MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_008321	ATC	2	6	1274599	1274604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969430
19502	NC_008321	GGGC	2	8	1274728	1274735	0 %	0 %	75 %	25 %	113969430
19503	NC_008321	GTT	2	6	1274742	1274747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969430
19504	NC_008321	GTTT	2	8	1274758	1274765	0 %	75 %	25 %	0 %	113969430
19505	NC_008321	AG	4	8	1274899	1274906	50 %	0 %	50 %	0 %	113969430
19506	NC_008321	GCG	2	6	1274920	1274925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969430
19507	NC_008321	TGC	2	6	1274930	1274935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969430
19508	NC_008321	T	6	6	1274937	1274942	0 %	100 %	0 %	0 %	113969430
19509	NC_008321	TTTA	2	8	1275560	1275567	25 %	75 %	0 %	0 %	113969431
19510	NC_008321	TC	3	6	1275595	1275600	0 %	50 %	0 %	50 %	113969431
19511	NC_008321	TTC	2	6	1275611	1275616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969431
19512	NC_008321	TTTA	2	8	1275713	1275720	25 %	75 %	0 %	0 %	113969431
19513	NC_008321	GCA	2	6	1275820	1275825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969431
19514	NC_008321	ATG	2	6	1275841	1275846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969431
19515	NC_008321	GC	3	6	1275869	1275874	0 %	0 %	50 %	50 %	113969431
19516	NC_008321	GTG	2	6	1275976	1275981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969431
19517	NC_008321	T	7	7	1276040	1276046	0 %	100 %	0 %	0 %	113969431
19518	NC_008321	GA	3	6	1276082	1276087	50 %	0 %	50 %	0 %	113969431
19519	NC_008321	CCG	2	6	1276117	1276122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969431
19520	NC_008321	TCA	2	6	1276248	1276253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969431
19521	NC_008321	A	6	6	1276288	1276293	100 %	0 %	0 %	0 %	113969431
19522	NC_008321	ATG	2	6	1276477	1276482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969431
19523	NC_008321	GGCG	2	8	1276494	1276501	0 %	0 %	75 %	25 %	113969431
19524	NC_008321	CGG	2	6	1276628	1276633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969431
19525	NC_008321	TGA	3	9	1276652	1276660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969431
19526	NC_008321	ATAACT	2	12	1276762	1276773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	113969431
19527	NC_008321	ATC	2	6	1276806	1276811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969431
19528	NC_008321	TGGTT	2	10	1276853	1276862	0 %	60 %	40 %	0 %	113969431
19529	NC_008321	AAAC	2	8	1276971	1276978	75 %	0 %	0 %	25 %	113969431
19530	NC_008321	GCC	2	6	1277013	1277018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969431
19531	NC_008321	CCG	2	6	1277044	1277049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969431
19532	NC_008321	A	7	7	1277134	1277140	100 %	0 %	0 %	0 %	113969431
19533	NC_008321	TAA	2	6	1277171	1277176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969431
19534	NC_008321	TTA	2	6	1277207	1277212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969431
19535	NC_008321	AGT	2	6	1277277	1277282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969431
19536	NC_008321	TGT	2	6	1277288	1277293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969431
19537	NC_008321	CAA	2	6	1277306	1277311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969431
19538	NC_008321	GTG	2	6	1277377	1277382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969431
19539	NC_008321	GCA	2	6	1277432	1277437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969431
19540	NC_008321	G	6	6	1277516	1277521	0 %	0 %	100 %	0 %	113969431
19541	NC_008321	GC	3	6	1277657	1277662	0 %	0 %	50 %	50 %	113969431
19542	NC_008321	TGC	2	6	1277830	1277835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969431
19543	NC_008321	CGT	2	6	1277967	1277972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969431
19544	NC_008321	TTA	2	6	1277984	1277989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969431
19545	NC_008321	GGA	2	6	1278031	1278036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969431
19546	NC_008321	GTC	2	6	1278090	1278095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969431
19547	NC_008321	AGC	2	6	1278306	1278311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969431
19548	NC_008321	TG	3	6	1278380	1278385	0 %	50 %	50 %	0 %	113969431
19549	NC_008321	TTC	2	6	1278480	1278485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969431
19550	NC_008321	GGT	2	6	1278539	1278544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969431
