MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 72678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_008322	AAG	2	6	3567515	3567520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048501
54002	NC_008322	AGGTC	2	10	3567557	3567566	20 %	20 %	40 %	20 %	114048501
54003	NC_008322	CGA	2	6	3567581	3567586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048501
54004	NC_008322	GCC	2	6	3567594	3567599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048501
54005	NC_008322	GT	3	6	3567661	3567666	0 %	50 %	50 %	0 %	114048501
54006	NC_008322	GTC	2	6	3567783	3567788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048501
54007	NC_008322	CGG	2	6	3567842	3567847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048501
54008	NC_008322	GTCA	2	8	3567863	3567870	25 %	25 %	25 %	25 %	114048501
54009	NC_008322	TAT	2	6	3567971	3567976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048501
54010	NC_008322	TTG	2	6	3568129	3568134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048501
54011	NC_008322	GGC	2	6	3568203	3568208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048501
54012	NC_008322	GCC	2	6	3568275	3568280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048501
54013	NC_008322	GGT	2	6	3568316	3568321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048501
54014	NC_008322	ATT	2	6	3568361	3568366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048501
54015	NC_008322	GAAATG	2	12	3568410	3568421	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	114048501
54016	NC_008322	AAG	2	6	3568483	3568488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048501
54017	NC_008322	GTG	2	6	3568500	3568505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048501
54018	NC_008322	GTC	2	6	3568510	3568515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048501
54019	NC_008322	ATC	2	6	3568531	3568536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048501
54020	NC_008322	CTT	2	6	3568547	3568552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048501
54021	NC_008322	GAA	2	6	3568602	3568607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048501
54022	NC_008322	CAAC	2	8	3568670	3568677	50 %	0 %	0 %	50 %	114048501
54023	NC_008322	CCA	2	6	3568739	3568744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048501
54024	NC_008322	CCA	2	6	3568942	3568947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048501
54025	NC_008322	CCCA	2	8	3569068	3569075	25 %	0 %	0 %	75 %	114048502
54026	NC_008322	TCA	2	6	3569204	3569209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048502
54027	NC_008322	TAT	2	6	3569256	3569261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048502
54028	NC_008322	AAC	2	6	3569530	3569535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048503
54029	NC_008322	TAAA	2	8	3569537	3569544	75 %	25 %	0 %	0 %	114048503
54030	NC_008322	GTT	2	6	3569560	3569565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048503
54031	NC_008322	GCC	2	6	3569602	3569607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048503
54032	NC_008322	GGT	2	6	3569692	3569697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048503
54033	NC_008322	TCGG	2	8	3569725	3569732	0 %	25 %	50 %	25 %	114048503
54034	NC_008322	CGG	2	6	3569811	3569816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048503
54035	NC_008322	ACG	2	6	3569840	3569845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048503
54036	NC_008322	TTG	2	6	3570011	3570016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048503
54037	NC_008322	ATT	2	6	3570098	3570103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048503
54038	NC_008322	TCGC	2	8	3570142	3570149	0 %	25 %	25 %	50 %	114048503
54039	NC_008322	TTGGC	2	10	3570150	3570159	0 %	40 %	40 %	20 %	114048503
54040	NC_008322	GCG	2	6	3570170	3570175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048503
54041	NC_008322	GT	3	6	3570194	3570199	0 %	50 %	50 %	0 %	114048503
54042	NC_008322	ACG	2	6	3570206	3570211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048503
54043	NC_008322	AGA	2	6	3570346	3570351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048504
54044	NC_008322	CTG	2	6	3570392	3570397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048504
54045	NC_008322	CAC	2	6	3570448	3570453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048504
54046	NC_008322	ATG	2	6	3570465	3570470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048504
54047	NC_008322	AAG	2	6	3570561	3570566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048504
54048	NC_008322	CCG	2	6	3570600	3570605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048504
54049	NC_008322	ATC	2	6	3570696	3570701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048504
54050	NC_008322	GA	3	6	3570715	3570720	50 %	0 %	50 %	0 %	114048504
54051	NC_008322	AC	3	6	3570767	3570772	50 %	0 %	0 %	50 %	114048504
54052	NC_008322	TCA	2	6	3570787	3570792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048504
54053	NC_008322	TG	3	6	3570938	3570943	0 %	50 %	50 %	0 %	114048504
54054	NC_008322	CTTCAT	2	12	3570952	3570963	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	114048504
54055	NC_008322	AG	3	6	3570965	3570970	50 %	0 %	50 %	0 %	114048504
