MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_008321	ACT	2	6	1209309	1209314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969380
18502	NC_008321	CGG	2	6	1209328	1209333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969380
18503	NC_008321	AGC	2	6	1209392	1209397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969380
18504	NC_008321	TCCAA	2	10	1209502	1209511	40 %	20 %	0 %	40 %	113969380
18505	NC_008321	TAC	2	6	1209641	1209646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969380
18506	NC_008321	CTT	2	6	1209709	1209714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969380
18507	NC_008321	ACA	2	6	1209717	1209722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969380
18508	NC_008321	AAGAC	2	10	1209774	1209783	60 %	0 %	20 %	20 %	113969380
18509	NC_008321	GGT	2	6	1209809	1209814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969380
18510	NC_008321	TCT	2	6	1209819	1209824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969380
18511	NC_008321	AGA	2	6	1209898	1209903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969380
18512	NC_008321	TAT	2	6	1210382	1210387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969381
18513	NC_008321	A	7	7	1210397	1210403	100 %	0 %	0 %	0 %	113969381
18514	NC_008321	GCA	2	6	1210404	1210409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969381
18515	NC_008321	CTG	2	6	1210513	1210518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969381
18516	NC_008321	TATC	2	8	1210526	1210533	25 %	50 %	0 %	25 %	113969381
18517	NC_008321	GAT	2	6	1210626	1210631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969381
18518	NC_008321	GCC	2	6	1210659	1210664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969381
18519	NC_008321	CG	3	6	1210707	1210712	0 %	0 %	50 %	50 %	113969381
18520	NC_008321	AGTT	2	8	1210744	1210751	25 %	50 %	25 %	0 %	113969381
18521	NC_008321	AAG	2	6	1210762	1210767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969381
18522	NC_008321	ATC	2	6	1210794	1210799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969381
18523	NC_008321	CCG	2	6	1210832	1210837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969381
18524	NC_008321	CTG	2	6	1210978	1210983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969381
18525	NC_008321	GCG	2	6	1210984	1210989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969381
18526	NC_008321	TGC	2	6	1210997	1211002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969381
18527	NC_008321	TC	3	6	1211056	1211061	0 %	50 %	0 %	50 %	113969381
18528	NC_008321	AC	3	6	1211108	1211113	50 %	0 %	0 %	50 %	113969381
18529	NC_008321	TTA	2	6	1211150	1211155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969381
18530	NC_008321	TTC	2	6	1211410	1211415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969382
18531	NC_008321	CGC	2	6	1211457	1211462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969382
18532	NC_008321	TGG	2	6	1211601	1211606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969382
18533	NC_008321	GTGAT	2	10	1211612	1211621	20 %	40 %	40 %	0 %	113969382
18534	NC_008321	GGT	2	6	1211656	1211661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969382
18535	NC_008321	GAT	2	6	1211670	1211675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969382
18536	NC_008321	AC	3	6	1211694	1211699	50 %	0 %	0 %	50 %	113969382
18537	NC_008321	AGT	2	6	1211772	1211777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969382
18538	NC_008321	CCG	2	6	1211825	1211830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969382
18539	NC_008321	ACA	2	6	1211855	1211860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969382
18540	NC_008321	TC	3	6	1211901	1211906	0 %	50 %	0 %	50 %	113969382
18541	NC_008321	GCG	2	6	1211960	1211965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969382
18542	NC_008321	GCG	2	6	1212013	1212018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969382
18543	NC_008321	ACG	2	6	1212043	1212048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969382
18544	NC_008321	AAG	2	6	1212110	1212115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969382
18545	NC_008321	GGC	2	6	1212199	1212204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969382
18546	NC_008321	TTG	2	6	1212317	1212322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969382
18547	NC_008321	AGTA	2	8	1212331	1212338	50 %	25 %	25 %	0 %	113969382
18548	NC_008321	ATT	2	6	1212355	1212360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969382
18549	NC_008321	GGT	3	9	1212439	1212447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969382
18550	NC_008321	GAA	2	6	1212580	1212585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969382
18551	NC_008321	A	6	6	1212592	1212597	100 %	0 %	0 %	0 %	113969382
18552	NC_008321	TGA	2	6	1212609	1212614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969382
18553	NC_008321	A	6	6	1212626	1212631	100 %	0 %	0 %	0 %	113969382
18554	NC_008321	AGC	2	6	1212657	1212662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969382
