MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_008322	CAC	3	9	3629592	3629600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048552
55002	NC_008322	GAG	2	6	3629674	3629679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114048552
55003	NC_008322	AAT	2	6	3629776	3629781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048553
55004	NC_008322	ATC	2	6	3629792	3629797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048553
55005	NC_008322	TGCT	2	8	3629831	3629838	0 %	50 %	25 %	25 %	114048553
55006	NC_008322	TGC	2	6	3629922	3629927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048553
55007	NC_008322	TAA	2	6	3630149	3630154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048553
55008	NC_008322	CTT	2	6	3630214	3630219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048553
55009	NC_008322	TAA	2	6	3630248	3630253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048553
55010	NC_008322	AT	3	6	3630345	3630350	50 %	50 %	0 %	0 %	114048553
55011	NC_008322	GCA	2	6	3630445	3630450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048553
55012	NC_008322	CCAG	2	8	3630540	3630547	25 %	0 %	25 %	50 %	114048553
55013	NC_008322	CAGG	2	8	3630553	3630560	25 %	0 %	50 %	25 %	114048553
55014	NC_008322	TCT	2	6	3630685	3630690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048553
55015	NC_008322	CGG	2	6	3630759	3630764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048553
55016	NC_008322	ACTCA	2	10	3630827	3630836	40 %	20 %	0 %	40 %	114048553
55017	NC_008322	GAT	2	6	3630890	3630895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048553
55018	NC_008322	ACGC	2	8	3631052	3631059	25 %	0 %	25 %	50 %	114048553
55019	NC_008322	TCG	2	6	3631224	3631229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048553
55020	NC_008322	TGT	2	6	3631302	3631307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048553
55021	NC_008322	CAC	2	6	3631661	3631666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048554
55022	NC_008322	GAT	2	6	3631670	3631675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048554
55023	NC_008322	GTA	2	6	3631758	3631763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048554
55024	NC_008322	ATC	2	6	3631791	3631796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048554
55025	NC_008322	TCA	2	6	3632095	3632100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048554
55026	NC_008322	AAT	2	6	3632113	3632118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048554
55027	NC_008322	CAT	2	6	3632128	3632133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048554
55028	NC_008322	AGC	2	6	3632171	3632176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048554
55029	NC_008322	AGAT	2	8	3632193	3632200	50 %	25 %	25 %	0 %	114048554
55030	NC_008322	CAC	2	6	3632338	3632343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048554
55031	NC_008322	TGC	2	6	3632508	3632513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048554
55032	NC_008322	TTG	2	6	3632516	3632521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048554
55033	NC_008322	CGT	2	6	3632545	3632550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048554
55034	NC_008322	TTC	2	6	3632573	3632578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048554
55035	NC_008322	CCG	2	6	3632787	3632792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048554
55036	NC_008322	GCT	2	6	3632828	3632833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048554
55037	NC_008322	GTC	2	6	3632871	3632876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048554
55038	NC_008322	GCGCC	2	10	3632902	3632911	0 %	0 %	40 %	60 %	114048554
55039	NC_008322	TTG	2	6	3632923	3632928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048554
55040	NC_008322	TCA	2	6	3633061	3633066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048554
55041	NC_008322	CCA	2	6	3633067	3633072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048554
55042	NC_008322	GC	3	6	3633137	3633142	0 %	0 %	50 %	50 %	114048554
55043	NC_008322	CACTTT	2	12	3633254	3633265	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	114048554
55044	NC_008322	TCG	2	6	3633276	3633281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048554
55045	NC_008322	CGC	2	6	3633286	3633291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048554
55046	NC_008322	GCT	2	6	3633292	3633297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048554
55047	NC_008322	TCGAG	2	10	3633310	3633319	20 %	20 %	40 %	20 %	114048554
55048	NC_008322	TAA	2	6	3633497	3633502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048554
55049	NC_008322	TGGC	2	8	3633525	3633532	0 %	25 %	50 %	25 %	114048554
55050	NC_008322	GA	3	6	3633588	3633593	50 %	0 %	50 %	0 %	114048554
55051	NC_008322	TCA	2	6	3633699	3633704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048554
