MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_008322	TAA	2	6	3863353	3863358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048751
58502	NC_008322	CAG	2	6	3863419	3863424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048752
58503	NC_008322	AAT	2	6	3863461	3863466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048752
58504	NC_008322	CGC	2	6	3863551	3863556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048752
58505	NC_008322	AAT	2	6	3863557	3863562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048752
58506	NC_008322	GCC	2	6	3863566	3863571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048752
58507	NC_008322	GCT	2	6	3863697	3863702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048752
58508	NC_008322	AAAG	2	8	3863749	3863756	75 %	0 %	25 %	0 %	114048752
58509	NC_008322	TTC	2	6	3863849	3863854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048752
58510	NC_008322	CAT	2	6	3863932	3863937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048752
58511	NC_008322	AGAT	2	8	3864137	3864144	50 %	25 %	25 %	0 %	114048752
58512	NC_008322	CCA	2	6	3864165	3864170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048752
58513	NC_008322	CAT	2	6	3864232	3864237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048752
58514	NC_008322	A	6	6	3864263	3864268	100 %	0 %	0 %	0 %	114048752
58515	NC_008322	CAG	2	6	3864373	3864378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048752
58516	NC_008322	TTC	2	6	3864412	3864417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048752
58517	NC_008322	GAT	2	6	3864505	3864510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048752
58518	NC_008322	GCCC	2	8	3864574	3864581	0 %	0 %	25 %	75 %	114048752
58519	NC_008322	TTG	2	6	3864645	3864650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048752
58520	NC_008322	CTG	2	6	3865232	3865237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048753
58521	NC_008322	AAGG	2	8	3865262	3865269	50 %	0 %	50 %	0 %	114048753
58522	NC_008322	CG	4	8	3865308	3865315	0 %	0 %	50 %	50 %	114048753
58523	NC_008322	CAT	2	6	3865345	3865350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048753
58524	NC_008322	ACA	2	6	3865418	3865423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048753
58525	NC_008322	TGC	2	6	3865445	3865450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048753
58526	NC_008322	TCG	2	6	3865479	3865484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048753
58527	NC_008322	CG	3	6	3865535	3865540	0 %	0 %	50 %	50 %	114048753
58528	NC_008322	GTA	2	6	3865670	3865675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048753
58529	NC_008322	CGC	2	6	3865693	3865698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048753
58530	NC_008322	T	6	6	3865731	3865736	0 %	100 %	0 %	0 %	114048753
58531	NC_008322	GCC	2	6	3865771	3865776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048753
58532	NC_008322	ACC	2	6	3865859	3865864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048753
58533	NC_008322	CGC	2	6	3865990	3865995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048753
58534	NC_008322	CATA	2	8	3866055	3866062	50 %	25 %	0 %	25 %	114048753
58535	NC_008322	GTTG	2	8	3866092	3866099	0 %	50 %	50 %	0 %	114048753
58536	NC_008322	AGCC	2	8	3866217	3866224	25 %	0 %	25 %	50 %	114048753
58537	NC_008322	GCC	2	6	3866234	3866239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048753
58538	NC_008322	CAC	2	6	3866263	3866268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048753
58539	NC_008322	CGG	2	6	3866271	3866276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048753
58540	NC_008322	GTC	2	6	3866302	3866307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048753
58541	NC_008322	CATA	2	8	3866337	3866344	50 %	25 %	0 %	25 %	114048753
58542	NC_008322	CGT	2	6	3866364	3866369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048753
58543	NC_008322	TTG	2	6	3866383	3866388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048753
58544	NC_008322	CCAA	2	8	3866491	3866498	50 %	0 %	0 %	50 %	114048753
58545	NC_008322	GCGA	2	8	3866504	3866511	25 %	0 %	50 %	25 %	114048753
58546	NC_008322	GTG	2	6	3866543	3866548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048753
58547	NC_008322	ATCGGC	2	12	3866621	3866632	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114048753
58548	NC_008322	CCA	2	6	3866769	3866774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048753
58549	NC_008322	GCC	2	6	3866779	3866784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048753
58550	NC_008322	CAT	2	6	3866785	3866790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048753
58551	NC_008322	GT	3	6	3866843	3866848	0 %	50 %	50 %	0 %	114048753
58552	NC_008322	GC	3	6	3866959	3866964	0 %	0 %	50 %	50 %	114048753
58553	NC_008322	GCAA	2	8	3866972	3866979	50 %	0 %	25 %	25 %	114048753
58554	NC_008322	CTTGG	2	10	3867015	3867024	0 %	40 %	40 %	20 %	114048753
58555	NC_008322	CGA	2	6	3867033	3867038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048753
