198	NC_008322	GCT	2	6	753025	753030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046153
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11200	NC_008322	TGG	2	6	753094	753099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046153
11201	NC_008322	CAGC	2	8	753134	753141	25 %	0 %	25 %	50 %	114046153
11202	NC_008322	AGC	2	6	753161	753166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046153
11203	NC_008322	GAG	2	6	753182	753187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046153
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11205	NC_008322	A	6	6	753557	753562	100 %	0 %	0 %	0 %	114046154
11206	NC_008322	CGT	2	6	753614	753619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046154
11207	NC_008322	CCGAGG	2	12	753669	753680	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114046154
11208	NC_008322	GCTG	2	8	753724	753731	0 %	25 %	50 %	25 %	114046154
11209	NC_008322	CAA	2	6	753736	753741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046154
11210	NC_008322	GCG	2	6	753776	753781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046154
11211	NC_008322	CCGATG	2	12	753804	753815	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114046154
11212	NC_008322	TGA	3	9	753820	753828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046154
11213	NC_008322	GAA	2	6	753842	753847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046154
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11215	NC_008322	CGC	2	6	754120	754125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046155
11216	NC_008322	AGC	2	6	754178	754183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046155
11217	NC_008322	CGC	2	6	754262	754267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046155
11218	NC_008322	CTT	2	6	754306	754311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046155
11219	NC_008322	ACAG	2	8	754326	754333	50 %	0 %	25 %	25 %	114046155
11220	NC_008322	TGC	2	6	754364	754369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046155
11221	NC_008322	AAT	2	6	754413	754418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046155
11222	NC_008322	GTG	2	6	754458	754463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046155
11223	NC_008322	TTA	2	6	754645	754650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046156
11224	NC_008322	GC	3	6	754679	754684	0 %	0 %	50 %	50 %	114046156
11225	NC_008322	GCG	2	6	754718	754723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046156
11226	NC_008322	CGG	3	9	754737	754745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046156
11227	NC_008322	CAC	2	6	754771	754776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046156
11228	NC_008322	CAC	2	6	754897	754902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046156
11229	NC_008322	GTC	2	6	754904	754909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046156
11230	NC_008322	GCA	2	6	754923	754928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046156
11231	NC_008322	GGC	2	6	754933	754938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046156
11232	NC_008322	CAT	2	6	754947	754952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046156
11233	NC_008322	CCAC	2	8	755016	755023	25 %	0 %	0 %	75 %	114046156
11234	NC_008322	CAG	2	6	755049	755054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046156
11235	NC_008322	TGG	2	6	755191	755196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046156
11236	NC_008322	GCG	2	6	755219	755224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046156
11237	NC_008322	ATC	2	6	755261	755266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046156
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11348	NC_008322	GCG	2	6	764141	764146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046163
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11351	NC_008322	GAT	2	6	764337	764342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046163
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11354	NC_008322	GCGA	2	8	764390	764397	25 %	0 %	50 %	25 %	114046163
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11467	NC_008322	CGA	2	6	770908	770913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046168
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11472	NC_008322	CAAG	2	8	771215	771222	50 %	0 %	25 %	25 %	114046168
11473	NC_008322	TGA	2	6	771223	771228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046168
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