55052	NC_008322	CGC	2	6	3633709	3633714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048554
55053	NC_008322	CAT	2	6	3633769	3633774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048554
55054	NC_008322	GCTC	2	8	3633862	3633869	0 %	25 %	25 %	50 %	114048554
55055	NC_008322	CAA	2	6	3633962	3633967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048554
55056	NC_008322	T	6	6	3634000	3634005	0 %	100 %	0 %	0 %	114048554
55057	NC_008322	ACC	2	6	3634089	3634094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048554
55058	NC_008322	CAT	2	6	3634136	3634141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048554
55059	NC_008322	GCCGA	2	10	3634188	3634197	20 %	0 %	40 %	40 %	114048554
55060	NC_008322	T	6	6	3634280	3634285	0 %	100 %	0 %	0 %	114048554
55061	NC_008322	GCG	2	6	3634386	3634391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048554
55062	NC_008322	TTC	2	6	3634416	3634421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048554
55063	NC_008322	ACTA	2	8	3634582	3634589	50 %	25 %	0 %	25 %	114048555
55064	NC_008322	GCGGCA	2	12	3634602	3634613	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114048555
55065	NC_008322	ATC	2	6	3634647	3634652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048555
55066	NC_008322	ACC	2	6	3634681	3634686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048555
55067	NC_008322	ATA	2	6	3634699	3634704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048555
55068	NC_008322	TAA	2	6	3634733	3634738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048555
55069	NC_008322	CGC	2	6	3634853	3634858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048555
55070	NC_008322	CCA	2	6	3634879	3634884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048555
55071	NC_008322	CAG	2	6	3634919	3634924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048555
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55073	NC_008322	A	6	6	3634971	3634976	100 %	0 %	0 %	0 %	114048555
55074	NC_008322	CAT	2	6	3634988	3634993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048555
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55076	NC_008322	CTCG	2	8	3635487	3635494	0 %	25 %	25 %	50 %	114048556
55077	NC_008322	GGC	2	6	3635605	3635610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048556
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55081	NC_008322	CGC	2	6	3635943	3635948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048556
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55084	NC_008322	CTGC	2	8	3636094	3636101	0 %	25 %	25 %	50 %	114048556
55085	NC_008322	CCA	2	6	3636170	3636175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048556
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55087	NC_008322	TGG	2	6	3636192	3636197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048556
55088	NC_008322	TGA	2	6	3636269	3636274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048556
55089	NC_008322	GCC	2	6	3636394	3636399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048556
55090	NC_008322	TAT	2	6	3636408	3636413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048556
55091	NC_008322	ATG	2	6	3636451	3636456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048556
55092	NC_008322	CCG	2	6	3636458	3636463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048556
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55095	NC_008322	TGCT	2	8	3636741	3636748	0 %	50 %	25 %	25 %	114048557
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55099	NC_008322	CGC	2	6	3636953	3636958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048558
55100	NC_008322	CAC	2	6	3637049	3637054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048558
55101	NC_008322	GCC	2	6	3637059	3637064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048558
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55103	NC_008322	CGCC	2	8	3637081	3637088	0 %	0 %	25 %	75 %	114048558
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55116	NC_008322	CTT	2	6	3638109	3638114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048559
55117	NC_008322	GGTG	2	8	3638124	3638131	0 %	25 %	75 %	0 %	114048559
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55232	NC_008322	CA	3	6	3651535	3651540	50 %	0 %	0 %	50 %	114048564
55233	NC_008322	CTG	2	6	3651594	3651599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048564
55234	NC_008322	CCG	2	6	3651658	3651663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048564
55235	NC_008322	GTCA	2	8	3651669	3651676	25 %	25 %	25 %	25 %	114048564
55236	NC_008322	GCA	2	6	3651716	3651721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048564
55237	NC_008322	TCT	2	6	3651787	3651792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048565
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55253	NC_008322	TGCGCG	2	12	3652592	3652603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114048565