54056	NC_008322	T	6	6	3570986	3570991	0 %	100 %	0 %	0 %	114048504
54057	NC_008322	TCA	2	6	3571062	3571067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048504
54058	NC_008322	TCACAC	2	12	3571177	3571188	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	114048504
54059	NC_008322	CCG	2	6	3571237	3571242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048504
54060	NC_008322	CAT	2	6	3571343	3571348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048504
54061	NC_008322	TGC	2	6	3571550	3571555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048504
54062	NC_008322	CTG	2	6	3571586	3571591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048504
54063	NC_008322	CGA	2	6	3571971	3571976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048505
54064	NC_008322	AC	3	6	3572074	3572079	50 %	0 %	0 %	50 %	114048505
54065	NC_008322	AT	3	6	3572088	3572093	50 %	50 %	0 %	0 %	114048505
54066	NC_008322	CCA	2	6	3572101	3572106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048505
54067	NC_008322	ATAA	2	8	3572120	3572127	75 %	25 %	0 %	0 %	114048505
54068	NC_008322	CAC	2	6	3572147	3572152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048505
54069	NC_008322	CAG	2	6	3572213	3572218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048505
54070	NC_008322	CAAA	2	8	3572309	3572316	75 %	0 %	0 %	25 %	114048505
54071	NC_008322	CAC	2	6	3572317	3572322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048505
54072	NC_008322	CGG	2	6	3572419	3572424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048505
54073	NC_008322	ATTG	2	8	3572507	3572514	25 %	50 %	25 %	0 %	114048505
54074	NC_008322	CCA	2	6	3572544	3572549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048505
54075	NC_008322	CCA	2	6	3572602	3572607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048505
54076	NC_008322	GGC	2	6	3572645	3572650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048505
54077	NC_008322	A	6	6	3572651	3572656	100 %	0 %	0 %	0 %	114048505
54078	NC_008322	CAA	3	9	3572756	3572764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048505
54079	NC_008322	AAATC	2	10	3572884	3572893	60 %	20 %	0 %	20 %	114048505
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54081	NC_008322	GCCA	2	8	3572947	3572954	25 %	0 %	25 %	50 %	114048505
54082	NC_008322	GCA	2	6	3573078	3573083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048505
54083	NC_008322	CAG	2	6	3573338	3573343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048506
54084	NC_008322	AC	3	6	3573496	3573501	50 %	0 %	0 %	50 %	114048506
54085	NC_008322	GCA	2	6	3573547	3573552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048506
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54088	NC_008322	GC	3	6	3573645	3573650	0 %	0 %	50 %	50 %	114048506
54089	NC_008322	TGG	2	6	3573681	3573686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048506
54090	NC_008322	CGC	2	6	3573806	3573811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048506
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54097	NC_008322	CAT	2	6	3574123	3574128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048506
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54101	NC_008322	T	6	6	3574473	3574478	0 %	100 %	0 %	0 %	114048507
54102	NC_008322	GCC	2	6	3574525	3574530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048507
54103	NC_008322	T	6	6	3574701	3574706	0 %	100 %	0 %	0 %	114048507
54104	NC_008322	GGA	2	6	3574730	3574735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114048507
54105	NC_008322	CTA	2	6	3574744	3574749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048507
54106	NC_008322	AC	3	6	3574770	3574775	50 %	0 %	0 %	50 %	114048507
54107	NC_008322	GCC	2	6	3574927	3574932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048507
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54109	NC_008322	CA	3	6	3575097	3575102	50 %	0 %	0 %	50 %	114048507
54110	NC_008322	T	6	6	3575116	3575121	0 %	100 %	0 %	0 %	114048507
54111	NC_008322	AATCAC	2	12	3575169	3575180	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	114048507
54112	NC_008322	GCG	2	6	3575233	3575238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048507
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54116	NC_008322	GCG	2	6	3575411	3575416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048507
54117	NC_008322	CTT	2	6	3575426	3575431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048507
54118	NC_008322	ATA	2	6	3575437	3575442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048507
54119	NC_008322	TGC	2	6	3575540	3575545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048508
54120	NC_008322	GGC	2	6	3575573	3575578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048508
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54122	NC_008322	ATC	2	6	3575651	3575656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048508
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54130	NC_008322	TGC	2	6	3576125	3576130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048508
54131	NC_008322	CAG	2	6	3576229	3576234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048508
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54135	NC_008322	CCTGC	2	10	3576721	3576730	0 %	20 %	20 %	60 %	114048509