19551	NC_008321	GAC	2	6	1278569	1278574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969431
19552	NC_008321	GTG	2	6	1278600	1278605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969431
19553	NC_008321	T	6	6	1278654	1278659	0 %	100 %	0 %	0 %	113969431
19554	NC_008321	CCTTAA	2	12	1278730	1278741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969431
19555	NC_008321	CGG	2	6	1278763	1278768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969431
19556	NC_008321	CGC	2	6	1279033	1279038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969431
19557	NC_008321	C	6	6	1279049	1279054	0 %	0 %	0 %	100 %	113969431
19558	NC_008321	GCAGC	2	10	1279056	1279065	20 %	0 %	40 %	40 %	113969431
19559	NC_008321	TGA	2	6	1279067	1279072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969431
19560	NC_008321	GATTGG	2	12	1279109	1279120	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	113969431
19561	NC_008321	GAG	2	6	1279134	1279139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969431
19562	NC_008321	TAC	3	9	1279200	1279208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969431
19563	NC_008321	AAT	2	6	1279216	1279221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969431
19564	NC_008321	ATG	2	6	1279258	1279263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969432
19565	NC_008321	T	7	7	1279277	1279283	0 %	100 %	0 %	0 %	113969432
19566	NC_008321	GGC	2	6	1279317	1279322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969432
19567	NC_008321	AG	3	6	1279329	1279334	50 %	0 %	50 %	0 %	113969432
19568	NC_008321	AAG	2	6	1279489	1279494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969432
19569	NC_008321	GCT	2	6	1279715	1279720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969433
19570	NC_008321	TGAT	2	8	1279768	1279775	25 %	50 %	25 %	0 %	113969433
19571	NC_008321	GCCGA	2	10	1279830	1279839	20 %	0 %	40 %	40 %	113969433
19572	NC_008321	CGA	2	6	1279859	1279864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969433
19573	NC_008321	CTT	2	6	1279880	1279885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969433
19574	NC_008321	GGC	2	6	1279911	1279916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969433
19575	NC_008321	ATT	2	6	1279953	1279958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969433
19576	NC_008321	GTA	2	6	1280112	1280117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969433
19577	NC_008321	GCC	2	6	1280226	1280231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969433
19578	NC_008321	CGGCTG	2	12	1280255	1280266	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	113969433
19579	NC_008321	GTG	2	6	1280279	1280284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969433
19580	NC_008321	T	6	6	1280574	1280579	0 %	100 %	0 %	0 %	113969434
19581	NC_008321	CG	3	6	1280633	1280638	0 %	0 %	50 %	50 %	113969434
19582	NC_008321	CTTGC	2	10	1280649	1280658	0 %	40 %	20 %	40 %	113969434
19583	NC_008321	TAT	2	6	1280773	1280778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969434
19584	NC_008321	CAC	2	6	1280906	1280911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969434
19585	NC_008321	GCA	2	6	1280917	1280922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969434
19586	NC_008321	ATC	2	6	1280996	1281001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969434
19587	NC_008321	CGA	2	6	1281019	1281024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969434
19588	NC_008321	T	6	6	1281110	1281115	0 %	100 %	0 %	0 %	113969434
19589	NC_008321	CAT	2	6	1281151	1281156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969434
19590	NC_008321	T	7	7	1281156	1281162	0 %	100 %	0 %	0 %	113969434
19591	NC_008321	CAT	2	6	1281182	1281187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969434
19592	NC_008321	GGA	2	6	1281212	1281217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969434
19593	NC_008321	GCG	2	6	1281309	1281314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969434
19594	NC_008321	GCC	2	6	1281614	1281619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969435
19595	NC_008321	GAA	2	6	1281671	1281676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969435
19596	NC_008321	TTG	2	6	1281692	1281697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969435
19597	NC_008321	ATT	2	6	1281750	1281755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969435
19598	NC_008321	GTCA	2	8	1281794	1281801	25 %	25 %	25 %	25 %	113969435
