MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_008321	CGG	2	6	1179717	1179722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969355
18003	NC_008321	CGG	2	6	1179755	1179760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969355
18004	NC_008321	TGAT	2	8	1179803	1179810	25 %	50 %	25 %	0 %	113969355
18005	NC_008321	TTAG	2	8	1179888	1179895	25 %	50 %	25 %	0 %	113969356
18006	NC_008321	AGC	2	6	1179921	1179926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969356
18007	NC_008321	GGT	2	6	1179980	1179985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969356
18008	NC_008321	TGG	2	6	1180109	1180114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969356
18009	NC_008321	AAG	2	6	1180216	1180221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969356
18010	NC_008321	A	6	6	1180245	1180250	100 %	0 %	0 %	0 %	113969356
18011	NC_008321	TTA	2	6	1180353	1180358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969356
18012	NC_008321	GTTT	2	8	1180439	1180446	0 %	75 %	25 %	0 %	113969356
18013	NC_008321	GAA	2	6	1180518	1180523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969356
18014	NC_008321	AAG	2	6	1180543	1180548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969356
18015	NC_008321	CTG	2	6	1180587	1180592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969356
18016	NC_008321	GA	3	6	1181039	1181044	50 %	0 %	50 %	0 %	113969357
18017	NC_008321	ATC	2	6	1181151	1181156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969357
18018	NC_008321	TGA	2	6	1181339	1181344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969357
18019	NC_008321	TGG	2	6	1181363	1181368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969357
18020	NC_008321	ATT	2	6	1181385	1181390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969357
18021	NC_008321	TG	3	6	1181716	1181721	0 %	50 %	50 %	0 %	113969358
18022	NC_008321	ATC	2	6	1181725	1181730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969358
18023	NC_008321	GTA	2	6	1181815	1181820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969358
18024	NC_008321	TCAC	2	8	1181848	1181855	25 %	25 %	0 %	50 %	113969358
18025	NC_008321	CAC	2	6	1181873	1181878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969358
18026	NC_008321	GCGA	2	8	1181902	1181909	25 %	0 %	50 %	25 %	113969358
18027	NC_008321	AGTC	2	8	1181973	1181980	25 %	25 %	25 %	25 %	113969358
18028	NC_008321	GAT	2	6	1181986	1181991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969358
18029	NC_008321	CT	3	6	1182149	1182154	0 %	50 %	0 %	50 %	113969358
18030	NC_008321	GCC	2	6	1182732	1182737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969359
18031	NC_008321	AGA	2	6	1182866	1182871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969359
18032	NC_008321	ATG	2	6	1182895	1182900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969359
18033	NC_008321	GTGA	2	8	1182942	1182949	25 %	25 %	50 %	0 %	113969359
18034	NC_008321	GTTG	2	8	1182991	1182998	0 %	50 %	50 %	0 %	113969359
18035	NC_008321	GGA	2	6	1183044	1183049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969359
18036	NC_008321	CG	3	6	1183177	1183182	0 %	0 %	50 %	50 %	113969359
18037	NC_008321	ATTGCA	2	12	1183200	1183211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113969359
18038	NC_008321	CCA	2	6	1183231	1183236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969359
18039	NC_008321	GC	3	6	1183242	1183247	0 %	0 %	50 %	50 %	113969359
18040	NC_008321	CAA	2	6	1183269	1183274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969359
18041	NC_008321	GCTC	2	8	1183325	1183332	0 %	25 %	25 %	50 %	113969359
18042	NC_008321	AAG	2	6	1183333	1183338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969359
18043	NC_008321	GCA	2	6	1183367	1183372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969359
18044	NC_008321	T	6	6	1183527	1183532	0 %	100 %	0 %	0 %	113969359
18045	NC_008321	GCAC	2	8	1183602	1183609	25 %	0 %	25 %	50 %	113969359
18046	NC_008321	GCG	2	6	1183621	1183626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969359
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18049	NC_008321	ATC	2	6	1183812	1183817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969359
18050	NC_008321	GCA	2	6	1183889	1183894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969359
18051	NC_008321	TTG	2	6	1183902	1183907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969359
18052	NC_008321	TTG	2	6	1183942	1183947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969359
18053	NC_008321	CAC	2	6	1184312	1184317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969359
18054	NC_008321	TTAGGT	2	12	1184382	1184393	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113969359
18055	NC_008321	GC	3	6	1184463	1184468	0 %	0 %	50 %	50 %	113969359
18056	NC_008321	GAA	2	6	1184491	1184496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969360
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18058	NC_008321	TC	4	8	1184535	1184542	0 %	50 %	0 %	50 %	113969360
18059	NC_008321	CT	3	6	1184557	1184562	0 %	50 %	0 %	50 %	113969360
18060	NC_008321	CAT	2	6	1184566	1184571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969360
18061	NC_008321	GGT	2	6	1184609	1184614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969360
18062	NC_008321	GTG	2	6	1184615	1184620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969360
18063	NC_008321	TGG	2	6	1184877	1184882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969360
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18066	NC_008321	TTTAA	2	10	1185008	1185017	40 %	60 %	0 %	0 %	113969360
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18070	NC_008321	AAC	2	6	1185134	1185139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969360
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18073	NC_008321	TCGG	2	8	1185293	1185300	0 %	25 %	50 %	25 %	113969360
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18077	NC_008321	CT	3	6	1185560	1185565	0 %	50 %	0 %	50 %	113969361
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18083	NC_008321	TGG	2	6	1185984	1185989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969362
18084	NC_008321	TGG	2	6	1186006	1186011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969362
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18086	NC_008321	CG	3	6	1186233	1186238	0 %	0 %	50 %	50 %	113969362
18087	NC_008321	TCA	2	6	1186273	1186278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969362
18088	NC_008321	AT	3	6	1186339	1186344	50 %	50 %	0 %	0 %	113969362
18089	NC_008321	AGT	2	6	1186369	1186374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969362
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18091	NC_008321	GTA	2	6	1186447	1186452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969362
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18099	NC_008321	TGT	2	6	1186835	1186840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969363
