MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20115	NC_008321	GCA	2	6	1314093	1314098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969463
20116	NC_008321	TCTG	2	8	1314103	1314110	0 %	50 %	25 %	25 %	113969463
20117	NC_008321	GCAG	2	8	1314200	1314207	25 %	0 %	50 %	25 %	113969463
20118	NC_008321	TTGA	2	8	1314257	1314264	25 %	50 %	25 %	0 %	113969463
20119	NC_008321	TGC	2	6	1314309	1314314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969463
20120	NC_008321	GCC	2	6	1314326	1314331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969463
20121	NC_008321	CGT	2	6	1314407	1314412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969463
20122	NC_008321	TGC	2	6	1314417	1314422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969463
20123	NC_008321	ATG	3	9	1314680	1314688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969464
20124	NC_008321	TGA	2	6	1314746	1314751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969464
20125	NC_008321	TGG	2	6	1314914	1314919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969464
20126	NC_008321	GAT	2	6	1314952	1314957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969464
20127	NC_008321	GCG	3	9	1314979	1314987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969464
20128	NC_008321	T	6	6	1314999	1315004	0 %	100 %	0 %	0 %	113969464
20129	NC_008321	CCG	2	6	1315013	1315018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969464
20130	NC_008321	GCG	2	6	1315077	1315082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969464
20131	NC_008321	GCGA	2	8	1315114	1315121	25 %	0 %	50 %	25 %	113969464
20132	NC_008321	CGG	2	6	1315426	1315431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969465
20133	NC_008321	AGG	2	6	1315453	1315458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969465
20134	NC_008321	TTG	2	6	1315600	1315605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969465
20135	NC_008321	CTG	2	6	1315623	1315628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969465
20136	NC_008321	TGGC	2	8	1315805	1315812	0 %	25 %	50 %	25 %	113969465
20137	NC_008321	GCA	2	6	1315857	1315862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969465
20138	NC_008321	TTA	2	6	1315884	1315889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969465
20139	NC_008321	GGC	2	6	1315905	1315910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969465
20140	NC_008321	ATC	2	6	1315917	1315922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969465
20141	NC_008321	CAA	2	6	1315941	1315946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969465
20142	NC_008321	CGC	2	6	1315962	1315967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969465
20143	NC_008321	ATTT	2	8	1316039	1316046	25 %	75 %	0 %	0 %	113969465
20144	NC_008321	TTG	2	6	1316137	1316142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969466
20145	NC_008321	GTT	2	6	1316175	1316180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969466
20146	NC_008321	ATT	2	6	1316240	1316245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969466
20147	NC_008321	ATA	2	6	1316252	1316257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969466
20148	NC_008321	A	6	6	1316424	1316429	100 %	0 %	0 %	0 %	113969466
20149	NC_008321	TCC	2	6	1316524	1316529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969466
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20151	NC_008321	A	7	7	1316557	1316563	100 %	0 %	0 %	0 %	113969466
20152	NC_008321	CAA	2	6	1316597	1316602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969466
20153	NC_008321	CAA	2	6	1316608	1316613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969466
20154	NC_008321	TCG	2	6	1316630	1316635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969466
20155	NC_008321	GTCA	2	8	1316662	1316669	25 %	25 %	25 %	25 %	113969466
20156	NC_008321	ATTG	2	8	1316694	1316701	25 %	50 %	25 %	0 %	113969466
20157	NC_008321	ATC	2	6	1316764	1316769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969466
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20159	NC_008321	ATT	2	6	1316836	1316841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969466
20160	NC_008321	CAGAT	2	10	1316879	1316888	40 %	20 %	20 %	20 %	113969466
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20162	NC_008321	GACA	2	8	1316921	1316928	50 %	0 %	25 %	25 %	113969466
20163	NC_008321	ATT	2	6	1317014	1317019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969466
20164	NC_008321	AGA	2	6	1317140	1317145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969467
20165	NC_008321	TAG	2	6	1317148	1317153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969467
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20170	NC_008321	AGA	3	9	1317320	1317328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969467
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20172	NC_008321	AAT	2	6	1317429	1317434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969467
20173	NC_008321	GCT	2	6	1317446	1317451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969467
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20177	NC_008321	GAC	2	6	1317822	1317827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969467
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20182	NC_008321	TTAACA	2	12	1318383	1318394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	113969468
20183	NC_008321	TGA	2	6	1318404	1318409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969468
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20185	NC_008321	CTT	2	6	1318516	1318521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969468
20186	NC_008321	TGCA	2	8	1318526	1318533	25 %	25 %	25 %	25 %	113969468
20187	NC_008321	GCCA	2	8	1318586	1318593	25 %	0 %	25 %	50 %	113969468
20188	NC_008321	AAT	2	6	1318621	1318626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969468
20189	NC_008321	CATC	2	8	1318729	1318736	25 %	25 %	0 %	50 %	113969468
20190	NC_008321	CCA	2	6	1318792	1318797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969468
20191	NC_008321	CGAT	2	8	1318854	1318861	25 %	25 %	25 %	25 %	113969468
20192	NC_008321	ATG	2	6	1318869	1318874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969468