18555	NC_008321	ATG	2	6	1212700	1212705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969383
18556	NC_008321	GCC	2	6	1212739	1212744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969383
18557	NC_008321	GTTTAG	2	12	1212854	1212865	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113969383
18558	NC_008321	GCG	2	6	1212871	1212876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969383
18559	NC_008321	TAT	2	6	1213010	1213015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969383
18560	NC_008321	GAA	2	6	1213141	1213146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969383
18561	NC_008321	T	6	6	1213181	1213186	0 %	100 %	0 %	0 %	113969383
18562	NC_008321	CGG	2	6	1213193	1213198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969383
18563	NC_008321	TGCC	2	8	1213215	1213222	0 %	25 %	25 %	50 %	113969383
18564	NC_008321	ACA	2	6	1213292	1213297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969383
18565	NC_008321	GCC	2	6	1213383	1213388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969383
18566	NC_008321	GCC	2	6	1213417	1213422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969383
18567	NC_008321	GGT	2	6	1213423	1213428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969383
18568	NC_008321	GTG	2	6	1213432	1213437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969383
18569	NC_008321	TTG	2	6	1213577	1213582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969383
18570	NC_008321	CCG	2	6	1213605	1213610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969383
18571	NC_008321	GCT	2	6	1213674	1213679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969383
18572	NC_008321	CA	3	6	1213998	1214003	50 %	0 %	0 %	50 %	113969384
18573	NC_008321	AT	3	6	1214068	1214073	50 %	50 %	0 %	0 %	113969384
18574	NC_008321	TGAC	2	8	1214106	1214113	25 %	25 %	25 %	25 %	113969384
18575	NC_008321	AATT	2	8	1214214	1214221	50 %	50 %	0 %	0 %	113969384
18576	NC_008321	ATC	2	6	1214300	1214305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969384
18577	NC_008321	GCT	2	6	1214366	1214371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969384
18578	NC_008321	TGA	2	6	1214388	1214393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969384
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18580	NC_008321	TG	4	8	1214580	1214587	0 %	50 %	50 %	0 %	113969384
18581	NC_008321	A	6	6	1214619	1214624	100 %	0 %	0 %	0 %	113969384
18582	NC_008321	TGA	2	6	1214667	1214672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969384
18583	NC_008321	CGC	2	6	1214928	1214933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969385
18584	NC_008321	TGAGAC	3	18	1215049	1215066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969385
18585	NC_008321	GAT	2	6	1215082	1215087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969385
18586	NC_008321	CTG	2	6	1215158	1215163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969385
18587	NC_008321	TTC	2	6	1215223	1215228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969385
18588	NC_008321	TGCTT	2	10	1215321	1215330	0 %	60 %	20 %	20 %	113969385
18589	NC_008321	CTG	2	6	1215396	1215401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969385
18590	NC_008321	TTC	2	6	1215463	1215468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969385
18591	NC_008321	CGG	2	6	1215502	1215507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969385
18592	NC_008321	GC	3	6	1215517	1215522	0 %	0 %	50 %	50 %	113969385
18593	NC_008321	AAC	2	6	1215544	1215549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969385
18594	NC_008321	CAG	2	6	1215570	1215575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969385
18595	NC_008321	CAT	2	6	1215576	1215581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969385
18596	NC_008321	TGC	3	9	1215583	1215591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969385
18597	NC_008321	CTT	2	6	1215611	1215616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969385
18598	NC_008321	A	6	6	1215627	1215632	100 %	0 %	0 %	0 %	113969385
18599	NC_008321	T	6	6	1215670	1215675	0 %	100 %	0 %	0 %	113969385
18600	NC_008321	GCCA	2	8	1215850	1215857	25 %	0 %	25 %	50 %	113969385
18601	NC_008321	GCT	2	6	1215863	1215868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969385
18602	NC_008321	GGGC	2	8	1215887	1215894	0 %	0 %	75 %	25 %	113969385
18603	NC_008321	TGT	2	6	1215913	1215918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969385
18604	NC_008321	AGC	2	6	1215958	1215963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969385
18605	NC_008321	GTA	2	6	1215971	1215976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969385
18606	NC_008321	GGCGAT	2	12	1216020	1216031	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	113969385
18607	NC_008321	GCT	2	6	1216204	1216209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969386
18608	NC_008321	TG	3	6	1216423	1216428	0 %	50 %	50 %	0 %	113969386
18609	NC_008321	TGA	2	6	1216584	1216589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969386
18610	NC_008321	GGC	2	6	1216623	1216628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969386