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54138	NC_008322	TTGATA	2	12	3576980	3576991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	114048509
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54142	NC_008322	AGT	2	6	3577291	3577296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048509
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54145	NC_008322	TTG	2	6	3577385	3577390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048509
54146	NC_008322	TTGGA	2	10	3577434	3577443	20 %	40 %	40 %	0 %	114048509
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54148	NC_008322	TCG	2	6	3577641	3577646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048509
54149	NC_008322	TGGC	2	8	3577670	3577677	0 %	25 %	50 %	25 %	114048509
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54153	NC_008322	GTG	2	6	3577794	3577799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048509
54154	NC_008322	CCG	2	6	3577801	3577806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048509
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54200	NC_008322	CAG	2	6	3580428	3580433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048510
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54202	NC_008322	GTTT	2	8	3580558	3580565	0 %	75 %	25 %	0 %	114048510
54203	NC_008322	GAT	2	6	3580589	3580594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048510
54204	NC_008322	GACA	2	8	3580635	3580642	50 %	0 %	25 %	25 %	114048510
54205	NC_008322	TCGTAG	2	12	3580660	3580671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114048510
54206	NC_008322	TCGC	2	8	3580753	3580760	0 %	25 %	25 %	50 %	114048510
54207	NC_008322	GCT	2	6	3580810	3580815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048510
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54209	NC_008322	ATT	2	6	3580849	3580854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048510
54210	NC_008322	AAT	2	6	3580940	3580945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048511
54211	NC_008322	GCT	2	6	3580951	3580956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048511
54212	NC_008322	TCA	2	6	3581010	3581015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048511
54213	NC_008322	TGC	2	6	3581057	3581062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048511
54214	NC_008322	A	7	7	3581090	3581096	100 %	0 %	0 %	0 %	114048511
54215	NC_008322	GCA	2	6	3581116	3581121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048511
54216	NC_008322	AATCG	2	10	3581203	3581212	40 %	20 %	20 %	20 %	114048511
54217	NC_008322	ACC	2	6	3581213	3581218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048511
54218	NC_008322	CTT	2	6	3581503	3581508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048511
54219	NC_008322	GCG	2	6	3581570	3581575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048511
54220	NC_008322	GAG	2	6	3581588	3581593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114048511
54221	NC_008322	CTG	2	6	3581606	3581611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048511
54222	NC_008322	TGG	2	6	3581617	3581622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048511
54223	NC_008322	AGC	2	6	3581639	3581644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048511
54224	NC_008322	AGA	2	6	3581657	3581662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048511
54225	NC_008322	ACG	2	6	3581692	3581697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048511
54226	NC_008322	CGG	2	6	3581707	3581712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048511
54227	NC_008322	ATG	2	6	3581763	3581768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048511
54228	NC_008322	CAA	2	6	3581774	3581779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048511
54229	NC_008322	AGT	2	6	3581792	3581797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048511
54230	NC_008322	TAC	2	6	3581798	3581803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048511
54231	NC_008322	TGC	2	6	3582328	3582333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048512
54232	NC_008322	TCA	2	6	3582443	3582448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048512
54233	NC_008322	TAA	2	6	3582460	3582465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048512
54234	NC_008322	CTA	2	6	3582653	3582658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048512
54235	NC_008322	CGA	2	6	3582660	3582665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048512
54236	NC_008322	CACCAT	2	12	3582666	3582677	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	114048512
54237	NC_008322	TTA	2	6	3582711	3582716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048512
54238	NC_008322	CAGT	2	8	3582749	3582756	25 %	25 %	25 %	25 %	114048512
54239	NC_008322	CTC	2	6	3582776	3582781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114048512
54240	NC_008322	T	6	6	3582802	3582807	0 %	100 %	0 %	0 %	114048512
54241	NC_008322	CAG	2	6	3582836	3582841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048512
54242	NC_008322	TGGG	2	8	3582913	3582920	0 %	25 %	75 %	0 %	114048512
54243	NC_008322	ATC	2	6	3582921	3582926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048512