20193	NC_008321	CTG	2	6	1318882	1318887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969468
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20200	NC_008321	GTA	2	6	1319387	1319392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969468
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20202	NC_008321	CGG	2	6	1319561	1319566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969468
20203	NC_008321	GC	3	6	1319580	1319585	0 %	0 %	50 %	50 %	113969468
20204	NC_008321	GTT	2	6	1319593	1319598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969468
20205	NC_008321	TGC	2	6	1319670	1319675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969468
20206	NC_008321	ATA	2	6	1319754	1319759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969468
20207	NC_008321	GCT	2	6	1319785	1319790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969468
20208	NC_008321	ATTC	2	8	1319824	1319831	25 %	50 %	0 %	25 %	113969468
20209	NC_008321	GCT	2	6	1319937	1319942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969468
20210	NC_008321	ACC	2	6	1319957	1319962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969468
20211	NC_008321	TTGA	2	8	1320026	1320033	25 %	50 %	25 %	0 %	113969468
20212	NC_008321	AGC	2	6	1320097	1320102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969468
20213	NC_008321	CAG	3	9	1320173	1320181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969468
20214	NC_008321	GCG	2	6	1320218	1320223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969468
20215	NC_008321	ATG	2	6	1320239	1320244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969468
20216	NC_008321	GTAGC	2	10	1320375	1320384	20 %	20 %	40 %	20 %	113969468
20217	NC_008321	TC	3	6	1320431	1320436	0 %	50 %	0 %	50 %	113969468
20218	NC_008321	TCG	2	6	1320450	1320455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969468
20219	NC_008321	CAC	2	6	1320482	1320487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969468
20220	NC_008321	GATCG	2	10	1320617	1320626	20 %	20 %	40 %	20 %	113969468
20221	NC_008321	CCA	2	6	1320627	1320632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969468
20222	NC_008321	AAT	2	6	1320663	1320668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969468
20223	NC_008321	TCA	2	6	1320687	1320692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969468
20224	NC_008321	AGA	2	6	1320694	1320699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969468
20225	NC_008321	CAG	2	6	1320728	1320733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969468
20226	NC_008321	CAT	2	6	1320773	1320778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969468
20227	NC_008321	ATC	2	6	1320797	1320802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969468
20228	NC_008321	CAAA	2	8	1321216	1321223	75 %	0 %	0 %	25 %	113969469
20229	NC_008321	TGC	2	6	1321235	1321240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969469
20230	NC_008321	CAT	2	6	1321280	1321285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969469
20231	NC_008321	ATC	2	6	1321409	1321414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969469
20232	NC_008321	AAC	2	6	1321421	1321426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969469
20233	NC_008321	GCC	2	6	1321446	1321451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969469
20234	NC_008321	CTAT	2	8	1321507	1321514	25 %	50 %	0 %	25 %	113969469
20235	NC_008321	A	6	6	1321518	1321523	100 %	0 %	0 %	0 %	113969469
20236	NC_008321	ATC	2	6	1321626	1321631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969469
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20238	NC_008321	ATG	2	6	1321713	1321718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969469
20239	NC_008321	TCA	2	6	1321777	1321782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969469
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20243	NC_008321	TGC	2	6	1321958	1321963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969469
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20250	NC_008321	GCT	2	6	1322443	1322448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969470
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20253	NC_008321	GAAA	2	8	1322656	1322663	75 %	0 %	25 %	0 %	113969470
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20329	NC_008321	CGAGCT	2	12	1326666	1326677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113969472
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20331	NC_008321	ATT	2	6	1326771	1326776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969472
20332	NC_008321	TCG	2	6	1327060	1327065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969473
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20334	NC_008321	TGA	2	6	1327090	1327095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969473
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20339	NC_008321	GCT	2	6	1329030	1329035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969474
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20341	NC_008321	TAA	2	6	1329088	1329093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969474
20342	NC_008321	CT	3	6	1329161	1329166	0 %	50 %	0 %	50 %	113969474
20343	NC_008321	GC	3	6	1329169	1329174	0 %	0 %	50 %	50 %	113969474
20344	NC_008321	GAA	2	6	1329184	1329189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969474
20345	NC_008321	GTA	2	6	1329237	1329242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969474
20346	NC_008321	CAA	2	6	1329300	1329305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969474
20347	NC_008321	GGC	2	6	1329355	1329360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969474
20348	NC_008321	ATG	2	6	1329386	1329391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969474
20349	NC_008321	CAT	2	6	1329454	1329459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969474
20350	NC_008321	CGC	2	6	1329613	1329618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969474
20351	NC_008321	GTC	2	6	1329646	1329651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969474
20352	NC_008321	GAT	2	6	1329682	1329687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969474