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55256	NC_008322	GAATT	2	10	3652805	3652814	40 %	40 %	20 %	0 %	114048566
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55301	NC_008322	TGA	2	6	3655878	3655883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048567
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55322	NC_008322	CCA	2	6	3657988	3657993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048569
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55324	NC_008322	CAA	2	6	3658043	3658048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048569
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55330	NC_008322	CGCTG	2	10	3658279	3658288	0 %	20 %	40 %	40 %	114048570
55331	NC_008322	CCA	2	6	3658374	3658379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048570
55332	NC_008322	GGCT	2	8	3658392	3658399	0 %	25 %	50 %	25 %	114048570
55333	NC_008322	CTG	2	6	3658432	3658437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048570
55334	NC_008322	AATC	2	8	3658506	3658513	50 %	25 %	0 %	25 %	114048570
55335	NC_008322	AGTG	2	8	3658548	3658555	25 %	25 %	50 %	0 %	114048570
55336	NC_008322	TGC	2	6	3658655	3658660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048570
55337	NC_008322	GTC	2	6	3658673	3658678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048570
55338	NC_008322	TTC	2	6	3658687	3658692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048570
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55340	NC_008322	TCA	3	9	3658918	3658926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048571
55341	NC_008322	AT	3	6	3658970	3658975	50 %	50 %	0 %	0 %	114048571
55342	NC_008322	T	6	6	3658988	3658993	0 %	100 %	0 %	0 %	114048571
55343	NC_008322	ACG	2	6	3659014	3659019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048571
55344	NC_008322	CAT	2	6	3659025	3659030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048571
55345	NC_008322	ACA	2	6	3659077	3659082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048571
55346	NC_008322	CTG	2	6	3659190	3659195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048571
55347	NC_008322	GCC	2	6	3659203	3659208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048571
55348	NC_008322	AATG	2	8	3659288	3659295	50 %	25 %	25 %	0 %	114048571
55349	NC_008322	ATC	2	6	3659337	3659342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048571
55350	NC_008322	ACGCC	2	10	3659365	3659374	20 %	0 %	20 %	60 %	114048571
55351	NC_008322	ACGCCA	2	12	3659462	3659473	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114048571
55352	NC_008322	TCA	2	6	3659477	3659482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048571
55353	NC_008322	AGC	2	6	3659494	3659499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048571
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55355	NC_008322	GTC	2	6	3659600	3659605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048572
55356	NC_008322	GAC	2	6	3659606	3659611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048572
55357	NC_008322	CACT	2	8	3659622	3659629	25 %	25 %	0 %	50 %	114048572
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55359	NC_008322	TCA	2	6	3659782	3659787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048572
55360	NC_008322	GTGA	2	8	3659816	3659823	25 %	25 %	50 %	0 %	114048572
55361	NC_008322	CCG	2	6	3659896	3659901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048572
55362	NC_008322	CTT	2	6	3659911	3659916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048572
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55366	NC_008322	ACA	2	6	3660354	3660359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048573
55367	NC_008322	TGG	2	6	3660365	3660370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048573
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55373	NC_008322	GAT	2	6	3660774	3660779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048574
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55379	NC_008322	CAG	2	6	3661176	3661181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048574
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55383	NC_008322	GCCT	2	8	3662610	3662617	0 %	25 %	25 %	50 %	114048576
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55386	NC_008322	T	6	6	3662789	3662794	0 %	100 %	0 %	0 %	114048576
55387	NC_008322	TAGA	2	8	3662868	3662875	50 %	25 %	25 %	0 %	114048576
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55403	NC_008322	TGA	2	6	3664102	3664107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048578
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55425	NC_008322	CTG	2	6	3665354	3665359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048579
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55435	NC_008322	TGCT	2	8	3665970	3665977	0 %	50 %	25 %	25 %	114048580