18611	NC_008321	GC	3	6	1216638	1216643	0 %	0 %	50 %	50 %	113969386
18612	NC_008321	ATT	2	6	1216717	1216722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969386
18613	NC_008321	TG	3	6	1216730	1216735	0 %	50 %	50 %	0 %	113969386
18614	NC_008321	GGC	2	6	1216816	1216821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969386
18615	NC_008321	CGTT	2	8	1216829	1216836	0 %	50 %	25 %	25 %	113969386
18616	NC_008321	GTC	2	6	1216930	1216935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969386
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18731	NC_008321	GTT	2	6	1224233	1224238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969392
18732	NC_008321	CCAAT	2	10	1224325	1224334	40 %	20 %	0 %	40 %	113969392
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18735	NC_008321	CTG	2	6	1224482	1224487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969392
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18840	NC_008321	ACTGA	2	10	1231710	1231719	40 %	20 %	20 %	20 %	113969396
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18847	NC_008321	TGG	2	6	1232191	1232196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969396
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18960	NC_008321	CAG	2	6	1240651	1240656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969402
18961	NC_008321	TCA	2	6	1240857	1240862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969402
18962	NC_008321	CGA	3	9	1240911	1240919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969402
18963	NC_008321	GAT	2	6	1240975	1240980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969402
18964	NC_008321	CGT	2	6	1241001	1241006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969402
18965	NC_008321	CAG	3	9	1241029	1241037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969402
18966	NC_008321	AATG	2	8	1241824	1241831	50 %	25 %	25 %	0 %	113969403
18967	NC_008321	ATT	2	6	1241887	1241892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969403
18968	NC_008321	AC	3	6	1241926	1241931	50 %	0 %	0 %	50 %	113969403
18969	NC_008321	GGC	2	6	1242017	1242022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969403
18970	NC_008321	T	6	6	1242026	1242031	0 %	100 %	0 %	0 %	113969403
18971	NC_008321	T	6	6	1242048	1242053	0 %	100 %	0 %	0 %	113969403
18972	NC_008321	CTT	2	6	1242100	1242105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969403
18973	NC_008321	GCGCTG	2	12	1242110	1242121	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	113969403
18974	NC_008321	TG	3	6	1242140	1242145	0 %	50 %	50 %	0 %	113969403
18975	NC_008321	GTT	2	6	1242148	1242153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969403
18976	NC_008321	T	7	7	1242197	1242203	0 %	100 %	0 %	0 %	113969403
18977	NC_008321	GCA	2	6	1242210	1242215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969403
18978	NC_008321	CTG	2	6	1242233	1242238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969403
18979	NC_008321	TGGGC	2	10	1242239	1242248	0 %	20 %	60 %	20 %	113969403
18980	NC_008321	GGC	2	6	1242261	1242266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969403
18981	NC_008321	GTA	2	6	1242293	1242298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969403
18982	NC_008321	ATG	2	6	1242308	1242313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969403
18983	NC_008321	TGG	2	6	1242410	1242415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969403
18984	NC_008321	GCT	3	9	1242469	1242477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969403
18985	NC_008321	CTCA	2	8	1242491	1242498	25 %	25 %	0 %	50 %	113969403
18986	NC_008321	GAGT	2	8	1242512	1242519	25 %	25 %	50 %	0 %	113969403
18987	NC_008321	GCT	2	6	1242682	1242687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969404
18988	NC_008321	TCATT	2	10	1242723	1242732	20 %	60 %	0 %	20 %	113969404
18989	NC_008321	GGC	2	6	1242840	1242845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969404
18990	NC_008321	AGC	2	6	1242894	1242899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969404
18991	NC_008321	GC	3	6	1242898	1242903	0 %	0 %	50 %	50 %	113969404
18992	NC_008321	ACTTCG	2	12	1242938	1242949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113969404
18993	NC_008321	GTT	2	6	1243063	1243068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969404
18994	NC_008321	GCC	2	6	1243121	1243126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969404
18995	NC_008321	CAC	2	6	1243222	1243227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969404
18996	NC_008321	TTG	2	6	1243348	1243353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969404
18997	NC_008321	TGT	2	6	1243370	1243375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969404
18998	NC_008321	GGT	2	6	1243477	1243482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969405
18999	NC_008321	ATT	2	6	1243549	1243554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969405
19000	NC_008321	GCA	2	6	1243668	1243673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969405

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