19599	NC_008321	GCT	2	6	1281840	1281845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969435
19600	NC_008321	CTC	2	6	1281866	1281871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969435
19601	NC_008321	CGT	2	6	1281877	1281882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969435
19602	NC_008321	TAG	2	6	1281951	1281956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969435
19603	NC_008321	GCG	2	6	1282049	1282054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969435
19604	NC_008321	TGCC	2	8	1282066	1282073	0 %	25 %	25 %	50 %	113969435
19605	NC_008321	GATGT	2	10	1282139	1282148	20 %	40 %	40 %	0 %	113969435
19606	NC_008321	CGC	2	6	1282171	1282176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969435
19607	NC_008321	TGG	2	6	1282254	1282259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969435
19608	NC_008321	GGGA	2	8	1282281	1282288	25 %	0 %	75 %	0 %	113969435
19609	NC_008321	GGC	2	6	1282309	1282314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969435
19610	NC_008321	TGC	2	6	1282350	1282355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969435
19611	NC_008321	TGA	2	6	1282431	1282436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969435
19612	NC_008321	GCA	2	6	1282450	1282455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969435
19613	NC_008321	CG	3	6	1282770	1282775	0 %	0 %	50 %	50 %	113969436
19614	NC_008321	CAT	2	6	1282835	1282840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969436
19615	NC_008321	GGT	2	6	1282874	1282879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969436
19616	NC_008321	GCCAT	2	10	1282966	1282975	20 %	20 %	20 %	40 %	113969436
19617	NC_008321	GTG	2	6	1283116	1283121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969436
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19721	NC_008321	CTGC	2	8	1288537	1288544	0 %	25 %	25 %	50 %	113969440
19722	NC_008321	ATG	2	6	1288714	1288719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969440
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19725	NC_008321	GAT	2	6	1288886	1288891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969441
19726	NC_008321	CCA	2	6	1288956	1288961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969441
19727	NC_008321	GT	4	8	1288965	1288972	0 %	50 %	50 %	0 %	113969441
19728	NC_008321	CGG	2	6	1289110	1289115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969441
19729	NC_008321	AGC	2	6	1289157	1289162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969441
19730	NC_008321	GCG	2	6	1289198	1289203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969441
19731	NC_008321	GGC	2	6	1289435	1289440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969441
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19733	NC_008321	ATC	2	6	1289577	1289582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969442
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19964	NC_008321	CGA	2	6	1304361	1304366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969455
19965	NC_008321	CTTG	2	8	1304379	1304386	0 %	50 %	25 %	25 %	113969455
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19968	NC_008321	TTCC	2	8	1304466	1304473	0 %	50 %	0 %	50 %	113969455
19969	NC_008321	GCA	2	6	1304571	1304576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969455
19970	NC_008321	GTC	2	6	1304615	1304620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969455
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19974	NC_008321	CG	3	6	1304774	1304779	0 %	0 %	50 %	50 %	113969455
19975	NC_008321	CGA	2	6	1304784	1304789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969455
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19980	NC_008321	GAA	2	6	1305043	1305048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969455
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19984	NC_008321	AGC	2	6	1305350	1305355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969455
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19992	NC_008321	AGA	2	6	1305582	1305587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969455
19993	NC_008321	AAG	2	6	1305595	1305600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969455
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19999	NC_008321	CTA	2	6	1306517	1306522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969456
20000	NC_008321	AT	3	6	1306652	1306657	50 %	50 %	0 %	0 %	113969456

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