MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_008321	AGTC	2	8	1147380	1147387	25 %	25 %	25 %	25 %	113969323
17502	NC_008321	CGG	2	6	1147787	1147792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969323
17503	NC_008321	AC	3	6	1147818	1147823	50 %	0 %	0 %	50 %	113969323
17504	NC_008321	ATCT	2	8	1147856	1147863	25 %	50 %	0 %	25 %	113969323
17505	NC_008321	TTC	2	6	1147966	1147971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969323
17506	NC_008321	ACT	2	6	1147972	1147977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969323
17507	NC_008321	CTG	2	6	1148020	1148025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969323
17508	NC_008321	CAG	2	6	1148043	1148048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969323
17509	NC_008321	AGTG	2	8	1148094	1148101	25 %	25 %	50 %	0 %	113969323
17510	NC_008321	CGC	2	6	1148134	1148139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969324
17511	NC_008321	ATG	2	6	1148192	1148197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969324
17512	NC_008321	CAAC	2	8	1148289	1148296	50 %	0 %	0 %	50 %	113969324
17513	NC_008321	GC	3	6	1148411	1148416	0 %	0 %	50 %	50 %	113969324
17514	NC_008321	ATT	2	6	1148437	1148442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969324
17515	NC_008321	ATGG	2	8	1148479	1148486	25 %	25 %	50 %	0 %	113969324
17516	NC_008321	ATTG	2	8	1148596	1148603	25 %	50 %	25 %	0 %	113969324
17517	NC_008321	CTG	2	6	1148852	1148857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969324
17518	NC_008321	TGC	2	6	1148865	1148870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969324
17519	NC_008321	CTAA	2	8	1148951	1148958	50 %	25 %	0 %	25 %	113969324
17520	NC_008321	T	6	6	1148977	1148982	0 %	100 %	0 %	0 %	113969324
17521	NC_008321	GTG	2	6	1149017	1149022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969324
17522	NC_008321	TTC	2	6	1149101	1149106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969324
17523	NC_008321	TGC	2	6	1149126	1149131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969324
17524	NC_008321	GGGT	2	8	1149203	1149210	0 %	25 %	75 %	0 %	113969324
17525	NC_008321	TAT	2	6	1149245	1149250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969324
17526	NC_008321	CAG	2	6	1149287	1149292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969324
17527	NC_008321	TAA	2	6	1149672	1149677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969325
17528	NC_008321	TTGGC	2	10	1149751	1149760	0 %	40 %	40 %	20 %	113969325
17529	NC_008321	CAC	2	6	1149795	1149800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969325
17530	NC_008321	CTCG	2	8	1149926	1149933	0 %	25 %	25 %	50 %	113969325
17531	NC_008321	CAG	2	6	1150082	1150087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969325
17532	NC_008321	TCT	2	6	1150093	1150098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969325
17533	NC_008321	AGATG	2	10	1150451	1150460	40 %	20 %	40 %	0 %	113969326
17534	NC_008321	CGCC	2	8	1150462	1150469	0 %	0 %	25 %	75 %	113969326
17535	NC_008321	GAC	2	6	1150518	1150523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969326
17536	NC_008321	CGC	2	6	1150575	1150580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969326
17537	NC_008321	TGAG	2	8	1150883	1150890	25 %	25 %	50 %	0 %	113969327
17538	NC_008321	AAT	2	6	1150891	1150896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969327
17539	NC_008321	GCA	2	6	1150977	1150982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969327
17540	NC_008321	GCT	2	6	1151001	1151006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969327
17541	NC_008321	TTTG	2	8	1151012	1151019	0 %	75 %	25 %	0 %	113969327
17542	NC_008321	CAG	2	6	1151026	1151031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969327
17543	NC_008321	GTG	2	6	1151098	1151103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969327
17544	NC_008321	GCG	2	6	1151134	1151139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969327
17545	NC_008321	CG	4	8	1151138	1151145	0 %	0 %	50 %	50 %	113969327
17546	NC_008321	AGA	2	6	1151214	1151219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969327
17547	NC_008321	ACTTC	2	10	1151330	1151339	20 %	40 %	0 %	40 %	113969328
17548	NC_008321	GGC	2	6	1151394	1151399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969328
17549	NC_008321	GCA	2	6	1151546	1151551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969328
17550	NC_008321	TTC	2	6	1151562	1151567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969328
17551	NC_008321	CAT	2	6	1151586	1151591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969328
17552	NC_008321	GGC	2	6	1151731	1151736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969328
17553	NC_008321	TTC	2	6	1151949	1151954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969328
17554	NC_008321	GAC	2	6	1151972	1151977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969328
17555	NC_008321	GCG	2	6	1152003	1152008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969328
17556	NC_008321	AAG	2	6	1152077	1152082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969328
17557	NC_008321	CTT	2	6	1152083	1152088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969328
17558	NC_008321	TGCT	2	8	1152120	1152127	0 %	50 %	25 %	25 %	113969328
17559	NC_008321	GCT	2	6	1152297	1152302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969329
17560	NC_008321	TGA	3	9	1152309	1152317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969329
17561	NC_008321	GTT	2	6	1152322	1152327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969329
17562	NC_008321	TAA	2	6	1152352	1152357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969329
17563	NC_008321	GCC	2	6	1152392	1152397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969329
17564	NC_008321	TTGCA	2	10	1152405	1152414	20 %	40 %	20 %	20 %	113969329
17565	NC_008321	AGC	2	6	1152502	1152507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969329
17566	NC_008321	GACG	2	8	1152646	1152653	25 %	0 %	50 %	25 %	113969329
17567	NC_008321	TGC	2	6	1152661	1152666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969329
17568	NC_008321	GAG	2	6	1152677	1152682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969329
17569	NC_008321	GCC	2	6	1152725	1152730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969329
17570	NC_008321	GT	3	6	1152856	1152861	0 %	50 %	50 %	0 %	113969329
17571	NC_008321	TGC	2	6	1152870	1152875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969329
