MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_008321	CGC	2	6	1115959	1115964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969297
17002	NC_008321	GCG	2	6	1116068	1116073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969297
17003	NC_008321	TGAT	2	8	1116164	1116171	25 %	50 %	25 %	0 %	113969297
17004	NC_008321	CGA	2	6	1116278	1116283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969297
17005	NC_008321	GGC	2	6	1116298	1116303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969297
17006	NC_008321	GC	3	6	1116348	1116353	0 %	0 %	50 %	50 %	113969297
17007	NC_008321	TGG	2	6	1116419	1116424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969297
17008	NC_008321	GT	3	6	1116496	1116501	0 %	50 %	50 %	0 %	113969297
17009	NC_008321	GCT	2	6	1116516	1116521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969297
17010	NC_008321	GTG	2	6	1116604	1116609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969297
17011	NC_008321	GAT	2	6	1116679	1116684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969297
17012	NC_008321	GCT	2	6	1116724	1116729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969297
17013	NC_008321	GGC	2	6	1116763	1116768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969297
17014	NC_008321	CA	3	6	1116801	1116806	50 %	0 %	0 %	50 %	113969297
17015	NC_008321	ACC	2	6	1116847	1116852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969297
17016	NC_008321	AT	3	6	1117056	1117061	50 %	50 %	0 %	0 %	113969298
17017	NC_008321	CAC	2	6	1117142	1117147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969298
17018	NC_008321	TCT	2	6	1117239	1117244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969298
17019	NC_008321	CGC	2	6	1117449	1117454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969299
17020	NC_008321	CGG	2	6	1117474	1117479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969299
17021	NC_008321	TTG	2	6	1117506	1117511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969299
17022	NC_008321	T	6	6	1117542	1117547	0 %	100 %	0 %	0 %	113969299
17023	NC_008321	GCC	2	6	1117566	1117571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969299
17024	NC_008321	TGA	2	6	1117584	1117589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969299
17025	NC_008321	TCT	2	6	1117625	1117630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969299
17026	NC_008321	GTG	2	6	1117697	1117702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969299
17027	NC_008321	GGC	2	6	1117770	1117775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969299
17028	NC_008321	TTC	2	6	1117776	1117781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969299
17029	NC_008321	GGC	2	6	1117788	1117793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969299
17030	NC_008321	CTTT	2	8	1117841	1117848	0 %	75 %	0 %	25 %	113969299
17031	NC_008321	CTG	2	6	1118062	1118067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969300
17032	NC_008321	CAT	2	6	1118071	1118076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969300
17033	NC_008321	CGG	2	6	1118112	1118117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969300
17034	NC_008321	ACAT	2	8	1118264	1118271	50 %	25 %	0 %	25 %	113969300
17035	NC_008321	TAA	2	6	1118334	1118339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969300
17036	NC_008321	CAC	2	6	1118374	1118379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969300
17037	NC_008321	CGC	2	6	1118490	1118495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969300
17038	NC_008321	ATA	2	6	1118504	1118509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969300
17039	NC_008321	TGT	2	6	1118561	1118566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969300
17040	NC_008321	CAG	2	6	1118569	1118574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969300
17041	NC_008321	CAA	2	6	1118593	1118598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969300
17042	NC_008321	TGAG	2	8	1118616	1118623	25 %	25 %	50 %	0 %	113969300
17043	NC_008321	CTG	2	6	1118629	1118634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969300
17044	NC_008321	CAC	2	6	1118665	1118670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969300
17045	NC_008321	ATA	2	6	1118671	1118676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969300
17046	NC_008321	AGC	2	6	1118741	1118746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969300
17047	NC_008321	T	6	6	1118752	1118757	0 %	100 %	0 %	0 %	113969300
17048	NC_008321	CGA	2	6	1118784	1118789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969300
17049	NC_008321	ATT	2	6	1119221	1119226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969301
17050	NC_008321	CAA	2	6	1119243	1119248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969301
17051	NC_008321	TGG	2	6	1119271	1119276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969301
17052	NC_008321	GAT	2	6	1119341	1119346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969301
17053	NC_008321	CAGC	2	8	1119362	1119369	25 %	0 %	25 %	50 %	113969301
17054	NC_008321	TAAC	2	8	1119384	1119391	50 %	25 %	0 %	25 %	113969301
17055	NC_008321	TTC	2	6	1119404	1119409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969301
17056	NC_008321	GTC	2	6	1119429	1119434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969301
17057	NC_008321	ACGTG	2	10	1119457	1119466	20 %	20 %	40 %	20 %	113969301
17058	NC_008321	CAT	2	6	1119469	1119474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969301
17059	NC_008321	CAA	2	6	1119529	1119534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969301
17060	NC_008321	CCA	2	6	1119542	1119547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969301
17061	NC_008321	CTG	2	6	1119555	1119560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969301
17062	NC_008321	GAA	2	6	1119577	1119582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969301
17063	NC_008321	CAG	2	6	1119585	1119590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969301
17064	NC_008321	CTT	2	6	1119595	1119600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969301
17065	NC_008321	GAA	2	6	1119605	1119610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969301
17066	NC_008321	TCGCA	2	10	1119682	1119691	20 %	20 %	20 %	40 %	113969301
17067	NC_008321	TAT	2	6	1119709	1119714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969301
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17070	NC_008321	ACA	2	6	1119768	1119773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969301
17071	NC_008321	GGT	3	9	1119794	1119802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969301