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18102	NC_008321	ATCAA	2	10	1186943	1186952	60 %	20 %	0 %	20 %	113969363
18103	NC_008321	GCTG	2	8	1186972	1186979	0 %	25 %	50 %	25 %	113969363
18104	NC_008321	TGA	2	6	1186980	1186985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969363
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18107	NC_008321	CAGGTA	2	12	1187090	1187101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969363
18108	NC_008321	CTTT	2	8	1187144	1187151	0 %	75 %	0 %	25 %	113969363
18109	NC_008321	TCG	2	6	1187171	1187176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969363
18110	NC_008321	TCG	2	6	1187183	1187188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969363
18111	NC_008321	CGTG	2	8	1187205	1187212	0 %	25 %	50 %	25 %	113969363
18112	NC_008321	A	6	6	1187230	1187235	100 %	0 %	0 %	0 %	113969363
18113	NC_008321	TAT	2	6	1187247	1187252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969363
18114	NC_008321	CGA	2	6	1187259	1187264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969363
18115	NC_008321	GGT	3	9	1187302	1187310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969363
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18117	NC_008321	GCT	2	6	1187427	1187432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969363
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18119	NC_008321	GCG	2	6	1187623	1187628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969363
18120	NC_008321	CG	3	6	1187627	1187632	0 %	0 %	50 %	50 %	113969363
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18226	NC_008321	AGC	2	6	1194728	1194733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969370
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18230	NC_008321	GAA	3	9	1194922	1194930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969370
18231	NC_008321	GCCGAA	2	12	1195015	1195026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969370
18232	NC_008321	GCTGAA	2	12	1195039	1195050	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969370
18233	NC_008321	AGC	2	6	1195068	1195073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969370
18234	NC_008321	AAGTCA	2	12	1195079	1195090	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113969370
18235	NC_008321	GAA	2	6	1195183	1195188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969370
18236	NC_008321	AGA	2	6	1195224	1195229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969370
18237	NC_008321	CAC	2	6	1195299	1195304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969370
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18240	NC_008321	GTG	2	6	1195400	1195405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969370
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18247	NC_008321	TGT	2	6	1195767	1195772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969370
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18333	NC_008321	CGG	2	6	1200216	1200221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969374
18334	NC_008321	CTGA	2	8	1200535	1200542	25 %	25 %	25 %	25 %	113969374
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18343	NC_008321	TG	3	6	1200797	1200802	0 %	50 %	50 %	0 %	113969374
18344	NC_008321	A	6	6	1200807	1200812	100 %	0 %	0 %	0 %	113969374
18345	NC_008321	TGC	2	6	1200833	1200838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969374
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18347	NC_008321	TCA	2	6	1200896	1200901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969374
18348	NC_008321	TTG	2	6	1200908	1200913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969374
18349	NC_008321	TAA	2	6	1200921	1200926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969374
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18463	NC_008321	TAG	2	6	1207545	1207550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969379
18464	NC_008321	GTC	2	6	1207556	1207561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969379
18465	NC_008321	TCC	2	6	1207578	1207583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969379
18466	NC_008321	A	6	6	1207595	1207600	100 %	0 %	0 %	0 %	113969379
18467	NC_008321	GTG	2	6	1207623	1207628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969379
18468	NC_008321	GCC	2	6	1207643	1207648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969379
18469	NC_008321	GGT	2	6	1207652	1207657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969379
18470	NC_008321	TGTAC	2	10	1207660	1207669	20 %	40 %	20 %	20 %	113969379
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18472	NC_008321	TCT	2	6	1207829	1207834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969379
18473	NC_008321	TAC	2	6	1207850	1207855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969379
18474	NC_008321	CAT	2	6	1207861	1207866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969379
18475	NC_008321	ATC	2	6	1207874	1207879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969379
18476	NC_008321	ATC	2	6	1207883	1207888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969379
18477	NC_008321	GGT	3	9	1207889	1207897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969379
18478	NC_008321	CTGCTA	2	12	1207938	1207949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113969379
18479	NC_008321	TGG	2	6	1208034	1208039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969379
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18483	NC_008321	GGT	2	6	1208138	1208143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969379
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18488	NC_008321	GGT	2	6	1208354	1208359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969379
18489	NC_008321	GTT	2	6	1208486	1208491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969379
18490	NC_008321	GTT	2	6	1208555	1208560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969379
18491	NC_008321	TGAC	2	8	1208580	1208587	25 %	25 %	25 %	25 %	113969379
18492	NC_008321	ATT	2	6	1208600	1208605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969379
18493	NC_008321	TG	3	6	1208616	1208621	0 %	50 %	50 %	0 %	113969379
18494	NC_008321	GGT	2	6	1208657	1208662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969379
18495	NC_008321	CGT	2	6	1208684	1208689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969379
18496	NC_008321	CAA	2	6	1208754	1208759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969379
18497	NC_008321	TGA	3	9	1209129	1209137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969380
18498	NC_008321	CTTTAG	2	12	1209150	1209161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113969380
18499	NC_008321	CAG	2	6	1209168	1209173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969380
18500	NC_008321	TGC	2	6	1209199	1209204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969380

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