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55449	NC_008322	A	6	6	3666804	3666809	100 %	0 %	0 %	0 %	114048581
55450	NC_008322	CA	4	8	3667127	3667134	50 %	0 %	0 %	50 %	114048582
55451	NC_008322	CTT	2	6	3667223	3667228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048582
55452	NC_008322	CTC	2	6	3667266	3667271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114048582
55453	NC_008322	GCA	2	6	3667297	3667302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048582
55454	NC_008322	GCG	2	6	3667335	3667340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048582
55455	NC_008322	CGG	2	6	3667364	3667369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048582
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55458	NC_008322	CTG	2	6	3667485	3667490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048582
55459	NC_008322	GCGTTA	2	12	3667522	3667533	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114048582
55460	NC_008322	ATT	2	6	3667539	3667544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048582
55461	NC_008322	ACCTT	2	10	3667558	3667567	20 %	40 %	0 %	40 %	114048582
55462	NC_008322	CG	3	6	3667600	3667605	0 %	0 %	50 %	50 %	114048582
55463	NC_008322	CCA	2	6	3667619	3667624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048582
55464	NC_008322	GCA	2	6	3667625	3667630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048582
55465	NC_008322	ATC	2	6	3667696	3667701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048582
55466	NC_008322	CGC	3	9	3667716	3667724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048582
55467	NC_008322	CG	3	6	3667827	3667832	0 %	0 %	50 %	50 %	114048582
55468	NC_008322	TAA	2	6	3667872	3667877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048582
55469	NC_008322	CTG	2	6	3668196	3668201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048583
55470	NC_008322	ACC	2	6	3668220	3668225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048583
55471	NC_008322	GCC	2	6	3668238	3668243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048583
55472	NC_008322	CG	3	6	3668276	3668281	0 %	0 %	50 %	50 %	114048583
55473	NC_008322	ATT	2	6	3668285	3668290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048583
55474	NC_008322	TTC	2	6	3668372	3668377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048583
55475	NC_008322	GCTC	2	8	3668385	3668392	0 %	25 %	25 %	50 %	114048583
55476	NC_008322	TTC	2	6	3668395	3668400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048583
55477	NC_008322	CCG	2	6	3668410	3668415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048583
55478	NC_008322	CAA	2	6	3668490	3668495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048583
55479	NC_008322	CTG	2	6	3668496	3668501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048583
55480	NC_008322	TAC	2	6	3668520	3668525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048583
55481	NC_008322	AGC	2	6	3668657	3668662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048583
55482	NC_008322	GAA	2	6	3668723	3668728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048583
55483	NC_008322	GTG	2	6	3668767	3668772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048583
55484	NC_008322	CGT	2	6	3668779	3668784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048583
55485	NC_008322	TTG	2	6	3668785	3668790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048583
55486	NC_008322	GAT	2	6	3668862	3668867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048583
55487	NC_008322	GAA	2	6	3668991	3668996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048583
55488	NC_008322	GTT	2	6	3669045	3669050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048583
55489	NC_008322	TTA	2	6	3669165	3669170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048583
55490	NC_008322	ATC	2	6	3669179	3669184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048583
55491	NC_008322	TAA	2	6	3669371	3669376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048584
55492	NC_008322	GT	3	6	3669427	3669432	0 %	50 %	50 %	0 %	114048584
55493	NC_008322	CAC	2	6	3669467	3669472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048584
55494	NC_008322	CCAG	2	8	3669490	3669497	25 %	0 %	25 %	50 %	114048584
55495	NC_008322	GAT	2	6	3669812	3669817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048584
55496	NC_008322	GTG	2	6	3669837	3669842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048584
55497	NC_008322	GAA	3	9	3669882	3669890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048584
55498	NC_008322	TGA	2	6	3670066	3670071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048584
55499	NC_008322	TTCG	2	8	3670074	3670081	0 %	50 %	25 %	25 %	114048584
55500	NC_008322	GCGCCA	2	12	3670105	3670116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114048584

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