17572	NC_008321	CA	3	6	1152885	1152890	50 %	0 %	0 %	50 %	113969329
17573	NC_008321	TGT	2	6	1152903	1152908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969329
17574	NC_008321	GTG	2	6	1152930	1152935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969329
17575	NC_008321	AGT	2	6	1153131	1153136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969330
17576	NC_008321	AAT	2	6	1153170	1153175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969330
17577	NC_008321	ACT	2	6	1153241	1153246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969330
17578	NC_008321	TCA	2	6	1153280	1153285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969330
17579	NC_008321	ACCA	2	8	1153432	1153439	50 %	0 %	0 %	50 %	113969331
17580	NC_008321	CTT	2	6	1153495	1153500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969331
17581	NC_008321	T	6	6	1153574	1153579	0 %	100 %	0 %	0 %	113969331
17582	NC_008321	GTG	2	6	1153582	1153587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969331
17583	NC_008321	CACGGC	2	12	1153633	1153644	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	113969331
17584	NC_008321	TTG	2	6	1153709	1153714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969331
17585	NC_008321	GCCT	2	8	1153730	1153737	0 %	25 %	25 %	50 %	113969331
17586	NC_008321	GAA	2	6	1153757	1153762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969331
17587	NC_008321	GGC	2	6	1153805	1153810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969331
17588	NC_008321	TGG	2	6	1153858	1153863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969331
17589	NC_008321	CAG	2	6	1153940	1153945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969331
17590	NC_008321	TTC	2	6	1154009	1154014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969331
17591	NC_008321	TAA	2	6	1154042	1154047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969331
17592	NC_008321	GCT	2	6	1154128	1154133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969331
17593	NC_008321	TCA	2	6	1154146	1154151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969331
17594	NC_008321	CGA	2	6	1154155	1154160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969331
17595	NC_008321	CA	3	6	1154198	1154203	50 %	0 %	0 %	50 %	113969331
17596	NC_008321	GAT	3	9	1154222	1154230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969331
17597	NC_008321	TGA	2	6	1154285	1154290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969331
17598	NC_008321	CAT	3	9	1154332	1154340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969331
17599	NC_008321	TCA	2	6	1154389	1154394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969331
17600	NC_008321	GCTG	2	8	1154405	1154412	0 %	25 %	50 %	25 %	113969331
17601	NC_008321	TTC	2	6	1154435	1154440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969331
17602	NC_008321	TAA	2	6	1154460	1154465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969331
17603	NC_008321	GGC	2	6	1154486	1154491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969331
17604	NC_008321	GCA	2	6	1154526	1154531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969331
17605	NC_008321	AGC	2	6	1154559	1154564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969331
17606	NC_008321	TCA	2	6	1154593	1154598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969331
17607	NC_008321	ACT	2	6	1154743	1154748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969332
17608	NC_008321	TCGG	2	8	1154801	1154808	0 %	25 %	50 %	25 %	113969332
17609	NC_008321	TCT	2	6	1154890	1154895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969332
17610	NC_008321	CCA	2	6	1154941	1154946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969332
17611	NC_008321	TGTA	2	8	1154949	1154956	25 %	50 %	25 %	0 %	113969332
17612	NC_008321	CG	3	6	1155039	1155044	0 %	0 %	50 %	50 %	113969332
17613	NC_008321	GCG	3	9	1155075	1155083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969332
17614	NC_008321	AAT	2	6	1155137	1155142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969332
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17616	NC_008321	TTA	2	6	1155357	1155362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969332
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17734	NC_008321	GCC	2	6	1162364	1162369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969340
17735	NC_008321	GTGCG	2	10	1162419	1162428	0 %	20 %	60 %	20 %	113969340
17736	NC_008321	GTC	2	6	1162432	1162437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969340
17737	NC_008321	CGA	2	6	1162506	1162511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969340
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17740	NC_008321	GCA	2	6	1162613	1162618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969340
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17744	NC_008321	GCT	2	6	1162713	1162718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969340
17745	NC_008321	TGA	2	6	1162949	1162954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969341
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17848	NC_008321	CAA	2	6	1169723	1169728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969347
17849	NC_008321	GAA	2	6	1169769	1169774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969347
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17852	NC_008321	CG	3	6	1169880	1169885	0 %	0 %	50 %	50 %	113969347
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17964	NC_008321	TTA	2	6	1176278	1176283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969352
17965	NC_008321	AAG	2	6	1176308	1176313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969352
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17994	NC_008321	GTT	2	6	1179360	1179365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969355
17995	NC_008321	TG	3	6	1179459	1179464	0 %	50 %	50 %	0 %	113969355
17996	NC_008321	TATGGG	2	12	1179506	1179517	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	113969355
17997	NC_008321	TGG	2	6	1179553	1179558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969355
17998	NC_008321	ATTG	2	8	1179634	1179641	25 %	50 %	25 %	0 %	113969355
17999	NC_008321	GAT	2	6	1179652	1179657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969355
18000	NC_008321	CCT	2	6	1179680	1179685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969355

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