20353	NC_008321	CGC	2	6	1329717	1329722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969474
20354	NC_008321	TCA	2	6	1329768	1329773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969474
20355	NC_008321	GGC	2	6	1329955	1329960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969474
20356	NC_008321	CAT	2	6	1329973	1329978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969474
20357	NC_008321	TGA	2	6	1330149	1330154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969474
20358	NC_008321	TCA	2	6	1330164	1330169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969474
20359	NC_008321	AGA	3	9	1330188	1330196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969474
20360	NC_008321	GTCG	2	8	1330222	1330229	0 %	25 %	50 %	25 %	113969474
20361	NC_008321	GCTGA	2	10	1330292	1330301	20 %	20 %	40 %	20 %	113969474
20362	NC_008321	ATC	2	6	1330345	1330350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969474
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20364	NC_008321	CCA	2	6	1330438	1330443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969474
20365	NC_008321	GA	3	6	1330452	1330457	50 %	0 %	50 %	0 %	113969474
20366	NC_008321	TGC	2	6	1330508	1330513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969474
20367	NC_008321	T	6	6	1330662	1330667	0 %	100 %	0 %	0 %	113969474
20368	NC_008321	GAC	2	6	1330789	1330794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969474
20369	NC_008321	CA	3	6	1330903	1330908	50 %	0 %	0 %	50 %	113969474
20370	NC_008321	CGA	2	6	1330958	1330963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969474
20371	NC_008321	GCA	2	6	1330974	1330979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969474
20372	NC_008321	GTG	2	6	1331066	1331071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969474
20373	NC_008321	AAATC	2	10	1331232	1331241	60 %	20 %	0 %	20 %	113969474
20374	NC_008321	CTT	2	6	1331265	1331270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969474
20375	NC_008321	ACG	2	6	1331338	1331343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969474
20376	NC_008321	GCT	2	6	1331346	1331351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969474
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20378	NC_008321	GGC	2	6	1331424	1331429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969474
20379	NC_008321	CTT	2	6	1331436	1331441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969474
20380	NC_008321	ATG	2	6	1331555	1331560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969474
20381	NC_008321	ATG	2	6	1331618	1331623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969474
20382	NC_008321	T	6	6	1331721	1331726	0 %	100 %	0 %	0 %	113969474
20383	NC_008321	GTT	2	6	1331783	1331788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969475
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20385	NC_008321	TTTG	2	8	1331938	1331945	0 %	75 %	25 %	0 %	113969475
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20408	NC_008321	CGT	2	6	1334779	1334784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969478
20409	NC_008321	GCTT	2	8	1334820	1334827	0 %	50 %	25 %	25 %	113969478
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20414	NC_008321	TCA	2	6	1335058	1335063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969478
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20416	NC_008321	T	6	6	1335203	1335208	0 %	100 %	0 %	0 %	113969478
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20432	NC_008321	TGA	3	9	1336356	1336364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969481
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20442	NC_008321	TCT	2	6	1336866	1336871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969481
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20450	NC_008321	GTT	2	6	1337951	1337956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969482
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20453	NC_008321	GTG	2	6	1338074	1338079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969482
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20459	NC_008321	GGC	2	6	1338820	1338825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969482
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20461	NC_008321	CTC	2	6	1338883	1338888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969482
20462	NC_008321	AGC	2	6	1338915	1338920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969482
20463	NC_008321	GCC	2	6	1338941	1338946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969482
20464	NC_008321	TCA	2	6	1338949	1338954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969482
20465	NC_008321	GCA	2	6	1338970	1338975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969482
20466	NC_008321	GT	3	6	1339050	1339055	0 %	50 %	50 %	0 %	113969482
20467	NC_008321	AGC	2	6	1339062	1339067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969482
20468	NC_008321	CAAG	2	8	1339101	1339108	50 %	0 %	25 %	25 %	113969482
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20473	NC_008321	TGG	2	6	1339236	1339241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969482
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20479	NC_008321	A	6	6	1339442	1339447	100 %	0 %	0 %	0 %	113969482
20480	NC_008321	TGA	2	6	1339597	1339602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969482
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20484	NC_008321	GAA	2	6	1339832	1339837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969482
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20489	NC_008321	GCA	2	6	1340113	1340118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969483
20490	NC_008321	GCG	3	9	1340164	1340172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969483
20491	NC_008321	CTCA	2	8	1340188	1340195	25 %	25 %	0 %	50 %	113969483
20492	NC_008321	GAG	2	6	1340233	1340238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969483
20493	NC_008321	GAAAA	2	10	1340282	1340291	80 %	0 %	20 %	0 %	113969483
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20495	NC_008321	AAGC	2	8	1340413	1340420	50 %	0 %	25 %	25 %	113969483
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