17072	NC_008321	ATC	2	6	1119818	1119823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969301
17073	NC_008321	ACG	2	6	1119837	1119842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969301
17074	NC_008321	GGT	2	6	1119890	1119895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969301
17075	NC_008321	ACT	2	6	1119921	1119926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969301
17076	NC_008321	AAGA	2	8	1119941	1119948	75 %	0 %	25 %	0 %	113969301
17077	NC_008321	AGC	2	6	1120000	1120005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969301
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17081	NC_008321	TATCAG	2	12	1120194	1120205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113969301
17082	NC_008321	AAG	2	6	1120257	1120262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969301
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17084	NC_008321	AGCCGT	2	12	1120315	1120326	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113969301
17085	NC_008321	TGC	2	6	1120330	1120335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969301
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17087	NC_008321	AAGC	2	8	1120544	1120551	50 %	0 %	25 %	25 %	113969301
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17089	NC_008321	CTT	2	6	1120716	1120721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969301
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17113	NC_008321	GAA	2	6	1121623	1121628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969302
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17115	NC_008321	A	6	6	1121704	1121709	100 %	0 %	0 %	0 %	113969302
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17232	NC_008321	GCT	2	6	1129492	1129497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969309
17233	NC_008321	GT	3	6	1129523	1129528	0 %	50 %	50 %	0 %	113969309
17234	NC_008321	CT	3	6	1129531	1129536	0 %	50 %	0 %	50 %	113969309
17235	NC_008321	CAA	2	6	1129585	1129590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969309
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17238	NC_008321	CAC	2	6	1129687	1129692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969309
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17251	NC_008321	CAT	2	6	1130504	1130509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969310
17252	NC_008321	GGT	2	6	1130530	1130535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969310
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17262	NC_008321	ATC	2	6	1130884	1130889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969310
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17341	NC_008321	ACTC	2	8	1136254	1136261	25 %	25 %	0 %	50 %	113969313
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17343	NC_008321	TGG	2	6	1136319	1136324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969313
17344	NC_008321	GGC	2	6	1136386	1136391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969313
17345	NC_008321	TTTAGC	2	12	1136411	1136422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113969313
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17348	NC_008321	GC	3	6	1136736	1136741	0 %	0 %	50 %	50 %	113969313
17349	NC_008321	GCG	2	6	1136819	1136824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969313
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17464	NC_008321	GCC	2	6	1144301	1144306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969321
17465	NC_008321	GAA	2	6	1144373	1144378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969321
17466	NC_008321	GCA	2	6	1144396	1144401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969321
17467	NC_008321	TAA	2	6	1144453	1144458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969321
17468	NC_008321	CAAGAG	2	12	1144496	1144507	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	113969321
17469	NC_008321	GGC	2	6	1144585	1144590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969321
17470	NC_008321	CTG	2	6	1144661	1144666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969321
17471	NC_008321	GGC	2	6	1144681	1144686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969321
17472	NC_008321	GAT	2	6	1144709	1144714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969321
17473	NC_008321	GGCG	2	8	1144731	1144738	0 %	0 %	75 %	25 %	113969321
17474	NC_008321	TTTG	2	8	1144744	1144751	0 %	75 %	25 %	0 %	113969321
17475	NC_008321	TC	3	6	1144809	1144814	0 %	50 %	0 %	50 %	113969321
17476	NC_008321	CCG	2	6	1144845	1144850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969321
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17480	NC_008321	CTGT	2	8	1145656	1145663	0 %	50 %	25 %	25 %	113969322
17481	NC_008321	ATG	2	6	1145696	1145701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969322
17482	NC_008321	GCATCA	2	12	1145730	1145741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113969322
17483	NC_008321	GCA	2	6	1145745	1145750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969322
17484	NC_008321	CG	3	6	1145860	1145865	0 %	0 %	50 %	50 %	113969322
17485	NC_008321	CCG	2	6	1145866	1145871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969322
17486	NC_008321	GGCGT	2	10	1146010	1146019	0 %	20 %	60 %	20 %	113969323
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17488	NC_008321	CCG	2	6	1146077	1146082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969323
17489	NC_008321	GAC	2	6	1146091	1146096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969323
17490	NC_008321	CATT	2	8	1146114	1146121	25 %	50 %	0 %	25 %	113969323
17491	NC_008321	CG	3	6	1146252	1146257	0 %	0 %	50 %	50 %	113969323
17492	NC_008321	GGT	2	6	1146268	1146273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969323
17493	NC_008321	TGG	2	6	1146354	1146359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969323
17494	NC_008321	CGCTG	2	10	1146665	1146674	0 %	20 %	40 %	40 %	113969323
17495	NC_008321	GTG	2	6	1146743	1146748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969323
17496	NC_008321	GCA	2	6	1147067	1147072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969323
17497	NC_008321	CTG	2	6	1147084	1147089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969323
17498	NC_008321	C	6	6	1147178	1147183	0 %	0 %	0 %	100 %	113969323
17499	NC_008321	CTG	2	6	1147213	1147218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969323
17500	NC_008321	GA	3	6	1147229	1147234	50 %	0 %	50 %	0 %	113969323

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