54244	NC_008322	GCT	2	6	3582956	3582961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048512
54245	NC_008322	ATCT	2	8	3582966	3582973	25 %	50 %	0 %	25 %	114048512
54246	NC_008322	GT	3	6	3582987	3582992	0 %	50 %	50 %	0 %	114048512
54247	NC_008322	GTG	2	6	3583017	3583022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048512
54248	NC_008322	CGG	2	6	3583127	3583132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048512
54249	NC_008322	TTA	2	6	3583134	3583139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048512
54250	NC_008322	ATT	2	6	3583200	3583205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048512
54251	NC_008322	TATCT	2	10	3583250	3583259	20 %	60 %	0 %	20 %	114048513
54252	NC_008322	CAT	2	6	3583349	3583354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048513
54253	NC_008322	GCT	2	6	3583358	3583363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048513
54254	NC_008322	TCA	2	6	3583375	3583380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048513
54255	NC_008322	TAA	2	6	3583449	3583454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048513
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54257	NC_008322	TCG	2	6	3583487	3583492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048513
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54260	NC_008322	AGT	2	6	3583541	3583546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048513
54261	NC_008322	AAT	2	6	3583570	3583575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048513
54262	NC_008322	GTT	2	6	3583605	3583610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048513
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54264	NC_008322	AGC	2	6	3583717	3583722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048513
54265	NC_008322	AGC	2	6	3583812	3583817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048513
54266	NC_008322	CTTGCA	2	12	3583829	3583840	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114048513
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54268	NC_008322	TGT	2	6	3584103	3584108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048514
54269	NC_008322	GCC	2	6	3584115	3584120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048514
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54271	NC_008322	CAT	2	6	3584402	3584407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048514
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54273	NC_008322	T	6	6	3584521	3584526	0 %	100 %	0 %	0 %	114048514
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54278	NC_008322	TCAG	2	8	3584899	3584906	25 %	25 %	25 %	25 %	114048514
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54284	NC_008322	GAT	2	6	3585369	3585374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048514
54285	NC_008322	GATA	2	8	3585402	3585409	50 %	25 %	25 %	0 %	114048514
54286	NC_008322	CGC	2	6	3585447	3585452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048514
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54300	NC_008322	TCT	2	6	3586341	3586346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048515
54301	NC_008322	ATC	2	6	3586525	3586530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048515
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54331	NC_008322	GCA	2	6	3588137	3588142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048515
54332	NC_008322	GAT	2	6	3588212	3588217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048515
54333	NC_008322	ACG	2	6	3588668	3588673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048516
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54335	NC_008322	TTTA	2	8	3588844	3588851	25 %	75 %	0 %	0 %	114048516
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54337	NC_008322	ATT	2	6	3588874	3588879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048516
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54339	NC_008322	A	6	6	3589275	3589280	100 %	0 %	0 %	0 %	114048516
54340	NC_008322	TGAA	2	8	3589292	3589299	50 %	25 %	25 %	0 %	114048516
54341	NC_008322	AGA	2	6	3589367	3589372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048516
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54343	NC_008322	ACG	2	6	3589400	3589405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048516
54344	NC_008322	GCA	2	6	3589411	3589416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048516
54345	NC_008322	AAC	2	6	3589521	3589526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048516
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54463	NC_008322	G	6	6	3596343	3596348	0 %	0 %	100 %	0 %	114048523
54464	NC_008322	T	6	6	3596394	3596399	0 %	100 %	0 %	0 %	114048523
54465	NC_008322	CTG	2	6	3596400	3596405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048523
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54489	NC_008322	CGC	2	6	3597614	3597619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048524
54490	NC_008322	CTCG	2	8	3597644	3597651	0 %	25 %	25 %	50 %	114048524
54491	NC_008322	CCAGCC	2	12	3597655	3597666	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114048524
54492	NC_008322	A	6	6	3597741	3597746	100 %	0 %	0 %	0 %	114048524
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