58556	NC_008322	AAATC	2	10	3867081	3867090	60 %	20 %	0 %	20 %	114048753
58557	NC_008322	CGG	2	6	3867195	3867200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048753
58558	NC_008322	CGCT	2	8	3867275	3867282	0 %	25 %	25 %	50 %	114048753
58559	NC_008322	CGG	2	6	3867366	3867371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048753
58560	NC_008322	AATC	2	8	3867390	3867397	50 %	25 %	0 %	25 %	114048753
58561	NC_008322	TAA	2	6	3867441	3867446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048753
58562	NC_008322	CCTGCG	2	12	3867474	3867485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114048753
58563	NC_008322	GGT	2	6	3867547	3867552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048753
58564	NC_008322	CGA	2	6	3867554	3867559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048753
58565	NC_008322	CGC	2	6	3867663	3867668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048753
58566	NC_008322	TTG	2	6	3867695	3867700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048753
58567	NC_008322	ATT	3	9	3867707	3867715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048753
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58569	NC_008322	CAT	2	6	3867976	3867981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048754
58570	NC_008322	TCG	2	6	3867990	3867995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048754
58571	NC_008322	CGG	2	6	3868023	3868028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048754
58572	NC_008322	GCT	2	6	3868042	3868047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048754
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58574	NC_008322	ATT	2	6	3868182	3868187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048754
58575	NC_008322	GGC	2	6	3868202	3868207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048754
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58577	NC_008322	TTG	2	6	3868292	3868297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048754
58578	NC_008322	CAAA	2	8	3868384	3868391	75 %	0 %	0 %	25 %	114048754
58579	NC_008322	GGC	2	6	3868394	3868399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048754
58580	NC_008322	GCCAC	2	10	3868422	3868431	20 %	0 %	20 %	60 %	114048754
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58583	NC_008322	GCT	2	6	3868955	3868960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048755
58584	NC_008322	CAA	2	6	3869031	3869036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048755
58585	NC_008322	CATA	2	8	3869069	3869076	50 %	25 %	0 %	25 %	114048755
58586	NC_008322	ACA	2	6	3869084	3869089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048755
58587	NC_008322	TTATC	2	10	3869096	3869105	20 %	60 %	0 %	20 %	114048755
58588	NC_008322	CCG	3	9	3869116	3869124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048755
58589	NC_008322	ATG	2	6	3869125	3869130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048755
58590	NC_008322	CCG	2	6	3869161	3869166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048755
58591	NC_008322	GGC	2	6	3869289	3869294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048755
58592	NC_008322	A	6	6	3869341	3869346	100 %	0 %	0 %	0 %	114048755
58593	NC_008322	CTG	2	6	3869397	3869402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048755
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58596	NC_008322	ACT	2	6	3869503	3869508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048755
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58598	NC_008322	TGAA	2	8	3869581	3869588	50 %	25 %	25 %	0 %	114048755
58599	NC_008322	CAG	2	6	3869836	3869841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048756
58600	NC_008322	CGA	2	6	3870009	3870014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048756
58601	NC_008322	AAC	2	6	3870122	3870127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048756
58602	NC_008322	TGC	2	6	3870143	3870148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048756
58603	NC_008322	GGC	2	6	3870154	3870159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048756
58604	NC_008322	C	6	6	3870185	3870190	0 %	0 %	0 %	100 %	114048756
58605	NC_008322	TCA	2	6	3870206	3870211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048756
58606	NC_008322	CAAT	2	8	3870231	3870238	50 %	25 %	0 %	25 %	114048756
58607	NC_008322	GCA	2	6	3870335	3870340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048756
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58611	NC_008322	TCA	2	6	3870515	3870520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048756
58612	NC_008322	TTGA	2	8	3870715	3870722	25 %	50 %	25 %	0 %	114048756
58613	NC_008322	GCG	2	6	3870795	3870800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048756
58614	NC_008322	ACTG	2	8	3870881	3870888	25 %	25 %	25 %	25 %	114048756
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58993	NC_008322	A	6	6	3896612	3896617	100 %	0 %	0 %	0 %	114048782
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